Examen Intra Flashcards
Définition Endémie
Maladie qui est constamment présente à un niveau significatif au sein d’une communauté. (ex; herpès)
Définition Épidémie
Augmentation inhabituelle du nombre de cas au sein d’une communauté.
Définition Pandémie
Épidémie impliquant plusieurs continents en même temps.
Définition R0
Formule mathématique qui permet de mesurer la contagiosité d’une maladie; Taux de reproduction de base du virus.
Permet de connaître le nombre moyen de personnes qu’une personne contagieuse pourrait infecter.
Permet d’évaluer les risques de d’épidémie
R0 < 1 = personne infectée infectera moins d’une personne; le nombre de nouveau ca déclinera rapidement
R0 = 1 = personne infecté infectera 1 personne; le nombre de nouveaux cas augmentera de manière régulière SANS causer d’épidémie
R0 > 1 personne infectée infectera plus d’une personne; la maladie va se propager dans la population et pourra devenir une épidémie
Quel est le calcul du R0
Calcul du R0 = Transmissibilité x nb de contacts sociaux x durée de la période contagieuse
*Transmissibilité ; probabilité de transmission d’une maladie
(facteurs aggravants ; hygiène,)
(facteurs positifs ; vaccination, campagnes de préventions)
*nb de contacts sociaux ;
(facteurs aggravants ; contactes directs (bise, poignée de main, calin, etc..)
(facteurs positifs ; quarantaine, fermeture des lieux publics, confinement)
*Période contagieuse ; durée dépend du virus (plus cette période est longue, plus la probabilité de contaminer de nouvelles personne est grande)
Définition de Temps de génération
Temps entre l’infection d’une personne et sa capacité à transmettre le virus à quelqu’un d’autre
Haut R0 + Court temps de génération = dangereux
Quels sont les principales étapes des cycles réplicatifs ?
(a) Le virus interagit spécifiquement avec la surface de l’hôte puis le génome viral pénètre à l’intérieur de la cellule
Implique la reconnaissance de protéines spécifiques à la surface du virus et de la cellules (récepteurs) chez les cellules animales et bactériennes
(b) Expression des gènes viraux par la cellule hôte
Synthèse de quelques ou plusieurs protéines virales par la machinerie de l’hôte
(c) Les protéines virales modifient la cellule hôte et permettent au génome viral de se répliquer en utilisant les enzymes de l’hôte mais aussi ses propres enzymes
Mécanisme complexe
Stade où la cellule est irrémédiablement modifiée et éventuellement tuée
La recherche actuelle en virologie vise la compréhension de ces mécanismes
(d) Protéines de la capside virale s’assemblent et inclusion du génome viral néo-formé - -
Assemblage
(e) Relarguage des virus et reprise du cycle sur une nouvelle cellule
(f) Reprise du cycle dans une nouvelle cellule cible
(g) Dissémination du virus vers un individu sain : Les virus quittant un organisme risquent de contaminer d’autres individus ou l’environnement.
Définition Période d’incubation
Intervalle qui sépare l’infection d’un organisme et l’apparition des premières manifestations cliniques de la maladie.
Définition Quarantaine
Isolement d’un individu malade ou potentiellement infecté afin de protéger les individus sains et les zones non contaminées d’un territoire donné contre la transmission d’agents biologiques pathogènes qui constituent une menace à la santé animale et humaine.
Définition Immunité collective
immunité procurant un état de protection indirecte d’une importante fraction de la population qui résulte de l’immunisation d’une large proportion des individus de cette population.
*Peut survenir suite à une campagne de vaccination de masse
*Peut survenir suite à une maladie qui a touché un grand nombre de sujets qui ont développé des anticorps pouvant combattre ultérieurement.
Quels sont les facteurs impliqués dans la dissémination des virus
Indice :
Virus
Hôte
Environnement
- Viraux
*caractéristiques du virus : résistance aux caractéristique ambiantes (température, pH, UV, sècheresse, etc.
*capacité d’infection de différents hôtes
*porte d’entrée
*capacité d’évasion du système immunitaire
*pathogenèse ; période d’incubation (longue, courte)
*Route par lequel le virus est éjecté - Hôte
*âge
*sexe
*facteurs génétique
*facteurs sociaux économiques
*nutrition
*condition immunologique - Environnement
*localisation géographique
*Urbain vs rural
*Existence de vecteurs zoonotiques
*Statut socio-économique (hygiène, surpopulation)
Qu’est ce que la pathogenèse? Quels sont les éléments qui la définissent?
