Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Tıp 1. Sınıf 1. Modül Hücre > Genetik > Flashcards

Genetik Flashcards

1
Q

Pellet

A

Santrifüjde çöken kısım.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Süpernatant

A

Santrifüjde yüzeyde kalan kısım

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

İnkübe etmek

A

Mikroorganizma ların optimum koşullarda bir araya getirilip bekletilmesi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Baz içeriği

A

Bir canlının DNA sının yüzde kaçının adenin yüzde kaçının sitozin olması gibi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Bakteriyofajla bakteri enfekte edilip santrifüjlendiğinde çöken kısımla çökmeyen kısım?

A

Çöken(pellet) :bakterilerden oluşur
Çökmeyen kısım: bakteriyofajdan kalanlar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Chargaff kuralları

A

Baz içeriği türden türe değişir
Baz içeriği aynı türde farklılık göstermez
Baz içeriği çevr. Koşullardan etkilenmez
A=T G=C
pürin sayısı= pirimidin sayısı

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Franklinin xray diffraction photo of DNA sine göre

A

Bu molekül helikal yapıda olmalı diyor
Bu molekül tek zincirli olamaz diyor
Fosfatlar dışarda diyor

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

DNA da bir dönümde kaç baz çifti ve açılanma ne kadar?

A

Yaklaşık 30 derece açılanma, 10,5 bç

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Fosfodiester neyle ne arasında

A

Zincire yeni katılacak nükleotitin fosfatıyla bir önceki nükleotitin 3’ OH grubu arasında

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Sudan fakir ortamlarda hangi DNA formu görülebilir

A

A

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

En sık görülen DNA formu

A

B

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Sola dönüşlü olan, yüksek tuz konsantrasyonlarında veya pürin-pirimidin tekrarında hangi form DNA görülebilir

A

Z

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Diyelim ki replikasyon olacak ve DNA çift zincir bir yerden ayrılacak. Nereden ayrılacağını enzim nasıl biliyor

A

Majör ve minör yarıklardan polimeraz nükleotit dizisini görüyor

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hibridizasyon

A

Farklı kaynaklardan gelen birbirinin tamamlayıcısı olan DNA zincirleri birb. Yapışır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

DNA polimerazın zinciri okuma yönü

A

3’ 5’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

DNA polimerazın sentez yönü

A

5’ 3’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Nükleotit yapısından 2 fosfat koparılarak enerji elde edilir bu iki fosfata ne denir

A

Pyrophosphate. Açığa çıkan enerjiyi DNA polimeraz fosfodiester bağı oluştururken kullanır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Primer RNA sentezini hangi enzim yapar

A

DNA primaz DNA yı kalıp olarak kullanarak sentezler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Öncü dizi, artçı dizi

A

Sırasıyla leading ve lagging zincirler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Proofreading

A

DNA sentezi sırasındaki hataları önlemeye yönelik mekanizmalar
Ör: DNA polimerazın 3’ 5’ ekzonükleaz aktivitesi ile hata oranını binden 10üzeri6 ya indirmesi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Tamir proteinlerinden oluşan sistem DNA polimerazın hata oranını 10 üzeri 6 dan kaça indirir

A

10 üzeri 9

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

RNAaz H

A

Primer RNA ları parçalar (5’ 3’ ekzonükeaz aktivitesi)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

DNA sentezinde yardımcı proteinler

A

Clamp loader
Sliding clamp
Single strand binding protein (SSBP)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Supercoiller DNA sentezini durdurur bu yüzden yok edilmeliler

A

Topoizomeraz
Topoizomeraz1 zincirlerden birinde kırık oluşturur, 2 ise ikisinde de

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Prokaryotik polimerazlar

A

Pol I: RNA primer uzaklaştırır. Dna tamiri
Pol II: dna tamiri
Pol III: dna replikasyonu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Ökaryotik polimerazlar

