Examen Intra (Cours 1-6) Flashcards
1
Q
vrai ou faux:
Les streptocoques sont des coccis enchaînées les unes après les autres
A
vrai
2
Q
Vrai ou faux:
les cocobacilles sont un hybrides entre les coccis et les bacilles
A
vrai
3
Q
quelle est la caractéristique principale des vibrions au niveau de leur forme?
A
forme typique est en virgule
4
Q
vrai ou faux:
les spirochètes se déplacent grâce à leurs flagelles?
A
faux, c’est le mouvement des filaments axiaux qui permet au corps de se déplacer tout en tortillant
5
Q
associez les bactéries et leurs pathologies associées: 1- vibrio cholera 2- streptococcus agalactie 3 - staphylococcus aureus 4- rhodospirillum rubrum 5 - bacillus megaterium
a) fertilisant des sols
b) présent dans le microbiote, mais peut être dangereux dans certaines conditions comme chez les nouveaux-nés (pneumonie et méningite)
c) cause le choléra chez l’homme
d) infection de la peau
e) capable de fixer l’azote dans les molécules d’ammonium
A
1 - c 2 - b 3 - d 4 - e 5 - a
6
Q
Nommez moi les 6 structures principales trouvées à l’extérieur d’une cellule
A
1- flagelle 2- fimbriae 3- pili 4- capsule 5- membrane plasmide 6- paroi bactérienne
7
Q
Nommez les 4 principales structures trouvées à l’intérieur d’une cellule
A
1- chromosome
2- ribosome
3- plasmide
4- inclusions
8
Q
Suite à la coloration de Gram, de quelles couleurs sont les bactéries?
A
Gram+: violet
Gram-: rose
9
Q
Vrai ou faux:
il n’y a pas de différence entre la paroi des bactéries Gram+ et Gram-
A
faux
10
Q
La base de la paroi bactérienne est faite de quelle substance?
A
Peptidoglycane (protéine, sucre, NAM et NAG)
11
Q
quelle est la différence entre le NAM et le NAG?
A
l’attachement d’un groupement OH chez la NAM (ajout d’un acide lactique)
12
Q
Quel type de liaison est présent entre les chaînes de peptidoglycane?
A
ponts peptidiques
13
Q
Quelles sont les caractéristiques des Gram+ parmi celles-ci?
- paroi très épaisse
- membrane interne = membrane externe
- peptidoglycane très mince
- peptidoglycane est attaché à la membrane
- le peptidoglycane est entouré des deux côtés de la membrane
- présence d’acide lipoteichoïque et teichoïque
A
- paroi très épaisse
peptidoglycane est attaché à la membrane - présence d’acide lipoteichoïque et teichoïque
14
Q
à quoi servent les porines présentes dans la membrane des Gram-?
A
permettent aux molécules importantes de pénétrer la membrane
15
Q
Quels sont les composants de la membrane externe des Gram-?
A
LPS
portion lipidique (lipide A)
polysaccharide O
lipoprotéine de Braun
16
Q
Complétez la phrase:
Toutes les protéines retrouvées dans le peptidoglycane sont de forme “_” chez l’être humain
A
L
17
Q
Chez les Gram-, le lien peptidique est direct entre quelles molécules?
A
D-Ala et le DAP
18
Q
Chez les Gram+, le pont interpeptidique relie quelles molécules?
A
D-Ala et L-lys
19
Q
Quel est le mode d’action de la pénicilline?
A
Elle se lie physiquement à l’enzyme transcriptidase, ce qui l’empêche de faire son travail d’enzymes et de former les ponts peptidiques entre les différentes molécules de NAM
20
Q
Vrai ou faux:
les inclusions sont des dépôts de nutriments qui s’accumulent dans une bactérie sans qu’elle ne puisse les utiliser
A
Faux, elle peut les utiliser lorsqu’elle manque de nutriment (par exemple lorsque le milieu s’appauvrit)
21
Q
Qu’est-ce qu’un magnétosome?
A
composé d’oxyde de fer qui est présent chez les bactéries aquatiques. cela leur permet de s’attacher à des rochers et de trouver où elles se situent par rapport le centre de gravité de la Terre
22
Q
Quelles sont les fonctions du glycocalix?
A
adhérence extracellulaire
protection de la cellule
23
Q
Quelles sont les fonctions du LPS?
