Fosforylacja oksydacyjna Flashcards
1
Q
Potencjały odłączania kolejnych fosforanów od ATP
A
-31, -31, -14 [kJ/mol]
ATP i ADP mają takie samo
2
Q
Im zwiazek bardziej utleniony tym ma … zasób energii
A
Mniejszy
3
Q
Produkty glikolizy (3weglowe)
A
1,3-BPG oraz PEP
4
Q
Duży spadek potencjału termodynamicznego procesu hydrolizy bezwodników wynika z
A
- odpychania elektrostatycznego
- stabilizacji produktów hydrolizy przez 1. odpychanie ładunków 2, rezonans
5
Q
DeltaGprim od najbardziej ujemnego fosforanu
A
PEP, Fosforan 1’ z 1,3-BiFosfoGlicerynianu, Kreatyna i Fosfokreatyna
6
Q
Gdzie odbywa się glikoliza
A
Cytoplazma
7
Q
Cykl Krebsa odbywa się w
A
Mitochondrium (macierz bo Natalia kazała)
8
Q
Bardzo ogólne efekty cyklu Krebsa
A
2x węgle utleniają się do CO2; wytworzenie czterech zredukowanych form przenośników wodoru
9
Q
W której błonie mitochondrialnej jest transport elektronów sprzężony z syntezą ATP
A
Wewnętrznej błonie mitochondrium
10
Q
Reduktor ma … potencjał
A
Niższy
11
Q
Utleniacz ma … potencjał
A
Wyższy
12
Q
Przekazywaniu elektronów w łańcuchu towarzyszy ,,, potencjału termodynamicznego
A
Spadek
13
Q
Delta G jest od zera (łańcuchu elektronów)
A
Niższa (a wartosc tej z primem to -220kJ)
-> więc reakcja jest nieodwracalna
14
Q
Kompleks 1 łańcucha oddechowego - inna nazwa
A
Oksydoreduktaza NADH-CoQ
15
Q
Kompleks 1 łańcucha oddechowego z czego na co przenosi
A
Z NADH na CoQ
16
Q
Co zawiera kompleks 1 ŁO (w kolejności przechodzenia elektronów)
A
FMN, Fe-S (ma tez 25 polipeptydów)
17
Q
Co tworzy ryboflawine
A
Izoalaksozyna, rybitol
18
Q
Fyboflawina + fosforan
A
FMN (mononukleotyd flawinowy)
19
Q
Jaką zasadę azotową ma FAD
A
Adeninę - bo dinukleotyd flawinoadenilowy
20
Q
Forma utleniona izoaloksazyny - kolor
A
Żółty
21
Q
Forma semichinonowa izoaloksazyny - kolor (uprotonowana)
A
Niebieski
22
Q
Forma rodnikowa izoaloksazyny - kolor
A
Czerwony
23
Q
Forma zredukowana izoaloksazyny - kolor
A
Bezbarwna
24
Q
Kompleks 2 ŁO, inne nazwy
A
Oksydoreduktaza FADH2-CoQ, (dehydrogenaza bursztynianowa)
25
Co dostarcza el. kompleksowi 1 ło
NADH
26
Co dostarcza el. kompleksowi 2 ło.
FADH2
27
Co zawiera kompleks 2 ło
FADH2 (?), centea Fe-S, ma też 4 polipeptydy
28
Czy kompleks 1 ło przenosi protony?
tak
29
Czy kompleks 2 ło przenosi protony?
nie
30
Jaki aminokwas tworzy centra żelazo-siarkowe?
Cysteina (ale jest w nich tez siarka spoza cysteiny)
31
Z iloma siarkami się łączy żelazo w centrach Fe-S
4
32
Kompleks 3 ło inna nazwa
oksydoreduktaza CoQ-CytC
33
Co zawiera kompleks 3 ło?
Cytochromy B, centea Fe-S, cytochromy C1 (9-10 poipeptydów)
34
Czy kompleks 3 ło jest pompą protonową?
tak
35
protoporfiryna ... stworzona z ....
protoporfiryna IX z cytochromów b
36
widma absorbcyjne cytochromów utlenionych są ...
mniejsze
37
widma absorbcyjne cytochromów zredukowanych są...
większe
38
komleks 4 ło inna nazwa
oksydaza cytochromowa
39
kompleks 4 ło co zawiera?