A

Pol alfa:carries a DNA primase as one of its subunits. Primer sentezi
Pol beta: dna tamiri
Pol gama: mitokondriyal DNA sentezi, 3’ 5’ ekzonükleaz aktivitesi
Pol delta: lagging zincirde DNA sentezi, 3’ 5’ ekzonükleaz aktivitesi
Pol epsilon: leading zincirde DNA sentezi 3’ 5’ ekzonükleaz aktivitesi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Helikazı yükleyici proteinler

A

cdc6 ve cdt1

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Telomeraz

A

Reverse transkriptaz yapar. RNA kalıbını üzerinde taşır(telomeraza özgü bir özellik).
Bütün hücrelerde aktif değil. Sürekli bölünen hücrelerde aktif. Malignitelerde aktif.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Telomerlerin fonksiyonları

A

1- DNA uçlarını ekzonükleazdan koruyor
2- telomerler olmazsa kromozomlar birbiriyle ilişkiye girer. Telomerler kromozomlar arasında yeni yapıların (reaarengement) oluşmasını engeller.
İnsanda telomeric repeat TTAGGG

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Insulator

A

Arttırıcılar ve destekleyiciler arasındaki etkileşimi engelleyen genetik sınır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Enhancer

A

Bir gen kümesindeki genlerin transkripsiyin hızının artmasını sağlayan, transkripsiyon faktörlerinin bağlandığı kısa bir DNA bölgesi.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Silencer

A

Baskılayıcı olarak adlandırılan transkripsiyon düzenleme faktörlerinin DNA üzerinde bağlandığı bölge
Bir baskılayıcı protein DNA nın susturucu (silencer) bölgesine bağlandığında RNA polimeraz DNA dizisinden RNA oluşumunu engeller.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Pyrophospate

A

Nükleotit trifosfattan iki fosfat koparılırken enerji çıkar bu enerjiyi DNA polimeraz fosfodiester bağı oluştururken kullanır.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

DNA primaz

A

Dna polimeraz senteze doğrudan başlayamaz. Başlayabilmesi için primer Rna gerekir. Primer rna dna primaz tarafından sentezlenir.
Dna primaz enzimi Dna yı kalıp olarak kullanarak kısa rna primerleri sentezler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

Lagging strand artçı dizi

A

Kesintili

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

Leading strand öncü dizi

A

Kesintisiz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

Okazaki fragmentleri kaç baz çifti?

A

Prokatyotlarda 1000-2000
Ökaryotlarda 100-200

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

Proofreading aktiviteleri

A

Dna sentezi esnasında birtakım hatalar meydana gelebilir ve bunları önlemeye yönelik mekanizmalara proofreading aktivite denir.
Bunlardan birisi dna polimerazın 3’-5’ ekzonükleaz aktivitesidir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

RNAaz H

A

Dna nın yapısında Rna bulunamayacağından primer Rna ların parçalanması lazım. RNAaz H primer RNA ları parçalar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

Sliding clamp ve clamp loader

A

Dna sentezinde bazı proteinler de görev alır.
Clamp loader clampı dnaya yükler. Sliding clamp ise dna polimerazı dna kalıbı üzerinde tutuyor. Bu yardımcı proteinler sayesinde DNA polimerazın kalıptan uzaklaşması önleniyor ve etkinliği artıyor.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

SSB proteinler (single strand binding proteins)

A

Saç tokası (hairpin) benzeri yapılar oluşmasını engeller ve tek zincirli DNA nın DNAaz tarafından parçalanmasını engeller.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

Supercoil

A

Dna sentezi sırasında yaşanabilecek problemlerden biri de supercoil oluşumudur
Dna çift zinciri açılırken kalan kısımde daha çok sıkışma meydana gelebilir ve burada iplikler birbiri üzerine katlanarak supercoil denen yapıları oluşturur. Supercoiller dna sentezini durdurur bu yüzden yok edilmeliler.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

