Humana DNA och RNA virus

Question 1

Vilka DNA virusfamiljer finns det?

Answer 1

Poxvirus
Herpesvirus
Adenovirus
Polyomavirus
Papillomvirus
Parvovirus
Hepatitvirus (förutom C)

En familj av virus kallas för -viridae. Exv Herpesviridae.

Question 2

Vilka viktiga virus hör till familjen Poxvirus? Något speciellt med dem?

Answer 2

Olika typer av koppor.
Variola virus (som orsakar smittkoppor)
Monkeypox
Cowpox
osv

Smittkoppsviruset eradikerades på 80-talet tack vare globala vaccinationskampanjer. Av denna anledning vaccinerar man ej längre mot detta i Sverige.

Question 3

Egenskaper hos Variola Viruset?

Answer 3

Stort DNA genom som kodar för ungefär 200 olika virusproteiner, behöver ej låna mycket av cellen. Cytoplasmisk amplifiering, inklusive DNA replikation.
Ingen mekanism för latens. Akut virus

Question 4

Hur indelas Herpesvirus?

Answer 4

Familjen Herpesviridae indelas in i tre subfamiljer;
Alphaherpesvirinae
Betaherpesvirinae
Gammaherpesvirinae

Question 5

Vilka herpesvirus ingår i subfamiljern Alphaherpesvirinae?

Answer 5

Herpes simplex virus 1 (HHV1)
Herpes simplex virus 2 (HHV2)
Variella zoster virus (HHV3)

Question 6

Vilka herpesvirus ingår i subfamiljen Betaherpesvirinae?

Answer 6

Cytomegalovirus (HHV5)
Human Herpes Virus 6 (HHV6)
Human Herpes Virus 7 (HHV7)

Question 7

Vilka herpesvirus ingår i subfamiljen Gammaherpesvirinae?

Answer 7

Epstein Barr virus (HHV4)
Human herpes virus 8 (HHV8)

Question 8

Vilka karaktäristika har familjen av Herpesvirus?

Answer 8

Höljeförsedda
Dubbelsträngat DNA m. ungefär 200 gener
Har maskineri för att klara sig i icke delande celler, och skapa latens där

Question 9

Vad karaktäriserar familjen Adenovirus?

Answer 9

Icosahedral kapsid, UTAN hölje
Dubbelsträngat DNA m. 30-40 gener
Ger persistenta infektioner, men ingen latens
Genomet kodar proteiner för DNA syntes, men inte för nukleotidsyntes

Question 10

Vilka subfamiljer (serogrupper) av Adenovirus finns det? Vilken sorts infektioner orsakar de?

Answer 10

Grupperas A-F, men finns många enskilda adenovirus i varje grupp. De flesta ger infektioner i luftvägarna. Någon enstaka ger infektion av ögat. Grupp F ger gastro-enterit.

Question 11

Vilket är det typiska sättet för Adenovirus att sprida sig? Varför då? Vanligaste grupperna att drabbas?

Answer 11

Adenovirus har inget hölje och är således relativt stabilt - klarar sig väl i mag-tarmkanal och i klorerat vatten. Barn och unga vuxna i trånga utrymmen t.ex. i badhus - viruset sprids där i vattnet och hamnar i ögon och hals, varpå man får pharyngit och conjunktivit.
Typiska fynd röda ögon, ont i halsen, och feber.

Question 12

Karaktäristika av Polyomavirus?

Answer 12

Dubbelsträngat cirkulärt genom, med ett fåtal (~5 gener) och kan således amplifieras endast i delande celler - har därför verktyg för att sätta igång cellcykeln hos den cell som den infekterat: inhibera p53 (förhindrar apoptos av cellen), inhiberar RbP (som normalt förhindrar cellen från att gå vidare i cellcykeln).
Har INTE hölje
Ger persistenta infektioner men ingen latens

Question 13

Förekomst av Polyomavirus? Vad orsakar de för sjukdomar normalt?

Answer 13

Polyomavirus finns överallt. Men trots mycket kraftig primärinfektion bryter sjukdom sällan ut.

Question 14

Vilka subfamiljer av Polyomavirus finns det?

Answer 14

Polyomavirus BK
JC
KI
Merkel cell polyomavirus

Question 15

Vilka sällsynta sjukdomar kan polyomavirus ge upphov till? När då?

