F8 site actif régulation allostérie Flashcards

1
Q

rôle du site actif (2)

A

fixation du substrat et transformation en produit

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

fixation au niveau de

A

site de liaison

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

transformation au niveau de

A

site catalytique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

proximité physique résidu AA grace au

A

repliement de la protéine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

deux modèle de fixation au substrat :

A

modele clef serrure, parfaite complémentarité

ajustement induit, changement de conformation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

méthode de caractérisation

A

méthode indirect, enzymatique
méthode physique
mutagénèse dirigé

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

méthode de caractérisation enzymatique

A

etude pH,
utilisation inhibiteur réversible compétitif ou non
utilisation inhibiteur irréversible
obtention complexe ES stable

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

méthode de caractérisation physique

A
résolution structure 3D, cristallographie et diffraction X
intéraction protéine ligand
ITC dégagement chaleur
SPR variation indince réfraction
échange H/D variation rapport mz
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

méthode de caractérisation mutagénèse

A

mutation résidu intérêt et ciloarausin oaralètre catalytique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

marquage d’affinité 2 puis vérif 3

A
utilisation réactif spécifique de groupe
utilisation analogue de substrat
vérif efficacité marqueur
vérif spécificité du marqueur
vérif spécificité du marquage pour enzyme
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

mécanisme catalytique 4

A

catalyse acide base : protonation et déprotonation, influ sur le pH optimum
catalyse covalente, formation intermédiaire covalent
catalyse métallique, ion métallique
catalyse électrostatique, stabilisation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

régulation enzymatique 3 méthode

A

régulation à quantité constante d’enzyme
régulation de la quantité d’enzyme
une enzyme peut etre soumis au deux

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

régulation à quantité constante d’enzyme

A

rapide, fine, peu économique
modalité par le taux de produit et de substrat, par un changement conformationnel allostérie, par modification covalente, par une protéine régulatrice, par compartimentation de la cell

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

régulation de la quantité d’enzyme

A

par régulation de la synthèse d’E

par formation de proenzyme = zymogène

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

régulation par le taux de produit

A

rétroinhibition = rétrocontrole négatif, enzyme ralentit son activité

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

régulation par le taux de substrat

A

v dépend de S, si S augmente, réaction S->P favorisé

17
Q

régulation allostérique

A

une E allostérique peut fixer plusieur ligand, effecteur allostérique différend du S et du P se fixe sur un site régulateur,
activateur allostérique, favorise réa
inhibiteur allostérique, défavorise

18
Q

propriété coopérative d’E allostérique

A

courbe v=f([ligand])
homotrope et hétérotrope
preuve

19
Q

courbe v=f(ligand) propriété

A

coopérative courbe sigmoide

non coopérative courbe hyperbolique

20
Q

effet homotrope et hétérotrope propriété

A

homotrope positif, coopérativité, fixation ligand favorise sa fixation
hétérotrope positif favorise fixation autre ligand
hétérotrope négatif défavorise fixation autre ligand

21
Q

preuve d’allostérie propriété

A

enzyme allostérique a au moins une courbe v=f(ligand) sigmoide

22
Q

postulat d’isomérie T/R

A

forme T=tendu : peu active

forme R=relaché : active

23
Q

postulat de symétrie

A

enzyme allostérique est généralement oligomérique, les protomères sont arrangé de manière symétrique

24
Q

postulat de conservation de symétrie

A

tout les protomère subisse en meme temps le passage d’un état conformationnel à un autre

25
Q

activateur allostérique

A

effet hétérotrope positif = diminution K1/2 = augmentation affinité E S

26
Q

inhibiteur allostérique

A

effet hétérotrope négatif = augmentation K1/2 = diminution affinité E S