Topoizomeraz enzimleri

A

Supercoilleri kaldıran enzimlerdir. Özellikle topoizomeraz 1 ve 2 etkilidir
Topoizomeraz 1 zincirlerden birinde kırık oluşturur.
Topoizomeraz 2 zincilerin ikisinde de kırık oluşturur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

Replikasyon orijinleri mekanizma

A

Belirli bölgelerdir tesadüfi değillerdir.
Bu başlangıç bölgelerine bağlanan proteinler var. İlk olarak ORC (Origin Recognition Complex) proteini bağlanır. Daha sonra ise cdc6 ve cdt1proteinleri ( helikazı yükleyici proteinlerdir) bağlanır. Bunlar da bağlandıktan sonra birkaç tane proteinden oluşan helikaz komplexi (mcm) bağlanıyor: pre-RC (prereplication complex

  • ORC, cdc6 ve cdt1 proteinlerinin bağlanması G1 fazında gerçekleşir.
  • S fazında ise cdc6 ve cdt1 proteinleri ayrılarak (kinazlarla fosforillenir ve degrade olurlar) helikazın aktifleştirilmesini sağlarlar.
    Bu mekanizma sayesinde her bir replikasyon orijini S fazında bir kez aktive olabilir.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q

Ökaryotik polimerazlar

A

Pol alfa,beta,gama,delta,epsilon

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
46
Q

Prokaryotik polimerazlar

A

Pol 1,2,3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
47
Q

Polimeraz alfa

A

Primer sentezi
Which carries DNA primase as one of its subunits)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
48
Q

Polimeraz beta

A

Dna tamiri

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
49
Q

Polimeraz gama

A

Mitokondriyel dna sentezi, 3’-5’ ekzonükleaz aktivitesi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
50
Q

Polimeraz delta

A

Lagging zincirde dna sentezi, 3’-5’ ekzonükleaz aktivitesi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
51
Q

Polimeraz epsilon

A

Leading zincirde dna sentezi,
3’-5’ ekzonükleaz aktivitesi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
52
Q

Polimeraz I

A

Rna primer uzaklaştırma, dna tamiri

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
53
Q

Polimeraz II

A

Dna tamiri

54
Q

Polimeraz III

A

Dna replikasyonu

55
Q

Telomeraz

A

Reverse transkriptaz enzimidir, kendi rna kalıbını üzerinde taşır bu ona has bir özelliktir.

56
Q

Telomerlerin fonksiyonları

A

1) DNA uçlarını ekzonükleazdan koruyor
2) telomerler olmasa kromozomlar birbirleriyle ilişkiye girebilir.
Telomerlerkromozomlar arasında rearrengement (yeni yapılar) oluşmasını engeller

57
Q

Gen ekspresyonu

A

Genin ifade edilmesi demektir. İfade ise transkripsiyon demektir. Eğer protein kodluyorsa translasyondur.

58
Q

Operon

A

Prokaryotlarda genler genellikle operon adı verilen yapılar halinde gözlenir.
Operonun yapısındaki temel elemanlar:
-promotör
-operatör
-transkripsiyon başlama noktası
-kodlayan dizi
-transkripsiyon sonlanma bölgesi (terminatör dizi)

59
Q

Promotör yapısı

A

●-10 bölgesi (pribnow bölgesi)
TATAAT (Consensus)
Dna çift sarmalının açıldığı bölgedir (unwinding domain)

●-35 bölgesi
TTGACA (Consensus)
Rna polimerazın tanınma bölgesidir (recognition domain)

Bu iki bölge arası 16-19 bç

!promotör transkripsiyinun nerde başlayacağını gösterir

60
Q

Consensus (uzlaşma) dizi

A

Operonlara bakıldığında -10 ve -35 bölgelerinde hepsi aynı değildir. Çoğu operon tarafından paylaşılan gen dizilerine consensus (uzlaşma) denir.

