Final Flashcards
Caractéristiques des vivants
o Hautement organisés
o Organisés en cellules
o Métabolisme énergétique
o Réagissent aux stimuli
o Développent de nouvelles structures
o Reproduction d’organismes vivants similaires
o Transmission de l’info génétique
o Pouvoir d’évolution et d’adaptation
Rôle des ponts hydrogène entre les molécules d’eau
o Cohésion et tension superficielle élevée
o Haute chaleur spécifique (pour augmenter la température, donc stabilisation) et de vaporisation (sueur)
o Densité maximale à 4˚C (vie possible sous la glace)
o Adhérence (contre la gravité)
o Solvant universel (ions et molécules polaires)
Caractéristiques de l’eau
o T˚ d’ébullition : 100˚C
o Polarité et électronégativité inégale
o Constituant le plus abondant (milieu nécessaire réactions, substance de base, moyen de transport)
o Diffusion rapide par osmose
o Chimiquement impliquée
o Transparente à la lumière et aux UV, mais opaque aux IR
Monosaccharides
une unité de saccharide (CH2O)n
o Glucides pentoses : 5 carbones (ribose et désoxyribose)
o Glucides hexoses : 6 carbones (glucose, fructose et galactose)
Groupements fonctionnels - glucides
o Aldoses : un carbone porte une fonction aldéhyde (H-C=O au bout), les autres portent une fonction alcool : glucose, ribose
o Cétoses : un carbone porte une fonction cétone (C=O pas au bout), les autres portent une fonction alcool : fructose, désoxyribose
Glucose
sucre de l’organisme, source d’énergie (production d’ATP)
Fructose
fruits, transformation en glucose (foie et intestin)
Galactose
transformé en glucose dans le foie, synthèse du lactose maternel
Ribose
élément de la structure de l’ARN et des coenzymes
Lactose
galactose + glucose (animal), lait, hydrolysé pendant la digestion
Maltose
glucose + glucose (végétal), malt et céréales, hydrolysé par une enzyme salivaire
Saccharose
glucose + fructose (végétal) : canne et betterave à sucre, hydrolysé par la saccharase intestinale
Amidon
source de réserve de glucides (chaînes de glucose) chez les végétaux, amylase animale l’hydrolyse
Cellulose
polymère de glucose, principale substance de soutien des parois cellulaires des plantes (fibres alimentaires), humains incapables de digérer directement
Glycogène
polymère de glucose animal, retrouvé dans le foie (réserve générale) et les muscles (réserve locale), hydrolysé par les amylases pancréatiques
Peptidoglycanes
paroi bactérienne, chaînes polysaccharidiques unies par des chaînes polypeptidiques
Chitine
carapace des invertébrés
Liaison glycosidique
liaison covalente entre deux monosaccharides formée quand OH d’un sucre réagit avec le carbone du carbonyle de l’autre sucre (perte de molécule d’eau déshydratation/condensation). Elle peut être rompue par une réaction hydrolytique (addition de molécules d’eau).
Composition chimique des polysaccharides
chaînes longues et complexes d’au moins sept saccharides (homo : un seul type de monomère; hétéro : plusieurs types)
Hydrolyse - glucides
pour cataboliser les sucres : dégradation en molécules séparées grâce à un ajout d’une molécule d’eau par liaison glycosidique
Condensation (déshydratation)
pour anaboliser les sucres : synthèse en une seule molécule grâce au retrait d’une molécule d’eau par liaison glycosidique
Relation entre glucose et galactose
isomères de structure
Respiration cellulaire
C6H12O6 + O2 –> H2O + CO2
Photosynthèse
H2O + CO2 –> C6H12O6 + O2
Caractéristiques chimiques des lipides
acides gras (hydrophobe), graisseux ou huileux (apolaires ou peu polaires), insolubles dans l’eau, mais soluble dans les solvants organiques non polaires. Majorité sont les trialcyglycérols (et cholestérol et phospholipides)
Acides gras
longue chaîne carbonée hydrophobe et extrémité hydrophile carboxylique (COOH)
Acides gras saturés
pas de double liaison, solides à T˚ normale
Acides gras monoinsaturés
une double liaison
Acides gras polyinsaturés
plusieurs liaisons doubles, liquides huileux à T˚ ambiante
Trialcyglycérols
ester de glycérol et 3 acides gras (2 saturés, 1 insaturé donc recourbé), 3 liaisons ester entre chaque acide gras et le glycérol
Glycérol
trialcool à 3 atomes de carbone
Phosphoglycérolipides
phospholipide qui contient 2 acides gras et 1 acide phosphorique (amine + phosphore) qui estérifient le glycérol, tête hydrophile et queue hydrophobe (deux pattes: une recourbée, insaturation)
Stéroïdes
cycle stéroïdien non polaire hydrophobe et une petite partie en bas polaire hydrophile (OH)
Rôle - trialcyglycérol
réserves énergétiques adipeuses et isolant thermique
Rôle phosphoglycérique
membranes biologiques
Rôle cholestérol
lipoprotéines plasmatiques, membranes cellulaires, précurseur acides biliaires et hormones (cortisol, testostérone)
Rôle acides gras
énergie
Acides gras essentiels : proviennent uniquement de l’alimentation
Acides gras non essentiels : synthétisés par les cellules
Formation des triacylglycérols
glycérol + 3 acides gras – 3 molécules d’eau (estérification). Contraire : hydrolyse enzymatique (triglycéride + 3 H2O 3 acides gras + glycérol)
Lipides produits par les organismes
insaturés en majorité produits par les plantes (huiles végétales, sauf coco et palme), saturés en majorité produite par les animaux (graisses)
Lipides stéroïdiens
Le cholestérol, le cortisol et les hormones sexuelles
Structure de la membrane cellulaire
double couche de phosphoglycérolipides (têtes à l’extérieur), glycolipides et cholestérol imbriqués.
