final Flashcards
Pourquoi le génome mitochondrial est-il souvent utilisé en phylogénie ?
Parce qu’il évolue rapidement, il est utile pour étudier les phylogénies sur des périodes relativement brèves (10 à 100 millions d’années).
Quel est un exemple d’anneau d’espèces ?
il s’agit d’un cas particulier où une série de populations interfécondes existe, mais où des barrières reproductives apparaissent dans la zone de contact entre les formes extrêmes de l’anneau.
Quels sont les principaux caractères étudiés en taxonomie moléculaire ?
1) Structure des protéines 2) Structure des acides nucléiques (ADN, ARN) 3) Séquences génétiques
Qu’est-ce que l’horloge moléculaire ?
L’horloge moléculaire est l’idée selon laquelle les molécules évoluent à un rythme constant, permettant de dater des événements évolutifs.
taxonomie: description d’organisme
- decrire et nommer de nouvelle espèce
- distinguer des espèce entre elle
- création d’outil d’identification
Qu’est-ce qu’un caractère biochimique ?
Un caractère biochimique est un attribut basé sur la structure des molécules, comme les protéines et les acides nucléiques, utilisé pour la classification des espèces.
Les études génétiques a besoin de morphologique
Les différences génétiques entre populations peuvent être difficiles à interpréter, en particulier lorsqu’il y a:
- deux individu différent mais forme hybride donc même génome
- trop d’hybride mélange le génome, faut se fixer au longueur d’aile
- génme différent mais même modification de l’os donc proche parent
Qu’est-ce qu’une espèce en biologie ?
Une espèce est un groupe d’organismes interféconds qui peuvent se reproduire entre eux, mais pas avec ceux d’une autre espèce.
Quelle est la différence entre les protéines à évolution rapide et lente ?
Les protéines à évolution rapide sont utiles pour les phylogénies récentes, tandis que celles à évolution lente sont mieux pour les phylogénies anciennes.
Qu’est-ce que le cytochrome c et pourquoi est-il important ?
Le cytochrome c est une protéine qui est couramment utilisée dans les études phylogénétiques pour établir les relations entre les espèces.
taxonomie: classification des taxon
- reconstitution des relation evolutive
- construction d’arbre phylogénétique
- c’est pas une espèce, c’est le nom pour un animal d’un certain niveau hiearchique
etape analyse cladistique
- délimiter un groupe d’interet
- definir le groupe de référence
- derterminer toute les combinaison d’arbre phylogénétique possible
- choisir des caractère utiliser et identifier des etat ancestraux ou derivé, dérivé donne 1 point car c’est un nouveau changemnt apporter
- matrice, pour chaque dérivé donner un point a l’animal si il l’a
- compter el nombre d’étape (pas) necessaire pour arrivé a l’arbre final.
- selectionné l’arbre
- calculer le nombre de tranformation (nombre de pas)
- chaque branche a 1 pas
- l’arbre le plus économique est le meilleur
classification cladistique, principe
La classification est basée sur la proximité évolutive. deux taxon sont apparenté par le noeud (innovation spécifique de l’ancêtre qui le sépare des autre). le moins de changemnt possible. innovation conserve des traces on peut donc déduire car rien apparait par magie. toumours en groupe monophylétique (contient les descendant, pas oublier personne de plus haut).
Qu’est-ce que l’ADN mitochondrial ?
L’ADN mitochondrial est une petite molécule d’ADN contenue dans les mitochondries, héritée uniquement de la mère, utilisée pour étudier la phylogénie des espèces. transmit au jeune mais peut muté
Quel est l’avantage des données moléculaires ?
Les données moléculaires offrent une résolution fine dans les relations phylogénétiques, et permettent d’examiner des caractères indépendants de l’évolution morphologique.
Qu’est-ce qu’un anneau d’espèces ?
Un anneau d’espèces est une série de populations géographiquement interconnectées, où les formes extrêmes ne peuvent pas se reproduire là où elles se chevauchent.
Qu’est-ce que l’électrophorèse ?
C’est une méthode qui permet de séparer des protéines ou des acides nucléiques en fonction de leur taille et de leur charge électrique.
classification phénétique, principe
La comparaison d’un grand nombre de caractères (ressemblance) doit
refléter l’évolution et la
phylogénie. permet d’agréger un
grand nombre de mesures en un indice global de similarité phénétique. classe seulement le look pas l’évolution:
- Forme des os des fossiles
* Patron des nervures des ailes des diptères
* Couleur du plumage
* Longueurs morphologiques
* Nombre et forme des chromosomes
* Séquence des nucléotides de l’ADN
Quel est le rôle de la comparaison des séquences génétiques ?
Elle permet de déterminer les relations phylogénétiques entre les espèces en observant les différences ou similarités dans leurs génomes.