Cu2+, cyt.a1, cyt.a3, (13 polipeptydów)
40
Hem A to wszystkie cytochromy typu...
a
41
Które kompleksy ło zawierają Fe-S
I, II, III
42
Cu2+ jest w kompleksie...
IV
43
Czy kompleks IV jest pompą protonową
tak
44
Który kompleks nie jest pompą protonową?
II
45
Droga elektronów po kolei w ło
NADH (2e) -> FMN -> Fe-S -> [równocześnie FADH2 (2e) -> Fe-S ->] -> CoQ -> cyt.b -> Fe-S -> cyt.c1 -> cyt.c -> cyt.a -> cyt. a3 -> woda
46
Kompleksy ilości polipeptydów (od największego)
I > IV > III > II
| 25, 13, 9-10, 4
47
Ile protonów przekazuje kompleks I na CoQ
2, tyle samo co elektrnów
48
Ile protonów wywala kompleks I do przestrzeni międzybłonowej
4
49
Która część syntazy ATP jest zakotwiczona w błonie?
F0
50
Która się obraca?
F0
51
Miarą wydajności układu ło jest?
P/O
52
P/O dla NADH?
2.5 (10H+/4H+)
53
P/O dla FADH2?
1.5 (6H+/4H+)
54
Właściwości czynników rozprzęgających
- rozpuszczalne w wodzie i lipidach
| - przyjmują/oddają H+ w zależności od pH
55
Co powodują czynniki rozprzęgające?
Przeciek H+ przez błonę
56
Przykładowe czynniki rozprzęgające
- DNP - dinitrofenol
| - FCCP
57
Oligomycyna jest?
Inhibitorem syntazy ATP
58
Od czego jest zależne zużycie tlenu przez ło?
Dostępności ADP
59
Zmiany w syntazie ATP spowodowane przepływem protonów
Rotacja F0, uwolnienie ATP z F1
60
Które podjednostki syntazy ATP są stacjonarne? (nieruchome)
alfa, beta, delta
61
Która podjednostka syntazy ATP jest ruchoma/powoduje rotację? co napędza rotację?
gamma; siła protonomotoryczna
62
Przez co jony H+ fizjologicznie mogą wracać do macierzy?
tylko przez F0 syntazy ATP
63
Rotacja podjednostki gamma syntazy ATP powoduje
Zmiany konformacji a przez to aktywności układów dwujednostkowych alfabeta
64
Trzy układy alfabeta
O - otwarte miejsce aktywne, uwalnianie ATP
L - słabe wiązanie ADP i Pi
T - silne wiązanie substratów, synteza ATP (spontaniczna!)
65
Czynnik rozprzęgający powoduje ... zatem powoduje ...
- przeciek protonów
| - rozdzielenie transportu elektronów (zużycia tlenu i syntezy ATP)
66
Inhibitory transportu elektronów
- rotenon
- amytal
- Antymycyna A
67
Blokowanie FMN
rotenon, amytal
68
Uniemożlienie przeniesienia 2el z NADH na CoQ
rotenon, amytal
69
rotenon, amytal powodują
- Blokowanie FMN (kompleks I)
| - Uniemożlienie przeniesienia 2el z NADH na CoQ
70
Antymycyna A
Blokowanie przeniesienia el. z cyt. b na cyt. c1 (kompleks 3)
71
Blokowanie przeniesienia el. z cyt. b na cyt. c1 (kompleks 3)
Antymycyna A
72
Inhibicja oksydazy cytochromu c
CO, CN-, N3-
73
Blokowanie kompleksu IV
CO, CN-, N3-
74
CO, CN-, N3-
- Inhibicja oksydazy cytochromu c
- nie zostaną el przeniesione na O2
- Blokowanie kompleksu IV
75
Potencjał dysocjacji ATP4-
-30,5Kj/mol
76
Oligomycyna powoduje (2x rzeczy)
zminimalizowanie syntezy ATP i zużycia tlenu
77
Rozprzęgające powodują
wzrost zużycia tlenu, obniżenie syntezy ATP
78
Rozprzęgające powodują
wzrost zużycia tlenu, obniżenie syntezy ATP
79
Rodniki tlenków azotu - z czym reagują?