A
stabiliser la membrane externe
aide à l’attachement aux surfaces
fait une barrière, ce qui empêche l’entrée de certaines toxines
24
Q
Vrai ou faux
le rôle du fimbriae est de faire un pont de conjugaison
A
Faux, c’est le rôle d’un pili. Les fimbriae servent à l’adhérence
25
Quels sont les 4 types de flagelles qui existent?
péritriche
Lophotriche
Monotriche
amphitriche
26
Qu'est-ce qu'un biofilm?
C'est une communauté bactérienne formée d'un grand nombre de bactéries différentes
27
Quel est le matériel visqueux produit par le biofilm qui leur permet de s'accrocher aux surfaces?
Les EPS (extracellular polymeric substances)
28
```
Remettez dans l'ordre les étapes de formation d'un biofilm.
1- Expansion
2- différenciation
3- Attachement initial
4- Attachement irréversible
```
Attachement initial
Attachement irréversible
Expansion
Différenciation
29
Quels sont les deux types de rotations des flagelles et quel est le mouvement associé au deux types de rotations?
CCW (sens contraire aux aiguilles d'une montre): course
| CW (sens des aiguilles d'une montre): culbute
30
Dans quel cas les mouvements flagellaires sont-ils dirigés?
Quand il y a quelque chose d'attrayant ou de dangereux pour la bactérie
31
Quelles sont les trois parties principales d'un flagelle?
Crochet
Filament
Corpuscule basal (intégré dans la membrane de la bactérie)
32
Quels sont les différents anneaux qui composent le flagelle d'un Gram-?
Anneau S: supramembrane
Anneau C: cytoplasmique
Anneau M: membrane
Anneau P: peptidoglycane
33
Où sont situées les protéines MotA et MotB?
Dans le corps basal
34
Quel est le rôle des protéines MotA et MotB?
Elles permettent le passage des protons du cytoplasme au périplasme.
35
Comment Rhodobacter se déplace-t-il?
Quand il veut changer de direction, il s'arrête, roule son flagelle sans bouger. Il se laisse transporter par le liquide environnant pour par la suite dérouler son flagelle et se remettre à avancer
36
Qu'est-ce que la Twitching mobility?
C'est le seul cas dans lequel les pili sont impliqué pour le déplacement de la bactérie. Quand le pili est projeté à l'extérieur, il y polymérisation. Quand il rentre à l'intérieur, par dépolymérisation il tire la cellule avec lui.
37
Quel est le mode de déplacement de Myxococcus?
Il possède deux systèmes pour glisser.
Le système S rejette les pili à l'extérieur et le système A sécrète des polysaccharides, des protéines (substance visqueuse). Comme elle se dépose, elle pousse la bactérie vers l'avant qui se tire au même moment par ses pili
38
Pourquoi une molécule veut-elle se déplacer?
Besoin de nourriture
| Présence de molécules toxiques, alors elle veut s'enfuir
39
Quel type de molécule attire ou repousse les bactéries?
Des molécules chimiques
40
Quels sont les récepteurs qui permettent aux bactéries d'interagir avec ce qui les entoure?
Les MCP
| Protéines méthylables de chimotactisme
41
Vrai ou faux:
| Peu importe le milieu environnant, la méthylation des MCP est toujours la même.
Faux, cette méthylation est différente selon ce qui se passe à l'entour de la bactérie. CheR et CheB la régule.
42
Quel est le rôle de CheW?
Mettre en contact les MCP avec CheA
43
Quel est le rôle de CheA?
Phosphoryler CheY
44
Quel type de rotation est engendré par CheY?
Rotation dans le sens des aiguilles d'une montre, donc une culbute
45
Quel est le rôle de CheZ?
Déphosphoryler CheY (le désactive)
46
Quel est le rôle de CheB?
Déméthyler les MCP
47
Vrai ou faux:
| la méthylation de CheA n'est pas affectée par les molécules attirantes?
Vrai
48
Quelle est la définition de Quorum Sensing?
Régulation de l'expression génique en réponse à la fluctuation de la densité cellulaire de la population
49
Quel est l'auto-inducteur des Gram-?
AHL (acetyl-homosérine lactone)
50
Expliquez le système à inducteur de Vibrio FISCHERI
Système à un inducteur.
LuxI produit un auto-inducteur et quand la concentration est élevée, il réussit à entrer dans la cellule pour activer LuxR.
LuxR, une fois activé cause la transcription des gènes impliquées dans la production de lumière.
51
Chez Vibrio HARVEYI, que se passe-t-il en absence de l'autoinducteur-1?
LuxN subit une réaction d'autophosphorylation et transfère son phosphate à LuxU. LuxU va transmettre son phosphate à LuxO qui va réprimé LuxR.
Le gène impliqué dans la production de lumière n'est donc pas activé.