Bu bölgelerdeki dizilim konsensüs diziye ne kadar benziyorsa o kadar güçlü

61
Q

Transkripsiyon başlama noktası

A

-10 bölgesine 5-9 bç uzakta
Genellikle (>%90) pürin nükleotitle başlar

62
Q

Prokaryot/ökaryot polisistronik/monosistronik

A

Prokaryotlar polisistroniktir (birden fazla geni temsil eden kodlama bölgesi
Ökaryotlar monosistroniktir (genelde tek bir transkript tek bir protein kodlar)

63
Q

Sonlanma bölgesi (terminatör dizi)

A

G ve C den zengin (h bağlarından dolayı daha kararlı stabil bir yapı oluşmasını sağlar) bir bölge sonrasında 4-8 nükleotitlik (Rna da) U dizisi (dna da) A dizisi var.
Hairpin adlı özel yapı oluşur
Prokaryotlarda transkripsiyonun nerde sonlancagini belirleyen temel etmenlerdendir

64
Q

Regülatör diziler

A

Operatör: -5/+20 arasında yer alan, represör molekülün bağlandığı bölgedir

Up (upstream) elemanları: -30/-65 arasında yer alan diziler

Enhancers (güçlendiriciler): -80/-160 arasında yer alır transkripsiyonu artırırlar.

65
Q

Represör

A

Operonun 5’ ucundaki yakın komşularında başka bir gen bulunur bu genin kodladığı protein represör olarak adlandırılır.
Represör proteinin görevi ilişkili olduğu operonun operatör bölgesine bağlanmaktır
Promotör ve operatörün dna daki dizilimleri örtüşür. Yani bir protein operatöre bağlandığında promotör bölgeyi işgal eder.

66
Q

Rna polimerazlar

A

Prokaryotlarda 1 adet ökaryotlarda 3 adet

67
Q

Ökaryot rna polimerazlar

A

Rna polimeraz I: class I genler: 5.8s, 18s ve 28s lik rRNA kodlayan genlerdir.

Rna polimeraz II: class II genler: mRNA kodlayan genlerdir

Rna polimeraz III: class III genler: tRna, 5S rRna kodlayan genler

68
Q

Ökaryotik vs prokaryotik rna polimerazlar

A

Ökaryotik rna polimerazlar prokaryotlardaki gibi kendi başlarına promoter bölgelerine bağlanamazlar. Bunun için çok sayısa faktöre gereksinim duyarlar. Bu faktörlere genel transkripsiyin faktörü denir

Sıralama:
TFIID TATA kutusuna bağlanır
TFIIA ve TFIIB bağlanır
TFIIF eşliğinde rna polimeraz bağl
TFIIE ve TFIIH bağlanarak preinitiation complex (başlangıç kompleksi) oluşur
Bu yapı oluşt sonra dnanın açılması ve transkripsiyin işlemleri gercekleşebilir.

69
Q

-10 box ile transk. Başl. Nok. Arası

A

Unwound region
Çözülmemiş bölgedir

70
Q

Class II genler promoter yapısı

A

TATA box (TATAAA)
•-25 te yer alır
•Çoğu promotörde gözlenen bir yapıdır

GC box (GGGCGG): -90 da yet alör

Oktamer (ATTTGCAT)

Initiator(başlatıcı) (Py-py-A-N-(T/A)-py-py)
•initiator nükleotit dizisi en sık görülendir. Class II gen dizisinin yaklaşık yarısında bu nükl. dizisi bulunur. 128 çeşit nükleotit dizisine sahip olabilir

71
Q

Not: promotördeki nükleotit dizilerinin büyük çoğunluğu transkripsiyonun başlad. Yere göre 5’ taraftadır ama 3’ yönünde olan diziler de var

A

Transkripsiyon başlama noktasına göre daha 3’ tarafındaki diziler görülebilir ama daha 5’ tarafındakiler sentezlenen rna dizilerinde görülemez

72
Q

Ekzon intron nedir

A

Ökaryotik diziler prokaryotlardan farklı olarak kodlama yapmayan diziler tarafından yer yer kesintiye uğrar
Ekzon: kodlama yapan diziler
İntron: kodlama yapmayan diziler
Kodlayan dizilerin karşılığı aa lerde görülür. İntronlar ise aminoasitlerde görülmez onlar daha sonra ayıklanır

