Génétique

Question 1

Gène (classique)

Answer 1

unité de base fonctionnelle / structurelle de l’information génétique qui contrôle un aspect spécifique du phénotype

Question 2

Gène (actuel)

Answer 2

une région génomique correspondant à une unité héritable, associée à des régions régulatrices, des régions transcrites et à d’autres séquences fonctionnelles

Question 3

Génotype

Answer 3

la somme des gènes qu’il possède

Question 4

Phénotype

Answer 4

la somme des caractères morphologiques, physiologiques ou comportementaux qui sont identifiables de l’extérieur

Question 5

Allèle

Answer 5

différente version d’un même gène ou séquence d’ADN

Question 6

Locus

Answer 6

emplacement d’un gène ou d’une séquence d’ADN sur un chromosome (fait référence à tous les allèles de ce gène). Cet emplacement est précis et invariable

Question 7

3 caractéristiques de la mutation

Answer 7

• séquence différente de l’ADN normal
• avec structure normale de l’ADN
• héritabilité

Question 8

Différents types de mutation et leurs conséquences : 6

Answer 8

• Mismatch : neutre ou perte de fonction
• Addition ou délétion : généralement perte de fonction (frameshift)
• Insertions d’éléments mobiles : perte de fonction
• Duplication ou délétion de grands fragments d’ADN : changements de dosage génique, perte de fonction
• Cassure et jointures de parties de chromosomes : changement de dosage génique, perte de fonction
• Changement dans le nombre de chromosome : changements de dosage génique, problème de méiose

Question 9

Effet sur l’expression génique (dépend de l’endroit / longueur) : 5

Answer 9

• mutation au niveau du promoteur ou enhancer : altération du niveau d’expression du gène
• mutation dans un intron : épissage anormal
• mutation dans un exon (peut altérer la séquence codante ou affecter l’épissage) :
  o mutation silencieuse
  o missense / mutation conservatrice ou non
  o mutation par codon stop
  o mutation framshift
• mutation par délétions importantes ou réarrangements chromosomiques
• perte d’un gène entier : diminution du niveau d’expression (=haploinsuffisance)

Question 10

Polymorphisme

Answer 10

locus avec deux allèles ayant une fréquence d’au moins 1%

Question 11

4 types de polymorphismes

Answer 11

• nucléotide simple : SNP
• longueur de fragment de restriction : RLFP
• répétition d’une séquence simple
• répétition en tandem

Question 12

Transmission mendélienne fondement : 5

Answer 12

o organisme diploïde
o une copie venant de chaque parent
o copies séparées durant la formation des cellules germinales haploïdes et réunies après fécondation
o notion d’allèle
o trait génétique : autosomal / lié au sexe /// dominant / récessif

Question 13

Transmission mendélienne 7

Answer 13

• Hérédité autosomale récessive :
  
  • Exprimé seulement chez les I porteurs de 2 copies de l’allèle mutant
  • ¼ des enfants atteints
• Autosomale dominante :
  
  • exprimé chez les hétérozygotes et homozygotes
  • 1 des parents atteint
• Récessive liée à l’X :
  
  • plus probable chez les hommes (car 1 seul chr X), les femmes ne l’expriment que si elles ont 2 X atteints
  • les porteurs hommes ne le transmettent jamais à leur fils
• Dominante liée à l’X :
  
  • seules les femmes sont atteintes : 1 chance sur 2 de le transmettre à leurs descendants. Les mâles meurent in utero
• Lié à l’Y :
  
  • touche les hommes, rare car souvent infertilité
• Hérédité pseudodominante :
  
  • transmission parent-enfant d’un trait connu comme récessif
  • concerne des mutations fréquentes et compatibles avec la reproduction, on a donc l’impression que c’est un allèle dominant
• Hérédité digénique : récemment mise en évidence

Question 14

Pénétrance

Answer 14

• Portion d’I possédant un génotype déterminé qui exprime le phénotype correspondant.
• Pénétrance incomplète (<1) == tous les porteurs du génotype à risque ne sont pas malades