Propriétés des données moléculaires
1) grande quantité d’informations
disponibles.
2) Caractères simples à analyser. ADN= 4
choix possibles (A,C,G,T). Acides aminés= 20
possibilités.
3) Indépendance des caractères. Mutations de l’ADN indépendantes. Chaque site peut évoluer
indépendamment des autres.
4) Poids égal entre les caractères. Mutation d’un nucléotide a le même poids peu importe le site où
il se produit. Impossible pour les caractères
morphologiques, mutation de poil est moins important que la tête.
taxonomie: rechercher fondamentale et appliquée
- conservation de la biodiversité
- science citoyenne et participative
Qu’est-ce que l’inflation taxonomique ?
L’inflation taxonomique fait référence à la prolifération excessive de sous-espèces et de variétés, rendant la classification plus complexe et moins précise.
polymorphisme trophique
même habitat, même espèce mais deux comportemtn différent, mange différent, reproduit différente date. début de nouvelle espèce
Qu’est-ce qu’un caractère taxonomique ?
C’est un attribut quelconque d’un membre d’un taxon par lequel il diffère ou pourrait différer d’un membre d’un taxon différent.
Qu’est-ce que l’espèce écologique ?
C’est un groupe d’organismes adaptés à une niche écologique particulière, souvent causée par des pressions externes comme la compétition.
Donne un exemple de problème causé par un nom vernaculaire.
- “Mulot” désigne plusieurs espèces de campagnols et autres petits mammifères, ce qui est imprécis.
taxonomie évolutive, principe
la cladistique peut amener des
classifications déroutantes parce que contraires à une
perception intuitive de la nature. perception adaptative. mélange de cladistique et phénétique.
Éviter les conclusions inattendues de la cladistique
* Éviter le «puritanisme» des cladisticiens purs et durs
* Parfait pour la communication scientifique et la
vulgarisation
Qu’est-ce qu’un gène d’ARN ribosomal ?
C’est un gène présent dans toutes les espèces et souvent utilisé pour les études phylogénétiques, car il est conservé à travers les évolutions.
Qu’est-ce que l’hybridation ADN-ADN permet de comparer ?
Elle permet de comparer les séquences d’ADN entre différentes espèces pour observer les similitudes ou différences.
Quelle est la différence entre un nom vernaculaire et un nom scientifique ?
- Le nom vernaculaire est le nom commun utilisé par le public.
- Le nom scientifique est standardisé et reconnu internationalement.
Qu’est-ce qu’un holotype ?
Un holotype est le spécimen de référence utilisé pour définir une nouvelle espèce. Il est généralement déposé dans un musée ou une collection scientifique.
caractère écologique
- niche écologique
- regime alimentaire
- mode de reproduction
Qu’est-ce que l’espèce par reconnaissance mutuelle ?
C’est un concept où les individus de l’espèce reconnaissent leurs partenaires sexuels pour la reproduction. Cela peut inclure des comportements comme le chant.
taxonomie
decrire les organismes vivant et de les regrouper en entité appelé taxon, les classer et de les reconnaitre via des clé de determination dichotomique. Ça complète le systématique, le science qui organise le classemnt des taxon et leur relation.
Que sont les mécanismes d’isolement reproductif ?
Les mécanismes incluent l’isolement mécanique, la létalité des hybrides et l’isolement éthologique.
règle des clé d’identification (5)
- pas universelle, fonctionne pas pour tous les taxon, contexte defini
- pas de limite au nombre de taxon
- suit l’ordre numérique de la clé a partir du num 1
- critère dichotomique, decrit deux possibilité
- ne reflète pas la classification des organisme ni leur relation évolutive
- vocubulaire peut être adapté a la clientèle
- ne doit pas parler de morphologie interne qu’on voit pas sur le terrain avec des jumelles
Quel est un exemple de sous-espèce chez les animaux ?
Les sous-espèces de la souris sylvestre, isolées par des montagnes ou des îles, illustrent l’isolement et l’évolution parallèle.
Quelle est la troisième étape de validation d’un nom d’espèce ?
- Validation du nom scientifique dans des bases de données spécialisées selon le groupe taxonomique.
Pourquoi les données moléculaires sont-elles parfois préférées aux données morphologiques ?
Les données moléculaires, comme l’ADN, permettent une analyse plus précise, une indépendance des caractères et une évolution plus rapide pour certaines périodes.
Qu’est-ce que l’espèce phénétique ?
C’est un ensemble d’organismes suffisamment similaires entre eux et différents des autres espèces, basé sur la comparaison de caractères phénétiques.
Comment les nouveaux noms d’espèces sont-ils choisis ?