Z białkami (grupą -SH) i związkami nienasyconymi
80
Nadtlenoazotyn i kwas nadtlenoazotawy reagują z
silny utleniacz - (krótkożyjący)
reaguje z białkami (TIOLE , TYROZYNY)
i wielonienasyconymi kw.tłuszczowymi
81
Anionorodnik ponadtlenkowy (O2-*) powstaje w reakcji
Wybuch tlenowy, katalizowana przez oksydaze NADPH (u neutrofilii, makrofagów, monocytów)
82
Reakcje wybuchu tlenowego
1. 202 + NADPH --oksydaza NADPH--> 202-* + NADP+ + H+
2. O2*- + O2*- + 2H+ --SOD(dysmutaza ponadtlenkowa)--> H2O2 + O2
3. H202 + CL- --MPR(mieloperoksydaza)--> OCl- + H2O
4. OCl- + O2*- + H+ ---> OH* + O2 + Cl-
83
Skąd oksydaza NADPH bierze NADPH, żeby zacząć syntezę RFT?
szlaku pentozofosforanowego
84
Reakcje w których powstaje anionorodnik ponadtlenkowy:
- tworzenie RFT w celu wybuchu tlenowego
- reakcja oksydazy ksantynowej
- mitochondrialne transporty łańcuchu elektronów
- w Hb
- w cyt. P450
85
Jaki przenośnik wodoru przechodząc z postaci zredukowanej do utlenionej tworzy anionorodniki ponadtlenkowe?
FMNH2 --> FMN
| inne pewnie też, ale to było w prezce
86
Co posiada w sobie oksydaza ksantynowa?
Atom Molibdenu na VI, FAD
87
Gdy HbFe2+ utllenia się do HbFe3+ to redukuje się ... , a gdy metHb się redukuje do HbFe2+ to utlenia się ...
1. tlen - wytwarza się anionorodnik ponadtlenkowy
| 2. cyt.bFe2+ do cyt.bFe3+
88
Gdy cyt.bFe2+ utlenia się do cyt.bFe3+ to redukuje się ... , a gdy cyt.bFe3+ redukuje się do cyt.bFe2+ to utlenia się ... .
1. HbFe3+ do HbFe2+
| 2. NADH do NAD+
89
Reduktaza cyt.P450 potrzebuje
NADPH, FAD(przechodzi w FMN)
90
Reakcje w których powsatje nadtlenek wodoru H202
- dysmutaza ponadtlenkowa (SOD)
| - oksydazy (ksantynowa, aminokwasów[FAD, FMN])
91
Rodzaje SOD (dysmutazy poadtlenkowej) + jakie pierwiastki posiadają
- wewnątrzkomórkowa (Cu, Zn)
- mitochondrialna (Mn)
- pozakomórkowa (Ec-SOD, nje wjem jaki atom)
92
Reakcja katalizowana przez SOD
O2-* + O2*- + 2H+ --SOD--> H2O2 + O2
93
Gdzie zachodzi deaminacja aminokwasów? (narządy i organella kom.)
Wątroba, nerki; peroksysomy
| w jelicie bakteryjne
94
Reakcje w których powstaje rodnik ponadtlenowy OH*
- prominiowanie jonizujące
| - reakcje Fentona
95
Homolityczny rozpad przez promieniowanie jonizujące (reakcja)
H2O -> OH* + H*
96
Reakcja Fentona
H2O2 + O2*- --[Fe3+/Fe2+ lub Cu2+/Cu+]--> O2 + OH* + OH-
97
Reakcje pośrednie w reakcji Fentona
H2O2 + Fe2+ -> OH- + OH* + Fe3+
| O2*- + Fe3+ -> O2 + Fe2+
98
Wpływ RFT (OH*) na wielonienasycone KT
Dochodzi do przegrupowania i tworzenia rodników alkilowych
99
Wpływ RFT (OH*) na białka
Tworzenie rodników białkowych, rodników nadltenku białka oraz tworzenie dimerów (z dwóch rodników białkowych)
Dimery tworzone przez Cysteinę oraz Tyrozynę
100
Jakie aa biorą udział w tworzeniu dimerów białka z udziałem RFT?
