génétique microbienne Flashcards
1
Q
Qu’est-ce que Griffith découvre (1928)?
A
La transformation
2
Q
Qu’est-ce que Griffith observe qui l’amène à la découverte de la transformation (1928)?
A
Observation de bactéries non-virulentes qui deviennent virulentes (S. pneumoniae)
3
Q
Qui amène le concept de la transformation en premier?
A
Griffith
4
Q
Quel est l’avancement de Beadle et Tatum (1941)?
A
Contrôle du métabolisme par l’information génétique
5
Q
Qui vient après Griffith?
A
Beadle et Tatum (1941)
6
Q
Qui contrôlent le métabolisme de Neurospora crash par l’information génétique en 1941?
A
Beadle et Tatum
7
Q
Qui expliquent le phénomène observé par Griffth (rôle de l’ADN dans la transformation bactérienne)?
A
Avery, McLeod et McCarty (1944)
8
Q
Que font Avery, McLeod et McCarty (1944)?
A
Ils expliquent le phénomène observé par Griffth (rôle de l’ADN dans la transformation bactérienne)
9
Q
Qui vient après Avery, McLeod et McCarty (1944)?
A
Lederberg et Tatum (1946)
10
Q
Quel concept apportent Lederberg et Tatum (1946)?
A
La conjugaison
11
Q
Qui apportent la conjugaison?
A
Lederberg et Tatum (1946)
12
Q
Qui vient après Lederberg et Tatum (1946)?
A
Zinder et Lederberg (1952)
13
Q
Quel concept apportent Zinder et Lederberg (1952)?
A
La transduction
14
Q
Qui apportent le concept de la transduction?
A
Zinder et Lederberg (1952)
15
Q
Qui découvrent le code génétique?
A
Nirenberg et Matthaei (1961)
16
Q
Qu’est-ce que que Nirnberg et Matthaei découvrent?
A
Le code génétique
17
Q
Qui vient après la découverte du code génétique?
A
S. Brenner, Jacob et Meselson (1961)
18
Q
Que découvrent S. Brenner, Jacob et Meselson (1961)?
A
Ribosome
19
Q
Qu’est-ce que Brenner vient confirmer?
A
L’hypothèse de l’ARNm
20
Q
Qui confirme l’hypothèse de l’ARNm?
A
Brenner
21
Q
Qu’est-ce que Cohen, Chang, Heilling et Boyer amènent comme concept (1973)?
A
Le clonage des gènes par plasmides
22
Q
Qui apportent le concept de clonage des gènes par plasmides (1973)?
A
Cohen, Chang, Heilling et Boyer
23
Q
À quoi sert le clonage des gènes par plasmides?
A
Permet de manipuler les gènes plus facilement
24
Q
Qui amènent le concept de séquençage des gènes (1977)?
A
Gilbert et Sanger
25
Qu'est-ce que le séquençage de Sanger?
Ajout de nucléotides qui stop la polymérisation de la séquence, et dépôt de cette séquence sur une gel
26
Qui débute la PCR (1986)?
Mullis
27
Qu'amène Mullis (1986)?
1. ADN pol stable à la chaleur
2. PCR
28
Qui fait la découverte de la 1ère séquence complète d'un génome? (1995)
Venter, Smith, Fraser et TIGR
29
Quel exploit font Venter, Smith, Fraser et TIGR (1995)?
Le premier séquençage complet d'un génome (Haemophilus influenzae)
30
Définition d'un génome
Ensemble des chromosomes et des gènes d'un organisme
31
Définition d'un chromosome
Brin d'ADN qui possède les informations génétiques
32
Définition d'un génotype
Caractéristiques héréditaires TOTALES de l'organisme
33
Définition d'un phénotype
Propriétés caractéristiques exprimées et observables
34
Qu'est-ce que le changement phénotypique?
Information génétique exprimée à un moment précis, suivant l'inactivation ou l'acquisition d'un gène (changement observable d'une propriété)
35
Qu'implique le changement phénotypique?
Nécessite une modification au niveau des gènes présents chez l'organisme
36
Quels sont les deux types de changements phénotypiques?
1. Naturel
2. Artificiel
37
Qu'est-ce qu'un changement phénotypique naturel?
1. Erreurs enzymatiques
2. Échange d'ADN
38
Qu'est-ce qu'un changement phénotypique artificiel?
Manipulation génétique en labo
39
Comment se font les changements au niveau du génome?
1. Mutation (naturelles ou artificielles)
2. Transfert d'information génétique (naturel ou artificiel)
- Transformation
- Conjugaison
- Transduction
40
Qu'est-ce qu'un plasmide?