Les nouveaux noms d’espèces suivent des règles précises de nomenclature, souvent en utilisant des noms latins et en décrivant les caractéristiques distinctives de l’espèce. le nom peut changer suite a l’approbation des ornithologue, commission de faune et congrès ornithologique international
résumé cladistique
- Utilisation d’un faible nombre de caractères très signifiants d’un
point de vue évolutif - Les caractères doivent permettre de retracer l’évolution d’une
structure à partir d’un design de base - observation et déduction des transformations, souvent à
partir de données fragmentaires - On considère seulement les groupes monophylétiques et on fuit les
convergences évolutives
Quels sont les défis des données moléculaires ?
Les défis incluent la sélection de molécules appropriées, l’évolution des molécules à des vitesses différentes, et les problèmes de recombinaison génétique.
Que signifie la spéciation rapide ?
La spéciation rapide fait référence à la formation rapide de nouvelles espèces, souvent observée dans des environnements changeants ou isolés.
Quelles sont les grandes familles de caractères en taxonomie ?
1) Caractères morphologiques (anatomie) 2) Caractères écologiques (niche) 3) Caractères biochimiques et moléculaires (ADN)
Pourquoi l’analyse des séquences d’ADN est-elle importante ?
L’analyse des séquences d’ADN permet de mieux comprendre les différences génétiques entre les espèces et de résoudre les questions taxonomiques complexes.
résumer phénétique
- Utilisation d’un très grand nombre de caractères de sources variées
- On ne se soucie pas de la signification évolutive des caractères
- Méthode: On applique un simple traitement statistique à l’ensemble des données
- On ne se soucie pas des convergences et des groupes
paraphylétiques - Principe: «on utilise tellement de données que ça finit par refléter
l’évolution!»
si le nom ne respecte pas les règle de Nomenclature
Les cas litigieux sont rapportés à ICZN qui doit statuer, mais 3 étapes doivent être respectées
1. Soumission du cas: Le cas est soumis publiquement.
2. Phase de commentaire: Les spécialistes sont invités à se prononcer, à donner leur commentaire sur le cas sous forme de «lettre ouverte».
3. Phase de l’opinion: Un verdict est émis par ICZN, en
considérant les recommandations des spécialistes.
Qu’est-ce que la mutation génétique ?
La mutation génétique est un changement dans la séquence de l’ADN, qui peut être utilisée pour étudier l’évolution des espèces.
Qu’est-ce que la nomenclature binomiale ?
La nomenclature binomiale consiste à attribuer à chaque espèce un nom scientifique composé de deux parties : le genre et l’espèce, comme dans Homo sapiens.
Qu’est-ce que la distance immunologique en biochimie ?
C’est une méthode ancienne permettant de comparer la similarité entre les protéines de deux espèces, basée sur leur réaction immunologique.
Quelle est la première étape pour valider un nom d’espèce ?
- Consultation des guides d’identification.
- Recherche rapide sur internet pour des cas simples.
étape classment phénétique
Construction d’une matrice de distance:
pourcentage de différences entre les taxons
1: on détermine quelle combinaison de deux taxons montre le moins de différences (humain et chien)
2. regrouper ces deux espèce et comparer a d’autre (humain vs oiseau + chien vs oiseau / 2 et vs poisson)
3. l’animal le plus petit nombre face au groupe 1 a un ancêtre commun avec le groupe 1
4. continue calcul
Quelle est la deuxième étape de validation d’un nom d’espèce ?
- Validation du nom français dans la Liste de la Faune Vertébrée du Québec.
Que signifie l’application du principe de priorité en nomenclature ?
Le principe de priorité signifie qu’en cas de conflit sur un nom scientifique, le nom le plus ancien a priorité.
principale problème: Plusieurs espèces sont désignées sous un
seul nom
Plusieurs auteurs ont nommé différemment la même espèce
Qu’est-ce qu’un synapside fossile ?
C’est un fossile d’un groupe d’animaux dont les mammifères sont les descendants, caractérisés par un certain type d’articulation de la mandibule.
Qu’est-ce qu’une sous-espèce ?
Une sous-espèce est un groupe isolé d’individus d’une espèce principale qui évolue parallèlement, souvent en raison de facteurs écologiques ou géographiques.
Carl von Linné
- nomenclature binomiale
- niveau hiérarchique (regne, embranchement, classe, ordre,famille, genre, espèce): groupe subordonné a d’autre groupe, classification naturelle dans la nature, ordre naturel influencé par l’équilibre
Quels sont les exemples de caractères morphologiques ?
tous qualitatif. présence de queue, aile ou la grosseur des yeux
Pourquoi est-il important de respecter les règles de nomenclature ?
Les règles de nomenclature assurent la stabilité des noms scientifiques et évitent la confusion en cas de découvertes taxonomiques multiples.
Pourquoi les biologistes doivent-ils valider les noms d’espèces ?
