Examen 2 Flashcards
Donnez la définition générale de «virus».
Substances infectieuses, signifie ‘‘poison’’
Quel genre de virus s'attaque à : 1- Des bactéries 2- Des champignons 3- Des virus 4- Des plantes
1- Bactéries –> bactériophage (ou simplement phage)
2- Champignons –> Mycovirus
3- Virus –> Virophage
4- Plantes –> phytovirus
Qu’est-ce que le spectre d’hôte?
Le spectre d’hôte représente l’éventail des différents types cellulaires permissifs à l’infection d’un virus.
Pourquoi dit-on qu’un virus est un parasite cellulaire obligatoire?
Parce qu’ils dépendent totalement d’une cellule hôte pour se reproduire (un virus ne possède peu ou pas d’enzymes nécessaires à son métabolisme et sa réplication).
Combien de gènes possède un virus?
De 10 à 400 (ils ont un génome restreint)
Qu’est-ce que la capside?
Une coquille de protéines formée de capsomères ( contient et protège le matériel génétique)
De quoi est constituée l’enveloppe d’un virus et d’où provient-elle (sachant que le virus est incapable de la synthétiser lui-même)?
Elle est constituée de phospholipides et elle est “volée” à la cellule infectée lors de la libération du virus (bourgeonnement).
Que sont les spicules?
Des protéines et glycoprotéines qui favorisent l’infection.
Quel virus possède un spectre d’hôte large?
Le lyssavirus (rage) qui attaque plusieurs types de cellules nerveuses de plusieurs animaux différents.
Quel virus possède un spectre d’hôte étroit?
Le poliovirus (poliomyelite) qui infecte 2 types cellulaires: épithélium du tube digestif et les neurones de la corne antérieure de la moelle épinière.
Expliquez le mécanisme du spectre d’hôte.
- Le virus se lie aux protéines membranaires de la cellule hôte par ses protéines de surface (la capside pour les virus nus et les spicules pour les virus enveloppés).
- Machinerie cellulaire compatible avec la réplication virale. (ex.: organites, polymérases, autres protéines)
Qu’est-ce que le virus modifie lors de l’infection virale?
- la physiologie de la cellule hôte
- le métabolisme cellulaire
Qu’est-ce que provoque une modification de la physiologie et du métabolisme de la cellule hôte par un virus?
Perte de l’homéostasie cellulaire et mort cellulaire par la lyse.
Décrivez la première étape du cycle lytique (l’attachement).
L’attachement: liaison spécifique entre les glycoprotéines virales (capside ou spicules) et les protéines de surface de la bactérie (cellule hôte).
Quelles sont les étapes du cycle lytique (seulement les noms)?
Attachement, pénétration, décapsidation et libération du provirus dans le cytoplasme, biosynthèse, assemblage et libération.
Décrivez la deuxième étape du cycle lytique (pénétration).
Injection de l’ADN viral dans la bactérie (le virus n’entre pas dans la bactérie).
Pourquoi les bactéries à Gram+ se font pénétrer plus facilement par les bactériophages?
Parce que la capside des virus porte le lysosyme qui affaiblit la paroi cellulaire de peptidoglycane.
Quels sont les 3 modes de pénétration chez les virus animaux?
1- Fusion avec l’enveloppe virale
2- Endocytose par récepteurs interposés
3- Translocation
Qu’est-ce que la biosynthèse? (cycle lytique)
Réplication des sous-unités de l’acide nucléique viral et la synthèse des protéines virales (capsomères et protéines pirates).
Que provoque la biosynthèse?
L’arrêt du métabolisme de la bactérie.
Quelles étapes sont les mêmes dans le cycle lytique et le cycle lysogénique?
Les étapes 1 et 2.
Parle-t-on de lysogénisation ou de cycle lytique lorsque l’ADN du prophage s’intègre au chromosome bactérien?
Lysogénisation
Qu’est-ce qui maintient le prophage/provirus en latence lors de l’intégration du prophage dans le génome bactérien?
Des protéines virales
Quelle est la différence entre la conversion phagique et la transduction localisée?
Conversion phagique: gènes complets transférés
Transduction localisée: fragments d’ADN
Quelle est la principale conséquence de la lysogénisation chez les animaux?
Les cancers.
Quels sont les 7 principaux types de virus qui causent des cancers chez les animaux?
Hépatite B Hépatite C Virus T-lymphotropique Papillomavirus (VPH) Herpesvirus de Kaposi Polyomavirus carcinome Virus Epstein-Bar
Quels sont les mécanismes directs de la carcinogenèse virale?
Transfert d’un oncogène viral lors de l’intégration du provirus au génome de la cellule hôte.
–> Entraîne la transformation cellulaire (perte de phénotype, immortalité [permet d’établir des lignées cellulaires])
Quels sont les mécanismes indirects de la carcinogenèse virale?
Mutations sur des gènes suppresseurs de tumeurs contrôlant l’intégrité de la cellule (points de contrôle du cycle cellulaire, gènes de réparation de l’ADN), gènes de mort cellulaire programmée
Quel cancer donnent les virus de l’hépatite B et C?