Séquence d'ADN extrachromosomique à réplication autonome
- petite molécule d'ADN circulaire
41
Pourquoi dit-on que le plasmide est de réplication autonome?
Il fonctionne de façon indépendante du chromosome
42
Quels sont les avantages sélectifs que le plasmide peut donner à la bactérie?
1. Résistance aux antibios
2. Résistance aux métaux lourds
3. Facteurs de virulence
4. Gènes cataboliques pour dégradation de substrats
43
Qu'est-ce que l'aspect transmissible des plasmides?
Peuvent se transmettre d'une bactérie à une autre (mobiles)
44
Que permet l'aspect transmissible des plasmides?
Résistance aux antibios
45
V/F: le plasmide a la possibilité d'intégration réversible dans le génome (épisome)
Vrai, le plasmide est un épisome
46
Quelles sont les deux grandes classes de transfert de l'information génétique?
1. Réplication (transfert vertical)
2. Recombinaison (transfert horizontal)
47
Qu'est-ce que le transfert vertical (réplication)?
L'information génétique est transmise d'une génération cellulaire à une autre pendant la divison
48
Qu'est-ce que le transfert horizontal (recombinaison)?
L'information génétique est transmise entre des cellules d'une même génération
49
Quels sont les trois types de transfert horizontal (recombinaison)?
1. Transformation
2. Conjugaison
3. Transduction
50
Quelles sont les caractéristiques de la réplication d'ADN bactérienne?
1. Une seule origine de réplication
2. Processus bidirectionnel
3. 5' vers 3'
4. Des bouts d'amorce peuvent venir aider l'ADN pol à répliquer le brin discontinu (enzymes viennent dérouler ADN double-brin)
51
Quelles sont les caractéristiques de la réplication des plasmides bactérienne?
1. Réplication de l'ADN par cercle roulant
2. Les plasmides se répliquent un brin à la fois
52
Quelles sont les caractéristiques de la transcription et de la traduction bactérienne?
1. Processus réalisés simultanément (aucun noyau, moins d'étapes qu'eucaryotes)
2. Polyribosomes
53
Dans la transcription et la traduction bactérienne, quel effet permet l'absence de noyau chez les procaryotes (vs les eucaryotes)?
Vu que les bactéries n'ont pas de noyau, l'ADN est nu. Il peut alors se faire lier par les ribosomes libres dans le cytoplasme et commencer la synthèse directement.
= FITNESS plus fort: peuvent réagir à des changements beaucoup plus rapidement
Les eucaryotes possèdent beaucoup plus d'étapes avant de pourvoir entamer la synthèse
54
De quelles façons les mutations peuvent-elles arrivées?
1. Mutations spontanées (naturelles)
2. Mutations induites par agents mutagènes (artificielles)
55
Qu'est-ce qu'un mutation spontanée?
Erreurs enzymatiques
56
Qu'est-ce qu'une mutation induite par agents mutagènes?
- Chimique
- Radiations ionisantes (rayons X et Gamma)
- Radiation non-ionisantes (rayons UV)
57
Que sont les mutations?
Changement génomique héritable (nouveau phénotype dans les générations suivantes)
58
Quels sont les quatre types de mutations?
1. Silencieuse
2. Faux-sens
3. Non-sens
4. Par décalage de cadre de lecture
59
Qu'est-ce qu'un mutation silencieuse?
C devient G; codon devient GGG au lieu de GGC
- Code quand même pour glycine
- Aucun impact
60
Qu'est-ce qu'un mutation faux-sens?
G devient A; glycine devient sérine (changement d'un seul a.a. dans la séquence)
- +/- d'impact
61
Qu'est-ce qu'un mutation non-sens?
AAG devient UAG; codon stop = arrêt de la synthèse
- Impact important
62
Qu'est-ce qu'un mutation par décalage de cadre de lecture?
Un nucléotide va être enlevé ou ajouté (change le cadre de lecture)
63
Le transfert d'information génétique est un processus important pour quoi?
Processus important pour ajouter de la variabilité génétique
64
Quelles sont les deux variables dans le transfert d'information génétique?
Bactérie donneuse et bactérie réceptrice
65
Quelles sont les sources du "nouvel" ADN? (types de transfert horizontal?
1. Transformation
2. Conjugaison
3. Transduction
66
Qu'intègre la recombinaison?
Intégration de nouveaux gènes (génère de nouvelles combinaisons)
67
Quelle est la condition pour l'expression d'un gène dans le génome d'un nouvel organisme?
Ce gène doit être maintenu de façon stable dans le nouvel organisme
68
Quels sont les deux types de recombinaison?
1. Homologue
2. Site spécifique
69
Qu'est-ce que la recombinaison homologue?
Échange de brin d'ADN de séquence presque identique au chromosome sur une grand nombre de nucléotides (grande séquence, plus que 500 pb)
70
Quel est le résultat de la recombinaison homologue?
Substitution d'un segment d'ADN dans le génome; modification d'un ou de plusieurs gènes
71
Qu'est-ce que la recombinaison site spécifique?
Séquence identique (homologie) sur un petit nombre de nucléotides (10-20 pb)
72
Quel est le résultat de la recombinaison site spécifique?
Ajout d'un nouveau segment d'ADN dans le chromosome bactérien et interruption de la séquence initiale
73
Qu'est-ce que la transformation (transfert horizontal)?
Modification génétiques découlant de l'introduction d'ADN nu dans la bactérie (ADN libre dans l'environnement)
74
En quoi consiste l'expérience de Griffith?
Spectrococus pneumoniae (car a capsule) + souris
- tue les bactéries ayant des capsules
- Mange les deux types de bactéries (mortes avec capsule et vivantes sans capsule)
- Bactéries deviennent virulentes (sont les mêmes que les premières avec capsule)
75
Quelle est la conclusion de l'expérience de Griffith?
Les bactéries mortes vont libérer de leur ADN, les bactéries vivantes vont prendre cet ADN et l'intégrer dans leur génome pour développer une capsule et produire un facteur de virulence (bactérie compétente)
76
Qu'est-ce que l'état de compétence/virulence d'une bactérie?
Capacité naturelle à recruter de l'ADN libre
77
Comment les bactéries compétentes fonctionnent-elles?
1. Attachement d'ADN sur récepteur
2. Internalisation de l'ADN
3. Singularisation d'un brin d'ADN (simple-brin)
78
Comment l'état de compétence des bactéries est-elle induite?
1. Par des facteurs de compétence dans l'environnement
2. En labo, induite artificiellement
- perméabilité des membranes
- CaCl2 et courant électrique
79
Qu'est-ce que la conjugaison (transfert horizontal)?
ADN échangé directement par contact (pili de conjugaison)
80
Quels sont les trois types de transfert par conjugaison?
1. Transfert de plasmide F
2. Souche Hfr
3. Transfert de plasmide F'
81
Qu'est-ce que la conjugaison par transfert de plasmide F?
1. Bactérie F+: donneuse (possède le plasmide)
2. Bactérie F-: receveuse (n'a pas de plasmide)
82
Pourquoi la bactérie F+ ne peut pas donner à une autre bactérie F+?
Système de régulation de transfert de matériel génétique
83
Dans la conjugaison par transfert de plasmide F, le plasmide F contient quoi?
Les gènes de synthèse du plus de conjugaison
84
Qu'est-ce que la conjugaison par souche Hfr?
Le plasmide F est transféré partiellement
85
Qu'est-ce que l'épisome dans la conjugaison par souche Hfr?
Plasmide F qui s'intègre réversiblement dans le chromosome
86
Comment la souche F- évolue-t-elle dans la conjugaison par souche Hfr?
La souche F- demeure F-, mais devient recombinante
87
Quel est la souche utilisée dans la conjugaison par souche Hfr?
La souche F+ (fréquence de conjugaison + élevée)
88
Qu'est-ce que la conjugaison par transfert de plasmide F'?
La souche Hfr s'excise complètement du plasmide avec le plasmide F' (gènes bactériens)
89
Qu'arrive-t-il aux bactéries receveuses lors de la conjugaison par transfert de plasmide F'?
Les bactéries F' sont donneuses, les bactéries receveuses deviennent des F'
90
Qu'est-ce que la transduction (transfert horizontal)?
Transfert d'ADN via les bactériophages
91
Qu'est-ce qu'un bactériophage?
Virus qui infecte les bactéries
92
Quels sont les 2 types de bactériophages?
1. Lytiques ou virulents
2. Lysogéniques ou tempérés
93
Qu'est-ce que des bactériophages lytiques ou virulents?
Causent la lyse (mort) de la bactérie
94
Qu'est-ce que des bactériophages lysogéniques ou tempérés?
Font la lysogénisation (prophage)
95
Quels sont les bactériophages qui font de la transduction?
Seuls les bactériophages tempérées (prennent le cycle lysogénique)
96
Quels sont les deux types de transduction?
1. Généralisée
2. Localisée
97
Qu'est-ce que la transduction généralisée?
Aucune sélection du gène transporté vers une nouvelle bactérie (gène aléatoire)
- ADN se fait couper en morceaux
98
Qu'est-ce que la transduction localisée?
Seuls les gènes à proximité du prophage peuvent être transportés
- prophage s'excise du chromosome
