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Ichtyologie > Génétique > Flashcards

Génétique Flashcards

1
Q

De quoi dépend la capacité d’un individu à survivre, croitre et se reproduire dans certaines conditions (2)

A

caractéristiques morphologiques, anatomiques,
physiologiques et comportementales produites suite à
l’expression de ses gènes

donc de sa génétique (1)

mais aussi de l’expérience et de
l’apprentissage, de la stochasticité des événements et
de la plasticité phénotypique

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2
Q

Qu’est-ce qu’un gène

A

unité d’information responsable de la

production d’une caractéristique d’un individu

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3
Q

qu’est-ce qui permet de déterminer les relations phylogénétiques entre les espèces

A

Le nombre, la morphologie et la forme des

chromosomes

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4
Q

dans quel intervalle se situe le nombre de chromosomes des poissons?

A

entre 9 et 52

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5
Q

que veut dire diploïde et tétraploïde

A

qui possède respectivement 2 et 4 ensembles de chromosomes par cellule somatique

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6
Q

Quel est le niveau de ploïdie des gamètes des poissons diploïdes

A

haploïdes (1N)

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7
Q

Quel est le niveau de ploïdie de la plupart des poissons

A

diploïde (2N)

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8
Q

Dans l’ADN, dequoi est formée l’échelle spiralée et dequoi sont constituées les barres des échelles?

A

échelle spiralée : les
côtés de cette échelle sont des sucres désoxyriboses
et des groupements phosphates en alternance

Les barres de l’échelle sont constitués de 4 paires de
bases : l’adénine, la guanine, la thymine et la cytosine

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9
Q

Qu’est-ce qui forme un chromosome

A

s des chaînes d’acides désoxyribonucléiques

ADN

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10
Q

Combien d’unités d’information contient 1 locus

A

Chaque locus ne peut contenir qu’une seule unité ou

sous-unité d’information à la fois

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11
Q

Qu’est-ce qu’un locus

A

section spécifique d’un chromosome qui contient une

séquence de bases qui correspond à une unité ou sous-unité d’information

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12
Q

Homozygote et Hétérozygote?

A

Hétérozygote :
• les deux chromosomes homologues d’un individu ne
portent pas exactement la même information à un
locus donné
• Allèles différents du gène au même locus sur chaque
chromosome
Homozogote :
• les deux chromosomes homologues d’un individu portent
exactement la même information à un locus donné
• Allèles identiques du gène au même locus sur chaque
chromosome

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13
Q

Qu’est-ce que le génotype

A

ensemble des gènes d’un individu

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14
Q

Qu’est-ce qu’un phénotype

A

l’ensemble des caractéristiques
morphologiques, anatomiques, physiologiques et
comportementales d’un individu

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15
Q

Que veut on dire par “relatif” en parlant du fitness?

A

un même individu peut être très
«pertinent» dans un ensemble donné de conditions
environnementales, mais très désavantagé sous
d’autres conditions

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16
Q

C quoi le fitness

A

se mesure par la participation relative de l’individu à la

prochaine génération

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17
Q

la durée de vie d’une espèce ou population est-elle plus grande que celle de l’individu

A

oui

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18
Q

De quoi dépend a capacité à survivre et à se perpétuer dans le
temps d’une espèce ou d’une population (2 mais la première est moche)

A

• la pertinence des individus qui la composent
• la variabilité génotypique et phénotypique entre les
individus

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19
Q

Quel est l’impact de la pêche sélective sur la génétique d’une population

A

recueillent une
portion spécifique de la variabilité phénotypique d’une
population
• La pêche recueille donc aussi une partie spécifique de la
variabilité génotypique des populations

ce qui contribue à:

  1. Retirer certains gènes de la population et par
    conséquent diminuer la variabilité génotypique et
    phénotypique qui permettent aux populations de se
    perpétuer dans le temps
  2. Éliminer des sous-populations de faibles
    abondances qui se trouvent, au moment de la pêche,
    en sympatrie avec une autre sous-population plus
    abondante
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20
Q

À quels niveaux les sous-populations peuvent différer

A

taux de fécondité ou de croissance, âge ou taille d’atteinte
de la maturité, comportement (temps ou sites de frai,
patron ou timing de migrations de reproduction ou de
nutrition), performance physiologique (température
optimale)

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21
Q

L’effet protecteur pour une population de la variabilité génétique provient de quoi (2 choses)

A

variabilité des individus et de la

présence de sous-populations dans la population

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22
Q

Quel impact peut avoir l’ensemencement (3).

A

Les objectifs de la pisciculture et des ensemencements
sont d’améliorer les stocks de poissons en favorisant les
traits phénotypiques et les gènes associés à la
production (particulièrement la croissance).
Donc ça entraîne une diminution de la variabilité génotypique des
populations naturelles (1)
2-Augmenter la compétition intra-spécifique au
désavantage des poissons sauvages
• la production de poissons de pisciculture qui
auront tendance à être plus gros que les poissons
naturels offre un avantage compétitif aux poissons
issus des piscicultures
3-. Faire entrer dans la population naturelle des gènes
avantageux en pisciculture mais néfastes pour les
populations naturelles
• des poissons bons pour la croissance mais faibles
pour résister à la prédation ou aux infections dans les
milieux naturels

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23
Q

La vérification des hypothèses sur les implications pratiques et conceptuelles de la génétique des poissons demande des réponses à quel niveau?