Hépatocarcinome (cancer des cellules épithéliales)
Quel cancer cause le virus T-lymphotropique?
Leucémie (cancer des globules blancs)
Quels cancers cause le papillomavirus (VPH)?
Cancers génitaux
Quel cancer cause l’herpesvirus de Kaposi?
Sarcome (cancer des tissus conjonctifs)
Quel cancer cause le virus d’Epstein-Bar?
Lymphosarcome (cancer des ganglions lymphatiques)
Nommez 4 propriétés qui définissent un virus.
1- Acellulaires
2- 1 seul type acide nucléique (ADN ou ARN)
3- Constitués d’une capside (parfois entourée enveloppe) qui contient matériel génétique)
4- Se reproduisent à l’intérieur de cellules vivantes en utilisant machinerie cellulaire
Nommez les méthodes de culture des virus.
Dans des animaux, dans des oeufs embryonnés et dans des cultures cellulaires
Pourquoi les virus sont considérés comme vivants sur le plan clinique?
Car ils causent des infections et des maladies. De plus. l’acide nucléique viral devient actif une fois à l’intérieur de la cellule hôte et résulte en une prolifération virale.
Pourquoi pourrait-on considérer les virus comme non-vivants?
Car ils sont acellulaires et ne contiennent qu’un seul acide nucléique. (agrégat de substances chimiques, donc inanimé)
Donnez la définition générale de la génomique.
L’étude de l’information génétique d’un organisme.
Qu’est-ce que le génome?
L’information génétique d’un organisme.
Nommez des types de séquences non-codantes dans le génome.
Introns
Répétitions
Pseudogènes (gènes répétés non-fonctionnels)
Hétérochromatine (architecture dynamique)
Les substances non-codantes jouent-elles un rôle dans le phénotype?
Oui, elles jouent un rôle que l’on commence a`découvrir (épigénétique).
Par quel chemin passent les gènes pour être transformés en protéine(s) chez les eucaryotes?
gènes –> ARN –> ARNm –> protéine(s) –> phénotype
Par quel chemin passent les gènes pour être transformés en protéine(s) chez les procaryotes?
gènes –> ARNm –> protéine(s) –> phénotype
Décrivez le chromosome bactérien.
Un seul chromosome circulaire.
Qu’est-ce qu’indique la carte du génome?
- les locus où les gènes se situent
- l’emplacement de l’origine de réplication
À quoi sert la carte du génome?
Elle sert à l’étude des gènes et applications en biotechnologie.
Qu’est-ce que le transfert vertical?
Le transfert du même génome d’une génération à l’autre par mitose.
Nommez les trois façons de faire du transfert horizontal.
1- Transformation bactérienne
2- Conjugaison bactérienne
3- Transduction (bactériophage)
Quelle est la différence entre le transfert horizontal et le transfert vertical?
Le transfert vertical se fait d’une génération à l’autre tandis que le transfert horizontal se fait au sein de la même génération.
Quels mécanismes assurent une variabilité génétique aux organismes à reproduction asexuée?
Les mutations et la recombinaison génétique
Qu’est-ce qu’une mutation?
Une modification ponctuelle dans la séquence génétique.
Donnez les deux sortes de mutations.
Substitutions et insertion/délétion
Quelles sont les sortes de substitutions (mutations)?
Substitutions silencieuses, faux-sens et non-sens
Quelles sont les causes des mutations?
- réparations erronées de dommages à l’ADN
- polymérases qui causent des erreurs
Qu’est-ce que la recombinaison génétique?
Des segments d’ADN (pouvant contenir plusieurs gènes) qui sont intégrés dans le génome [pour les bactéries il s’agit d’un transfert horizontal].
Qu’est-ce qui est nécessaire pour faire de la recombinaison génétique?
- des séquences d’ADN homologues (séquence d’insertion)
- des recombinases (enzymes)
Qu’est-ce qui est similaire dans la recombinaison génétique et dans les mutations?
Cela introduit de la diversité génétique
Qu’est-ce qui est différent dans la recombinaison génétique et dans les mutations?
Les mutations sont souvent silencieuses et pas nécessairement bénéfiques (faux-sens et non-sens) tandis que dans la recombinaison génétique, un ou plusieurs gènes sont transférés de sorte que la probabilité d’être bénéfique est plus grande.
Qu’est-ce que la transformation bactérienne?
Une cellule qui absorbe de l’ADN libre et qui l’intègre à son génome par recombinaison génétique.
Quelle est la condition pour que les cellules fassent de la transformation bactérienne?
Les cellules doivent être compétentes (compétence naturellement acquise [strep., staph., Bacillus, Neisseria] ou artificiellement acquise [E.Coli. en labo])
Qu’est-ce que la conjugaison bactérienne?
Transfert d’un plasmide conjugatif (F+) par contact direct.
Comment se fait la conjugaison bactérienne chez les Gram-, les gram+?
Gram- : pilus
Gram+ : pont de conjugaison
Qu’est-ce que la transduction?
Transfert de fragments d’ADN via un virus (cycle lysogénique) et recombinaison dans le génome.
Quel est l’effet d’une plus grande charge antigénique dans un vaccin?
Une plus grande réponse (mémoire) immunitaire.
