General Flashcards
Frediich Mieschner
Aislo por primera vez el ADN el cual llamo Nucleína
Región leader del mecanismo de atenuación de procariotas, posee
Codón de inicio AUG
Para le diseño del modelo del ADN Watson y crick se basaron en la tecnica
Difraccion de rayos X
El balanceo de ARNt permite reconocer mas de un codón, si la 1era base del anticodón es G, la tercera base del codón será?
U y C
Cuando la proteína emerge de la sub unidad mayor del ribosoma en procariotas, encuentra en su salida a…
Las enzimas péptido deformilasa y metionina aminopeptidasa
Sintetizo ARN (UC) en el que eran 50/50, el Dr. 1——– logro un polipeptido 2——– demostrando que 3 ———-
1 Khorana
2 Ser- Leu
- los codones están compuestos de tripletes
La enzima que permitio a Severo Ochoa producir ribonucleotidos sinteticos fue la:
Polinucleotida fosforilaza
Mientras se transcribe el ARNm precursos en eucariontes, la estructura 7 metil guanosina 5’-5’ trifosfato permanece unido al dominio carboxilo terminal de la ARN polimerasa II gracias a….
El complejo proteico CBC
Caracteristicas del Rho en la terminacion de la transcripcion
- Formado por 3 unidades de 2 dominios
- Posee un domino N terminal que permite su union al ARN
- Posee un dominio C terminal con actividad ATPasa
- Reconoce los sitios rut sobre la secuencia de ARN transcrito
Factores del tipo global en la regulacion de expresion genica en procariotas
- CRP (respuesta catabólica)
- FNR y ArcA (reg. anaerobiosis)
- LRP (reg. metabolismo y transp. aminoacidos)
- FIS, IHF, HNS (Proteinas de estructura de ADN)
Factor sigmaF expresa genes de procariotas durante
Sintesis de flagelo
Factor sigma31 expresa genes de procariotas durante
Shock termico
Factor sigma54 expresa genes de procariotas durante
Asimilacion de nitrogeno
Factor sigmaE expresa genes de procariotas durante
proteinas extracelulares
Regiones de ADN unidas en la periferia interna nuclear con interacciones de proteínas lamina B1 asociadas a
Genes down regulated
Los elementos de reconocimiento del ARNt por la aminoacil-tRNA-sintetasa, son los sgtes:
- Por lo menos una base en el anticodon
- Uno o mas de los tres pares de base en el tallo aceptor
- La base en la posicion 73 (que precede al CCA terminal) como base discriminatoria
Caracteristicas notables de la telomerasa
- Tienen un componente ARN 3’ AAUCCC-5’
- Codificado por TERC
Las chaperoninas son un conjunto de diversas familias de proteinas requeridas para el
plegamiento y ensamblaje de otras proteinas un vivo
Durante la formacion de la estructura en forma de gorra 5’ (7 metil guanosina 5’-5’ trifosfato), el fosforo gamma del nucleotido del extremo 5’ en el ARNm precursor es removido por la enzima
Fosfohidrolasa
El factor gatillador es una proteina
que se une temporalmente a la proteina L23 de la subunidad mayor del ribosoma
Durante el corte y empalme del ARNm…..
El extemo 5’ del SnRNA U2 se une a los nucleotidos que se encuentran a los lados del nucleotidos que se encuentra en el punto de ramificación
La ADNpol III actua luego de la primasa ya que…
solo puede agregar nucleotidos en su extremo 3’ OH existente
la subunidad epsilon de la holoenzima tiene actividad de prueba de lectura de..
3’ a 5’
Las enzimas que eliminan cebadores en celulas eucariotas son:
FEN1 y RNAsa H1
La replicacion de ADN se inicia reconociento 1.—— que en E. coli es unico y en Sacharomyces son 2.——
- Replicones
- 400
Las nucleasas, segun el lugar de accion se clasifican en
Endonucleasas y Exonucleasas
el punto de origen de replicacion en procariotas es denominado
OriC
Proteina el cual es un iniciador de replicacion en procariotas
DnaA
Tambien conocido como Helicasa
DnaB
La DnaB necesita de una chaperona para poder ingresar a la cadena, esta se llama
DnaC
Relajan la cadena de ADN y producen superenrollamiento negativo
Girasas o Topoisomerasas
Cataliza pequeños segmentos de ARN llamados cebadores o primers proporcionando un OH libre que requiere la ADN polimerasa para iniciar sintesis
Primasa
Se encargan de remover los primers antes de que actue la ligasa
Polimerasa I
Participa en el reinicio de la horquilla cuando hay daño al ADN
Polimerasa II
Responsable de la sintesis de nuevas cadenas de ADN
Polimerasa III
El complejo re replicativo ORC en eucariotas se asocia en primer lugar con la proteina
cdc6p y con proteinas MCM
La estabilizacion de hebras monocatenarias esta dada por
Las proteinas SSB
Eliminan el primer cebador de la hebra retardada
FEN1 y RNasa H1
Otras enzimas involucradas en la eliminacion de cebadores
RNasa H2, DNA2, Pol b
La cebasa realiza…
Hidratacion de primers
La telomerasa esta presente en..