52
Chez Vibrio HARVEYI, que se passe-t-il en présence de l'autoinducteur-1?
La cascade de phosphorylation est inhibée, ce qui permet l'expression de LuxR.
53
Vrai ou faux:
| Les autoinducteurs-2 sont spécifiques à des bactéries d'une même espèces
Faux, ce sont les autoinducteurs-1
54
Quels sont les autoinducteurs des Gram+?
Ce sont des peptides
55
Quelle est la différence entre pouvoir pathogène et virulence?
Le pouvoir pathogène est la capacité de produire une maladie chez l'hôte alors que la virulence est l'intensité du pouvoir pathogène.
56
Quelles sont les étapes de la pathogénicité?
1- Accéder à un hôte par une porte d'entrée préférée
2- Adhérer aux tissus et aux cellules de l'hôte et y entrer (Adhésion et Invasion)
3- Franchir les défenses de l'hôte et y résister
4- Se nourrir et sécréter des toxines
5- Sortir de l'hôte pour se transmettre à d'autres hôtes respectifs
57
Quelle interaction cellulaire permet l'entrée de la bactérie à l'intérieur de l'hôte?
L'interaction entre les adhésines présentes sur la bactéries et les intégrines présentes sur l'hôte
58
Quelle est la méthode d'entrée des uropathogènes?
Elles arrivent à entrer via l'urètre et elles s'attachent à l'épithélium et remontent à la vessie
59
Que font les invasines en général?1
Elles déclenchent le réarrangement des filaments d'actines du cytosquelette à proximité de la membrane (chiffonemment). L'actine de la cellule de l'hôte change sa conformation, ce qui permet à la bactérie d'entrer.
60
Quel est le modèle d'invasion de Shigella?
Elle s'attache aux cellules M de l'épithélium. Les bactéries sont par la suite transférées à un macrophage et suite à l'apoptose du macrophage, les bactéries sont relâchées. Elle peuvent alors envahir les intégrines et se multiplier dans le cytoplasme.
61
Quelle est la principale différence entre le modèle d'invasion de Shigella et celui de Salmonella?
Quand Salmonella se multiplie, elle le fait dans une vacuole et non dans le cytoplasme.
62
Les bactéries ont développé une méthode pour capturer le fer environnant. Quelle est cette méthode?
La production de sidérophores.
63
Vrai ou faux:
| Les endotoxines sont plus dangereuses que les exotoxines
Faux, les endotoxines sont produites de façon active par la bactérie, elles ne sont donc pas dangereuses. Les exotoxines sont sécrétées suite à la mort de la bactérie, les rendant de ce fait dangereuses.
64
Nommez moi deux types de variations géniques.
Inversion génique
| Conversion génique
65
Salmonella Thyphimurium est capable de monter une résistance face à quel agent?
La flagelline
66
Comment Salmonella Thyphimurium fait-elle pour échapper à la recognition du système immunitaire de l'hôte?
Elle fait des inversions géniques, ce qui empêche l'expression de la flagelline H2 et elle exprime alors la flagelline H1, qui n'est pas reconnue par l'hôte.
67
Nommez moi les personnages essentiels à la traduction
Ribosome 70S
ARNm
ARNt
68
Quel est le rôle de l'IF3 (Facteur d'initiation 3)?
empêcher l'interaction des sous-unités 30S et 50S dans le cytoplasme et assurer l'interaction entre la 30S et l'ARNm
69
La phase de l'initiation utilise combien de GTP?
1 seule
70
Quelle est la définition d'un antibiotique?
Substance naturelle ou synthétique qui détruit ou bloque la croissance des bactéries
71
Quelles sont les cibles d'un antibiotique? (5 cibles)
```
Paroi cellulaire
Synthèse protéique
Membrane plasmique
Réplication
Synthèse des métabolites essentiels
```
72
Quel est le mode d'action de la spectinomycine?
Elle empêche l'interaction entre l'ARN et le complexe 30S
73
Quel est le mode d'action des aminosides?
Se lient à la sous-unité 30S et empêchent la formation du complexe 70S, car ils empêchent l'arrivée de la 50S
74
Quel est le mode d'action de la tétracycline?
