Examen 2 Flashcards
a quel niveau l’expression de certaines gènes est régulée ?
au niveau de la synthese proteique
a quel niveau la traduction s’exerce?
a l’initiation
comment regule négativement l’initiation de la traduction ?
en liant une proteine pres du site de liaison du ribosome et en formant des appariements de bases avec lui-meme , masquant plusieurs RBS
la synthese de chacune des proteine est coordoné avec quoi ?
la quantité d’ARNr libre
la vitesse de synthese prtohéique est lié a quoi ?
la vitesse de croissance de la cellule
Les proteines r agissent comme… ?
Répresseur de leur propre synthese
Les proteine R sont regroupé sous quelle forme ?
d’opérons
comment Les proteines r agissent ?
pour chaque opéron , une proteine r se lie au site de L,ARNm où débute la traduction de l’un des premiers gènes de l’opéron , ce qui empêche les ribosomes de se lier et d’initier la traduction
La proteine r régulatrice se lie également a quoi ?
un site de forte affinité sur l’ARNr
L’ARN 16 S et l’ARNm ont-ils des séquences semblables ?
oui
où est situé le codon d’initiation AUG
sur le site de liaison
que ce passe t’Il lorsqu’il y a liaison d’exces S8 ?
la traduction est reprimée
vrai ou faux : les Aminoacyl-ARNT ne se fixe pas sur leur propre ARNm
Faux , cela permet de régulé en ce fixant
s’Il y a des conditions de temperatures specifique ou des concentrations de certains métabolites specifique , que ce passe t’il ?
formation de differente strucutres
Que font les ribocommutateurs
Régulent la traduction
tous les ARNm bactériens ne sont pas traduits à la meme vitesse , pourquoi ?
la vitessse varie selon la séquence Shine-Dalgarno et la vitesse d’élongation dépend de la fréquence des codons préférés
comment le ribosome procaryotique s’associe a l’ARNm et comment il reconnait le codon initiateur
par appariement de base entre la séquence Shine-Dagarno et L’extremité 3’ de l’ARNr 16S
a quelle étape la traductiton est régulé ?
à la reconnaissance de l’ARNm et lors de la liaison de l’ARNt initiateur de la sous-unité 40S
le mecanisme d’inhibition est controlé par quoi ?
la phosporylation
quelle est la sous-unité de eIF2 qui est phosporile
Alpha
la phophorylation de la sous-unité de eIF2 inhibe quoi
l’activité d’un facteur d’échange de GTP
Decrire chacune des 4 Kinases qui phosporylent eIF2 : 1. HRI 2. PKR 3 GCN2 4 PEK
1 est activé lorsque qu’il n’y a pas assez d’hème
2 activé par un ARN double brin
3 GCN2 activé par liaison avec ARNt non chargés
4 Activé lorsque le reticulum endoplasmique a trop de proteine non replié ( associé au diabete type 1)
La protine 4E-BP est en competition avec quelle autre proteine lorsqu’elle n’est pas phosphorylé ?
la eIF4G
la eIF4G et la 4E-BP ce lient a quoi ?
la eIF4E
ques qui regule la eIF4G et la 4E-BP?
la phopshporylation
ques qui enpeche la 4E-BP de se lier à eIF4E ?
la phosphorylation par la proteine kinase mTor
l’inhibiton de eIF4E est fais avec quoi dans la drosophile
Bruno et Cup qui se lie a Bruno
dans les ovocytes , qu’es qui reprime les ARNm ?
La Maskin
Ques qui recrute la Maskin ?
la CPEB
la ferritine est une proteine qui lient le fer et qui est régulé par l’IRP
VRAI
L’iRP lient le fer et l’ARNm de la ferritine ?
Vrai
Quel est le nom des structures tige boucle reconnu par L’IRP ?
L’IRE , placé dans la region 5’ non traduite
l’ADN polymerase sert a quoi ?
allonger la chaine d’ADN apparié avec la matrice d’un nucleotide a la fois
l’adn est synthtisé de quelle coté ?
5’ vers 3 ‘
la replication d’ADN est uni ou bidirectionnelle ?
Bidirectionnelle
role de l’ADN Gyrase ?
deroulé les superenroulement en produisant des sepurenroulements negatif
ques que le brin retardé ?
le brin d’ADN qui est inversé a la synthese
Comment est synthétisé le brin retardé ?
a l’aide des fragments d’Okazaki
Ques que les fragements d’Okazaki ?
Des fragements d’ADN créé du brin retardé qui sont par la suite relié par un ADN ligase pour former l’ADN
comment les amorces sont ajouté sur les ADN ?
a l’aide de DnaG qui produit les amorces.
Les amorces nouvellement synthétisé pour les fragments d’Okasaki ont quoi comme séquence ?
pppAG
ADN Polymerase 1 (Pol 1) posede deux activité exonucléase , lesquesl?
3’à5’ et 5’à 3’
avec quelle fonction Pol 1 corrige ses fautes ?