Pathogenèse : Étude des effets d’une infection sur un hôte
1) Origine de la maladie : Elle étudie les causes initiales de la maladie, qu’elles soient biologiques, chimiques, physiques ou psychologiques .
2) Développement des lésions : La pathogenèse examine comment ces causes pathogènes entraînent des lésions ou des altérations dans l’organisme.
3) Processus d’évolution : Elle décrit les différentes étapes par lesquelles la maladie progresse, y compris les mécanismes d’action des agents pathogènes sur l’organisme.
4) Facteurs impliqués : Cela inclut l’analyse de tous les facteurs impliqués dans le développement et l’évolution de la maladie, que ce soit les agents infectieux, les conditions environnementales, ou les réponses immunitaires de l’hôte
Quels sont les voies de transmission des virus ?
Quels sont les 3 grandes catégories
Quels sont les 8 moyens
3 grandes catégories :
1) Virus résistants et vont restés dans l’environnement avant d’infecter leur hôte
2) Virus plus fragiles donc doivent être transmis d’un individu à l’autre avec contact proche (virus enveloppé (grippe, influenza)
3) Via des insectes piqueurs (arbovirus)
____________________________
8 moyens de transmission:
1) Voies respiratoires
2) Féco-orale
3) parentérale (aiguille, scalpel ; sang contaminé)
4) sexuelle
5 mère-enfant (allaitement)
6) via des vecteurs (réservoir = oiseau, vecteur = moustique, hôte = humain)
7) Zoonose (animal to human)
8) Transmission iatrogène (via du matériel médical souillé)
Expliquer les notions de réservoir et de vecteur
La source du virus infectieux = réservoir. Les réservoirs doivent permettre la réplication dynamique du virus afin que celui-ci demeura capable d’initier une infection productive (production de virions infectieux)
- Le réservoir peut être différent de l’animal qui va être infecté
- Vecteur et réservoir peut être le même (ex; virus de la rage; lapin)
- Dans le cas des arbovirus; ils se répliquent dans les insectes et les réservoirs primaires (vertébrés). Dans certains cas, le vecteur sert de réservoir secondaire permettant une ronde supplémentaire de réplication = production d’une plus grande quantité de virus.
Quelles sont les principales mesures de contrôle pour contrôler la propagation des maladies infectieuses?
1) Mesures individuelles
- hygiène personnelle (lavage des mains)
- port du condom
- s’isoler
2) Mesures communautaires
- surveillance de la nourriture, de l’eau, des produits sanguins
- maintenir une hygiène dans les lieux très populeux
- contrôle d’insectes
- immunisation des animaux
- dissémination de l’information aux professionnels et au publique
- campagnes de vaccination de masse
*C’est mesures ne peuvent pas être mise en place accoutrement dans les pays en voie de développement
Des mesures spécifiques à un virus peuvent être mises en place
Ex; Fièvre jaune = mesures antimoustiques, insecticide, fillets à moustique et chasse moustique, vaccination.
Quelle est la différence ente une infection localisée et généralisée?
LOCALISÉE : Suite à la pénétration des virus dans l’organisme, certains virus occasionnent des infections localisés (grippe, verrues)
Virus se situe dans l’environnement qui va entrer dans l’organisme et va infecter les cellules qui se trouvent dans l’entrée et vont reproduire le virus et le relarguer
GÉNÉRALISÉE : Alors que d’autres se propagent à distance, donnant lieu à des infections généralisées (rougole, poliomyélite.)
Virus dans l’environnement va via la porte d’entrée va;
se répliquer et les nouvelles particules virales répliquées vont se disperser dans l’organisme via le réseau lymphatique ou via système sanguin et vont aller cibler d’autres organes et vont induire dans ces organes de secondes rondes de multiplications de particules virales + relargage.
Très peu de symptômes dans la porte d’entrée mais symptômes une fois rentrée aux organes
Quelle est la différence entre un virus et un virion?
Virus = concerne l’agent infectieux à tous les stades du cycle viral (extra ou intracellulaire)
Virion = définit la particule virale infectieuse complète. Le virion est constitué par 1) un génome 2) une capside
L’ensemble est appelé nucléocapside : virus nus
3) une enveloppe de nature lipidique peut entourer la nucléocapside = virus enveloppés
Quelle est la différence entre un virus nu et un virus enveloppé?