Se lie à la sous-unité 30S et empêche le nouveau ARNt de se lier au site A (site d'arrivée)
75
Associez les différents antibiotiques à leur mode d'action:
1- Chloramphénicol
2- Macrolides
3- Acide fusidique
a) Se lie à la sous-unité 50S et inhibe la peptidyltransférase et la translocase
b) Se lie à la protéine EF-G et empêche la dissociation du complexe EF-G-GDP
c) Se lie à la sous-unité 50S et inhibe l'enzymepeptidyltransférase
Chloramphénicol: se lie à la sous-unité 50S et inhibe l'enzyme peptidyltransférase
Macrolides: Se lie à la sous-unité 50S et inhibe la peptidyl transférase et la translocase
Acide fusidique: Se lie à la protéine EF-G et empêche la dissociation du complexe EF-G-GDP
76
Associez l'antibiotique au mode d'action ci-dessous:
Bloquent la synthèse des précurseurs d'acides nucléiques et de la méthionine
a) Rifamycines
b) Quinolones
c) Sulfamides, triméthoprime
Sulfamides, triméthoprime
77
Quels antibiotiques inhibent l'action de l'ADN gyrase en bloquant la réplication, la transcription et en induisant la fragmentation de l'ADN?
Les quinolones (acide nalidixique, ciprofloxacine)
78
Vrai ou faux:
| La Rifampicine se fixe sur l'ARN polymérase cellulaire, bloquant ainsi la synthèse d'ARN?
Faux! Il se fixe sur l'ARN polymérase BACTÉRIEN, bloquant ainsi la synthèse d'ARN.
79
Contre quels types de bactéries les polymixines sont-elles efficaces?
Sur les bactéries Gram-
80
Quelle est la définition de la résistance aux antibiotiques?
Perte de sensibilité à l'activité tueuse (bactéricide) ou inhibitrice de la croissance (bactériostatique) d'un antibiotique
81
L'infection survenue suite à la 2e G.M a été causée par quelle bactérie?
Shigella dysenteriae
82
Quels ont été les deux traitements face à cette bactérie?
Sulfamides, puis une combinaison de streptomycine, tétracycline et chloramphénicol
83
Est-il vrai d'affirmer que plusieurs résistances chromosomiques peuvent se transférer aux cellules filles?
Non, cela est faux. Seulement une résistance peut se transférer du chromosome
84
Quels sont les 4 modes d'actions de la résistance?
1- modification de la cible
2- dégradation
3- Inactivation
4- changement de perméabilité
85
Qu'est-ce que la dégradation?
l'antibiotique arrive, mais la bactérie sécrète des enzymes qui vont le détruire
86
Qu'est-ce que la modification?
L'antibiotique peut entrer, mais la bactérie sécrète des enzymes qui vont le désactiver, mais ne le détruirons pas
87
Associez les modes d'action de résistance aux bons antibiotiques.
1- Peut être complètement inhibée par une acétyltransférase qui transfère un groupement acétyle et une phosphotransférase qui ajoute des groupements phosphates
2- Une acétyltransférase transfère des groupes acétyles sur l'antibiotique, le rendant si gros que cela l'empêche de se lier et de faire son action
3- Même mode d'action qu'en #1, mais attaqué de façon différent
a) Kanamycine
b) Chloramphénicol
c) Streptomycine
1-A
2-B
3-C
88
Le changement de perméabilité peut se faire à partir de pompes. Nommez moi 3 types de pompes à efflux et leurs caractéristiques
NorA (Staphylococcus aureus): utilisent la force proton-motrice
AcerD (E.coli): utilise le gradient des protons
Mez: complexe de protéines qui forment un canal entre la membrane interplasmique et externe
89
Associez les modifications de cibles aux bons antibiotiques:
- Bêta lactames
- Vancomycine
- Quinolone
- Aminosides
- Triméthoprime
1- Mutation dans les PLP (protéines de liaison aux pénicilline)
2- Au lieu d'utiliser l'enzyme inhibée par l'antibiotique, ils utilisent une autre enzyme
3- ADN gyrase altéré
4- Peut être inhibée en altérant le précurseur
5- Protéines ribosomales altérées
Bêta Lactames: Mutation dans les PLP
Vancomycine: Peut être inhibée en altérant le précurseur
Quinolone: ADN gyrase altéré
Aminosides: Protéines ribosomales altérées
Triméthoprime: Au lieu d'utiliser l'enzyme inhibée par l'antibiotique, ils utilisent une autre enzyme
90
Qu'est-ce que le SARM?
Staphylococcus aureus résistant à la méticilline
91
Qu'est-ce que le ERV?
Entérocoques résistants à la vancomycine
92
Vrai ou faux, des mutations chromosomiques et plasmidiques sont liées au ERV?
Vrai! Plasmidique: vanA, vanB et chromosomique VanC
93
Qu'est-ce que le MDR?
Mycobacterium tuberculosis multirésistants
94
À quoi est associée la NDM-1? (New Delhi Metallo-beta-lactamase-1?