Celulas germinales, tejidos fetales y algunas celulas madres poco diferenciadas
La telomerasa consta de 2 subunidades
- TERT con funciion catalitica de transcriptasa reversa
- TERC que brinda una hebra de ARN molde
Transcripcion es
Sintesis de molecula de ARN (mRNA) en la regio codificande del ADN por medio de la enzima ARN polimerasa
Estructura donde se agrupan enzimas o proteinas que se dedican a una via metabolica en comun
operon
En los procariotas la transcripcion y traduccion ocurre de manera simultanea ?
verdadero
la enzima central tiene afinidad con cualquier seccion del ADN, sin embargo la ARN polimerasa inicia transcripcion de sitios especificos al unirse a
el factor sigma
Conforme el ARN polimerasa se acerca al final del gen que se esta transcribiendo, llega a una region..
rica en nucleotidos C y G
Region del ADN que sufre desenrollamiento parcial
Burbuja de transcripcion
el proceso de iniciacion tipico de eucariotas utiliza promotores que tienen la secuencia
TATA
En eucariotas la transicion viene marcada por la fosforilacion del dominio
CTD de la RNApol-II
La terminación se produce como consecuencia de la combinación de dos factores o mecanismo:
- Detención o pausa de la RNA polimerasa
- Desestabilización del hibrido RNA:DNA
Se denominan secuencias promotoras distales, los cuales pueden aumentar la velocidad de inicio de la transcripcion
Enhancers
Antibioticos tipo I: inactivan la RNA polimerasa de manera directa
Rifamicinas (Rifampicina)
Antibiotico de tipo I, se fija a la subunidad b inhibiendo la elongacion
Estreptolidigina
Inactivan de manera indirecta la transcripcion uniendose al ADN
Antibioticos tipo II: Actinomicina
Antibioticos que impiden la accion de la DNA girasa
Antibioticos de tipo III (quinolonas, cumermicina, novobiocina)
El spliceosoma divide al transcrito pribosomal 80S en dos fragmentos:
20S pre rRNA y 32S pre-rRNA
Codon de inicio
AUG
Codones terminales
UAA, UAG, UGA
El alineamiento entre el codon y anticodon es de tipo
Antiparalelo
Nucleosido poco frecuente pero de aparicion comun en los tRNA, su base nitrogenada es la hipoxantina
Inosina (I)
Fundamental en el proceso de sintesis de proteinas, transporta los aminoacidos activados hacia el ribosoma
Aminoacil tRNA
Garantiza la correcta union de los aminoacidos a sus moleculas de ARNt
Aminoacil tRNA sintetasa
Como se corrigen los errores de la Aminoacil tRNA sintetasa
mediante hidrolisis
Copia de la informacion contenia en la secuencia de ADN, actua en el ribosoma como molde para la sintesis de proteinas
ARNm
Tipo de gen en donde se transcribe un ARNm que codifica multiples proteinas
gen policistronico
En procariotas, cada cistron de un ARNm posee una secuencia denominada —— que interacciona especificamente con la subunidad pequeña del ribosoma
Shine-Dalgarno
En eucariotas el inicio de la traduccion requiere la union dle tRNA al codon de inicio1. —— en el mRNA, en el entorno del 2. ——-
- AUG
- sitio P de la subunidad menor
En procariotas hay ——– para incorporar N formil-metionina al inicio de la traduccion
aminoacilacion y formilacion
en eucariotas solo hay ——— pra incorporar metionina al inicio de la sintesis
Aminoacilacion
Agentes desnaturalizantes que pueden desenrollar las proteinas causando la perdidad de su actividad enzimatica
Cloruro de guanidina - Urea
Enzima que elimina el grupo formilo (CHO) del aminoacido inicial de la proteina (metionina)
Peptido deformilasa
Elimina el aminoacido metionina del extremo N terminal de la proteina
Metionina aminopeptidasa
Cis y trans prolina son interconvertidas en una reaccion catalizada por
peptidilpropil cis/trans isomerasa
En la trans prolina el grupo carboxilo se encuentra alejado del grupo amino de la sgte proteina, esto les da
menor flexibilidad pero mas estabilidad
La fragmentacion de un polipeptido ocurre por
proteólisis
fases del splicing proteico
- Reconocimiento de la inteina
2.Corte N-terminal - Reacción de transesterificación
- Ciclación de asparagina
La secuencia del peptido señal se encuentra..
en el extremo N terminal de la proteina inmadura (region N)
Proceso enzimatico de modificacion de proteinas post traduccional
Ubiquitinizacion
En la ubiquitinizacion, la ubiquitina se agrega a las proteinas diana por la accion de las
enzimas ubiquitina ligasa
Destruyen proteinas que han sido sintetizadas dentro de la celula
proteosomas
Sitio donde la RNA polimerasa se une antes del inicio de la transcripcion
Promotor
Sitio de union para el Represor
Operador
Una holoenzima esta compuesta por
RNAP core o apoenzima (alfa2bb w) + sigma factor
Genes SOS estan regulados negativamente por dimeros de..
proteina represora LexA
El operon lac es de tipo
Inducible
El operon trp es de tipo
Represible
Estudio de los fenomenos y mecanismo que causa los cambios en la expresion del gen que no depende de cambios de la secuencia de ADN
Epigenetica
Reguladores epigeneticos
- remodelamiento de la cromatina
- modificaciones en las histonas
- metilacion/desmetilacion del ADN
- ncRNAs
En la RNA polimerasa II, esta ubicado en la superficie del core, importante para el proceso de exportar el ARNm
Heterodimero compejo Rpb4/7
Caracteristicas del Inr
- Puede actuar sinergicamente con TATA
- Puede funcionar independientemente de TATA
- Coincide con el sitio de inicio de la transcripcion