A

La vérification de ces hypothèses demande des
réponses au niveau :
• De la relation entre le génotype et le phénotype des
poissons
• Des caractéristiques génétiques des populations
• De la différence inter-population des caractéristiques
génétiques

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24
Q

Pourquoi les objectifs de la génétique des poissons
pratiquée dans une perspective de pisciculture (et
souvent d’ensemencement) sont incompatibles avec
l’objectif adopté pour les populations naturelles?

A

On ne peut à la fois sauvegarder la variabilité génétique

et favoriser un trait phénotypique particulier

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25
Q

De quoi dépend la variance des caractéristiques (2)

A

variance causée par des variations
génotypiques (tous les individus n’ayant pas le même génome)

variance causée par des variations
environnementales (tous les individus n’ayant pas
été soumis exactement aux mêmes conditions
environnementales ; plasticité, épigénétique)

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26
Q

Qu’est-ce qui est exclus dans l’équation de la variance d’une caractéristique

A
  • Covariance environnement x génotype
  • interaction environnement x génotype
  • conséquences de la dominance
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27
Q

à quel niveau la composante environnementale joue lorsque 2 individus clonales ont une croissance différente

A

la plasticité

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28
Q

la taille à un âge donné est susceptible de plus dépendre des variations génotypiques ou des variations de l’environnement?

A

les variations environnementales dominent

exemple des perch
les perchaudes croissent d’une différences de facteur 2 dans des lacs différents, m ais une fois dans un environnement identique, le taux de croissance est identique

29
Q

le patron de couleur chez les guppy est susceptible de plus dépendre des variations génotypiques ou des variations de l’environnement?

A

la composante génétique domine largement.

30
Q

Qu’est-ce qu’est l’héritabilité au sens large du terme ?

A

la fraction de la variance totale d’une caractéristique
représentée par la composante génétique (entre 0 et 1)
(H^2 = V g / V t)

31
Q

Qu’est-ce qu’est l’héritabilité au sens étroit du terme ?

A

Expression des caractères des

parents à la génération suivante

32
Q

L’héritabilité au sens étroit du terme peut être estimée selon 3 méthodes

A
  1. La méthode de corrélation
  2. La méthode de la pente
  3. La méthode de la différentielle de sélection
33
Q

décrivez la méthode de corrélation

A

h2 est le coefficient de corrélation entre :
• J : mesure d’une caractéristique A chez les jeunes
• P : mesure d’une caractéristique A chez leurs parents
Si J et P sont très corrélés à 1
Si J et p ne sont pas corrélés à 0

34
Q

décrivez La méthode de la pente

A

h2 est la pente de la relation entre «J» et «P»

où

  • J : mesure d’une caractéristique A chez les jeunes
  • P : mesure d’une caractéristique A chez leurs parents
35
Q

décrivez la méthode de la différentielle de sélection

A

deltaJ/delataP
ΔJ est la différence entre la moyenne de la
caractéristique des jeunes des parents
sélectionnés et celle de tous les jeunes
ΔP est la différence entre la moyenne d’une
caractéristique des parents sélectionnés pour la
reproduction et la moyenne de cette
caractéristique pour tous les parents (la
différentielle de sélection)

36
Q

décrivez la méthode de la différentielle de sélection

A

deltaJ/delataP
ΔJ est la différence entre la moyenne de la
caractéristique des jeunes des parents
sélectionnés et celle de tous les jeunes
ΔP est la différence entre la moyenne d’une
caractéristique des parents sélectionnés pour la
reproduction et la moyenne de cette
caractéristique pour tous les parents (la
différentielle de sélection)

37
Q

quelle méthode de détermination de l’héritabilité au sens étroit est la plus facilement utilisable en pisiculture

A

La méthode de la différentielle de sélection

38
Q

Vrai ou faux? Les mesures d’héritabilité des poissons (pour les
caractères étudiés à date) sont plus petites que celles
d’autres organismes

A

vrai: taille des humains : 0.65 ; masse des vaches : 0.65 ; taille de
la drosophile : 0.40

39
Q

est-ce que les caractéristiques
morphométriques des poissons sont très plastiques et
peu fiables en taxonomie

A

oui

40
Q

qu’est-ce qui cause une diminution la taille moyenne des saumons chinook (Oncorhyncus
tshawytscha) de 50% et la diminution de 2 ans de l’âge à la maturité

A

à la pêche sélective et

intense de ces saumons

41
Q

Qu,est ce qu’engendre des prises
sélectives des plus gros saumons atlantique (Salmo salar) en
mer? (2)

A

la fréquence des jacks augmente
Chez certaines populations, la majorité des mâles ne sont
plus anadromes - ils restent en eau douce.

