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Microbiologie > Examen final > Flashcards

Examen final Flashcards

1
Q

L’eau recouvre quelle quantité de la terre ?

A

L’eau recouvre les 2/3, 3/4 de la surface de la terre

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Q

À combien s’élève le pourcentage d’eau salée et d’eau douce sur la terre ?

A

97 % d’eau salée, 3 % d’eau douce

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3
Q

Pourquoi les milieux aquatiques sont riches en microorganismes ?

A
  • Toujours de l’eau
  • Il y a une grande stabilité de la T°C
  • Présence de M. min. (Photolithotrophe et chimio)
  • Présence de M.O et d’O2 (Chimioorganotrophes)
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4
Q

La distribution des microorganismes dans les écosystèmes varie selon quel facteur ?

A
  • La profondeur
  • Lumière
  • O2 dissous
  • Nutriments ino.
  • Nutriments org.
  • T°C de l’eau
  • pH
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5
Q

Où sont abondants le microorganismes des les cours d’eau ?

A

Zone euphotiques (photosynthèse), Zone benthique (Décomposeurs)

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6
Q

Quel microorganisme s’occupe de la photosynthèse ?

A

Phytoplancton (Cyano., Algues), Zooplancton (Consommateurs, protozoaires)

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7
Q

Les microorganismes faisant de la photosynthèse (phytoplancton) sont consommés par qui ?

A

Zooplancton (protozoaires)

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8
Q

Que se passe-t-il si la M.O est très élevée dans un plan d’eau ?

A

Bcp de décomposition = Bcp de R.C.A, donc l’O2 s’épuise. On entre dans le processus d’eutrophisation.

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9
Q

Quel est la stratification thermique des lacs et que se passse-t-il dans les strates ?

A

1- Épilimnion : Qté. de nutriments diminue = utilisés par producteurs
2- Thermocline : Grande variation de T°C -> Sépare physiquement
3 - Hypolimnion : Bcp de décomposition = Moins d’O2 et nutriments inorg. s’accumulent

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10
Q

Pourrais-tu m’expliquer ce qu’est un brassage saisonnier ?

A
  • À l’automne, l’eau refroidit au niveau de l’épilmnion -> devient plus dense et riche en O2
  • Cette eau coule au fond et soulève l’eau + les nutriments inorg. de l’hypolimnion
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11
Q

Quel sont les deux conséquences du brassage saisonnier ?

A

1- Les eaux de surface (riche en O2) approvisionnent les décomposeurs de la zone benthique
2 - Les eaux benthiques remontent en surface et approvisionent les producteurs en nutriments inorg.

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12
Q

Qu’est-ce qui cause les marées rouges ?

A

L’apport excessif d’éléments nutritifs (résidus terrestres) aux algues unicellulaires (Dinoflagellé)
-> Produisent toxines

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13
Q

Serais-tu capable d’associer ces taxons : Algues, mycètes, protozoaires aux types d’organismes auxquels ils appartiennent ?

A
  • Algues = Photolithotrophes
  • Mycètes = Décomposeurs
  • Protozoaires = Consommateurs
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14
Q

Qu’est-ce que la pollution naturelle ?

A

L’apport de limon, d’argile, de minéraux dissous et de M.O dans les cours d’eau provenant de l’érosion et du ruissellement.

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15
Q

Quels effets la pollution naturelle a sur l’eau ? (Entrophisation naturelle )

A
  • Turbidité élevé
  • Mauvais goût
  • Dureté élevé
  • Multiplication rapide des décomposeurs (M.O)
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16
Q

Qu’est-ce qu’une surcharge de M.O entraîne dans le cours d’eau ?

A

Buffet à volonté pour décomposeurs -> Décomposition ↑ -> Qte. d’O2 ↓ -> Épuisement O2 dans zone benthique -> Disparition sp. anaérobies -> Décomposition ↓ -> M.O s’accumule -> Prolifération bactéries anaérobies (fermentations) -> T°C ↑ -> O2 ↓

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17
Q

Comment peut-on mesurer la charge en M.O de l’eau ?

A
  • DBO5 (Mesure de la demande en O2) :

Eau du milieu + ensemencement E.coli -> Mesure O2 au début et à la fin -> La différence = RCA = qte M.O

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18
Q

Qu’est-ce que la pollution agricole ? (Eutrophisation artificielle)

A

Emploi abusif d’engrais artificiels qui se retrouvent par ruissellement dans le cours d’eau

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19
Q

Qu’est-ce qu’une surchage de M. Inorg. entraîne dans le cours d’eau ?

A

Lessivage de nitrate et phosphate -> Prolifération algues + cyano -> Photosynthèse ↑ -> M.O ↑ -> Décomposeurs ↑ -> O2 ↓ -> Décomposition ↓ -> M.O s’accumule -> T°C ↑ -> O2 ↓ -> Le lac se comble

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20
Q

Quels sont les caractéristiques d’un lac eutrophe ?