Answer 15

Merkel cell polyomavirus kan orsaka Merkel cell carcinom.

Hos immunosupprimerade (främst AIDSpersoner) kan JC polyomavirus orsaka progressiv multifocal leucoencephalopati som har 100% dödlighet.

Reaktivering av BK polyomavirus kan orsaka problem vid njurtransplantationer.

Question 16

Karaktäristika av papillomvirus?

Answer 16

Dubbelsträngat DNA med ca. 8 gener, däribland DNA helikas, ändå mkt beroende av cellulärt maskineri.
Pressar cellen framåt i cellcykeln genom att inhibera Rb och p53.
Ger persistenta infektioner men har ingen mekanism för latens.

Question 17

Vilken typ av celler angriper Papillomavirus helst? Kännetecken? Vilken farlig sjukdom kan de ge upphov till? Ger alla sorter av papillomvirus det?

Answer 17

Papillomvirus har tropism för epitelceller i hud och mukösa membran - resulterar i “godartade tumörer” = vårtor, kondylom.

Finns över 100 olika papillomvirus - HPV-16 och HPV-18 är sk högrisktyper som efter persistent infektion i underlivet hos kvinnor är en stor riskfaktor för cervixcancer.

Question 18

Karaktäristika av Parvovirus?

Answer 18

Enkelsträngat DNA virus med ungefär 5 gener.
Har INTE hölje
Icosaedrisk

Question 19

Vilka två virus finns i gruppen Parvovirus?

Answer 19

Erythtrovirus
Bocavirus

Question 20

Vad är B-19 virus för något? Vad orsakar det?

Answer 20

B19 virus är en typ av Parvovirus som orsakar Erythema infectiosum eller “femte sjukan” hos barn.

Question 21

Vad är femte sjukan? Vilket virus orsakar det? Vilka celler angrips och vad kan detta orsaka? Symptom?

Answer 21

Femte sjukan orsakas av B19 virus (Ett parvovirus) - utbrott ofta sent på vintern, tidigt på våren.

Viruset amplifieras i erythroida progenitor celler vilket kan ge en mild anemi hos barn.

Question 22

Symptomen av en B19 virusinfektion är bifasisk. Vilka symptom uppkommer när och varför? När uppkommer en s.k. aplastic crisis?

Answer 22

Första fasen: ospecifika förkylningssymptom, ev lätt anemi.
Andra fasen: ledvärk och utslag som uppkommer i samband med att immunsystemet kommer igång på riktigt.

Aplastic crisis = livshotande reticulocytopeni. Kan uppkomma hos patienter med hemolytisk anemi (ex sickle cell anemi) - när B19 sätter sig i erytroida prekursorer så kommer ej några nya röda blodkroppar att bildas. Då personer med hemolytisk anemi förbrukar sina blodkroppar snabbt har de fler erytroblaster - infektionen blir starkare och kan slå ut alla dessa. Om man ej gör något åt situationen dör patienten.

Question 23

Läs i slides fr 9.9.2015 om karaktäristika hos DNA virus och RNA virus och jämför dessa.

Question 24

Varför uppkommer så många sk “quasispecies” hos RNA virus jämfört med DNA virus?

Answer 24

RNA virus har låg fidelitet - med fel 1/10000, och det finns ingen reparationsmekanism för skador på RNA. Detta tillsammans med den stora populationen av virus får man en extrem stor förökningshastighet med många mutationer - alla RNA “överlever” ju och de bildade RNA molekylerna kommer att selekteras för eller emot - men vid en given tidpunkt finns ju förstås en hel massa olika RNA i omlopp.

Question 25

Är RNA virusinfektioner normalt akuta eller kroniska? Varför? Vilket viktigt undantag till denna regel finns det?

Answer 25

RNA virusinfektioner är oftast akuta - detta beroende på bla deras instabilitet i celler (halveringstid på några dygn) och deras oreglerade genuttryck: ger ingen organisation av infektionen till en tidig och sen fas - allt bildas bara på en gång vilket ger alarm till immunsystemet och dessutom ofta dödar värdcellen.

Hepatit C är ett väldigt viktigt undantag till denna regel, samt retrovirus.

Question 26

Vilka typer av RNA virus finns det?

