Fråga 1

Question 1

Alpha helix

Answer 1

Snurrar åt höger, uppbyggd av AA som stabiliseras mha vätebindningar mellan C och N terminaler på var 4de AA. Gly och Pro ingår inte.

Question 2

Beta sheet

Answer 2

Minst 2 beta strands och en turn, kan vara parallella (N terminaler åt samma håll, mindre stabil) eller antiparallella (N terminaler åt olika håll, stabilare). R-kejorna “sticker upp” ur sheet

Question 3

Kollagenhelix

Answer 3

3 alpha helixar som snurras runt varandra, sträcktåligt

Question 4

Beta turn

Answer 4

Mellan beta strands för att forma sheets, finns två typer. En med pro på position 2 och en med gly på position 3. Är pro och gly pga deras speciella egenskaper.

Question 5

Random coil

Answer 5

Struktur som inte passar in i de andra kategorierna

Question 6

Var lägger sig polära (hydrofila) AA i ett integralt membranbundet protein?

Answer 6

Lägger sig i gränsen mellan membranets hydrofoba och hydrofila del ex Tyrosin

Question 7

Var lägger sig opolära (hydrofoba) AA i integrala membranbundna proteiner?

Answer 7

Lägger sig i den yttre delen av proteinet mot membranet ex Alanin och Glycin

Question 8

Var lägger sig laddade AA i integrala membranbundna proteiner?

Answer 8

I gränsen mellan membran och cytosol ex Histidin och Glutaminsyra

Question 9

Assisted folding mha chaperoner

Answer 9

Chaperoner skyddar oveckade proteiner och ger dem ett medium att kunna vecka sig i utan att reagera med annat i celler

Question 10

Alpha keratin

Answer 10

Två alpha helixar som är bundna med van der waals och disulfidbindningar

Question 11

Varför är inte enzymer lika hårda som naglar?

Answer 11

Enzymer är globulära protein tillskillnad från alpha keratin som är fibröst. Fibrösa proteiner binder hår mha disulfidbindningar och de kan packas tätt. I globulära proteiner kan disulfidbindningar bli starkare eller svagare beroende på närliggande AA och dess bindningar, kan inte heller packas lika tätt.

Question 12

Glu -> Val

Answer 12

Ger sickelcellsanemi. Glu = vattenlöslig, Val = ej vattenlöslig. Erytrocyterna ändrar form och klibbar ihop när hemoglobin inte har syre bundet.

Question 13

Gln -> Asn

Answer 13

Båda opolära, ger typ ingen skillnad

Question 14

Asp -> Arg

Answer 14

Asp = negativt laddad, Arg = positivt laddad, medför viss skillnad i funktion

Question 15

Vad händer om man byter ut Ser195 i chymotrypsin mot Leu i samma position?

Answer 15

Enzymet kommer ej funka, binder inte substrat pga serin är polär och leucin är opolär