Go Flashcards
Pourquoi étudier la biologie moléculaire des virus?
pour pouvoir inhiber selectivmenet la réplication virale avec des médaicament antiviraux et vaccins
Transfert horizontal
intégrer matière génétique sans être le descendant
3 Carastéristiques des virus
Grande diversité génétique
mutation rapide
petite taille (<300nm)
Premier virus animal identifié
le virus de la fièvre aphteuse
le plus gros virus
mimivirus (mimicking microbe virus)
virus géant
virus à virus (virophage)
Spoutnik
5 critères pour être un virus
- posséder 1 seul type d’acide nucléique (ADN ou ARN)
- Se reproduire à partir de cette a. nucléique
- Ne possède pas d’information génétique pour les enzyme du métabolisme intermédiaire de production d’énergie
- Sa multiplication nécessite les structure de la cellule hôte et de ses ribosomes
- incapable de croître et de subir une fision binaire
les 2 formes de virus
intracellulaire : Variable
Extracellulaire: Virion - particule complète, mature, infectieuse - c’est l’unité structurale du virus
Structure virion
Génome viral : contient ensemble info nécessaire à la réplication
Capside : role de protection, intervient dans attachement lorsque nu et porte des structures antigénique
(2 ensemble virus nu - ce sont les deux éléments constants)
Enveloppe : role de protection
(3 ensemble virus enveloppé
Qu’est ce qui détermine le tropisme et l’infectiosité
la structure la plus externe
composition de l’enveloppe viral
protéine, lipique, glucide
spicule (péplomère) : anti-récepteur viraux
dérivé de la membrane des cellules (plasmique, nucléaire, organites)
Caractéristique et Ex de virus nu
Pas de prédominance sur les saisons
Résistant à l’extérieur (pH, enzyme, dessication)
adénovirus
Virus poliomyélite
Caractéristique et ex de virus enveloppé
prédominance sur les saison froide
rapidement inactivé dans l’environnement
VIH, variole, grippe, influenza
5 formes de base de particule virale et exemple
Hélicoidal nu (VMT) ou enveloppé (rage, influenza, ebola)
icosaédrique nu (poliovius, adénovirus, parvovirus) ou enveloppé (herpès, fièvre jaune, rubéole)
Complexe (poxvirus, phages T-pair)
ex virus hélicoidal
Grippe
mosaique du tabac
rage
Caractéristique et ex virus icosaédrique
capside composé de capsomères (composé de protomère)
Pentons (5 protomères) : sommet
hexon (6 protomères) : face et arrêtes
adénovirus
polyomavirus
Caractéristique et ex virus complexe
symétrie binaire pour T pair (T2,T4,T6..) : tête icosaédrique et queue hélicoidale
Poxvirus
bactériophage
Fonction et caractéristiques Spicule
Fixation Fusion Activité enzymatique Glycoprotéine anti-recepteur viraux synonyme :Péplomères même spicule peut faire 2 rôles
qu’est-ce qui détermine la taille d’un virus
la taille du génome et la quantité d’information génétique
Type de génome viraux
ARN ou ADN
Sb ou Db
+ ou - (pour ARN)
carastérique virus ADN
Stable biochimiquement et génétiquement
taux de mutation faible
long segment
Pas besoin d’enzyme spécifique pour la réplication
Sert directement de matrice (ADN–> ARNm–> prot)
carastérique virus ARN
instable biochimiquement et génétiquement
taux de mutation élevé
court segment fragmenté
Besoin d’enzyme de réplication viral spécifique
Double rôle de matrice (ARN et ARNm)
Majorité des prot virales sont..
multifonctionnelle
classification des virus (5 façon)
en fct du mode de transmission (arbovirus : arthrpode borne virus)
en fct de l’organisme parasité (bactériophage : bacétrie; phytovirus : végétaux)
en fct tropisme cellulaire ou tissulaire ( dermotrope, neurotrope..)
Système universelle de calssification
Classification de Baltimore
Systme universele de classification, 4 critères
nature a. nucléique
symétrie nucléocapside
enveloppé ou non
nb de capsomères (icosaédrique) ou le diamètre du nucléocapside (hélicoidale)
2 critères systmème de baltimore
type d’a. nucléique
grande étape de réplication et expression viral
Viroide
ARNsb ciruclaire
pas de capside
prions
glucoprotéines mal replié
ex: encéphalopathie spongiforme bovine
virusoide
ne code pas pour ces propres protéines de fixation
étape de la réplication viral
Étape précoce
- fixation (présence de recepteur viraux détermine tropisme )
- pénétration (endocytose, injection, fusion)
- décapsidation
Étape de synthèse et réplication viral
Étape tardive
- assemblage (dans noyau pour virus à ADN, cytop ARN)
-libération (par lyse ou bourgeonnement)
combien de particule viral par cellule infecté
100 à 1000 (pas toute infectieuse)
type d’nteraction virus/cellule
aboritive: pas de replication
persistante: replication sans lyse cellulaire
productive: interaction lytique
cytopathogène: altération morphologique de la cellule
- Transformation en cellule maligne : pouvoir oncogène chez certains virus
Concept iceberg
proportion des cas d’une maladie qui demeure cliniquement muet
facteurs qui détermine groupe de risque
gamme d'hôtes pathogénicité dose infectieuse mode de transmission disponibilité des mesures préventives efficaces disponibilit de traitement
groupe agents pathogènes
2,3 et 4
différent type celulaires par virus
résistante: ne possède pas de recepteur
susceptible : possède recepteur mais ne peut pas forcément se réplique
sensible: possède recepteur et permet la réplication
porte d’entrée
tractus digestif, urigéntial système respiratoire vaisseux sanguins blessure peau et conjonctive piqûre d'insecte
particularité transmision voie respiratoire
humidité, température, intensité de production et infectiosité du virus
Conséquence de la transmission verticale