73
Q

PoliA sinyali = poliadenilasyon sinyali

A

Transkripsiyonun sonlandığı yer prokaryotlarda terminatör dizisiyle ökaryotlarda ise poliadenilasyon sinyaliyle belirlenir
Poli A sinyali 6 nükleotitlik bir dizidir AAUAAA
mRNA üzerinde bu nükleotit dizisi oluşt zaman birtakım proteinler o bolgeye bağlanır. Bu proteinler önce mRna yı parçalar daha sonra başka enzimler tarafından buraya A tekrarından oluşan ve poliA kuyruğu denen yaklaşık 200 nükleotit eklenir

74
Q

Regulator diziler ökaryot

A

PPE (promoter proximal element)
• -100/-200 arasında yer alan 15-30 bç uzunluğunda dizilerdir

Enhancer
100-200 bç uzunluğunda kısa nükleotit tekrarlarından oluşan dizilerdir

75
Q

UTR (untranslated region)

A

Başlangıc kodonu hemen transkriptin başında değildir, stop kodonu da transkriptin en sonunda değildir.

5’ UTR deki nükleotit dizileri daha çok translasyonun etkinliğiyle alakalı. Translasyonun az veya çok olması gibi etkileri kontrol ediyor

3’ UTR bölgesindeki nükleotit dizilimleri de daha çok mRNA nın stabilitesiyle ilgili. Parçalanıp parçalanmayacağı, yarı ömrü gibi şeyleri kont eder

76
Q

Prokaryot vs ökaryot transkripti

A

Prok larda sent ilk transkr ürünü aynı zmnda son sentez ürünüdür herhangi modifikasyonlar görülmez ökaryotlarda görülür. Ökaryotlarda İlk ürün primer transkript olarak adlandırılır. (hnRNA). Daha sonra bazı modifikasyonlar yaparak olgun mRNA haline gelir

77
Q

Posttranskripsiyonel modifikasyonlar

A

Ayıklanma(splicing)
Başlık takılması (5’ capping)
Poliadenilasyon

78
Q

Posttranskripsiyonel modifikasyonların sebebi

A

1- RNA yı parcalayan enzimlerden rnayı korumak
2- transportta fonksiyonu vardır
3- translasyonda fonksiyonu vardır

79
Q

Başlık takılması (5’ capping)

A

mRNAnın 5’ ucundaki ilk nükleotide guanilil transferaz enzimi aracılığıyla GMP eklenir

Guanin 7 metil transferaz enzimi tarafından metillenir

80
Q

Ekzonükleazlar

A

Uçlardan parçalarlar.
Hem 3’-5’ hem de 5’-3’ ekzonükleazlar vardır

81
Q

Endonükleazlar

A

İçerden parçalar

82
Q

Intronların 5’ yönündeki ilk iki nükleotiti/ 3’ yönündeki iki nükleotiti

A

GU
AG
GU-AG kuralı diye geçer

83
Q

Ayıklanma splicing

A

Ekzon intron birleşim yerleri çok iyi belirlenip intronu olması gereken yerden ayıklayarak AGG nükleotit dizisi oluşturulur. Ayıklanması gereken yerlerin sağa veya sola kayması durumunda mutasyon gerçekleşir.

84
Q

Ayıklama işini yapan kompleks

A

Splaysozom

85
Q

Splicing i gerçekleştiren proteinler

A

U1 U2 U4 U5 U6
Bunlar sadece protein değildir yapılarında RNA da bulunur. Ribonükleoprotein (RNP) yapılıdırlar

86
Q

Lariat

A

Kement

87
Q

Poliadenilasyon

A

PoliA sinyali olarak adlandırılan AAUAAA dizisinin 11-30 nükleotit alt bölgesinden
-CPSF (cleavage/poliadenilasyon specificity factor)
-CstF (cleavage stimulation factor)
-CFI ve CFII (cleavage factors)
Proteinleri tarafından mRNA kesilir ve poliA polimeraz enzimi tarafından adenin nükleotitleri eklenir.