Question 15

L’expressivité

Answer 15

• Degré d’expression phénotypique d’un trait génétique (les caractéristiques des I affectés différent d’un individu à un autre : organe différent…)

Question 16

Hétérogénéité : 4

Answer 16

• Hétérogénéité génétique : plusieur gènes associés à un même phénotype (gènes impliqués dans une même voie bio (ex : surdité))
• Hétérogénéité allélique : un seul gène impliqué dans un phénotype spécifique mais mutation diffère d’un individu à l’autre
• Hétérogénéité de locus : mutation dans différents gènes donne des phénotypes identiques
• Hétérozygotie composée : dans un trouble autosomique récessif les 2 allèles mutants peuvent différer l’un de l’autre

Question 17

Mosaïcisme : 2

Answer 17

• germinal : la mutation a lieu durant le développement des cellules germinales et peut impliquer de nombreux spermatozoïdes ou ovules (parent non affecté, risque de transmettre à + d’un déscendant)
• somatique : mutation a lieu durant le dev embryonnaire précoce (mélange de cellules avec et sans la mutation). On peut avoir une faible manifestation du phénotype ou une manifestation restreinte à une région du corps. Si dans lignée germinale, risque de transmission sinon pas.

Question 18

Empreinte parentale : 5

Answer 18

• Inactivation sélective de quelque gènes, durant la spermatogénèse ou l’ovogénèse  le génome diploïde issu de la fécondation sera fonctionnellement haploïde pour ces gènes
• Concerne 100 gènes rassemblés en clusters
• Empreinte paternelle = inactivation  seul l’allèle maternel est exprimé et vis versa
• Réversible à chaque génération
• Haploïdie fonctionnelle, donc si l’allèle qui est sensé s’exprimer a une anomale  suppression totale de l’expression du gène concerné  maladies causées par un gène à empreinte maternelle sont transmis par le père et vis versa

Question 19

Hérédité mitochondriale : 3

Answer 19

• division indépendante // répartition au hasard dans les cellules filles
• transmission maternelle exclusive
• la sévérité de la maladie dépend de la proportion de mitochondries avec le gène muté

Question 20

Hérédité multifactorielle : 4

Answer 20

• maladie fréquentes chez une famille mais ne respecte pas les lois de Mendel (dominance / récessivité)
• Phénotype = gène + environnement
• Maladie multifactorielle  combinaison particulière d’allèles « normaux » de certains gènes qui est pathologique
• Maladie multifactorielle =
  o Agrégation familiale de malades
  o Concordance d’atteinte entre vrais jumeaux
  o Augmentation du nombre de malades avec changement du mode de vie de la population

Question 21

Héritabilité : 2

Answer 21

• Donnée statistique et quantitative qui évalue la part des facteurs génétiques par rapport à l’environnement dans l’expression d’un caractère donné et au sein d’une population donnée
• Plus la concordance entre des vrais jumeaux est importante, plus grande est la contribution génétique

Question 22

Modèles pour l’hérédité multifactorielle

Answer 22

Modèle additif
Modèle du seuil
Modèle mixte

Question 23

• modèle additif : 2

Answer 23

o action de plusieurs gènes mais pas de facteurs env  hérédité polygénique
o concerne plutôt les traits quantitatifs comme la taille, pression artérielle, poids…

Question 24

• modèle du seuil : 4

Answer 24

o concerne les malformations congénitales (tout ou rien)
o facteurs génétique et env
o susceptibilité plus ou moins importante en fonction du nb de gènes prédisposant et du degré d’exprosition
o jusqu’à un certain point, pas de malformation mais elle apparaîtra lorsque ce seuil de susceptibilité sera franchi

Question 25

• modèle mixte : 3

Answer 25

o prédisposition sous la dépendance d’un gène majeur de susceptibilité
o composante polygénique
o facteurs env (tabac, alcool, pollution)

Question 26

Etudes d’association génétiques : 4

Answer 26

• recherche des variants génétiques associés avec un risque accru de la maladie (implique de grande pop)
• plus simple : etude de cas / témoins
• calcul de risque relatif : fréquence du trait chez les malades / fréquence du trait chez les contrôles
• > 1  variant associé positivement avec la maladie sans relation de causalité (<1 : « protecteur »)