Au tourisme médical
95
Nommez moi des causes de résistances aux antibiotiques?
Usage excessif
Disponibilité des antibiotiques dans les pays du tiers monde
Industrie agroalimentaire (donne des antibiotiques qu'on ingère par la suite)
Maladies chroniques
Tourisme médical
96
Quel est le modèle de Baltimore pour contrôler la résistance?
DOT : directly observe therapy
| Supervision des patients souffrant de la tuberculose pendant toute leur antibiothérapie
97
Quel est le modèle de Danemark?
Usage contrôlé des antibiotiques dans les hôpitaux et meilleur rapport entre les médecins et les microbiologistes
98
Comment peut-on contrôler la résistance aux antibiotiques?
```
Usage conservatif et spécifique
Posologie adéquate pour la durée indiquée
Utiliser l'antibiotique recommandé
Spectre étroit si possible
Éviter l'utilisation des combinaisons
Éviter l'usage prophylactique
Éviter la contamination environnementale
Utiliser les procédures aseptiques
```
99
Nommez moi les 4 protéines structurales trouvées dans le chromosome des procaryotes et leur utilités
Hu : se lie à l'ADN (liaison non spécifique + déformation de l'ADN)
IHF: liaisons à des sites spécifiques + déformation de l'ADN
SMC: Structural maintenance of chromosomes (condensines)
HNS: Se lie à l'ADN déformé dans les régions riches en Adénine et en Thymine
100
Quelle est la forme de MukB?
La lettre "V"
101
Vrai ou faux, pour condenser l'ADN chez E.coli par MukBEF, il faut une liaison spécifique?
Faux, l'interaction avec l'ADN n'est pas spécifique
102
Quel sont les rôles des H-NS? (Histone-like nucléoid structuring protein)
Rôle régulateur de certains gènes: Répression de l'ARN polymérase par blocage, empêche l'ARN de commencer la traduction
Rôle dans la structure du nucléoïde toujours inconnu
103
Quelle est la structure des HNS? (3 parties)
Tête, queue, partie qui lie l'ADN
104
Quelle est la principale entre les deux modèles de réplication, soient le Factory et le Train-on-Track?
Dans le factory model, les protéines sont au centre de la cellule et les nouvelles origines migrent vers les extrémités de la cellule pour être par la suite héritées par les cellules filles alors que dans le Train-on-track, les réplisomes peuvent se trouver n'importe où et les fourches peuvent se promener partout
105
Quel est le rôle des protéines SSB? (Single-strand binding)
Elles évitent que les deux brins originaux d'ADN se referment entre eux
106
Comment peut-on s'assurer que le mouvement des fourches de réplications est le même partout?
Grâce aux séquences ter:
les fourches peuvent dépasser les séquences ter, mais arrivées à la deuxième, elle sont arrêtées et doivent attendre que la seconde fourche arrive pour compléter leur mouvement.
107
Comment les SMC aident-elles à la division cellulaire?
Elles aident la migration des OriC en condensant l'ADN autour des OriC
108
durant la division cellulaire, comment les chromosomes sont-ils tirer vers les deux pôles?
À l'aide des protéines Par qui attachent l'ADN à des séquences spécifiques (séquences S) et d'autres protéines Par s'attachent en faisant un filament qui tire aux extrémités les nouvelles molécules d'ADN en se dépolymérisant.
109
Quels sont les deux problèmes pouvant être engendrés par la séparation finale des molécules?
Formation de dimères
| Formation de concatènes
110
Quelles sont les protéines qui interviennent pour résoudre ces problèmes?
La topoisomérase IV (coupe une petite partie afin de permettre la séparation des deux molécules)
Protéines XerCD (se lient à une séquence dif et peuvent séparer les deux molécules par recombinase site-spécifique)
111
À quoi servent les protéines FtsK et FtsZ?
FtsK permet de diriger l'ADN vers la bonne direction grâce aux séquences KOPS
112
Pourquoi est-il important de coordonner la division cellulaire avec la réplication du chromosome?
Si la cellule se divise avant que la réplication ne soit terminée, c'est presqu'inévitable qu'une des deux cellules filles n'héritera pas de chromosomes
113
Comment coordonne-t-on la division cellulaire et la réplication du chromosome chez E. coli?
La protéine SeqA saisit (séquestre) l'origine de réplication en l'attachant à la membrane plasmique.
SeqA reconnaît la séquence GATC hémi-méthylée (l'origine qui vient de se répliquer)
Ainsi, la formation de nouvelles fourches au site oriC est retardée
114
Quel est le nom des deux méthodes permettant de visualiser différentes régions du chromosome?