88
Q

RNA polimerazın karboksi terminal domaini (CTD)

A

Bu bölge başlık takılmasında, ayıklanmada, poli-A kuyruğunun eklenmesinde gelen bütün proteinlerin yerleştiği bölgedir. Bu karboksil uç ortadan kalktığında ya da kısaldığında canlı yaşayamaz çünkü transkripsiyin yapamaz.

89
Q

Posttranskripsiyonel modifikasyonlar..

A

Hepsi tarnskripsiyon ile eş zamanlı gerçekleşir

90
Q

Her bir modifikasyondan sonra o modifikasyona proteinler veya kompleksler bağlanır. Mesela:

A

Cap başlık takıldıktan sonra cap bindin complex (CBC) bağlanır

ya da intronlar ayıklandıktan sonra ekzonlar birleşir ve bj bölgelere exon junction complex (EjC) bağlanır.

Bir proteine bakıldığında CBC, EJC ve poly-A binding proteinleri görülüyorsa bu olgun bir mRna proteinidir

91
Q

Alternatif ayıklama yöntemleri

A

Ekzon atlaması
Alternatif ayıklanma
Birbirini dışlayan ekzonlar
İntron korunması

92
Q

Nüklein

A

Frederick miescherin çekirdek içerisinden izole ettiği materyale verdiği ad
Yaklaşık %50si asidik(DNA)%50 si bazik(histon) yapıdadır.

93
Q

Nükleik asitlerin varlığını gösteren ilk kişi

A

Frederich miescher

94
Q

Hershey ve chase deneyinde santrifüjde çöken kısım nelerden çökmeyen kısım nelerden

A

Çöken kısım bakterilerden çökmeyen kısım bakteriyofajdan kalanlar

95
Q

Pellet

A

Santrifüjde çöken kısım

96
Q

Süpernatant

A

Santifüjde yüzeyde kalan kısım

97
Q

İnkübe etmek

A

Mikroorganizmaların optimum koşullarda bir araya getirilip bekletilmesi

98
Q

Baz içeriği

A

Bir canlının DNA sının yüzde kaçının adenin yüzde kaçının sitozin olması gibi

99
Q

Chargaff kuralları

A

● Baz içeriği türden türe değişiklik gösterebilir. İnsanda %40 guanin sitozin %60 adenin timindir

● Baz içeriği aynı tür içinde farklılık göstermez.

● hangi tür olursa olsun dna da A=T G=C

● pürin bazlarının toplamı ile pirimidin bazlarının toplamı birnirine eşittir.

100
Q

Rosalind Franklinin Xray diffraction dna fotoğrafına göre

A

Bu molekül helikal yapıda olmalı
Bu molekül tek zincirli olamaz
Fosfatlar dışarda

101
Q

Fosfat hangi karbona hidroksil grubu hangi karbona

A

Fosfat 5’ karbona bağlı
Hidroksil grubu 3’

102
Q

Dna nın yönü

A

5’nden 3’ ne

103
Q

Watson cricke göre Dna yapısı

A

●Çift zincirli sağa dönümlü helikal (sarmal bir merdiven)

●zincirler antiparalel. karşı zincir=komplementer zincir

● bazlar arasında hidrojen bağı

●majör ve minör yarıklar içerir

●Bir dönümde 10.5 baz çifti yer alır (yaklaşık 30 derece açılanma)

104
Q

Fosfodiester bağı neyle ne arasında

A

Yeni katılacak nükleotitin fosfat grubuyla öncekinin 3’ OH grubu arasında

105
Q

Dna nın formları

A

A
B
Z
…
DNA nın 30 küsür formu var

106
Q

Dna nın B formu

A

Watson crick tarafından tanımlanan formu
Fizyolojik koşullarda en sık görülen formu

107
Q

Dna nın A formu

A

Sudan fakir ort. larda gözlenebilir

108
Q

Dna nın Z formu

A

Yüksek tuz konsantrasyonlarında ya da pürin pirimidin bazlarının tekrarında görülebilir sola dönüşlüdür

109
Q

Kodon

A

Triplet

110
Q

Genetik kodun dejeneresansı

A

Aynı aa birden fazla kodon tarafından kodlanabilir (metiyonin ve triptofan hariç). Buna “genetik kodun dejeneresansı” adı verilir.

