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Génétique moléculaire II > Examen 3 > Flashcards

Examen 3 Flashcards

1
Q

Quel est l’équivalent procaryotique du PCNA?

A

L’attache bêta

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Q

Quelles sont les différences entre la réplication chez les procaryotes et les eucaryotes?

A

Période de réplication durant le cycle cellulaire

Nature des protéines de réplication

Nombre de réplicons

Régulation de l’initiation de la réplication

Problème de la réplication des extrémités des chromosomes linéaires

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3
Q

Durant quelle phase du cycle cellulaire les cellules eucaryotes répliquent-elles leur ADN?

A

La phase S

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4
Q

Quelles polymérases sont fidèles?

A

Delta, epsilon et gamma

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5
Q

Quelles ADN polymérases possèdent une protéine PCNA?

A

Delta et epsilon

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6
Q

Quelles enzymes enlèvent les amorces d’ARN?

A

RNAse H et FEN-1

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7
Q

Vrai ou faux: Les chromosomes eucaryotes ont plusieurs origines de réplication?

A

Vrai

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8
Q

Quelles sont les 2 étapes de l’initiation de la réplication?

A

1- La sélection des origines (phase G1): Formation d’un complexe préréplicatif (pré-RC) à chaque origine
2- Activation des origines (phase S): Complexe pré-RC initie la réplication

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9
Q

Quel est l’équivalent de DnaA chez les eucaryotes?

A

ORC (origin recognition complex)

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10
Q

Quelles protéines activent les pré-RC?

A

Les kinases Cdk et Ddk

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11
Q

Que va entraîner une forte activité Cdk?

A

Activation des pré-RC existants
Inhibition de la formation de nouveaux pré-RC

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12
Q

À quelle phase l’activité Cdk sera forte et à laquelle elle sera faible?

A

Faible: G1
Forte: S

Voir section 2.4 page 24 pour des explications

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13
Q

Vrai ou faux: les tétramères H3-H4 sont libérés de l’ADN au cours de la réplication des chromosomes?

A

Faux: ce seont les dimères H2A-H2B

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14
Q

Pourquoi certaines parties du nucléosome restent sur le chromosome fils?

A

pour recruter les enzymes qui ajouteront les mêmes modifications sur les tétramères nouvellement synthétisés

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15
Q

Que sont les transcriptases réverses et où les retrouve-t-on?

A

Ce sont des enzymes qui possèdent une activité ADN polymérase dépendante de l’ARN et on les retrouve dans les rétrovirus

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16
Q

Qu’est-ce qui fait en sorte que les rétrovirus évoluent très rapidement?

A

Leur absence d’exonucléase de correction 3’ -> 5’ cause plus d’erreurs et plus de mutations par le fait même

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17
Q

Qu’est-ce qu’un télomère?

A

L’extrémité d’un chromosome linéaire

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18
Q

Qu’est-ce qui peut faire varier le nombre de copies de la répétition dans l’ADN télomérique?

A

L’espèce

Le chromosome

Le tissu dans lequel se retrouve le chromosome

L’âge de l’individu

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19
Q

À quelle extrémité les télomères portent-ils une extension simple-brin riche en G?

A

L’extrémité 3’

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20
Q

Qu’est-ce qui protège les télomères de la réparation d’ADN?

A

Le complexe Shelterine

Voir section 2.4 page 42

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21
Q

Qu’est-ce qu’une boucle T?

A

C’est un télomère qui envahit une région double-brin et déplace l’autre brin

Voir section 2.4 page 45

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22
Q

Qu’est-ce qu’une télomérase?

A

Une ribonucéloprotéine qui synthétise l’ADN télomérique de manière discontinue

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23
Q

Qui contrôle le nombre de répétitions qu’effectue la télomérase?

A

Les protéines liant les télomères rendent l’extrémité 3’ des télomères inaccessibles

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24
Q

Vrai ou faux: Tous les organismes eucaryotes utilisent la télomérase pour allonger leurs télomères?

A

Faux, la drosophile et d’autres insectes ne le font pas

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25
Q

Comment l’ADN mitochondrial est-il répliqué?

A

Une boucle D est synthétisée à partir du brin H (brin intérieur)

Voir section 2.4 page 59

26
Q

Comment une cytosine peut devenir une uracile?

A

Par désamination

27
Q

Comment la dépurination se produit-elle?

A

Par l’hydrolyse du lien N-glycosidique

28
Q

Quels sont les systèmes de réparation de l’ADN?

A
  1. Système de réparation directe
  2. Système de réparation par excision (NER et BER)
  3. Systèmes de réparation de bases mésappariées
  4. Système de ‘‘réparation’’ par recombinaison (réparation de cassures bicaténaires)
29
Q

Quelle ADN polymérase fait la réponse SOS?

A

ADN polymérase tranlésionnelle ou de contournement (UmuC chez E. coli)

30
Q

Quels types de dommages de l’ADN la restauration directe arrange-t-elle?

A

L’irration UV ou les agents akylants

31
Q

Quelle protéine peut réparer les dimères de thymine?