Protéine couplée à une molécule fluorescente et FISH
115
Vrai ou faux:
| Il peut y avoir plusieurs types de plasmides présents dans la même cellule
Vrai, seulement si les plasmides sont compatibles entre eux
116
Vrai ou faux:
| Les plasmides ont des fonctions essentielles pour la croissance bactérienne
Faux, si une cellule n'est pas stressée ou en difficulté, elle peut viver sans le plasmide.
117
Quelle est la méthode la plus utilisée pour classifier les plasmides?
La méthode des groupes d'incompatibilité
118
Par quel phénomène les plasmides peuvent-ils être transférés de cellules en cellules?
Par la conjugaison
119
Vrai ou faux:
| Les plasmides ne peuvent pas se répliquer à un autre moment que lors de la réplication du chromosome.
Faux, il existe certains plasmides qui peuvent se répliquer sans que la cellule ne se réplique.
120
Comment peut-on trouver l'origine de réplication d'un plasmide?
En coupant le plasmide avec des enzymes de digestion. On jumèle ensuite chacun des morceaux à une autre molécule d'ADN. On les transfert à des bactéries qui n'ont pas de résistance (ce que le plasmide apporte) et on les fait croître sur des géloses sélectives. La bactérie qui est capable de se multiplier est celle qui contenait l'origine.
121
Vrai ou faux:
| La réplication thêta peut être unidirectionnelle ou bidirectionnelle.
Vrai, cela dépend de la fourche de réplication
122
Quelle est la protéine la plus importante pour la réplication à cercle roulant?
La protéine Rep (pour réplication)
123
Vrai ou faux:
Dans le cas de la réplication à cercle roulant, le plasmide utilise beaucoup de la machinerie métabolique de la cellule hôte
Vrai
124
Quel est le mode de réplication des plasmides chez Borrelia burgdorferi?
Réplication linéaire
125
Qu'est-ce qui permet de reformer le plasmide linéaire?
le clivage par une résolvase
126
Pourquoi le plasmide linéaire est-il stable?
Les extrémités sont liées par un lien covalent, ainsi la fin fait une boucle et lie le nucléotide avec celui de l'autre côté
127
Quelle est la particularité du modèle de raquette des plasmides linéaires chez Streptomyces?
L'origine se retrouve dans la loop alors que l'autre extrémité est gardée ensemble par des protéines. De plus, les protéines terminales ont deux fonctions
128
Quel est le but de la régulation de la réplication des plasmides?
Garder le bon nombre de copies de plasmides
129
Quels sont les 3 types de régulation de la réplication des plasmides?
1- Protéine-ADN
2- ARN-ARN
3- Protéine-ADN + ARN-ARN
130
La régulation chez COLE1 est fait par quel type de régulation?
ARN-ARN
131
Quelles sont les étapes de la régulation ARN-ARN?
ARN II produit en premier
Il est clivé par RNaseH è l'origine de la réplication
Utilisé comme amorce pour initier la réplication
ARN I interagit avec l'ARN II à l'aide de la protéine Rop, ce qui empêche le clivage d'ARN III par RNaseH
132
Vrai ou faux:
| ARN II peut être utilisé comme amorce dans le modèle de la réplication ARN-ARN?
Faux!
133
La régulation du plasmide R1 est fait par quel type de régulation?
ADN-protéines et ARN-ARN
134
Quelle est la définition d'incompatibilité plasmidique?
Deux plasmides sont considérés incompatibles quand ils ne peuvent pas coexister dans la même cellule. On dit dans ce cas qu'ils appartiennent au même groupe d'incompatibilité
135
Vrai ou faux:
| Des individus appartenant au même groupe d'incompatibilité plasmidique peuvent coexister dans la même cellule
Faux, s'ils sont dans le même groupe d'incompatibilité, c'est qu'ils ne peuvent pas coexister ensembles.
136
Il existe deux types d'incompatibilités, quels sont-ils?
Incompatibilité quant au système de réplication
| Incompatibilité quant au système de répartition
137
Il existe deux types de systèmes quant à la stabilité des plasmides, quels sont-ils?
Système actif: Protéines qui interagissent avec des plasmides pour assurer leur ségrégation
Système passif: plasmides multicopies, système de monomérisation
138
Pourquoi une cellule qui perd son plasmide a tendance à se répliquer plus vite?
La machinerie métabolique est plus à sa disposition qu'une cellule possédant un plasmide
139
Pourquoi veut-on empêcher la formation de dimères?