Answer 26

Enkelsträngat: + , - och retrovirus
Dubbelsträngat: +/-

Question 27

Vilket viktigt virus hör till dsRNA-virusgruppen och familjen av Reoviridae?

Answer 27

Rotavirus

Question 28

Vilket är det viktigaste dsRNA-viruset i Sverige och vilken sjukdom orsakar den? Hos vem?

Answer 28

Rotaviruset. Ger gastro-enterit (diarré) hos barn!!

Question 29

Karaktäristika hos Rotavirus?

Answer 29

dsRNA med segmenterat genom med 15 uttrycksbara gener
Segment kan omarrangeras för att få ett nytt virus (speciellt om olika typer av Rotavirus kombinerar sina)

Question 30

Hur undkommer det dsRNA viruset Rotavirus detektion av immunsystemet? dsRNA är ju normalt mycket alarmerande för cellen..

Answer 30

Har flera lager av kapsider och använder dessa för att alltid dölja dsRNA - bildar en sträng i taget av genomet för att först i det dolda låta dem slås samman.

Question 31

Vilken typ av RNA virus är Picornavirus?

Answer 31

+ssRNA

Question 32

Vilka är de viktigaste virusen som hör till familjen av Picornavirus?

Answer 32

Ett gäng olika Enterovirus
Poliovirus
Rhinovirus
Hepatit A

Question 33

Hur sprids de viktigaste familjemedlemmarna av Picornavirus mellan människor?

Answer 33

Dom har olika sätt.
Enterovirus 71 sprids via kontaminerat vatten och mat.
Poliovirus och Hepatit A sprids med blod.

Question 34

Vad karaktäriserar -ssRNA virus?

Answer 34

De har helixsymmetri och har lipidhölje.
Äntrar cellen genom fusion med plasmamembranet (ej influensavirus)
Måste bära med sig ett RNA-polymeras i virionet för att viral gen expression skall kunna komma igång i början.
Replikerar sig i cytoplasman (dock ej influensa)
“Budding” från plasmamembranet.

Question 35

Nämn de fem vanligast förekommande -ssRNA virusen:

Answer 35

Rabies virus
Morbillivirus (mässling)
Puumala virus (sorkfeber- ger renalt syndrom)
Influensavirus (A, B, C)
Ebolavirus

Question 36

Hur sprids mässling? Vilka symptom ger det initialt?

Answer 36

Mässling är en luftbureen smitta. De initiella symptomen är kraftig snuva och infektion av ögonvitan. Hosta, hög feber och utslag förekommer också.

Question 37

Varför är det bra att vaccinera mot mässling?

Answer 37

Trots att den initiella mässlingsinfektionen inte är så farlig så ger den i många fall mycket svåra komplikationer:
Encephalit (0.1%)
Ökar risken för bakteriella infektioner:
Otitia media (10%)
Croup
Bakteriell pneumoni (5%)
Diarre (<10%)
Postinfektiös encephalit

I Sverige föds cirka 100,000 barn per år - med mässlingsvaccinet besparas väldigt mycket lidande - av dessa skulle t.ex. 100 barn få väldigt svåra, och bestående men av encephaliten.

Question 38

Det finns endast en serotyp av mässling vilket innebär att om man vaccinerats, eller smittats en gång så har man livslång immunitet. Hur kan det endast finnas en serotyp när RNA virus, såsom Morbilliviruset, är vanligen så variabelt?

Answer 38

Trots att kopiering av RNA är error prone så har det hittills inte slumpmässigt lyckats bildas ett “bättre” virus (smittsammare, kraftigare) som skulle kunnat konkurrera ut det nuvarande mässlingsviruset.

Question 39

Har antalet fall per år av mässling ökat eller minskat i Sverige de senaste åren? Varför?

Answer 39

Det har ökat. Det beror delvis på att vissa befolkningsgrupper riktar skepsis mot och tar avstånd ifrån vaccinationer (främst välbärgade och “utbildade”) samt att det invandrar stora mängder människor som ej är vaccinerade.

Question 40

Läs lite om RNA virus i kompendierna - fokusera på indelning och lite namn. Samt på hur RNA virus skiljer sig från DNA virus, och vilka karaktäristika de olika grupperna av RNA virus har.