42
Q

que permet le coefficient de consanguinité “F”

A

quantifier La variabilité génétique

43
Q

que veut dire un “F” de 0

A

indique que la population ne comprend pas
d’homozygotes par descendance
• la variabilité génétique est jugée maximale

44
Q

que veut dire un “F” de 1

A

indique que tous les loci de la population sont
homozygotes par descendance
• la variabilité est jugée minimale

45
Q

nommez 2 facteurs qui peuvent influencer la variabilité génétique

A

la taille de la population et le mode de reproduction

46
Q

qu’est-ce qui se défini par une reproduction bisexuelle monoïque, 2 sexes, 1 individu

A

l’autofertilisation

47
Q

que veut dire Homozygotes par descendance.

A

les deux loci portent

des séquences de bases obtenues d’un même ancêtre

48
Q

Qu’est-ce que qu’un (full sib

mating system

A

croisements successifs

des frères et soeurs de plusieurs générations

49
Q

que veut dire “N” dans l’équation du coefficient de consanguinité

A

nombre d’ancêtres communs entre les
parents de l’individu pour lequel on estime «F» et
l’ancêtre le plus vieux

50
Q

Quel est le danger de choisir l’homozygotie pour un trait qu’on recherche?

A

Le danger de ce processus est que l’homozygocité pour
un allèle désirable est souvent, sinon toujours,
accompagnée par l’atteinte de l’homozygocité à d’autres
loci dont l’allèle pourrait être mal adapté pour la vie en
nature

51
Q

Qu’est-ce qu’une situation de panmixie?

A

• Si lors de la méiose, chaque individu produit un même
nombre de gamètes portant un des allèles
• et si on permet l’autofécondation et la reproduction
bisexuelle dioïque (rapport sexuel 1:1)
• et si l’association des gamètes pour former un zygote se
fait tout à fait au hasard

52
Q

à quoi ressembleront les gamètes d’un individu hétérozygote pour tous les locus

A

chaque allèle sera représenté dans 50% des gamètes.

53
Q

Quel sera le coefficient de consanguinité si tous les individus parents d’une population sont des hétérozygotes pour chaque locus

A

0,5 car il y aura 50% de chances d’engendrer un descendant qui sera homozygote et 50% d’engendrer un hétérozygote (pour 1 locus donné)

54
Q

À quoi ressembleront les gamètes d’individus homozygotes pour tous leurs locus et quel sera le coefficient de consanguinité?

A

elles seront toutes pareilles avec un type d’allèle pour chaque locus et le coefficient de consanguinité sera de 1

55
Q

quel est le coefficient de consanguinité minimal de la

génération suivante

A

0,5

56
Q

En quoi des freres et soeurs qui bz est différent de l’autofertilisation (2 différences)?

A 
des gènes identiques peuvent être reçus
selon plus d'une trajectoire 
et
Le fait qu'il y ait plus de générations qui contribuent à
l'échange génétique
57
Q

lorsqu’on augmente la probabilité de se
reproduire avec un poisson avec qui on partage un
ancêtre (petite population), qu’arrive-t-il avec l’homozygocité?

A

elle augmente

58
Q

lorsqu’on augmente la probabilité de se
reproduire avec un poisson avec qui on partage un
ancêtre (petite population), qu’arrive-t-il avec la variabilité génétique?

A

diminue

59
Q

Qu’est-ce qui limite l’utilisation de la formule qui permet d’estimer la consanguinité? et dans quelle situation cette limite n’en est plus une?

A

il faut connaître le pedigree des poissons

dans une pisiculture, on peut savoir qui descend de qui

60
Q

Dans une pisciculture, comment on peut s’assurer que les jeunes produits auront aussi le gène d’intérêt des géniteurs?

A

lignée parfaitement homozygote en un

locus

61
Q

Comment on crée une lignée homozygote pour un locus d’intérêt?

A

tu croises les individus qui ont le phénotype associé au locus homozygote.

62
Q

qu’est-ce que la dérive génétique? (pas selon berni entk)

A

La tendance d’un génotype de devenir fixe pour un locus ou des
loci imprévisibles

63
Q

pour une population plus abondante, la vitesse à laquelle la consanguinité augmente, augmente ou diminue

A

diminue

64
Q

Quel est le processus d’entrée de gènes dans une population le plus courant

A

la migration

65
Q

quelle proportion d’immigrants dans une population ça prend pour annuler la tendance d’intensification de la consanguinité?

A

1%

66
Q

quelle proportion d’immigrants dans une population ça prend pour renverser la tendance d’intensification de la consanguinité?

A

5%

67
Q

Une augmentation de 10 % de consanguinité chez les

truites arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) résultent en

A

• Une diminution de 7 % de la masse d’oeuf produite
par les femelles
• Une augmentation de 11 à 19 % des alevins
anormaux
• Une augmentation de 6 à 12 % de la mortalité des
alevins
• Une diminution de 4 à 8 % de la masse à un âge
donné

68
Q

comment se nomme l’effet néfaste de la consanguinité?

A

dépression de consanguinité

69
Q

Est-il possible que l’augmentation de la consanguinité augmente la performance

A

oui, 10% des cas

Ichtyologie (4 decks)

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