Génétique Flashcards
De quoi dépend la capacité d’un individu à survivre, croitre et se reproduire dans certaines conditions (2)
caractéristiques morphologiques, anatomiques,
physiologiques et comportementales produites suite à
l’expression de ses gènes
donc de sa génétique (1)
mais aussi de l’expérience et de
l’apprentissage, de la stochasticité des événements et
de la plasticité phénotypique
Qu’est-ce qu’un gène
unité d’information responsable de la
production d’une caractéristique d’un individu
qu’est-ce qui permet de déterminer les relations phylogénétiques entre les espèces
Le nombre, la morphologie et la forme des
chromosomes
dans quel intervalle se situe le nombre de chromosomes des poissons?
entre 9 et 52
que veut dire diploïde et tétraploïde
qui possède respectivement 2 et 4 ensembles de chromosomes par cellule somatique
Quel est le niveau de ploïdie des gamètes des poissons diploïdes
haploïdes (1N)
Quel est le niveau de ploïdie de la plupart des poissons
diploïde (2N)
Dans l’ADN, dequoi est formée l’échelle spiralée et dequoi sont constituées les barres des échelles?
échelle spiralée : les
côtés de cette échelle sont des sucres désoxyriboses
et des groupements phosphates en alternance
Les barres de l’échelle sont constitués de 4 paires de
bases : l’adénine, la guanine, la thymine et la cytosine
Qu’est-ce qui forme un chromosome
s des chaînes d’acides désoxyribonucléiques
ADN
Combien d’unités d’information contient 1 locus
Chaque locus ne peut contenir qu’une seule unité ou
sous-unité d’information à la fois
Qu’est-ce qu’un locus
section spécifique d’un chromosome qui contient une
séquence de bases qui correspond à une unité ou sous-unité d’information
Homozygote et Hétérozygote?
Hétérozygote :
• les deux chromosomes homologues d’un individu ne
portent pas exactement la même information à un
locus donné
• Allèles différents du gène au même locus sur chaque
chromosome
Homozogote :
• les deux chromosomes homologues d’un individu portent
exactement la même information à un locus donné
• Allèles identiques du gène au même locus sur chaque
chromosome
Qu’est-ce que le génotype
ensemble des gènes d’un individu
Qu’est-ce qu’un phénotype
l’ensemble des caractéristiques
morphologiques, anatomiques, physiologiques et
comportementales d’un individu
Que veut on dire par “relatif” en parlant du fitness?
un même individu peut être très
«pertinent» dans un ensemble donné de conditions
environnementales, mais très désavantagé sous
d’autres conditions
C quoi le fitness
se mesure par la participation relative de l’individu à la
prochaine génération
la durée de vie d’une espèce ou population est-elle plus grande que celle de l’individu
oui
De quoi dépend a capacité à survivre et à se perpétuer dans le
temps d’une espèce ou d’une population (2 mais la première est moche)
• la pertinence des individus qui la composent
• la variabilité génotypique et phénotypique entre les
individus
Quel est l’impact de la pêche sélective sur la génétique d’une population
recueillent une
portion spécifique de la variabilité phénotypique d’une
population
• La pêche recueille donc aussi une partie spécifique de la
variabilité génotypique des populations
ce qui contribue à:
- Retirer certains gènes de la population et par
conséquent diminuer la variabilité génotypique et
phénotypique qui permettent aux populations de se
perpétuer dans le temps - Éliminer des sous-populations de faibles
abondances qui se trouvent, au moment de la pêche,
en sympatrie avec une autre sous-population plus
abondante
À quels niveaux les sous-populations peuvent différer
taux de fécondité ou de croissance, âge ou taille d’atteinte
de la maturité, comportement (temps ou sites de frai,
patron ou timing de migrations de reproduction ou de
nutrition), performance physiologique (température
optimale)
L’effet protecteur pour une population de la variabilité génétique provient de quoi (2 choses)
variabilité des individus et de la
présence de sous-populations dans la population
Quel impact peut avoir l’ensemencement (3).
Les objectifs de la pisciculture et des ensemencements
sont d’améliorer les stocks de poissons en favorisant les
traits phénotypiques et les gènes associés à la
production (particulièrement la croissance).
Donc ça entraîne une diminution de la variabilité génotypique des
populations naturelles (1)
2-Augmenter la compétition intra-spécifique au
désavantage des poissons sauvages
• la production de poissons de pisciculture qui
auront tendance à être plus gros que les poissons
naturels offre un avantage compétitif aux poissons
issus des piscicultures
3-. Faire entrer dans la population naturelle des gènes
avantageux en pisciculture mais néfastes pour les
populations naturelles
• des poissons bons pour la croissance mais faibles
pour résister à la prédation ou aux infections dans les
milieux naturels
La vérification des hypothèses sur les implications pratiques et conceptuelles de la génétique des poissons demande des réponses à quel niveau?