Composition et organisation moléculaire de base de la membrane plasmique
o Bicouche lipidique de phospholipides avec la tête à l’extérieur
o Cholestérol chez les eucaryotes imbriqué dans les feuillets
o Protéines membranaires périphériques (surface) et intégrées (intrinsèques)
o Glucides membranaires (glycolipides et glycoprotéines) en surface
Diagramme de la structure des membranes
la bicouche phospholipidique, le cholestérol (petites molécules à l’intérieur des couches), les glycoprotéines (tête + queue), les phospholipides (tête + queue qui forment la bicouche) et protéines intégrées et périphériques (hélices)
Mécanisme moléculaire et dynamique cellulaire de l’osmose
milieu isotonique (concentration du milieu égale à la concentration intracellulaire) et milieu hypertonique (concentration dans le milieu supérieure à la concentration intracellulaire donc osmose)
Transport actif
contre le gradient de concentration (demande de l’énergie ATP), pompe
acides aminés, sucres et Na+
Transport passif
dans le même sens que le gradient de concentration, petites particules liposolubles
o Diffusion simple : membrane perméable
o Diffusion facilitée : canal ou perméase facilite la diffusion
Transport en vrac
Endocytose : formation d’une vacuole, absorption, ATP
Phagocytose : pénétration de substances solides
Pinocytose : pénétration de substances dissoutes (eau)
Exocytose : transport vers l’extérieur par vacuole (Golgi et sécrétion cellulaire)
Lysosome
contient des enzymes qui digèrent les intrus ingérés par les cellules phagocytes.
Acide aminé
groupement aminé (NH2) et groupement carboxyle (COOH) sur le même carbone (chaîne radicale qui varie)
Liaison peptidique
covalente entre le groupement carboxyle (1er) et le groupement aminé (du 2e) de deux acides aminés par libération d’une molécule d’eau (condensation, formation des protéines). L’hydrolyse, grâce à la peptidase, est la réaction inverse qui, contrairement à la dénaturation (qui garde la liaison et ouvre la molécule), coupe la liaison peptidique. 100 acides aminés = 99 liaisons peptidiques.
Grandes catégories de fonction des protéines
transport (hémoglobine), enzyme (amylase, catalase, lactase), antigène (anticorps)
Interactions chimiques protéines primaires
Liaisons peptidiques intra (entre acides aminés), succession d’acides aminés
Interactions chimiques protéines secondaires
Ponts H entre acides aminés (carboxyle – H), premier niveau de repliement de la chaîne polypeptidique, hélices et feuillets
Interactions chimiques protéines tertiaires
Liaisons non-covalentes (ponts H, liaisons ioniques, VDW, ponts disulfure, liaisons hydrophobes, hydrophiles) plusieurs structures secondaires, forme propre et surface extérieure caractéristiques, propriétés biologiques (possibilité de dénaturation) (myoglobine)
Interactions chimiques protéines quaternaires
Association de sous-unités protéiques par des liaisons non covalentes pour former la protéine (hémoglobine, catalase)
Changement d’un seul acide aminé
suffit à changer la nature d’une protéine.
Repliement tertiaire : site de reconnaissance/liaison, géré par les interactions intermoléculaires entre radicaux.
Interactions ioniques différentes si molécule différente –> repliement différent –> effet sur l’identité de la protéine (hémoglobine : glutamate –> valine : une mauvaise sous-unité, incapable de reconnaître –> anémie falciforme)
change site actif donc fonction: mutation silencieuse
Dénaturation d’une protéine
dénaturer (pH, température, etc.), c’est ouvrir la molécule, perturber les interactions intermoléculaires. Altération structurale (2e-3e) qui modifie ses propriétés originelles
Facteurs dénaturants protéines
température élevée (sites actifs), pH (affecter les propriétés ioniques du substrat et de l’enzyme et sa conformation)
Spécificité d’action des protéines
site actif doit se lier à un substrat spécifique en raison de leurs formes géométriques complémentaires (clef-serrure), amidon et amylase (pas de dénaturation si différente enzyme)
Enzyme
catalyseur pour les réactions chimiques biologiques, protéine qui accélère la vitesse de réaction et se retrouve intacte une fois celle-ci terminée
Énergie d’activation
énergie requise pour que la réaction ait lieu
Activité enzymatique
quantifiée en mesurant la vitesse de la réaction
Substrat
molécule qui subit la réaction déclenchée par l’enzyme
Produit
molécule obtenue suite à la réaction