Virus nu = Génome + Capside (=nucléocapside)
Virus enveloppé = nucléocapside + enveloppe de nature lipidique
Comment appel-t-on le complexe
Génome + Capside?
Nucléocapside
Qu’est-ce que le génome?
Acide nucléique (ARN ou ADN, jamais les deux) qui est protégé par une capside de nature protéique
Le génome virale code pour quoi? (3)
Les protéines de structures (capside et enveloppe)
Les enzyme nécessaires à la réplication
Les protéine de régulation qui se fixent sur les promoteurs des gènes viraux (pour en activer ou réprimer l’expression)
Quelles sont les 2 fonctions de la capside ?
protection du génome viral + fixation du virus à sa cellule cible
Définition de Protomère
sous unité protéique = sous unité de structure
Trouver le mot : sous unité protéique = sous unité de structure
Protomère
Définition Capsomères :
unité morphologique formée par l’assemblage de sous-unités de structure, identiques ou différentes.
trouver le mot : unité morphologique formée par l’assemblage de sous-unités de structure, identiques ou différentes.
capsomères
Selon la symétrie engendrée par l’agencement des protéines de capside autour de l’acide nucléique
—ça engendre quoi?
2 types principaux de virus ;
hélicoidale + Icosaédrique
sinon; symétrie complexe
Quelles sont les caractéristiques de la symétrie hélicoidale?
a capside de ces virus est directement constituée par l’assemblage de sous-unités IDENTIQUES.
La nucléocapside forme un cylindre
Quel est le mode d’assemblage des capsides hélicoidales?
auto-assemblage
Quelles sont les caractéristiques de la symétrie Icosaédrique?
polyèdre obtenu par l’assemblage de 20 triangles
équilatéraux
12 sommets, 20 faces et 30 arêtes.
À chacun des sommêts on trouve 5 versants ; on doit trouver au moins 1 unité de structure / versant
Dans un virion à symétrie icosaédrique, combien y a-t-il de
sommets :
faces :
arrêtes :
unités de structures (au minimum)
12
20
30
60
Qu’est-ce que sont les pentamères?
À chaque sommet les capsomères sont entourés de 5 autres : ce sont des
pentamères. Il y a toujours 12 pentamères par virion
Combien de pentamères par virion?
12
Qu’est-ce que sont les hexamères?
Sur les arêtes et sur les faces, les capsomères sont entourés de 6 autres :
ce sont des hexamères : la quantité d’hexamères varie selon la taille du
virus étudié
combien d’hexamères par virion?
varie selon la taille du virus
Quels sont les 2 types d’assemblage & dans quelles circonstances sont-ils utilisés?
Auto-assemblage = 1 seule sorte de protéine
protéine d’échaffaudage = lorsqu’on a un nombre de protéine élevé
Quels sont les avantages d’avoir un plus grand nombre de triangulations?
Construire une capside plus volumineuse pour pouvoir contenir un génome plus volumineux.
Avoir plus de protéines de surface
Est-ce que tous les virus ont une enveloppe?
Non
Seulement les virus enveloppés
De quoi la membrane est virus est constituée.
Comment le virus acquière l’enveloppe?
Et à quoi elle sert?
Enveloppe de même nature lipidique que les cellules infectées
L’enveloppe est acquise lorsque les nucléocapsides traversent l’une des membranes de la cellule-hôte.
L’enveloppe porte des déterminants viraux (glycoprotéines) qui se lient aux récepteurs cellulaires de manière spécifique. Après la fixation aux récepteurs de la membrane cellulaire, l’enveloppe peut se fusionner avec cette membrane et permettre l’introduction du nucléocapside dans l cellule.
Quel virus est plus fragile (nu ou enveloppé)
Enveloppé
Quels sont les autres composantes de la capside virale?