La vérification de ces hypothèses demande des
réponses au niveau :
• De la relation entre le génotype et le phénotype des
poissons
• Des caractéristiques génétiques des populations
• De la différence inter-population des caractéristiques
génétiques
Pourquoi les objectifs de la génétique des poissons
pratiquée dans une perspective de pisciculture (et
souvent d’ensemencement) sont incompatibles avec
l’objectif adopté pour les populations naturelles?
On ne peut à la fois sauvegarder la variabilité génétique
et favoriser un trait phénotypique particulier
De quoi dépend la variance des caractéristiques (2)
variance causée par des variations
génotypiques (tous les individus n’ayant pas le même génome)
variance causée par des variations
environnementales (tous les individus n’ayant pas
été soumis exactement aux mêmes conditions
environnementales ; plasticité, épigénétique)
Qu’est-ce qui est exclus dans l’équation de la variance d’une caractéristique
- Covariance environnement x génotype
- interaction environnement x génotype
- conséquences de la dominance
à quel niveau la composante environnementale joue lorsque 2 individus clonales ont une croissance différente
la plasticité
la taille à un âge donné est susceptible de plus dépendre des variations génotypiques ou des variations de l’environnement?
les variations environnementales dominent
exemple des perch
les perchaudes croissent d’une différences de facteur 2 dans des lacs différents, m ais une fois dans un environnement identique, le taux de croissance est identique
le patron de couleur chez les guppy est susceptible de plus dépendre des variations génotypiques ou des variations de l’environnement?
la composante génétique domine largement.
Qu’est-ce qu’est l’héritabilité au sens large du terme ?
la fraction de la variance totale d’une caractéristique
représentée par la composante génétique (entre 0 et 1)
(H^2 = V g / V t)
Qu’est-ce qu’est l’héritabilité au sens étroit du terme ?
Expression des caractères des
parents à la génération suivante
L’héritabilité au sens étroit du terme peut être estimée selon 3 méthodes
- La méthode de corrélation
- La méthode de la pente
- La méthode de la différentielle de sélection
décrivez la méthode de corrélation
h2 est le coefficient de corrélation entre :
• J : mesure d’une caractéristique A chez les jeunes
• P : mesure d’une caractéristique A chez leurs parents
Si J et P sont très corrélés à 1
Si J et p ne sont pas corrélés à 0
décrivez La méthode de la pente
h2 est la pente de la relation entre «J» et «P»
où
- J : mesure d’une caractéristique A chez les jeunes
- P : mesure d’une caractéristique A chez leurs parents
décrivez la méthode de la différentielle de sélection
deltaJ/delataP
ΔJ est la différence entre la moyenne de la
caractéristique des jeunes des parents
sélectionnés et celle de tous les jeunes
ΔP est la différence entre la moyenne d’une
caractéristique des parents sélectionnés pour la
reproduction et la moyenne de cette
caractéristique pour tous les parents (la
différentielle de sélection)
décrivez la méthode de la différentielle de sélection
deltaJ/delataP
ΔJ est la différence entre la moyenne de la
caractéristique des jeunes des parents
sélectionnés et celle de tous les jeunes
ΔP est la différence entre la moyenne d’une
caractéristique des parents sélectionnés pour la
reproduction et la moyenne de cette
caractéristique pour tous les parents (la
différentielle de sélection)
quelle méthode de détermination de l’héritabilité au sens étroit est la plus facilement utilisable en pisiculture
La méthode de la différentielle de sélection
Vrai ou faux? Les mesures d’héritabilité des poissons (pour les
caractères étudiés à date) sont plus petites que celles
d’autres organismes
vrai: taille des humains : 0.65 ; masse des vaches : 0.65 ; taille de
la drosophile : 0.40
est-ce que les caractéristiques
morphométriques des poissons sont très plastiques et
peu fiables en taxonomie
oui
qu’est-ce qui cause une diminution la taille moyenne des saumons chinook (Oncorhyncus
tshawytscha) de 50% et la diminution de 2 ans de l’âge à la maturité
à la pêche sélective et
intense de ces saumons
Qu,est ce qu’engendre des prises
sélectives des plus gros saumons atlantique (Salmo salar) en
mer? (2)
la fréquence des jacks augmente
Chez certaines populations, la majorité des mâles ne sont
plus anadromes - ils restent en eau douce.