A
  • Vieux lac riche en nutriments
  • Grande biomasse et PPN (Producteurs)
  • Bcp de décomposition, Peu d’O2
  • Peu profond
  • Eau trouble
  • Petite biodiversité
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21
Q

Quels sont les caractéristiques d’un lac oligotrophe ?

A
  • Lac jeune
  • Profond
  • Eau claire et froide (↑ O2)
  • Peu productif
  • Bonne biodiversité
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22
Q

Qu’est-ce que la pollution biologique ?

A

Rejet des eaux usées non traitées dans le cours d’eau

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23
Q

Qu’est-ce qu’entraîne la pollution biologique ?

A
  • L’eutrophisation (M.O)
  • Infections et épidémies (Microorganismes de intestins)
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24
Q

Qu’est-ce que l’assainissement de l’eau ?

A

Le traitement que font les municipalités afin de rendre l’eau brute des cours d’eau potable et l’épurations des eaux usée.

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25
Q

Quels éléments les municipalités souhaitent éliminer en traitant l’eau brute ?

A
  • Les enteropathogènes (E.coli)
  • Les microorganismes (Algues, bactéries sulfureuses)
  • Substances et microrganismes qui causent l’obstruction (Ca+, Bactéries visqueuses)
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26
Q

Quels sont les étapes du traitement de l’eau brute ?

A

1- tamisage et sédimentation
2- Coagulation
3- Floculation
4- Décantation
5- Filtration
6- Désinfection

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27
Q

Peux-tu m’expliquer le procédé de la coagulation ?

A

Par un traitement chimique, on déstabilise les colloïdes en altérant leur charge, donc ils adhèrent ensemble

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28
Q

Peux-tu m’expliquer le procédé de la floculation ?

A

Traitement physico-chimique menant à l’agrégation des particules stabilisées pour former flocons

-> Petits groupes de particules formées par coagulation se réunissent pour former flocons

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29
Q

Quels sont les différentes techniques de désinfection
?

A

1- À l’ozone (Oxyde la MO)
2- Aux UV (Altère ADN et ARN) La plus efficace -> Tue 100% virus et bactéries
3- Au chlore

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30
Q

Comment rendre l’eau potable en voyage ?

A

1- Ébulition : Bouillir 1 à 10 min
2- Désinfection chimique
3- Filtration : Microfiltre (LifeStraw)

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31
Q

Quels éléments le municipalités souhaitent prévenir en traitant les eaux usées ?

A

1- La dissémination de pathogènes
2- La contamination des cultures et élevage de fruits de mer
3- L’épuisement de l’O2 (Éviter l’eutrophisation)

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32
Q

Quels sont les principaux traitements de l’épuration des eaux usées ?

A

1- Traitement primaire : Tamisage -> Ajout de coagulant -> Floculation -> Décantation -> Sédimentation -> Boues fortements contamiées

2- Traitement secondaire (Boues activées) : Oxydation -> Séparation boues activées -> Inoculation bactéries (Zooglea ramigera) + oxygénation -> Floculation -> Décantation
3- Rejet dans le cours d’eau

4- Traitement secondaire (Lits bactériens) : Gicleur rotatif répand les eaux -> Les eaux s’écoulent sur structure alvéolaire -> Film bactérien sur structure
5- Sortie de l’eau

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33
Q

Quels sont les bactéries présentent dans les boues activées ?

A
  • 50% Gram -
  • Bactéries Gram +
  • Bactéries filamenteuse
  • Bactérie gluantes
34
Q

Peux-tu m’expliquer la méthode de digestion anaérobie des boues ?

A

Fermentation des boues en condition anaérobies dans la terre
-> On récupère méthane produit par le procédé afin de faire l’électricité

35
Q

Le traitements secondaires 1 et 2 sont suffisants pour le petites municipalités… Que doivent faire les grandes municipalités ?

A

Elles doivent procéder à un traitement tertiaire

36
Q

Quels sont les buts du traitement tertiaire ?

A

1- Éliminer complètement la M.O
2- Éliminer complètement N et P
3- Éliminer complètement métaux lourds

37
Q

De quel façon le phosphore est éliminé (traitement tertiaire) ?

A

Précipitation chimique à l’aide de chaux, alun ou chlorure de fer

38
Q

De quel façon l’azote est éliminé (traitement tertiaire) ?

A

À l’aide de bactéries dénitrifiantes

39
Q

Comment les métaux lourds sont éliminés (traitement tertiaire) ?

A

Précipitation à l’aide de substances chimiques -> Retrait

40
Q

Que doit être absolument respecté lors d’un prélèvement d’échantillon d’eau ?