Protéines de la matrice
Enzymes
-polymérases, intégrases et autres protéines associés
- protéases
- enzyme de modifications (ajout de la coiffe sur ARNm)
-Topoisomérases
Autres composantes virales
-protéines activatrices
-protéines nécessaire à la dégradation de l’ARN,
Composantes cellulaires
- histones
-ARNt
-myristate
-lipides
-cyclophiline A
-
Quel est le principe de classification de Baltimore
Classer les virus en fonction de leur génome (ADN vs ADN, simple brin vs double brin, polarité positive vs négative)
Et leur mécanisme de production d’ARNm
Quelles sont les 7 classes de la classification de Baltimore
Classe 1 : virus ADN double brins. Transcription de l’ADN pour produire de l’ARNm.
Classe 2 ; virus avec ADN simple brin = pour pouvoir produire l’ARNm, le virus doit avoir une étape où il va y avoir une synthèse d’un brin qui est complémentaire au brin d’ADN simple brin. On se retrouve alors avec la production d’un ADN double brins intermédiaire qui servira de matrice pour la production de l’ARNm viral.
Classe 3 : Virus à ARN double brins. Ces virus vont faire une transcription du brin négatif afin de produire un ARNm (qui va servire pour le reste du cycle réplicatif)
Classe 4 : Virus à ARN simple brin mais qui possède une polarité positive ; donc peuvent servir directement comme ARNm.
Classe 5 Virus à ARN simple brin à polarité négative. Requiert une étape de transcription de ce brin négatif afin de produire un brin d’ARNm
Classe 6 : Rétrovirus (VIH) Virus à ARN simple brin de polarité positive MAIS a une étape de transcription inverse qui permet de produire un ADN double brin intermédiaire, qui lui va s’insérer dans le génome de la cellule hôte, et par la suite il y aura production d’ARNm
Classe 7 : virus qui possède de l’ADN partiellement double brins, circulaire
Quels sont les niveaux taxonomiques et leur suffixes
Ordre ; virales
Famille ; viridae
Sous-famille ; virinae
Genre ; virus
Espèce ; virus individuel, ex; rougeol
Suffixe Ordre
virales
Suffixe famille
viridea
Suffixe sous-famille
virinae
Suffixe genre
virus
Suffixe espèces
virus individuel (ex; rougeol)
Comment un virus avec un ADN double brins produit de l’ARNm?
Transcription de l’ADN
Comment un virus avec un ADN simple brin produit de l’ARNm?
pour pouvoir produire l’ARNm, le virus doit avoir une étape où il va y avoir une synthèse d’un brin qui est complémentaire au brin d’ADN simple brin. On se retrouve alors avec la production d’un ADN double brins intermédiaire qui servira de matrice pour la production de l’ARNm viral.
Comment un virus avec un ARN double brins produit de l’ARNm?
Ces virus vont faire une transcription du brin négatif afin de produire un ARNm (qui va servir pour le reste du cycle réplicatif)
Comment un virus avec un ARN simple brin à polarité positive produit de l’ARNm?
peuvent servir directement comme ARNm.
Comment un virus avec un ARN simple brin à polarité négative produit de l’ARNm?
Requiert une étape de transcription de ce brin négatif afin de produire un brin d’ARNm
Comment un rétrovirus avec un ARN simple brin à polarité positive produit de l’ARNm?
étape de transcription inverse qui permet de produire un ADN double brin intermédiaire, qui lui va s’insérer dans le génome de la cellule hôte, et par la suite il y aura production d’ARNm
Quelles sont les 7 étapes des cycles réplicatifs des virus ?
ÉTAPE 1 : Attachement.
Le tropisme ne se fait pas au hasard. Les cellules cibles pour un virus particulier expriment à leur surface des récepteurs cellulaires (qui interagissent avec les virus). Ce sont les protéines de surface qui sont soit sur la capside, soit sur l’enveloppe qui va s’attacher à ces différents récepteurs *qui sont situés à la surface de la cellule)
ÉTAPE 2 : Pénétration.
a) Le virus ENVELOPPÉ va pénétrer la cellule par fusion (entre la bicouche lipidique qui est située à la surface du virus et la membrane cytoplasmique). Donc une fois que les récepteurs vont interagir avec les protéines virales, il va y avoir induction de la fusion.
b) Le virus (enveloppé ou nu) peut aussi pénétrer par endocytose. Les récepteurs interagissent avec les protéines virales; cela induit des évènements à la surface de la membrane cellulaire qui va faire en sorte qu’il va y avoir de l’endocytose.
c) Pénétration par phagocytose. Les virus qui entrent par phagocytose sont résistant aux enzymes qui sont présentes dans le lysosome.