que permet le coefficient de consanguinité “F”
quantifier La variabilité génétique
que veut dire un “F” de 0
indique que la population ne comprend pas
d’homozygotes par descendance
• la variabilité génétique est jugée maximale
que veut dire un “F” de 1
indique que tous les loci de la population sont
homozygotes par descendance
• la variabilité est jugée minimale
nommez 2 facteurs qui peuvent influencer la variabilité génétique
la taille de la population et le mode de reproduction
qu’est-ce qui se défini par une reproduction bisexuelle monoïque, 2 sexes, 1 individu
l’autofertilisation
que veut dire Homozygotes par descendance.
les deux loci portent
des séquences de bases obtenues d’un même ancêtre
Qu’est-ce que qu’un (full sib
mating system
croisements successifs
des frères et soeurs de plusieurs générations
que veut dire “N” dans l’équation du coefficient de consanguinité
nombre d’ancêtres communs entre les
parents de l’individu pour lequel on estime «F» et
l’ancêtre le plus vieux
Quel est le danger de choisir l’homozygotie pour un trait qu’on recherche?
Le danger de ce processus est que l’homozygocité pour
un allèle désirable est souvent, sinon toujours,
accompagnée par l’atteinte de l’homozygocité à d’autres
loci dont l’allèle pourrait être mal adapté pour la vie en
nature
Qu’est-ce qu’une situation de panmixie?
• Si lors de la méiose, chaque individu produit un même
nombre de gamètes portant un des allèles
• et si on permet l’autofécondation et la reproduction
bisexuelle dioïque (rapport sexuel 1:1)
• et si l’association des gamètes pour former un zygote se
fait tout à fait au hasard
à quoi ressembleront les gamètes d’un individu hétérozygote pour tous les locus
chaque allèle sera représenté dans 50% des gamètes.
Quel sera le coefficient de consanguinité si tous les individus parents d’une population sont des hétérozygotes pour chaque locus
0,5 car il y aura 50% de chances d’engendrer un descendant qui sera homozygote et 50% d’engendrer un hétérozygote (pour 1 locus donné)
À quoi ressembleront les gamètes d’individus homozygotes pour tous leurs locus et quel sera le coefficient de consanguinité?
elles seront toutes pareilles avec un type d’allèle pour chaque locus et le coefficient de consanguinité sera de 1
quel est le coefficient de consanguinité minimal de la
génération suivante
0,5
En quoi des freres et soeurs qui bz est différent de l’autofertilisation (2 différences)?
des gènes identiques peuvent être reçus selon plus d'une trajectoire et Le fait qu'il y ait plus de générations qui contribuent à l'échange génétique
lorsqu’on augmente la probabilité de se
reproduire avec un poisson avec qui on partage un
ancêtre (petite population), qu’arrive-t-il avec l’homozygocité?
elle augmente
lorsqu’on augmente la probabilité de se
reproduire avec un poisson avec qui on partage un
ancêtre (petite population), qu’arrive-t-il avec la variabilité génétique?
diminue
Qu’est-ce qui limite l’utilisation de la formule qui permet d’estimer la consanguinité? et dans quelle situation cette limite n’en est plus une?
il faut connaître le pedigree des poissons
dans une pisiculture, on peut savoir qui descend de qui
Dans une pisciculture, comment on peut s’assurer que les jeunes produits auront aussi le gène d’intérêt des géniteurs?
lignée parfaitement homozygote en un
locus
Comment on crée une lignée homozygote pour un locus d’intérêt?
tu croises les individus qui ont le phénotype associé au locus homozygote.
qu’est-ce que la dérive génétique? (pas selon berni entk)
La tendance d’un génotype de devenir fixe pour un locus ou des
loci imprévisibles
pour une population plus abondante, la vitesse à laquelle la consanguinité augmente, augmente ou diminue
diminue
Quel est le processus d’entrée de gènes dans une population le plus courant
la migration
quelle proportion d’immigrants dans une population ça prend pour annuler la tendance d’intensification de la consanguinité?
1%
quelle proportion d’immigrants dans une population ça prend pour renverser la tendance d’intensification de la consanguinité?
5%
Une augmentation de 10 % de consanguinité chez les
truites arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) résultent en
• Une diminution de 7 % de la masse d’oeuf produite
par les femelles
• Une augmentation de 11 à 19 % des alevins
anormaux
• Une augmentation de 6 à 12 % de la mortalité des
alevins
• Une diminution de 4 à 8 % de la masse à un âge
donné
comment se nomme l’effet néfaste de la consanguinité?
dépression de consanguinité
Est-il possible que l’augmentation de la consanguinité augmente la performance
oui, 10% des cas