- Changements fréquents des noms pour des raisons scientifiques.
- Guides d’identification parfois désuets.
- Différences dans l’utilisation des noms vernaculaires.
- Variabilité des régionalismes et des niveaux de langage.
Qu’est-ce qu’une taxonomie moléculaire ?
C’est l’étude des relations évolutives entre les espèces basées sur des données moléculaires, comme l’ADN, l’ARN ou les protéines.
choix d’un caractère
justification nécessaire.
Dépend de l’information qu’il procure versus sa
capacité de résolution ou sa signification
évolutive. choisir entre deux nom, cladistique ou phénétique
Que signifie sp. nov. dans le nom scientifique ?
Sp. nov. signifie ‘nouvelle espèce’ et est utilisé pour indiquer qu’une espèce est nouvellement décrite.
Quel est l’objectif des études de phylogénie ?
L’objectif est de déterminer l’histoire évolutive des espèces et de comprendre leurs relations à travers le temps.
Quels sont les différents concepts d’espèce ?
1) Espèce phénétique
2) Espèce biologique
3) Espèce par reconnaissance mutuelle
4) Espèce écologique
Qu’est-ce qu’un gène de l’ADN nucléaire et mitochondial ?
Un gène de l’ADN nucléaire est situé dans le noyau cellulaire et est utilisé pour les phylogénies à long terme, car il évolue lentement. le mitochondrie evolue plus vite
Qu’est-ce que l’espèce biologique ?
L’espèce biologique regroupe des organismes interféconds, c’est-à-dire qu’ils peuvent se reproduire entre eux, mais pas avec des membres d’autres espèces.
Pourquoi est-il important d’identifier correctement les espèces et sous-espèces ?
Pour l’application des lois, la conservation et la recherche scientifique.
Quelles sont les conséquences des problèmes taxonomiques ?
Ils peuvent entraîner des difficultés d’application des lois et de protection des espèces.
Quel est le rôle de la définition juridique d’une espèce ?
Donner un cadre légal clair pour protéger les espèces, incluant sous-espèces, populations isolées, races ou variétés.
Selon la Loi sur les espèces menacées ou vulnérables, que signifie le terme ‘espèce’ ?
Il inclut sous-espèces, populations isolées, races ou variétés animales ou végétales.
Donner un exemple de statut légal influencé par la taxonomie.
Loi sur les espèces en péril au Canada ou l’Endangered Species Act aux États-Unis.
Quelles unités biologiques sont jugées irremplaçables ?
Celles montrant des différences taxonomiques, une différenciation génétique ou des adaptations locales.
Quelles sont les catégories de statut de la L.E.P ?
Non en péril, Préoccupante, Menacée, En voie de disparition, Disparue.
Donne un exemple d’espèce avec des statuts différents selon la population.
La Paruline polyglotte : Non en péril dans les prairies, en voie de disparition en Colombie-Britannique et en Ontario.
Quelles justifications expliquent le statut de la Paruline polyglotte en Colombie-Britannique ?
Petite population en déclin à cause de la perte d’habitat.
Quel est l’objectif de la Loi sur les espèces en péril ?
Empêcher la disparition des espèces indigènes, rétablir et gérer les espèces pour éviter qu’elles deviennent en péril.
Donner un objectif du plan de gestion de la Paruline polyglotte.
Maintenir l’effectif actuel de la sous-espèce virens au Canada.
Cite une méthode recommandée pour gérer l’habitat de la Paruline polyglotte.
Créer des parcelles de 4 ha ou plus par brûlage dirigé ou déboisement mécanique.
Que prévoit la Loi sur les espèces menacées ou vulnérables en termes de gestion ?
Établir des programmes de protection des habitats et de rétablissement des habitats détériorés.
Cite un exemple d’amphibien menacé selon la loi québécoise.
La salamandre sombre des montagnes.
Quel est l’objectif de la conservation de la biodiversité ?
Maintenir un maximum d’espèces ou prioriser les espèces uniques ou très isolées phylogénétiquement.
Raconte l’histoire de Tibbles le chat de Stephen’s Island.
Tibbles a causé l’extinction de Traversia lyalli, démontrant l’impact des espèces introduites.
Quels critères entrent dans l’analyse multicritère de priorisation ?
Bénéfice, unicité taxonomique, coût, et probabilité de succès.
Quelle formule utilise-t-on pour l’analyse de priorisation en conservation ?
Efficacité = (Bénéfice x Unicité taxonomique x Probabilité de succès) / Coût.
Pourquoi faut-il corriger les comparaisons statistiques entre espèces ?
Parce que les espèces apparentées ne sont pas des unités indépendantes.
Donne un exemple de recherche comparée nécessitant une correction phylogénétique.
Étude sur la capacité de réabsorption d’eau par les reins chez les rongeurs du désert.