Question 27

Cohortes : 4

Answer 27

• cohorte = phénotype d’intérêt + contrôles
• pop la plus homogène possible
• définir le phénotype aussi précisément que possible
• tous les cas doivent être similaires dans l’origine de la maladie

Question 28

Loi de Hardy-Weinberg : 4

Answer 28

• permet le calcul de la fréquence de porteurs de traits récessifs : p2 + q2 + 2pq = 1
• Relation simple entre la fréquence d’allèles à un locus génétique donné et les génotypes résultat de ces allèles
• Implique les restrictions suivantes :
  
  • Pop de taille infinie
  • Panmixie (accouplement au hasard)
  • Absence de migration
  • Absence de mutation sur allèles considérés
• Polymorphisme équilibré : la perte d’un allèle mutant est équilibré par la perte d’un allèle sauvage

Question 29

Concept de l’effet fondateur : 2

Answer 29

• on peut avoir un effet « goulot d’étranglement » dû par exemple à une vague de malaria
• parmi les survivants on peut avoir un individu qui détient un allèle muté spécifique qui va devenir prévalent dans la pop

Question 30

Maladie génétique : 4

Answer 30

• maladie due à une ou plusieurs anomalies sur un ou plusieurs chromosomes qui entrainent un défaut de fonctionnement de certaines cellules de l’organisme
• liées à l’altération d’un ou plusieurs gènes
• sont dominantes ou récessives
• toutes les maladies génétiques ne sont pas héréditaires (ex cancer) mais toutes les maladies héréditaires sont génétiques

Question 31

Deux grands types de maladies génétiques

Answer 31

• maladie génétique monofactorielle

- multifactorielle (génétique et env)

Question 32

Anomalies génétiques de la sphère craniofaciale et dents : 4

Answer 32

• hypodontie et oligodontie
• dents surnuméraires
• anomalie de forme
• anomalie d’éruption

Question 33

Exemples de maladies dentaires : 5

Answer 33

• Dentinogenèses imparfaites et dysplasies dentinaires (DI et DD)
• Amélogenèses imparfaites
• Dysplasie ectodermique : groupe de maladies génétiques résultant de problèmes de developpement précoce de la couche ectodermique de l’embryon
• Syndrome de Rieger : malformations squelettique, hypoplasie maxillaire, hypertélorisme, agénésies dentaires
• Solitary Median Maxillary Central Incisor (SMMCI) Charge

Question 34

L’effet fondateur (déviation de Hardy-Weinberg)

Answer 34

Si une pop est grande, même si la fréquence d’un allèle est faible, l’allèle sera maintenu dans la population. Si elle est très petite, les accouplements avec allèle muté peuvent ne pas avoir lieu et sa fréquence peut chuter même sans sélection = dérive génétique

Question 35

Mutation de novo

Answer 35

Il peut arriver qu’une mutation récente, mutation de novo ou néomutation, se produise dans une cellule sexuelle d’un des parents –> si ça donne un allèle dominant pathologique –> un ou plusieurs enfants malades

Question 36

Particularité : consanguinité

Answer 36

• Les enfants sont plus souvent homozygotes
• Augmente le risque que les filles soient malades récessives de l’X
• Risque de confusion quant au mode de transmission

Question 37

Maladie à anticipation

Answer 37

Il y a anticipation quand la maldie peut devenir de plus en plus sévère et / ou se manifester cliniquement de plus en plus tôt au fil des générations

Question 38

Disomie uniparentale

Answer 38

Les deux chromosomes proviennent du même parent (cas très rare).
On a :
- Hétérodisomie : c’est 2 chromosomes différents du même parent
- Isedisomie : c’est le même chromosome

Question 39

Chimérisme

Answer 39

Résultat de la fusion de 2 cellules-oeuf en un seul embryon à un stade précoce ==> l’enfant sera composé de 2 lignées cellules qui diffèrent par de nombreux gènes / chromosomes
2 zygotes -> 1 embryon

Question 40

Fausse paternité

Answer 40

Situation dans laquelle le père supposé d’un individu n’est pas son père biologique