ÉTAPE 3 : Décapsidation.
Plusieurs façons selon les virus de faire ce processus de décapsidation ; mais dégradation des protéines de la capside et va permettre le relargage du génome dans le cytoplasme ou à la membrane nucléaire.
ÉTAPE 4 : Réplication du génome viral
Selon les différentes classes de Baltimore
À partir du génome il va y avoir ;
réplication du matériel génétique (répliquer un maximum de fois le génome) +
(se faire en parallèle) production du maximum de protéines virales afin de faire ultiment des virus.
ÉTAPE 5 : Assemblage
Les protéines virales qui vont faire partie de l’enveloppe vont se retrouver à la membrane cytoplasmique/nucléaire/du réticulum endoplasmique.
Les protéines de la capside (dépendamment du virus), vont s’assembler soit dans le noyau ou dans le cytoplasme
Ce capside (si c’est un virus enveloppé) va aller chercher les protéines qui sont dans les membranes (donc bourgeonnement du virus)
Ce capside (si virus nu) ; pas de bourgeonnement, le virus va provoquer la lyse de la cellule cible soit intentionnellement avec une protéine virale ou soit naturellement par le fait qu’il y ait tellement de nouvelles particules virales qui sont produites à l’intérieur de la cellule (la cellule éclate)
ÉTAPE 6 ou 7 : RELARGAGE
ÉTAPE 6 ou 7 MATURATION
Comment se fait l’attachement du virus à la cellule ?
Le tropisme ne se fait pas au hasard. Les cellules cibles pour un virus particulier expriment à leur surface des récepteurs cellulaires (qui interagissent avec les virus). Ce sont les protéines de surface qui sont soit sur la capside, soit sur l’enveloppe qui va s’attacher à ces différents récepteurs *qui sont situés à la surface de la cellule)
Est-ce que les virus nu et les virus enveloppés pénètrent les cellules de la même manière?
Quelles sont les différentes façon qu’un virus peut pénétrer une cellule?
Non
a)Le virus ENVELOPPÉ va pénétrer la cellule par fusion (entre la bicouche lipidique qui est située à la surface du virus et la membrane cytoplasmique). Donc une fois que les récepteurs vont interagir avec les protéines virales, il va y avoir induction de la fusion.
b) Le virus (enveloppé ou nu) peut aussi pénétrer par endocytose. Les récepteurs interagissent avec les protéines virales; cela induit des évènements à la surface de la membrane cellulaire qui va faire en sorte qu’il va y avoir de l’endocytose.
c) Pénétration par phagocytose. Les virus qui entrent par phagocytose sont résistant aux enzymes qui sont présentes dans le lysosome.
Est-ce qu’un virus nu peut pénétrer dans une cellule par fusion ?
non
Comment se déroule la décapsidation et à quoi sert-elle?
Plusieurs façons selon les virus de faire ce processus de décapsidation ; mais dégradation des protéines de la capside et va permettre le relargage du génome dans le cytoplasme ou à la membrane nucléaire.
Comment se fait la réplication du génome viral
Selon les différentes classes de Baltimore
Est-ce que l’assemblage se fait de la même manière pour les virus nus et enveloppés?
Comment l’assemblage est faite?
Non
Les protéines virales qui vont faire partie de l’enveloppe vont se retrouver à la membrane cytoplasmique/nucléaire/du réticulum endoplasmique.
Les protéines de la capside (dépendamment du virus), vont s’assembler soit dans le noyau ou dans le cytoplasme
Ce capside (si c’est un virus enveloppé) va aller chercher les protéines qui sont dans les membranes (donc bourgeonnement du virus)
Ce capside (si virus nu) ; pas de bourgeonnement, le virus va provoquer la lyse de la cellule cible soit intentionnellement avec une protéine virale ou soit naturellement par le fait qu’il y ait tellement de nouvelles particules virales qui sont produites à l’intérieur de la cellule (la cellule éclate)
Pourquoi l’étape de maturation peut être nécessaire pour certains virus?
Certaines glycoprotéines ont besoin de maturer pour devenir des particules virales infectieuses
Est-ce qu’on fait des diagnostiques avec un microscope électronique ?
Non, trop long et coûteux
Qu’est-ce qu’on peut voir avec un microscope (normal)
Les cellules infectées
PAS les virus