Afin de s'assurer que les deux cellules filles reçoivent le plasmide suite à la réplication cellulaire
140
Quels sont les deux types de recombinases utilisés chez les plasmides?
Cre (Plasmide P1)
| Protéine D (Plasmide F')
141
Quels sont les deux types de recombinases utilisés chez les chromosomes?
XerC (ColE1)
| XerD (ColE1)
142
Vrai ou faux:
| Les protéines servant à résoudre les dimères sont encodées par des gènes plasmidiques?
Faux, elles sont encodées par des gènes chromosomiques
143
Vrai ou faux:
| Les cellules sans plasmide sont tuées par les cellules ayant un plasmide (dans le cas des systèmes tueurs)
Vrai
144
Quel est le rôle du système de partition?
S'assurer qu'au moment de la division cellulaire chaque cellule fille reçoit au moins une copie du plasmide
145
Remettez les énoncés suivants dans l'ordre (description du modèle de partition du plasmide R1)
1- ATP-ParM se fixe au complexe ParR-parC
2- Le complexe ParM-ADP est instable et induit la dissociation du filament en laissant les plasmides éloignés
3- ParR se fixe au site ParC
4- L'hydrolyse de l'ATP est nécessaire pour attacher autres sous-unités de ParM au complexe (croissance du filament qui pousse les plasmides aux pôles)
3- ParR se fixe au site ParC
1- ATP-ParM se fixe au complexe ParR-ParC
4- L'hydrolyse de l'ATP est nécessaire pour attacher autres sous-unités de ParM au complexe (croissance du filament qui pousse les plasmides aux pôles)
2- Le complexe ParM-ADP est instable et induit la dissociation du filament en laissant les plasmides éloignés
146
Quelles sont les étapes de la conjugaison?
1- Le donneur entre en contact avec le receveur par un pilus de conjugaison
2- Le pilus se retir et forme un canal, les cellules entrent en contact direct
3- Un des deux brins du plasmide est transféré dans le receveur
4- Le donneur reconstitue le plasmide en synthétisant le brin complémentaire. le receveur aussi synthétise le deuxième brin et il devient F+
147
Qu'est-ce qu'un plasmide autotransférables?
un plasmide qui contient toute l'information nécessaire pour le transfert d'ADN
148
Qu'est-ce qu'un plasmide mobilisable?
Un plasmide qui a besoin des fonctions de transfert d'un plasmide autotransférable
149
L'origine de transfert agit en cis ou en trans?
En cis, elle fait transférer le plasmide sur laquelle elle se trouve.
150
Les gènes tra agissent en cis ou en trans?
En trans,
151
Qu'est-ce que TraJ chez le plasmide F?
Une activatrice transcriptionnelle de l'opéron Tra
152
Quel est le rôle de la relaxase dans la formation des mating pairs?
Elle joue le rôle de RepA (elle permet le transfert du plasmide)
153
Vrai ou faux:
| Un transconjugant peut devenir à son tour une cellule donneuse?
Vrai
154
Le pilus sort de quelle partie de la cellule lors de la conjugaison?
Il sort de la cellule contenant l'oriT. Il est produit grâce aux gènes Tra
155
Vrai ou faux:
| Les plasmides ne peuvent, en aucun cas, transférer des parties du chromosome?
Faux, dans le cas des HFR, une partie du chromosome est transféré avec le plasmide
156
Dans le cas d'une HFR, la cellule receveuse devient-elle F+?
Non!!!
157
Est-ce qu'un gène éloigné de l'oriT a beaucoup de chances d'être transféré avec le plasmide?
Non
158
Dans le cadre d'une conjugaison de type F': est-il vrai d'affirmer qu'une recombinaison homologue doit absolument suivre la conjugaison?
Non, cela est vrai dans le cas des HFR
159
Quelle maladie est provoquée par Agrobacterium tumefaciens?
La galle du collet chez certaines plantes
160
Quels sont les 4 étapes de l'infection d'Agrobacterium Tumefaciens?
1- Attachement
2- Ancrage
3- Transfert d'ADN
4- Formation des tumeurs
161
Quel est le récepteur pour la bactérie chez les plantes infectées par Agrobacterium Tumefaciens?
L'acide polygalacturonique
162
Qu'est-ce qui caractérise la phase de l'ancrage/adhérence chez les plantes infectées par Agrobacterium tumefaciens?
La production de gènes chvAB et pscA impliqués dans la synthèse et le transport de sucres/polysaccharides
163
Pour la formation des tumeurs, l'intégration de l'ADN-T est sélective, car elle a des sites préférenciels?
