Genoma Flashcards
Genoma
Set completo de instrucciones para hacer funcionar un organismo. Se localizan los núcleos celulares y está organizado en cromosomas.
Genoma procariota
Usualmente corresponde a un cromosoma circular sin intrones. Puede existir plasmidios.
Genoma eucariota
Localizado en diversos cromosomas lineales poseen una baja densidad de genes. Los cloroplastos y mitocondrias poseen su propio material genético.
Genoma de las plantas
Contienen 3 genomas el del núcleo celular el de los cloroplastos y las mitocondrias. El tamaño del genoma se miden pares de bases y es especie dependiente. La diferencia del tamaño del genoma radica principalmente en el número de secuencias idénticas de tamaño variable.
Arabidopsis thaliana
Planta modelo utilizada en biología vegetal por su rápido crecimiento es una maleza dicotiledónea que posee 5 cromosomas con 70 mpb aproximadamente.
Tamaño del genoma
Cantidad total de DNA contenido en una única copia de genoma.
Paradoja valor C
No hay relación entre complejidad y tamaño.
Paradoja valor K
El tamaño del genoma no refleja el número de cromosomas en las eucariotas.
Paradoja valor N
El tamaño del genoma no refleja el número de genes en las eucariotas.
¿Por qué ocurre esta gran variación en el tamaño de los genomas de las plantas?
Principalmente por poliploidización lo que significa que el genoma completo se duplica generando el aumento del tamaño. Hay alopoliploidía qué es la combinación de cromosomas genéticamente distintos y la autopoliploidia que es la recombinación entre lo mismos cromosomas.
Tipos de duplicación de genes
Duplicación de la parte de un gen: un dominio interno que puede alterar la función.
Duplicación de un gen completo: generando familia de genes y generar agrupaciones con una función nueva.
Duplicación de cluster o grupo de genes: set de genes qué pueden duplicarse individualmente o en grupo.
Pérdida de genes
Aplicar genes puede existir una falla en el proceso lo que genera pseudogenes qué es una secuencia génica que no codifica pero la secuencia similar a genes codificantes.
Clasificación de los genes
Genes codificantes de proteínas: genes solitarios, duplicados, diferenciados, familias de genes, pseudogenes no funcionales.
Genes repetidos en tandem: codifican para RNAm, RNAt e histonas.
DNA repetido: secuencias simples, moderadamente repetitivas (transposones, retrotransposones virales y no virales)
Región codificante
Nucleótidos leen un fragmento que codifica el aminoácido de una proteína.
Región no codificante
Se compone de regiones reguladoras intrones y sitios de poliadenilacion.
DNA repetitivo
El DNA moderadamente repetido se compone de repeticiones en tandem de RNAm, RNAt y genes codificantes de histonas. Por otro lado las secuencias simples de DNA están compuestas por secuencias cortas repetidas en tandem las que se encuentran en los centrómeros y telómeros. Se utilizan como huella digital.
DNA móvil
Secciones de DNA que se mueven dentro de los genomas. Hay elementos de clase 1 con un intermediario de RNA, se transcribe y luego existe una transcripción inversa. Existe duplicación.
Elementos de clase 2: se cortan o sacan de su lugar y se mueven directamente como DNA al sitio receptor.
Secuencias de las eucariotas
Compuesto por secuencias únicas, secuencias moderadamente repetidas, altamente repetidas y elementos móviles.
Duplicación genómica
Se produce principalmente por fenómenos de poliploidía dentro del cual podemos encontrar aneupoliploidía qué es la variación en las copias de un cromosoma (trisomías) y eupoliploidía que se clasifican en alopoliploidía autopoliploidia.
Expresión génica en plantas
Existen diferentes mecanismos de regulación génica lo que aumenta o disminuye la producción. Los inducibles están apagados hasta que existe la presencia de una molécula inductora que lo promueva y los sistemas reprimible se están encendidos hasta que una molécula correpresora suprime o inhibe la expresión de genes.
Tipos de regulación
Regulación positiva qué es el proceso que desencadena una señal provocando una mayor expresión de genes. Y regulación negativa qué es el proceso que ocurre que desencadena una señal provocando una disminución de la expresión de genes.
Estructura de un gen en plantas
Posee sitio de inicio de transcripción que inicia la lectura de la base del segmento. Una región promotora que se caracterizan por la presencia de secuencias que hace más eficiente la unión de la polimerasa. Una región codificante que están dentro del gen inicia en el codón AUG y termina el codón de término UGA, UAA, UAG. Una región de modificación del RNAm.
Proteínas reguladoras de la transcripción
Proteínas activadoras se unen a secuencias específicas de ADN y favorecen la transcripción.
Proteínas depresoras se unen a secuencias específicas de ADN e inhibe la transcripción.
Control del procesamiento del ARN
Splicing alternativo es dónde se produce la combinación de axones de diferentes maneras.
Genoma cloroplastos
Múltiples moléculas circulares como las procariontes, tiene copia de plastidios y cada uno tiene copia de genes poseen intrones, muchas proteínas de cloroplastos son codificadas en el núcleo.
Genoma mitocondrial
Hay entre 5000 a 2000 en plantas entre 1 y 100 genomas en cromosomas circulares el ADN mitocondrial se repite antes o durante la mitosis.