A
  • Il faut se laver les mains
  • Manipuler la bouteille stérile de façon aspetique
  • La transporter dans une boîte isolante (T°C < 10°C)
  • Entreposer dans un frigo et faire l’analyse dans les 30 h suivantes
41
Q

Quels sont les différentes techniques pour déceler la présence de coliformes dans un échantillon d’eau ?

A
  • Faire un frottis (Coliformes = rose, car Gram - )
  • Cytochrome oxydase -
  • Fermentation du lactose dans tube LT
42
Q

Peux tu m’expliquer comment les cellules des Gram - et des Gram + sont constituées ?

A

Gram - :
- Membrane sur peptidoglycane, donc colorant violet s’échappe
- Alcool brise membrane
- On rajoute du rose qui colore le peptidoglycane

Gram + :
- Pas de membrane sur peptidoglycane, donc il se colore violet

43
Q

Où retrouve-t-on les coliformes totaux le plus en nature ?

A

Ceux qui se retrouvent dans :
- Les fèces des animaux
- Le sol
- L’eau
- La matière organique végétale

44
Q

Quels sont les caractéristiques des coliformes fécaux ?

A
  • Se retrouve dans les intestins des homéothermes
  • Capable de fermenter le lactose
  • 90% sont des E.coli
45
Q

Comment peut-on retrouver la source d’une pollution ?

A
  • Par des prélèvements multiples
  • Avec les résultats, on remonte le gradient de concentrations
  • La concentration la plus élevée sera près de la source
46
Q

Que signifie BHAA lorsque l’on fait le dénombrement total lors de la numération standart sur plaque ?

A

Cela signifie le total de Bactérie Hétérotrophe aérobie et anaérobie facultative

47
Q

Pourquoi choisir la numération standart sur plaque ?

A

Parce que c’est utile pour vérifier l’efficacité des différentes étapes de traitement de l’eau potable.

48
Q

Quels sont les deux méthodes pour faire une analyse quantitative des coliformes ?

A

1- fermentation en tubes multiples
2- Membrane filtrante

49
Q

Quels sont les deux méthodes pour faire une analyse qualitative des coliformes ?

A

1- Test présence - absence
2- Test de Colilert

50
Q

Quels sont les inconvénients de la technique en tubes multiples ?

A
  • Complexe
  • Prend du temps (5-7 j.)
  • Peu représentatif (Faible V d’eau)
  • Très $$$
51
Q

Quel est l’avantage de la technique en tubes multiples ?

A

Utile pour analyser les échantillons avec charge bactérienne élevée. (C’est pour cela qu’on fait des dilutions)

52
Q

Peux tu m’expliquer la technique sur membrane filtrante ?

A

On place un volume de tampon dans l’entennoir -> On vide un volume d’échantillon -> On filtre -> On récupère le filtre -> On le place sur un milieu -> Incubation

53
Q

Sur quel milieu on dépose le filtre suite à la filtration ?

A

C. Totaux : M-endo
C. Fécaux : Mfc-BCIG
Strep fécaux : m-enterococcus

54
Q

Quels sont les avantages de la technique sur membrane filtrante ?

A
  • Facile, simple et efficace
  • Rapide
  • On peut utiliser un volume important d’échantillon (0,5 à 200 mL)
  • Peu couteux
55
Q

Quels sont les inconvénients de la technique sur membrane filtrante ?

A
  • Si la densité ↑ , la croissance des indicateurs = masquée en raison de compétition
  • Pas utile pour eau turbide, car bloque filtre
  • Pas utile pour eau contenant substances toxiques (inhibe croissance bactéries)
56
Q

Comment fait-on le test présence - absence pour les coliformes ?

A

On met 100 mL d’eau dans un flacon de culture contenant bouillon lactosé, si jaune (pH acide = fermentation), il y a présence de coliformes

57
Q

Comment faire le test de Colilert pour les coliformes ?

A

Mettre 100 mL d’eau à analyser + milieu contenant ONPG et MUG -> Si sous UV = fluo il y a présence de E.coli. Si seulement jaune = Coliformes totaux. Si ni jaune, ni fluo = potable

58
Q

Quels sont les intermédiaires énergétiques ?

A

Nucléotide et Dinucléotide (ATP et NAD(P))

59
Q

Quel molécule s’occupe du stockage et de la transmission de l’info. génétique ?

A

Les polynucléotides (ADN et ARN)

60
Q

Quel est l’unité de base de l’ADN et de quoi est-il formé ?

A

C’est le nucléotide qui est formé d’une base azotée (A, T, G, C), d’un glucide et d’un groupement phosphate

61
Q

Qu’est-ce qu’un gène ?

A

Une portion d’ADN sur un chromosome

62
Q

Quels sont les 3 types d’ARN ?