Faux, l'intégration est complètement aléatoire
164
Qu'est-ce qu'une cytokinines?
Hormone végétale qui induit la croissance de la tumeur dans les tiges
165
Qu'est-ce que l'auxine?
Hormone végétale qui induit la croissance tumorale dans les racines.
166
Est-ce que les gènes de virulences "vir" sont transférés à la plante?
Non, ces gènes codent les protéines impliquées dans la production et le transfert d'ADN-T
167
```
Associés les différents gènes à leurs rôles:
1- virA
2- VirB
3- virC
4- virD
5- virE
6- virG
```
a) protéine membranaire, participe de façon importante à la formation du port de conjugaison
b) protéine SSB, stabilise le simple brin du T-ADN transféré
c) hélicase
d) Récepteur des signaux libérés par les plantes blessées
e) Endonucléase, guide l'ADN-T dans le noyau de la cellule végétale
f) une fois activé par virA, contrôle la transcription de l'opéron "vir"
1-D 2-A 3-C 4-E 5-B 6-F
VirA: récepteur des signaux libérés par les plantes blessées
VirB: protéine membranaire, participe de façon importante à la formation du port de conjugaison
VirC: hélicase
VirD: endonucléase, guide l'ADN-T dans le noyau de la cellule végétale
VirE: protéine SSB, stabilise le simple brin du T-ADN transféré
VirF: une fois activé par VirA, contrôle la transcription de l'opéron "vir"
168
Quel type de sécrétion est utilisé par Agrobacterium?
Sécrétion de type IV
169
Il existe 3 types de recombinaisons, quels sont-ils?
Générale (homologue)
Site-spécifique
Transposition
170
Quels sont les (4) rôles principaux de la recombinaison?
Réparation de l'ADN
Génère la diversité
Ségrégation des chromosomes et plasmides
Réarrangement d'ADN
171
Qu'est-ce qui est nécessaire pour faire la recombinaison?
1- Homologie
2- Appariement
3- Enzymes de recombinaison
4- Formation d'hétéroduplex entre 2 molécules d'ADN
172
Le modèle d'invasion d'Holliday invade combien de brins?
2
173
Quelles sont les protéines impliquées dans les résolutions des jonctions d'Holliday?
RuvA
RuvB
RuvC
174
Quels sont les rôles des protéines impliquées dans les résolutions des jonctions d'Holliday?
RuvA: liaison à la jonction, garde la structure plate
RuvB: activité ATPase, se met des deux côtés de RuvA et fait bouger les croisements dans un sens ou dans l'autre
RuvC: clivage, elle entre dans la structure planaire et coupe soit d'un côté ou de l'autre et on obtient le produit final
175
Le modèle de Meselson et Radding invade combien de brins?
1
176
Pourquoi le modèle de Szostak est-il dangereux?
Il est dangereux, car il y a des brins qui sont cassés
177
Quels sont les deux types de recombinaison chez E. coli?
la voie RecBCD et la voie RecF
178
Quelles sont les 3 étapes de la recombinaison RecBCD?
1- Présynapsis (préparation de l'ADN pour la liaison de RecA)
2- Synapsis (Échange de brins pour former la jonction de Holliday)
3- Postsynapsis (migration de branches et résolution de la jonction d'Holliday)
179
Le changement de conformation engendré par les séquences 'chi" permettent quoi à RecA?
De se lier au brin qui reste suspendu et libre
180
La voie de RecBCD est utilisé lors de quel type de cassure?
Lors des cassures bicaténaires
181
La voie de RecF est utilisé lors de quel type de cassure?
Lors des cassures monocaténaires
182
Quelles sont les fonctions de RecA?
Fixation à l'ADN monocaténaire, formation des hétéroduplex
183
Vrai ou faux:
| La recombinaison site-spécifique est dépendante du système RecA?
Faux, elle est aucunement dépendante de ce système
184
Il existe 3 résultats possibles suite à la recombinaison spécifique, quels sont ces 3 résultats?
Inversion
Excision/Résolution
Intégration/fusion
185
Il existe deux types de recombinases impliquées dans la recombinaison spécifiques, quels sont-ils?
Intégrases et Résolvases/Invertases
186
Vrai ou faux:
La recombinaison par la Serine-recombinase libère un gorupement 3'OH et clive un seul brin alors que la recombinaison par la Tyrosine-Recombinases libère un groupement 5'OH et clive les deux brins.
Faux: la Serine-Recombinase clive les deux brins alors que la Tyrosine-Recombinase clive un seul des brins