Cysteina oraz Tyrozyna
101
Promieniowanie jonizujące (powodujące powstanie OH*) może powodować w DNA
Depurynacje (i generalnie rozrywać różne wiązania w DNA)
102
Wewnątrzkomórkowa ochrona przed RFT
- SOD (dysmutaza ponastlenkowa)
- katalaza
- GP (peroksydaza glutationowa)
103
Zewnątrzkomórkowa ochrona przed RFT
1. pozakomórkowa SOD
2. albumina
3. moczan
4. witamina C
5. witamina E
(tokoferole)
6. bilirubina
104
Jaki aminokwas zawiera peroksydaza glutationowa?
Selenocysteinę
105
Reakcje katalizowane przez GP
1. 2GSH + H2O2 _GP_͕ GS−SG + 2H2O
| 2. ROOH + 2GSH + --GP--> ROH + H2O + GS-SG (organiczne ugrupowania nadltlenkowe są redukowane do grup hydroksylowych)
106
Odtworzenie GSH (jaki enzym katalizuje i reakcja)
```
reduktaza glutationowa (potrzebuje NADPH)
GS-SG + NADPH --reduktaza glutationowa--> 2GSH + NADP+
```
107
Konsekwencje wpływu RFT
```
APOTOZA
CUKRZYCA
CHOROBA PARKINSONA
CHOROBA ALZHEIMERA
AIDIS
MIAŻDŻYCA
NOWOTWORY
STARZENIE SIĘ
```
108
Losy pirogronianu
a/ redukcja do mleczanu
b/ utlenianie do acetylo-CoA
c/ karboksylacja do szczawiooctanu
d/ transaminacja do alaniny
109
Produkty uboczne pirogronian -> AcetyloCoA
CO2, 2 elektrony
110
Utlenianie pirogronianu do AcetyloCoA, enzym?
dehydrogenaza pirogronianowa
111
Utlenianie pirogronianu do AcetyloCoA
Pir + NAD+ + CoA -> AcCoA + CO2 + NADH + H+
112
Reakcja utleniania pirogronianu jest odwracalna/nieodwracalna?
Nieodwracalna (deltaG ujemna)
113
Enzymy tworzące dehydrogenazę pirogronianową
E1 - dekarbokzylaza pirogronianowa
E2 - transacetylaza dihydroliponianowa
E3 - dehydrogenaza dihydroliponianowa
114
Z jakiej witaminy jest NAD+
B3
115
Z jakiej witaminy jest FAD
B2
116
Jaka witamina potrzebna do stworzenia CoA
B5
117
Koenzym E1 (dehydrogenazy pirogronianowej)
TPP (pirofosforan tiaminy)
| [do jego syntezy potrzebna wit. B1]
118
Co potrzebne do utleniania pirogronianu do AcetyloCoA?
wit. B1, B2, B3, B5, liponian
119
Koenzym E3 (transacetylaza dihydroliponianowa)
FAD, NAD+
120
Koenzym E3 (dehydrogenazadihydroliponianowa)
Kwas liponowy
| Koenzym A
121
Regulacja aktywności dehydrogenazy pirogronianowej
(-) AcetyloCoA
(-) NADPH
(-) ATP
(+) AMP
122
Dehydrogenaza pirogronianowa aktywna forma jest ...
Nieufosforylowana
123
Nieaktywna forma dehyfrogenazy pirogronianowej jest ,,,
Ufoforylowana
124
Czynniki aktywujące fosfatazę dehydrogenazy pirogronianowej
Mg2+, Ca2+
125
Czynniki aktywujące kinazę dehydrogenazy pirogronianowej
NADPH, AcetyloCoA
126
Powstawanie cytrynianu
- z czego
- enzym + jaki to rodzaj reakcji
- co hamuje reakcje (syntaze cytrynianową)
- acetylo CoA (dawca grupy acetylowej) , szczawiooctan
- syntaza cytrynianowa, kondensacja (potrzeba H2O)
- cytrynian, ATP
- deltaG ujemna bo reakcja nieodwracalna
127
CoA jest regenerowane dla utleniania
| pirogronianu dzięki?
