Genoma Flashcards
Genoma
Set completo de instrucciones para hacer funcionar un organismo. Se localizan los núcleos celulares y está organizado en cromosomas.
Genoma procariota
Usualmente corresponde a un cromosoma circular sin intrones. Puede existir plasmidios.
Genoma eucariota
Localizado en diversos cromosomas lineales poseen una baja densidad de genes. Los cloroplastos y mitocondrias poseen su propio material genético.
Genoma de las plantas
Contienen 3 genomas el del núcleo celular el de los cloroplastos y las mitocondrias. El tamaño del genoma se miden pares de bases y es especie dependiente. La diferencia del tamaño del genoma radica principalmente en el número de secuencias idénticas de tamaño variable.
Arabidopsis thaliana
Planta modelo utilizada en biología vegetal por su rápido crecimiento es una maleza dicotiledónea que posee 5 cromosomas con 70 mpb aproximadamente.
Tamaño del genoma
Cantidad total de DNA contenido en una única copia de genoma.
Paradoja valor C
No hay relación entre complejidad y tamaño.
Paradoja valor K
El tamaño del genoma no refleja el número de cromosomas en las eucariotas.
Paradoja valor N
El tamaño del genoma no refleja el número de genes en las eucariotas.
¿Por qué ocurre esta gran variación en el tamaño de los genomas de las plantas?
Principalmente por poliploidización lo que significa que el genoma completo se duplica generando el aumento del tamaño. Hay alopoliploidía qué es la combinación de cromosomas genéticamente distintos y la autopoliploidia que es la recombinación entre lo mismos cromosomas.
Tipos de duplicación de genes
Duplicación de la parte de un gen: un dominio interno que puede alterar la función.
Duplicación de un gen completo: generando familia de genes y generar agrupaciones con una función nueva.
Duplicación de cluster o grupo de genes: set de genes qué pueden duplicarse individualmente o en grupo.
Pérdida de genes
Aplicar genes puede existir una falla en el proceso lo que genera pseudogenes qué es una secuencia génica que no codifica pero la secuencia similar a genes codificantes.
Clasificación de los genes
Genes codificantes de proteínas: genes solitarios, duplicados, diferenciados, familias de genes, pseudogenes no funcionales.
Genes repetidos en tandem: codifican para RNAm, RNAt e histonas.
DNA repetido: secuencias simples, moderadamente repetitivas (transposones, retrotransposones virales y no virales)
Región codificante
Nucleótidos leen un fragmento que codifica el aminoácido de una proteína.
Región no codificante
Se compone de regiones reguladoras intrones y sitios de poliadenilacion.