Fehérjék Flashcards
A fehérjék szerkezete
Apoláris aminosavak
Poláris aminosavak
Aromás aminosavak
Pozitív töltésű aminosavak
Negatív töltésű aminosavak
Peptidkötés
Szekunder savamidkötés
- planáris, merev szerkezet (a karbonilcsoport pí elektronjai, és az oxigén nemkötő elektronpárjai delokalizálódnak)
- 120 fok
- nincsen forgás ( de 2 peptidkötés 2 szigmakötése között lehetséges )
- transz-konformáció ( kivétel a prolin, mely cisz-transz is lehet)
Ramachadran-diagram
Peptidkötésnél a szigma kötések mentén létrejövő szöglárok nem vehetnek fel akármilyen értékeket, ez térbeli gátláshoz vezetne.
A fehérjék másodlagos szerkezeti elemei
Fehérjedomének
A másodlagos szerkezeti elemeknél nagyobb, de a teljes polipeptidlánc által alkotott szerkezetnél kisebb fehérjeszerkezeti egységek.
Harmadlagos szerkezet
Vizes közeg határozza meg, melynek hatására a fehérje globuláris szerkezetet vesz fel.
A fehérjék szerkezetét stabilizáló erők
- Hidrofób
- Van der Waals
- hidrogénhíd ( inkabb molekulán belüli a fontos)
- sókötés
- diszulfidhíd (= kovalens kötés 2 cisztein SH-csoportja között)
A fehérjék denaturációja
REVERZIBILIS
- kisózás
- oldószercsere
IRREVERZIBILIS
- hő
- extrém pH
- urea, guanidin, kaotróp ionok
- detergensek
A fehérjeszerkezet kialakulása
- Alfa-hélix, Béta-redő
- hidrofób kollapszus (= Levinthal paradoxon)
- köztitermék, olvadt gombóc ( masodlagos szerkezete kb kialakult, harmadlagos fluktuál, tartalmaz külső hidrofób részeket, aggregációra hajlamos)
- natív fehérje ( záró lépések: diszulfidhidak, sókötések, prolin cisz-transz izomerizációja)
Anfinsen kísérlet