Fundamentos de la PCR cuantitativa en tiempo real Flashcards

1
Q

¿Qué es la PCR y quién la desarrolló?

A

La PCR (reacción en cadena de polimerasa) es una técnica de replicación in vitro de una molécula de ADN, desarrollada por Kary Mullis en 1983.

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2
Q

¿Qué delimita la longitud del fragmento que se desea replicar en una PCR?

A

Los primers (cebadores u oligonucleótidos).

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3
Q

¿Cuál es el objetivo de la PCR convencional y cómo se evalúa?

A

Amplificar una región genética específica, evaluándose mediante gel de agarosa o acrilamida.

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4
Q

¿Cuál es la diferencia entre PCR cualitativo, semicuantitativo y cuantitativo?

A

Cualitativo: Identifica la presencia o ausencia de un fragmento específico. -> enfermedades infecciosas
Semicuantitativo: Mide niveles de expresión génica (ARNm). -> biopsias
Cuantitativo: Mide la cantidad de microorganismos o ARNm específico, usando una curva de referencia.

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5
Q

¿Qué es la PCR múltiple?

A

Es una PCR que amplifica varias regiones génicas en una sola reacción, usando pares de oligonucleótidos específicos para cada región.

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6
Q

¿Cuáles son los principios básicos de la PCR?

A

Complementariedad de bases.
Dirección 5’ → 3’ (requiere un extremo 3’ libre).

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7
Q

¿Cuáles son las tres etapas principales de la PCR?

A
  1. Desnaturalización.
  2. Alineamiento.
  3. Elongación.
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8
Q

¿Qué componentes se requieren para una reacción de PCR?

A

ADN, primers, DNA polimerasa, dNTPs (en forma trifosfatada) y magnesio como cofactor.

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9
Q

Describe las temperaturas y tiempos típicos en el proceso de PCR.

A
  1. Inicio de desnaturalización: 95°C, 5 min.
  2. Ciclos de amplificación:
    • Desnaturalización: 95°C, 30 s.
    • Alineamiento: 50-60°C, 30-40 s.
    • Extensión: 72°C.
  3. Amplificación final: 72°C.
  4. Almacenamiento temporal: 4°C.
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10
Q

¿Qué es la PCR en tiempo real y quién la describió?

A

Higuchi et al. en 1992 describieron la PCR en tiempo real, una modificación que permite observar en tiempo real el crecimiento de la curva de amplificación.

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11
Q

¿Cómo se detecta la amplificación en PCR en tiempo real?

A

Mediante fluorescencia:
• SYBR Green: Se intercala en el ADN de doble cadena y emite fluorescencia al ser excitado con láser.
• TaqMan: Utiliza un fluoróforo y una sonda específica para detectar SNPs.

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12
Q

¿Cuáles son las etapas de la amplificación en PCR en tiempo real?

A

Desnaturalización, alineamiento y extensión.

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13
Q

¿Qué permite la detección en PCR en tiempo real?

A

La detección se realiza mediante fluorescencia.

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14
Q

¿Qué es el SYBR Green en PCR en tiempo real?

A

Un intercalante de DNA que emite fluorescencia cuando se incorpora en el DNA de doble cadena al ser excitado por un láser.

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15
Q

¿Para qué se usa SYBR Green en PCR en tiempo real?

A

Para cuantificar la expresión genética.

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16
Q

¿Qué es TaqMan en PCR en tiempo real?

A

Una técnica más específica que usa una sonda con un fluoróforo y un apagador para identificar SNPs.

  1. La sonda TaqMan se une a una secuencia dentro del amplicon entre los cebadores
  2. La DNA polimerasa inicia la síntesis del nuevo ADN a partir del cebador
  3. La exonucleada de la polimerasa degrada la sonda
  4. El reportero se libera del apagador y emite fluorescencia
17
Q

¿Qué contiene la sonda TaqMan?

A

Un fluoróforo y un apagador.

18
Q

¿Cuáles son los fluoróforos o reporteros comunes en las sondas de PCR en tiempo real?

A

VIC y FAM.

19
Q

¿Dónde se encuentra el apagador en relación al reportero en la sonda de PCR en tiempo real?

A

Muy cercano al reportero, absorbiendo la fluorescencia.

20
Q

¿Cuál es la ventaja de la PCR en tiempo real sobre la PCR de punto final?

A

Mayor rapidez y eficiencia, y no requiere geles de agarosa para verificar resultados.

21
Q

¿Qué aplicaciones tiene la PCR en tiempo real en el análisis de expresión?

A

Se utiliza en investigaciones sobre cáncer.

22
Q

¿Cómo se usa la PCR en tiempo real en investigación?

A

Para la detección de polimorfismos asociados a enfermedades y estudios de asociación caso-control.

23
Q

¿Cuál es una aplicación diagnóstica de la PCR en tiempo real?

A

Diagnóstico de COVID-19 (SARS-CoV-2).

24
Q

¿Qué se puede calcular con la PCR en tiempo real?

A

La eficiencia de la reacción.