Hépatite C (HCV) Flashcards
Donner les généralités sur ce virus? (type de capside, présence ou non d’enveloppe, type de molécule portant l’information génétique)
Capside icosaédrique
Enveloppé
ARN+ sp
Monocistronique: code pour une unique polyprotéine.
Décrire étape par étape le processus ayant permis la découverte du virus de l’hépatite C.
1 - Prélèvement de plasma (tout sauf globules rouges) chez des chimpanzés.
2- Ultracentrifugation (les acides nucléiques vont se retrouver dans le culot).
3 - Extraction d’acides nucléiques.
4 - Génération d’ADNc par rétrotranscription.
5 - Introduction de l’ADNc dans des phages et les faire se multiplier dans l’objectif d’en faire une banque.
6 - Clonage dans E.coli, apparition de plages de lyse.
7 - Transfert sur filtre du contenu protéique présent sur les plages de lyse et immunoblot avec le sérum d’un malade infecté.
Quels sont les modes de transmission du HCV?
Transfusion sanguine, injection de drogue par voie intraveineuse.
Quelles sont les pathologies associés au HCV?
Dans 75% des infection il y a transformation en hépatite chronique. 25% du temps en Cirrhose. 4% en CHC (Cancer Hépato Cellulaire).
Cela provoque:
- Insulino-résistance.
- Diabète type II.
- Obésité.
nb: les enfants ont tendance à éliminer le virus plus souvent car celui-ci a besoin de cibles spécifiques rares chez les enfants (ex : le gras).
Le HCV est restreint à l’homme, chimpanzé, tupaïa.
Quelle est la meilleure approche pour l’étude du HCV en modèle animale?
Réalisation de Xénotransplantations de foie humain dans des souris, ainsi que de cellules souches immunitaires humaines.
Quelles sont les cibles cellulaires du HCV?
Se sont les hépatocytes.
nb: Des traces d’ARN viral ont été retrouvé dans les PBMC (Peripheral Blood Mononuclear Cell). Des traces d’ARN et de protéines virales aussi retrouvées dans des Lymphocytes T et B.
Quelles sont les Glycoprotéines d’enveloppe du HCV?
E1 et E2.
Avec quelles autres structures s’associent les virus du HCV pour circuler dans l’organisme?
Le virus circule en se fixant aux Lipoprotéines (HDL, LDL, VLDL, Chylomicrons). Le HCV a tendance à se fixer plus sur LDL et VLDL.
Quels sont les différents récepteurs (indirects et directs) utilisés par le HCV pour s’introduire dans les hépatocytes?
Récepteurs indirects (reconnaissants les lipoprotéines):
- LDL-R : reconnait les LDL auxquels sont associés les virus.
- GAG : Longues chaines polysaccharidiques.
Récepteurs directs (reconnaissants le virus):
- SRB1 : Récepteur des LDL et HDL. Capable d’interagir avec la protéine d’enveloppe E2.
- CD81 : Interagit aussi avec E2.
- CLDN1 : Protéine impliquée dans la formation des jonctions serrées dans le foie et tissus épithéliaux.
- OCLN1 : Protéine impliquée dans la formation des jonctions serrées.
Décrire les étapes d’attachement du HCV aux cellules?
1 - Attachement des récepteurs des lipoprotéines (LDL-R, GAG), puis reconnaissance des récepteurs viraux (SRB1).
2 - Liaison de E2 à SRB1 et CD81. Déclenchement d’une cascade de signalisation du la cellule (EGFR, NPC1L1, …).
3 - Mouvement latéral de HCV sur la cellule tout en continuant d’interagir avec les récepteurs. Il va y avoir interaction de CLDN1 et CD81 au niveau des jonctions serrées, entrée du virus.
4 - Endocytose clathrine-dépendante.
5 - Fusion-membranaire pH acide-dépendante (libération ARN viral + protéine dans la cellule).
Quel est le rôle du miARN-122 dans la transcription de ce virus?
La partie 5’ au début de la région IRES est reconnue par un miARN-122, cela stabilise, protège l’ARN et stimule la transcription.
A la base le miARN-122 est sensé aller sur la partie 3’ des ARN pour aider à leur dégradation. Sans ce miARN-122 le virus est incapable de se multiplier. Cela détermine le tropisme du virus.
Quels sont les facteurs d’initiation cellulaires de la traduction intervenant sur l’ARN du virus?
eIF2 et eIF3 sont recrutés au niveau de l’IRES. Entre les deux viendra se fixer la SU 40S du ribosome.
Décrire l’organisation structurale retrouvée en 3’ de l’ARN viral?
Du coté 3’, après le codon STOP, il y a une région hypervariable (40 nucléotides), suivi d’une séquence poly U-C (50-200 nucléotide), suivi de la région X (98 nucléotides) composé de SL-1 SL-2 et SL-3 (ces 3 sites permettent la reconnaissance par la polymérase).
Donner les différentes protéines issues de la traduction de l’ARN du HCV? Décrire brièvement leur fonction.
- CORE : Première région codante. Code pour les protéines de capsides. Cette séquence CORE possède un second ORF avec un second cadre de lecture.
- ARFP : Protéine alternative issue du second ORF. Elle est très compliquée à détecter, on estime que son rôle serait de participer au fait de forcer la cellule à bosser pour le virus et non pour faire son rôle de base.
- E1 et E2 : Sont adressés à la lumière du RE de la cellule pour y être maturées.
- P7 : Protéine se rassemblant en multimères permettant la formation du canal ionique sur la cellule.
- NS2 et NS3 : C’est une protéase-cystéine. La partie 3’ term de NS2 et 5’ de NS3 forment un site catalytique protéase-sérine qui permet de couper la protéine en deux et de libérer NS2 du reste de la polyprotéine.
- NS3 : Activité protéase-sérine situé en N’term qui dépend d’un cofacteur NS4A. Va couper la polyprotéine dans sa partie possédant les protéines non structurales. La partie 3’ a une activité hélicase d’ARN.
- NS4B : Détourne les membranes du RE de la cellule pour en faire des « usines » virales. Elle crée des réseaux membranaires contenant des protéines virales les permettant de se cacher du reste des protéines cellulaires.
- NS5A : Protéines phosphorylée qui permet au virus d’échapper à l’immunité innée. Elle joue un rôle très important dans la formation des virions néosynthétisés, et des complexes virion-gouttelettes lipidiques.
- NS5B : Code pour l’ARN pol ARN dépendante.