111
Q

Sinonim kodon

A

Aynı aa i kodlayan kodonlara denir. Bu kodonlarda genellikle ilk iki nükleotit aynı, 3. Pozisyondaki nükleotit farklıdır.

112
Q

Reading frame

A

Kodonların arka arkaya gelmesi ile oluşan yapı, okuma kalıbı (reading frame) olarak adlandırılır.

113
Q

Open reading frame

A

Stop kodonu içermeyen 50 ya da daha fazla kodonun yer aldığı dizi bu şekilde adlandırılır.

NOT: intronlarda stop kodonlarına sık rastlanır. Exonlarda ise nadir rastlanır. Dolayısıyla 50 ya da daha fazla kodonu stop kodonu olmayacak şekilde sıralanabiliyorsa o nükleotit dizisi bir gene aittir, bir exona aittir)

114
Q

Aminoaçil tRNA sentetaz enzimi

A

Her bir tRNA ya doğru aminoasidin bağlanması için her bir aminoaside özgü aminoaçil tRNA sentetaz enzimleri bulunmaktadır

Aa ler aminoaçiltrna sentetaz enzimi ile trna nın 3’ ucuna bağlanarak aminoaçil trnaları oluşturur

trna ya spesifik çalışmıyor aa e spesifik çalışıyor

115
Q

İnozin nükleotiti

A

I ile gösterilir. mRNA da görülmez tRNA da görebiliriz

116
Q

Wobble hipotezi ve bazı

A

•bir mRna kodonundaki ilk iki baz trna daki antikodonla her zaman güçlü watson crick baz eşleşmesini yapar.

•Wobble hipotezine göre, bir baz, birden fazla baz ile hidrojen köprüsü yapabilir. Buna wobble bazı denilir ve bu tRNA ların birden fazla kodonu tanımalarını sağlar.

•antikodondaki ilk baz (5’-3’) kodondaki 3. Bazın karşısındaki bazdır ve bu baz wobble bazıdır.

mRNA: G tRNA: C
mRNA: U tRNA: A
mRNA: C U tRNA: G
mRNA: A G tRNA: U
mRNA: C A U tRNA: I

Her kodon için farklı tRNA ya gerek yoktur örneğin insanlarda yaklaşık 30 tane tRNA vardır bu olay olası mutasyon etkilerini azaltır

117
Q

Ribozomların içinde bulunan üç bölge

A

Akseptör (A)
Peptidil (P)
Exit (E)

Başlangıç trna sı hariç tüm tRNA ların izlemek zorunda old bir yol vardır: APE

118
Q

tRNA sayısı

A

Tam bilinmemekle birlikte 20<trna sayısı<61

119
Q

Cognate trna

A

Aynı aa e özgü birden fazla trna vardır ve bu trna lara cognate trna denir

Aminoaçil sentetaz da aminoasiti tanıyıp cognate trnalardan birine bağlar

120
Q

tRna nın akseptör ucu

A

3’ ucudur. Özgül aminoasit gelip oraya bağlanır

121
Q

Aminoaçil trna sentetazın proofreading mekanizması vardır

A

Bu editing diye geçer. Sentez sırasında ve sonrasında doğru aminoasit ve doğru tRNA nın bağlanıp bağlanmadığını kontrol eder. Yanlış bağlanma varsa hataları onarmaya çalışır. Hata payı yaklaşık 1/50000 dir

122
Q

Translasyon evreleri

A

1) başlama
2) uzama
3) sonlanma

123
Q

Prokaryotlarda hangi AUG nin başlangıç kodonu olduğu nasıl belirlenir

A

Demek ki sadece AUG yok. Başlangıç kodonunun 5’ ucuna yakın komşusunda bir nükleotit dizisi var: shine dalgarno sekansı.