A

La photolyase

32
Q

Quelles sont les deux fonctions de la protéine Ada chez E. coli?

A

O6-méthylguanine-ADN méthyltransférase (C-terminal)
Réparation des groupements phosphate méthylés (N-terminal)

33
Q

Quelle est la protéine participant à la réparation directe chez l’humain?

A

MGMT

34
Q

Quels sont les deux sentiers NER?

A
  • Sentier agissant sur le génome global (GGR)
  • Sentier agissant sur les gènes transcrits (TCR)
35
Q

Quel système fait intervenir les protéines Uvr A, B, C et D chez E. coli?

A

NER

36
Q

À quoi sert NER?

A

À éliminer les dimères de pyrimidines et les lésions dues à l’addition de groupement volumineux sur une base

37
Q

Qui reconnaît l’ARN polymérase en détresse chez E. coli, l’Homme et la levure?

A

Mdf, CSB et Rad26

38
Q

Qui enlève les bases altérées?

A

Les ADN glycosylases

39
Q

Comment les ADN glycosylases agissent sur les bases?

A

En faisant pivoter la base altérée vers l’extérieur de la double hélice pour la placer dans leur site actif

40
Q

Quelles sont les deux fonctions de l’endonucléase III?

A
  • Reconnaître les pyrimidines oxydées
  • Faire l’activité endonucléase AP
41
Q

Qui est remplacé lors d’une liaison G-T?

A

T

42
Q

Qui participe à la réparation des mésappariements chez E. coli?

A

MutH, MutL et MutS

43
Q

Vrai ou faux: la coupure que fait MutH peut se faire en amont ou en aval du mésappariement?

A

Vrai

44
Q

Quels sont les homologues de MutS, Mut L et MutH?

A
  • MSH
  • MLH et PMS
  • Mut H n’a pas d’homologue
45
Q

Qu’est-ce qui cause les cassures bicaténaires?

A

Les radiations ionisantes ou les fourches de réplication bloquées par un lésion d’ADN

46
Q

Quelles protéines participent à la voie de réparation des cassures double-brin par recombinaison homologue?

A
  • Complexe MRN
  • Kinase ATM (recrutée par MRN pour phosphoryler)
  • BRCA1 (réparation)
  • BRCA2 (recrute Rad51)
  • Rad51 (crée des filaments sur l’ADN sb)
47
Q

Dans quel cas le NHEJ est-il employé?

A

Si un chromosome non répliqué subit une cassure

48
Q

Vrai ou faux: Le mécanisme NHEJ est utilisé plus fréquemment par les bactéries que par les mammifères?

A

Faux

49
Q

Comment se passe la voie NHEJ chez les mammifères?

A
  1. Ku70 et Ku80 se lie à chaque extrémité de l’ADN cassé et recrute DNA-PKcs qui forme un complexe avec Artemis
  2. Artemis digère les extrémités cassées grâce à l’activation donnée par DNA-PKcs
  3. L’ADN ligase IV, XRCC4 et Cernunnos-XLF ligaturent les extrémités cassées
50
Q

Dans quel cas la réponse SOS est-elle induite?

A

Lorsque le génome de la bactérie souffre de lésions trop nombreuses et lorsque la réplication de l’ADN est inhibé

51
Q

Qui recrute la polymérase translésionnelle dans la réponse SOS?

A

L’anneau PCNA modifié par l’ubiquitine

52
Q

Qui inhibe et qui active les gènes de la réponse SOS?

A

Inhibe: LexA
Active: RecA

53
Q

En quoi consiste le test de Ames?

A

À compter le nombre de Salmonella thyphimurium incubés dans de l’homogénat de foie dont le phénotype est revenu à his+ avec l’agent mutagène

54
Q

Quel est l’agent cancérigène le plus puissant?

A

L’aflatoxine B1

55
Q

Nommer les ADN polymérases translésionnelles chez les eucaryotes

A

Pol êta, iota et dzêta

56
Q

Quelles sont les étapes de la recombinaison homologue?

A
  • Alignement des
    molécules homologues.
  • Cassures db d’ADN et
    formation des régions sb
    d’ADN.
  • Invasion des sb vers les
    régions complémentaires
    et formation de
    hétéroduplex (étape clé)
  • Formation de la jonction
    de Holliday et sa
    migration (branch
    migration)
  • Résolution de la jonction
    de Holliday
57
Q

Quelles sont les voies de recombinaison chez E. coli?

A

RecBCD, RecE et RecF

58
Q

Quelles sont les fonction de chaque sous-unités de RecBCD?

A

RecB: Activité hélicase 3’->5’ et activité nucléase dégradant l’ADN
RecD: Activité hélicase 5’->3’
RecC: Reconnaissance des sites Chi

59
Q

L’ADN dans le filament RecA est-il étiré ou compressé?

A

Étiré (1,5 fois plus grand)

60
Q

Qu’est-ce qui génère les cassures bicaténaires lors de la méiose?

A

La protéine Spo11

Génétique moléculaire II (4 decks)

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