Fermentai

Question 1

Kokios grupės medžiagos, priskiriamos prie fermentų, nėra baltymai?

Answer 1

Katalizinė RNR

Question 2

Nuo ko priklauso fermentų katalizinis aktyvumas?

Answer 2

Nuo baltymo konformacijos. Visos 4 baltymų strūktūros yra labai svarbios fermentų kataliziniam aktyvumui.

Question 3

Kokia yra kofermentų funkcija?

Answer 3

Pernešti specifines funkcines grupes.

Question 4

Kas yra prostetinė grupė?

Answer 4

Kofermentas arba Me jonas, kuris yra kovalentiškai arba stipriai surištas su fermento baltymu.

Question 5

Kas yra halofermentas (haloenzimas)?

Answer 5

Katalitiškai aktyvus fermentas, kartu suriškas su kofermentu ar metalo jonais.

Question 6

Kas yra vadinama apoproteinu/apofermentu?

Answer 6

Haloenzimo baltyminė dalis.

Question 7

Kokia yra pagrindinė termodinaminė sąvoka, biocheminių reakcijų termodinamikos kontenkste?

Answer 7

Laisvoji (Gibso) energija

Question 8

Ką svarbu žinoti apie termodinaminį fermentų aktyvumą?

Answer 8

Kad fermentai nepaveikia pusiausvyros, bet keičia reakcijos greitį (didina jį).

Question 9

Kas yra fermento perėjimo būsena?

Answer 9

Tai yra fazė/etapas, kuomet gali vykti ryšių nutraukimas, suformavimas, krūvio pasikeitimas ir kuriame gali vykti tiek reakcijos grįžimas į substratą, tiek tolimesnė reakcija iki produkto.

Question 10

Koks yra skirtumas tarp reakcijos pradinės (ground state) ir perėjimo būsenos?

Answer 10

Aktyvacijos energija deltaG

Question 11

Kaip fermentai geba mažinti aktyvacijos energijas ir greitinti reakcijas?

Answer 11

Per kovalentinius ir nekovalentinius ryšius, kurie formuojasi fermento-substrato komplekse aktyviajame centre.

Question 12

Kas yra vadinama rišimo (binding) energija deltaGb?

Answer 12

Tai energija, gauta iš fermento-substrato komplekso sąveikos.
Rišimo energija yra didelis šaltinis laisvos energijos, naudojamos fermentų mažinti reakcijų aktyvacijos energiją.

Question 13

Ar fermentas komplementarus substratui ar reakcijos perėjimo būsenai?

Answer 13

perėjimo būsenai.

Question 14

Kokia yra fermentinės katalizės varomoji jėga?

Answer 14

Silpnos surišimo jėgos tarp fermento ir substrato.

Question 15

Kas suteikia fermentui specifiškumo?

Answer 15

Rišimo energija.

Question 16

Nuo ko priklauso fermentinių reakcijų greitis?

Answer 16

Nuo pH, temperatūros, aktyviklų, inhibitorių, koncentracijų.

Question 17

kada fermentinės reakcijos greičio priklausomybė nuo substrato koncentracijos yra tiesinė?

Answer 17

kai substrato koncentracija yra maža.

Question 18

Kodėl kintant pH keičiasi fermentinės reakcijos greitis?

Answer 18

Dėl baltymo molekulėje esančių polinių aminorūgščių šoninių grupių, kurių jonizacija priklauso nuo pH. Jos sudaro aktyvujį centrą, palaiko tretinę struktūrą.

Question 19

Kokia stadija yra reakcijos greitį ribojanti stadija?

Answer 19

ES komplekso skilimas į E ir S.

Question 20

Nuo ko nepriklauso reakcijos greitis?

Answer 20

nuo substrato koncentracijos.

Question 21

kas rūgštinės - bazinės katalizės metu didina reakcijos greitį?

Answer 21

protonų pernaša

Question 22

Apibūdinti elektrofilinę katalizę

Answer 22

fermento centro amino rūgščių šoninės grupės atakuoja elektrofilinius substrato centrus, susidaro tarpinis kovalentinis ES junginys, kuris vėliau atakuojamas H2O molekulės ir susidaro galutinis produktas.