avortement, malformation ou immunotolérence à ce virus
mode de transmission horizontal
direct: physique, sexuel
indirect: eau, aliments, vecteur, maladie iatrogène
mode excrétion viral
voies respiratoire tractus gastro-intestinal et urogéntial sang peu/muqueuse s. nerveux
infx localisé particularité
reste au site d’entré
infx généralisé particularité
entré virus
propagation au g. lymphatique de la région
virémie primaire –>propagation à organes sensibles
virémie secondaire plus intense –>dissémination à d’autres organe (comme peau)
longue incubation
virémie secondaire
developpement de sirus dans un site secondaires
site de réplication primaire
site ou se developpe l’infection au début
type d’infection viral
aboritive: échec/élimination
aigue: rapide et autolimitante (ou mort)
Persistante
-chronite: réplication continue
-chronite lente: réplication progressive
-latente: pas grand production virus, peu ou pas de réponse immunitaire, peut se réactiver plus tard
méthode défense
barrière physique: peau, muqueuse, acidité, larme, microflore
défense intrisèque: absence recepteur, autophagie, apoptose
immunité inné: cytokin, mastocyte, macrophage, NK, complément, fievre, inflammation…
immunité adaptative, PRR: TLR (m. cytoplasmique) NLR et RLR (dans cytoplasme)
symptome
subjectif (douleur, appétit)
signe
objectif (fièvre, erruption cutané…)
syndrome
ensemble des signes et symptomes liés à une maladie
période d’incubation
entrée du virus jusqu’à apparition signe et symptome
virus pathogène
capable d’induire des signes et symptome (maladie)
Pathogénicité
capacité à causé une maladie (qualitatif)
Virulence
interaction avec hôte (quantitatif- étendu)
-capaciter rentre, croitre dans la cellule de l’hote et combattre les mécanismes de l’ote
- capacité a produire des domamges temporaire ou permanent à l’hote
c’est un trait relatif
transmissibilité
efficacité que c’est transmis à un hôte naif
reservoir
soure qui fourni des conditions favorable à la survie et propagation du pathogène
Pathogènese
le mécanisme par lequel le virus endommage des population cellulaire menant à des signes et symptômes de la maladie
Stratégie pour éviter une réponse immunitaire
- inhiber la reconnaissance immunitaire
- infx latente
- mutation
- lyse des cellules immunitaires
- virokines
- virorecepteur
- inhiber le complément
mécanisme d’action des anticoprs neutralisant
- inhiber attachement des virus au recepteur cellulaire
- inhiber l’interaction avec cellule donc bloc l’internalisation du virus
- empêche la décapsidation
- favorise l’aggrégation
ADE de la denge
Antibody-dependent enhancement
-Les anticorps qui se lient lors d’une seconde infection a la denge facilité la synthèse viral de cette dernière parce qu’elles peuvent s’échapper de la vacuole (lien anticorps et virus moins fort) et se répliquer dans le macrophage
facteurs qui affecte la pathogénèse
Voie d'entrée le type cellulaire le stade de réplication de la cellule la réponse immunitaire facteurs de restriction de l'hote
la virulence du virus la vitesse de réplication et de propagation du virus stabilité infx bactérienne secondaire Dosage
3 mécanismes des oncovirus
Déregulation du cycle cellulaire et apoptose en inactivant les supresseurs de tumeur (ex:p53)
Pertubation de la division cellulaire par des protéines virales
Mutagénèse insertionnelle: insertion du génome viral dans le génome cellualire
effet que peut avoir virus sur hote
aucune inflammation fievre, malaise anorexie mucus diarrhée perte de fonction dévelpement anormal avortement retard de coirssance lésion infx secondaire
Facteurs hote affectant la pathogénèse viral
manque de récepteur age état métabolique -nutrtion -déficience vit A -grossesse réponse immunitaire diminué L'immunité (innée et adaptative)
Facteurs viraux affectant la pathogénèse viral
manque de récepteur antigéniques
dérive antigénique
cassure antigénique
capacité à entraver la réponse immunitiaire
deux type de variations antigénique
saut angtigénique: réarangement important –> nouveau sous-types
dérive antigénique : modification légère
méthode diagnostic
direct: mettre en évidence présence du virus
ex: microscopie électronique, ELISA sandwich, qPCR, PCR
indirect: mettre en évidence antirops sythétisé
ex: ELISA, qPCR, PCR, detection ECP, test hémaglutination, quantification du titre infectieux par plages de lyse
concentration critique pour voir des virus en microscopie électronique
10^6 particule/mL
DICC
dose infection en culture de cellule
DL50
la dose qui cause la mort de 50% des cellules
la concentration en particule viral
charge viral
beaucoup de nouvelle opportunité environnemental pour les virus
migration et déplacaement humain
échange internatiaux
invasion de nouvelle endroit
production animal intensive avec mauvaise pratique sanitaire
mauvaises surveillance dans certains pays
Avantage et incovénient PCR
relativment rapide
peu couteux
sensible et précis
contamination : faux positif
avantage test agglutination
rapide
précis
donne quantité relative (ne quantifie pas les particules infectieuse précisément)
isolement et culture viral
sur animaux
oeuf embryonné de pouls
culture cellulaire primaire, diploide ou ligne continue, explants (culture d’organe)
Effet cytopathogène et ex
dépende de la nautre de la cellule et du virus
formation de syncytia (fusion de cellule)
principe du test de neutralisation
détecte des anticops capanle de neutralisé spécifiquement un virus dans l’échantillon (pas de destruction cellulaire dans le test = test positif)
