genetik Flashcards
Angelman / prader willie orsaker?
- imprinting/deletion
2. uniparental disomy
Huntingtons arv:
Autosomal dominant
Duchennes arv:
x-länkat recessiv
CF arv:
autosomalt recessiv
Vad är missense, nonsens och tyst mutation?
Missens = Amiosyra byts ut mot en annan
Nonsens = prematurt stoppkodon pga AA
tyst mutation = mutation som i bp som inte påverkar vilket
Vad är Val603Phe (V603F) för typ av mutation?
Missens
Vad är Glu60Stop (E60X) för typ av mutation?
Nonsens
Vad är ΔF508 för typ av mutation?
Deletion av kodon
Vad är 394delTT för typ av mutation?
Deletion av två BP
Beskriv haplotyp:
Den uppsättnings alleler som oftast ärvs från en förälder men som kan sitta nära varandra
Vad vilka enzym styr acetylering/deacetylering?
HAT/HDAC
Vad finns det för tre aktörer vid epigenetisk modifiering?
Writers - till exempel HAT; acetylerar, metylerar för att reglera transkription
Readers - binder in och tolkar de epigenetiska signalerna.
Erasures - HDAC tar bort epigenetiska modifieringar
Beskriv epigenetisk modifiering genom icke-kodande RNA:
lncRNA finns i cis och trans.
Cis: tävlar om transkriptionsfaktorer samt har en roll i XIST vilket leder till x-kromosominaktivering
Trans: inhiberar proteiners funktion genom att binda upp dom.
miRNA:
tystar genom komplementär basparing.
Vad är TAD?
Typologically accociated domain, en grupp av DNA som ligger varandra när det inte är celldelning. Kromosomerna ligger i öar och hålls frånskilda men DNA-delar kan ändå ligga nära varandra fysiskt trots det långa avståndet i antal baspar emellan. Dessa hålls på plats av insulatorprotein. Mutationer i TAD –> cancer.
Beskriv x-chromosominaktivering:
Normalt hos kvinnor sker en x-kromosominaktivering genom aktivering av Xic. Då omger lncRNA en kromosom som kondenseras och lägger sig perifert i nukleus. Dessa kallas barr body.
Anledning till skev x-kromosominaktivering.
Slump
Xic-mutation
x / autosomal translokation
Selektion för viabla celler
X / autosomal translokation vad gör att den friska x-kromosomen tystas?
Vid X / autosomal translokation så sker en reciprok translokation mellan en X kromosom och en autosomal kromosom. Då skapas en x kromosom som är har autosomalt DNA på sig och en autosomal kromosom med x kromosomalt DNA. Tystas x-kromosomen utan translokation har det inte skett någon förlust av DNA och cellerna är viabla.
Hur studerar man metylering?
- Metyleringsspecifika restriktionsenzymer
- bisulfitsekvensering
- Metyleringsarrayer