Bu dizi ile 16S rRNA nın (prokaryotlarda robozomun küçük alt ünitesinde bulunan rRNA) 3’ ucu ile baz eşleşmesi yapıyor. Böylelikle P bölgesi bu başlangıç kodonuna hizalanıyor.

124
Q

Translokasyon (kromozomdaki değil)

A

Ribozom mRNA üzerinde ilerliyor 3 nükleotit kadar 5’nden 3’ ne

125
Q

Release Factors

A

Stop kodonu tanıyan trna yok dolayısıyla aminoasit gelemiyor. Stop kodonunu tanıyanlar prokaryotlarda release factor diye geçiyor.

Release factorler stop kodonunu tanırlar. Stop kodon gelince RF ler sentezlenen polipeptitle trna arasındaki bağı hidroliz eder peptit yapıdan ayrılır. Ribozomun alt br leri ayrılır translasyon sona erer.

126
Q

Prokaryot vs ökaryot translasyon farklar

A

Prokaryotlarda başlangıç kodonu mRna üzerinden doğrudan bağlanırken (3’, 5’ veya ortası fark etmez) ökaryotlarda ribozom öncelikle 5’ cap bölgesindeki proteinlerle (başlangıç faktörleri) ilişki kurmak zorunda. Sonra 5’den 3’ne doğru tarama işlemi ile mRNA üzerinden başlangıç kodonunu bulana dek ilerler..

Hangi AUG nin kullanılacağı prokaryotlarda olduğu gibi özel bir diziyle belirlenir : KOZAK dizisi

127
Q

Reassociation kinetiği eğrisi

A

Bu bir deney yapılan şey de şu: rna ile de dna ile de dna ile rna arasında da yapabilirsiniz.
Diyelim ki dna ile yapıyoruz dna yı izole et tüpe koy ısıt denatüre et soğut renatüre olurken arada bir ölçüm yap

Eğrinin özelliği: bu denatüre olan dna tekrar çift zinc olm başl sonra bi duruyor sonra tekrar falan 3 fazlı bir eğri.
Bunu prokaryotik dna da yapınca tek fazlı eğri. Ve zaman daha kısa

Açıklama: ilk faz en erken renatüre olanlar (çünkü kopya sayıları daha yüksek) son faz en geç renatüre olanlar (kopya sayıları en düşükler (unique, low copy number))

Yani kopya sayısı fazla olunca komplementerini bulma şansı daha fazla falan..

128
Q

Reassociation minetiği eğrisinde bizim genlerimiz nerede

A

Çoğunluk 3. Fazda

129
Q

Dokuya spesifik ekspresyon

A

Bazı proteinler bazı hücrelerde çok fazla miktarda sentezlenir farklı hücre tiplerinde ise hiç sentezlenmezler

130
Q

Housekeeping genler

A

Her hücrede çalışması gereken genler

131
Q

Soeu: dedik ki genlerin çoğu housekeeping, çok az gen var ki dokuya özgü ekspresyon oluyor. Fazlardan hangisi dokuya özgü rna bölgesi

A

Dokuya özgü olan genler sayıca az olabilir ama ekspresyon çok yüksek. En sağda housekeeping genler (ekspresyon düzeyi en düşük olan genler)

132
Q

Gen ifadesi farklı düzeylerde kontrol edilebilir:

A

1) transkripsiyonel düzeyde (en çok kullanılan)

2) RNA processing yani transkripsiyon sonrasında

3) translasyon sırasında

4) posttranslasyonel (translasyondan sonra) = protein activity control

Tıp 1. Sınıf 1. Modül Hücre (5 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions