Génétique Flashcards
S6
Gène (classique)
unité de base fonctionnelle / structurelle de l’information génétique qui contrôle un aspect spécifique du phénotype
Gène (actuel)
une région génomique correspondant à une unité héritable, associée à des régions régulatrices, des régions transcrites et à d’autres séquences fonctionnelles
Génotype
la somme des gènes qu’il possède
Phénotype
la somme des caractères morphologiques, physiologiques ou comportementaux qui sont identifiables de l’extérieur
Allèle
différente version d’un même gène ou séquence d’ADN
Locus
emplacement d’un gène ou d’une séquence d’ADN sur un chromosome (fait référence à tous les allèles de ce gène). Cet emplacement est précis et invariable
3 caractéristiques de la mutation
- séquence différente de l’ADN normal
- avec structure normale de l’ADN
- héritabilité
Différents types de mutation et leurs conséquences : 6
- Mismatch : neutre ou perte de fonction
- Addition ou délétion : généralement perte de fonction (frameshift)
- Insertions d’éléments mobiles : perte de fonction
- Duplication ou délétion de grands fragments d’ADN : changements de dosage génique, perte de fonction
- Cassure et jointures de parties de chromosomes : changement de dosage génique, perte de fonction
- Changement dans le nombre de chromosome : changements de dosage génique, problème de méiose
Effet sur l’expression génique (dépend de l’endroit / longueur) : 5
- mutation au niveau du promoteur ou enhancer : altération du niveau d’expression du gène
- mutation dans un intron : épissage anormal
- mutation dans un exon (peut altérer la séquence codante ou affecter l’épissage) :
o mutation silencieuse
o missense / mutation conservatrice ou non
o mutation par codon stop
o mutation framshift - mutation par délétions importantes ou réarrangements chromosomiques
- perte d’un gène entier : diminution du niveau d’expression (=haploinsuffisance)
Polymorphisme
locus avec deux allèles ayant une fréquence d’au moins 1%
4 types de polymorphismes
- nucléotide simple : SNP
- longueur de fragment de restriction : RLFP
- répétition d’une séquence simple
- répétition en tandem
Transmission mendélienne fondement : 5
o organisme diploïde
o une copie venant de chaque parent
o copies séparées durant la formation des cellules germinales haploïdes et réunies après fécondation
o notion d’allèle
o trait génétique : autosomal / lié au sexe /// dominant / récessif
Transmission mendélienne 7
- Hérédité autosomale récessive :
- Exprimé seulement chez les I porteurs de 2 copies de l’allèle mutant
- ¼ des enfants atteints
- Autosomale dominante :
- exprimé chez les hétérozygotes et homozygotes
- 1 des parents atteint
- Récessive liée à l’X :
- plus probable chez les hommes (car 1 seul chr X), les femmes ne l’expriment que si elles ont 2 X atteints
- les porteurs hommes ne le transmettent jamais à leur fils
- Dominante liée à l’X :
- seules les femmes sont atteintes : 1 chance sur 2 de le transmettre à leurs descendants. Les mâles meurent in utero
- Lié à l’Y :
- touche les hommes, rare car souvent infertilité
- Hérédité pseudodominante :
- transmission parent-enfant d’un trait connu comme récessif
- concerne des mutations fréquentes et compatibles avec la reproduction, on a donc l’impression que c’est un allèle dominant
- Hérédité digénique : récemment mise en évidence
Pénétrance
- Portion d’I possédant un génotype déterminé qui exprime le phénotype correspondant.
- Pénétrance incomplète (<1) == tous les porteurs du génotype à risque ne sont pas malades
L’expressivité
- Degré d’expression phénotypique d’un trait génétique (les caractéristiques des I affectés différent d’un individu à un autre : organe différent…)
Hétérogénéité : 4
- Hétérogénéité génétique : plusieur gènes associés à un même phénotype (gènes impliqués dans une même voie bio (ex : surdité))
- Hétérogénéité allélique : un seul gène impliqué dans un phénotype spécifique mais mutation diffère d’un individu à l’autre
- Hétérogénéité de locus : mutation dans différents gènes donne des phénotypes identiques
- Hétérozygotie composée : dans un trouble autosomique récessif les 2 allèles mutants peuvent différer l’un de l’autre
Mosaïcisme : 2
- germinal : la mutation a lieu durant le développement des cellules germinales et peut impliquer de nombreux spermatozoïdes ou ovules (parent non affecté, risque de transmettre à + d’un déscendant)
- somatique : mutation a lieu durant le dev embryonnaire précoce (mélange de cellules avec et sans la mutation). On peut avoir une faible manifestation du phénotype ou une manifestation restreinte à une région du corps. Si dans lignée germinale, risque de transmission sinon pas.
Empreinte parentale : 5
- Inactivation sélective de quelque gènes, durant la spermatogénèse ou l’ovogénèse le génome diploïde issu de la fécondation sera fonctionnellement haploïde pour ces gènes
- Concerne 100 gènes rassemblés en clusters
- Empreinte paternelle = inactivation seul l’allèle maternel est exprimé et vis versa
- Réversible à chaque génération
- Haploïdie fonctionnelle, donc si l’allèle qui est sensé s’exprimer a une anomale suppression totale de l’expression du gène concerné maladies causées par un gène à empreinte maternelle sont transmis par le père et vis versa
Hérédité mitochondriale : 3
- division indépendante // répartition au hasard dans les cellules filles
- transmission maternelle exclusive
- la sévérité de la maladie dépend de la proportion de mitochondries avec le gène muté
Hérédité multifactorielle : 4
- maladie fréquentes chez une famille mais ne respecte pas les lois de Mendel (dominance / récessivité)
- Phénotype = gène + environnement
- Maladie multifactorielle combinaison particulière d’allèles « normaux » de certains gènes qui est pathologique
- Maladie multifactorielle =
o Agrégation familiale de malades
o Concordance d’atteinte entre vrais jumeaux
o Augmentation du nombre de malades avec changement du mode de vie de la population
Héritabilité : 2
- Donnée statistique et quantitative qui évalue la part des facteurs génétiques par rapport à l’environnement dans l’expression d’un caractère donné et au sein d’une population donnée
- Plus la concordance entre des vrais jumeaux est importante, plus grande est la contribution génétique
Modèles pour l’hérédité multifactorielle
Modèle additif
Modèle du seuil
Modèle mixte
- modèle additif : 2
o action de plusieurs gènes mais pas de facteurs env hérédité polygénique
o concerne plutôt les traits quantitatifs comme la taille, pression artérielle, poids…
- modèle du seuil : 4
o concerne les malformations congénitales (tout ou rien)
o facteurs génétique et env
o susceptibilité plus ou moins importante en fonction du nb de gènes prédisposant et du degré d’exprosition
o jusqu’à un certain point, pas de malformation mais elle apparaîtra lorsque ce seuil de susceptibilité sera franchi