A

1- L’ARN messager (Transcrit d’un gène d’ADN)
2- L’ARN de transfert (Transfert des acides aminés -> Ribosomes)
3- L’ARN ribosomal (Molécule constituant ribosome)

63
Q

Qu’est-ce que la transcription ?

A

ADN qui synthètise un ARNm dans le noyau grâce à une enzyme

64
Q

Qu’est-ce que la traduction ?

A

La synthèse de polypeptide selon l’information transportée par l’ARNm dans le ribosome grâce à l’énergie et aux ARN de transfert

65
Q

Comment les bactéries font pour synthétiser des polypeptides ?

A

Elles font une transcription directement dans le cytosol et une tranduction sans maturation (Eucaryote) aussi dans le cytosol. Ensuite, un polypeptide est sythétisé dans le ribosome

66
Q

Quels sont les caractéristiques des plasmides bactériens ou de levures ?

A
  • Petits anneaux d’ADN circulaire qui se répliquent indépendamment du chromosome bactérien
  • Stables
  • Présents en plusieurs exemplaires
  • Petit nb de gène pour résistance à antibio.
  • Pas nécessaire a survie de cellule
  • Facilité à entrer et sortir des cellules
67
Q

Quels sont les différentes étapes pour produire une bactérie recombinée ?

A

1- La synthèse de l’ADN recombinée
2- Infection d’une culture de cellules hôtes
3- Clonage des cellules hôtes

-> Voir schéma de Campbell

68
Q

Comment peut-on cibler un gène à transplanter lors de la synthèse de l’ADN recombinée ?

A

À l’aide d’enzymes de restriction (Endonucléase) qui passent en revue les molécules d’ADN et qui sectionnent à des endroits précis nommés sites de restrictions à l’interieur de section (palindromes)

69
Q

Quels cellules peuvent servir de vecteur pour transporter les gènes dans cellule hôte ?

A
  • Plasmides bactériens ou levures
  • Virus comme bactériophages
  • Chromosome bactérien artificiel
70
Q

Sur quelles caractéristiques on peut se baser pour le choix d’une cellule hôte ?

A
  • Si elle se multiplie rapidement
  • Si elle est inoffensive car doit produire substances thérapeutiques
  • Stable génétiquement
71
Q

Comment est-il possible d’infecter une cellule hôte ?

A

En rendant les membranes plus perméables à l’aide d’une traitement (choc thermique)

72
Q

Suite au clonage des cellules ayant intégré le gène intéresssant, comment peut-on retrouver les cellules pour lesquelles ça a fonctionné ?

A

Par une sonde marquées ou par des anticorps marqués

73
Q

Qu’est-ce que Crispr Cas9 ?

A

C’est une protéine provenant d’une bactérie qui coupent l’ADN des virus dans une section palindrome. Cette partie d’ADN peut être injectée aux bactéries pour qu’elles puissent reconnaître les virus et se défendre.

74
Q

Quels conditions doivent être respectées pour assurer une croissance des microorgansimes ?

A

1- Disponibilité de l’eau libre (Ne doit pas être prise par molécule hydrophiles)
2- Une température se situant entre 30 et 40°C (Mésophiles)
3- Un pH spécifique (Acidophile, Neutrophile, Alcalophile)
4- Présence d’O2 (Aérobie obligatoire, Aérobie facultative, Anaérobie aérotolérant, Anaérobie strict et Microaérophile)

75
Q

Quels sont les différentes méthodes de conservation des aliments ?

A

1- La lyophilisation (séchage)
2- Confisage et salage
3- Réfrigération et congélation/surgélation
4- Cuisson et chauffage
5- Fermentation
6- Appertisation (Canage)
7- Agents de conservation

76
Q

En quoi consiste la lyophilisation ?

A

Retirer d’un produit à l’aide de la surgélation suivie d’une évapo. sous vide la glace sans la faire fondre

77
Q

En quoi consiste le confisage et salage ?

A

Retirer l’eau d’une produit et ajouter du sucre ou sel (Osmose)

78
Q

En quoi consiste la cuisson et le chauffage comme mode de conservation ?

A

Tuer bactéries en dénaturant enzymes :
- Pasteurisation (Dénature enzymes)
- Stérilisation (Tue les microorganismes)

79
Q

En quoi consiste la fermentation comme méthode de conservation ?

A
  • Fermentation lactique produit acide lactique ou acide acétique ce qui diminue le pH de l’aliment (Inhibe neutrophiles et alcalophiles)
  • Présence de bactéries et levures dans produits augmentent leur conservation par la compétition pour le substrat
80
Q

En quoi consiste l’appertisation ?

A

Mettre les aliments dans récipients étanches à l’air, puis chaufferà 110-120°C -> Dénature enzymes

Microbiologie (2 decks)

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