Syntezie cytrynianu (tam AcetyloCoA do CoA)
128
Cytrynian do izocytrynianu (poprzez cis-akonitan)
1. DEHYDRATACJA
2. REHYDRATACJA C2 (10% izocytrynian) i C3
(90% cytrynian)
3. reakcja w kierunku izocytrynianu powodowana
jego zużywaniem w dlaszych reakcjach
(reakcja odwracalna, deltaG dodatnia)
129
Cytrynian do izocytrynianu (poprzez cis-akonitan)
- enzym
- hamowanie
- przyspieszanie
- akonitaza
- (-) NADH, ATP, bursztynylo-Coa
- (+) wzrost ilosci ADP
130
Utlenianie izocytrynianu do alfa-ketoglutaranu
| -enzym (co przyjmuje elektron?)
- dehydrogenaza izocytrynianiowa (NAD+/NADP+)
[ (-) wzrost NADH, ATP, (+) wzrost ATP ]
(deltaG ujemna bo reakcja nieodwracalna)
131
Podczas utleniania izocytrnianu
- Powstaje 1-szy NADH (lub NADPH)
| - 1-szy węgiel opuszcza cykl jako CO2
132
Utlenianie alfa-ketoglutaranu do bursztynylo-Coa
- enzym
- co potrzebne
- hamowanie
-Dehydrogenaza alfa-ketoglutaranu
- CoA-SH, NADH
- (-) wzrost NADH, bursztynylo-Coa
(deltaG ujemna bo reakcja nieodwracalna)
133
Podczas utleniania alfa-ketoglutaranu do bursztynylo-CoA
- Powstaje 2-gi NADH;
| - 2-gi węgiel opuszcza cykl jako CO2
134
Dehydrogenaza alfa-ketoglutaranu
Podobny kompleks enzymatyczny jak dehydrogenaza pirogronianowa.
koenzymy: DPT, kwas liponowy, FAD, NAD+ i CoA
135
Bursztynylo Coa do bursztynianu
- jaki to rodzaj reakcji
- jaki enzym
- co potrzebne
- fofsorylacja substratowa
- syntetaza bursztynylo Co-A
- GDP + Pi
(deltaG ujemna bo reakcja nieodwracalna)
136
Podczas przemiany bursztynylo-CoA do bursztynianu wytwarza się
Wytworzenie 1 mola GTP (=ATP)
137
W reakcji ADP + GTP -> ATP + GDP deltaG wynosi
0 kJ/mol
138
Bursztynian do fumaranu
- rodzaj reakcji
- jaki enzym
- ktory kompleks
- inhibicja
- co potrzebne
- odwodornienie
- dehydrogenaza bursztynianowa
- kompleks II
- malonian (inhibitor kompetycyjny)
- potrzebne FAD (przyjmuje wodory)
139
Bursztynian do fumaranu - co powstaje?
Powstaje 1 mol FADH2
140
Bursztynian do fumaranu - inhibicja (co i jaki rodzaj)
malonian, inhibitor kompetycyjny
141
Delta G reakcji odwodornienia bursztynianu
Równa zero! kJ/mol
142
Fumaran do L-jabłczanu
- rodzaj reakcji
- enzym
- hydratacja
- fumaraza
(deltaG ujemna bo reakcja nieodwracalna)
143
Fumaraza to enzym...
stereospecyficzny: D-jabłczan nie jest cool
144
Jabłczan do szczawioctanu:
- rodzaj reakcji
- enzym
- co potrzebne
-utlenienie/odwodorowanie
- dehydrogenaza jabłczanowa
- NAD+
(DeltaG dodatnia, ale bardzo niska)
145
Utlenianie jabłczanu do szczawiooctanu, co powstaje?
1 mol NADH
146
Regulacja cyklu Krebsa zachodzi poprzez
```
1. DOSTĘPNOŚCI
ACETYLO-CoA i
SZCZAWIOOCTANU
2. KUMULACJI
PRODUKTÓW
3. HAMOWANIA
AKTYWNOŚCI
ENZYMÓW
```
147
Cokolwiek spalane w organizmie musi ulec przekształceniu do...
Acetylo-CoA
148
Ile moli ATP z 1 mola Acetylo-CoA?
```
10 moli, bo
[dzieki fosforylacji oksydacyjnej]
3 NADH -> 7.5 ATP
1 FADH2 -> 1.5 ATP
oraz 1 GTP
```