5’ à 3’
qu’elle est le prix de la fidelitte de Pol1
3 % des nt correctements incorporés sont excisés
comment fonctionne l’exonucléase 5’ 3’
elle permet a Pol de ce lier a un site de coupure simple brin de l’ADN
es ce que la Pol 1 est une replicase ?
non
de quelle coté est clivé la lésion apr l’exonucléase ?
5’
comment est activé l’exonucléase de Pol 1 ?
lors du clivage du coté 5’
ques que Pol 1 fait en meme temps de d’exciser l’ADN endommagé ?
elle comble la breche avec son activité polymérase
qu’elle est la fonction physiologique de Pol1 ?
enlever les amorces d’ARN
qu’elle est l’enzyme Pol la plus abondante ?
Pol 1
quelles pol sont impliqué dans la réparation des lésions
Pol1 Pol 2 Pol 4 et Pol5
Combien de complexe enzymatique compose Pol 3
10
Quelle sont les sous-unités du centre catalytique de Pol3
Alpha , epsilon et theta
quelles sont les composantes de Pol3
le centre catalytique ( Alpha, Epsilon et Theta)
Composante de dimerisation ( )
Attache dimertique (beta)
Chargeur d’attache
a quoi sert les attaches dimertique de Pol 3
retenir Pol3 sur l’ADN
a quoi sert la composante de dimeration de Pol3 ?
lier les deux centres catalytiques
a quoi sert le chargeur d’attache de Pol3
a placer les attaches dimerique sur l’ADN
vrai ou faux , le dimere Beta de pOL 3 A UN MAXIMUM D’INTERACTION AVEC L’ADN
Faux , c’est un minimum d’interaction
comment le chargement de l’attache beta est couplé?
avec la liaison et l’hydrolyse de l’ATP
Vrai ou faux : Pol 3 ne peut pas derouler le duplex d’ADN
Vrai
a quoi collaborent la DnaB et la SSB ?
Creer la fourche de replication
a quoi est couplés la DnaB et la SSB
l’hydrolyse de l’ATP
que fais la DnaB
elle sépare l’ADN en deux
que fias la SSB
previent le reappariement de l’ADN
autre la DnaB , quelle autre Hélicase est utilisé dans plusieurs ADN de phages d’ E. Coli
la Rep et la PriA
a quelle prix se deplace la Rep et la PriA
l’hydrolise de l’ATP
par quoi est fournie l’energie pour les ligases lors de la soudure des brins
le NAD et l’ATP
la replication de l’ADN chez E. Coli est fait par quoi ?
le replisome
Qu’es ce que le primosome
sous complexe proteique du replisome qui est impliqué dans la syntheses de chaque brin d’okazaki
Le complexe de primosome est constitue de quoi ?
Une hélicase (DnaB et une Primase (DnaG)
es ce que la primase est permanente au primosome
non , elle est la seulement pour l’amorcage
Étape du modele du trombone
1- Creation d’une boucle du coté retardé
2- le primosome synthese une amorce d’Arn
3-la sous-unité alpha de Pol3 synthétise le brin retardé à l’amorce d’ARN
4- la matrice du brin reatrdé est tiré en sens inverse permettant de creer l’ADn
es ce que les sites alpha du modele trombone sont du meme coté ?
non , ils sont du sens inverses
l’hélicase se deplace sr la matrice du brin retardé dans quelle sens ?
5’ 3’
la replication des deux brins sont effectuée par quoi ?
deux centre catalytique de Pol 3
que ce passe t’il lorsque l’ADN polymerase a fini de repliquer un fragment d’Olasaki ?
elle ce detache de l’attache beta et de l’ADN
de combien de fois la liaison d’hélicase à l’holoenzyme Pol 3 augmente la vitesse de separation des brins parentaux ?
10 fois
es ce que le complexe y peux charger et decharger les attaches beta ?
oui
qu’arrive -t-il lorsque la sous-unité alpha est liée à beta ?
le complexe y ne peut ce lier, donc il faut qu’alpha ce libere de la vieille attache
l’ADN polymerase est transférée d’une attache beta a una autre de la synthese du brin retardé
yup thats right
les chromosomes de bacteries ont combien d’origine de replication ?
une seule, oriC permet d’avoir cette origine
étape de la replication au site oriC
DnaA vient se lier
DnaA entraine la fusion (separtion des brins d’ADN)
complexe DnaB6*DnaC6 se lie a la region
comment la premiere amorce d’ARN est-elle synthétisée ?
-DnaB agrandit la region desappariée
-La primase reconnait DnaB et se lie
-le complexe DnaBprimase se deplace le long de l’ADN et la primase fabrique le premier fragment d’Okazaki
l’holoenzyme Pol3 s’assemble sur DnaBPrimase et utilise L’amorce pour debuter la synthese
combien de temps separe l’initiation de la replication et la division cellulaire ?
60 min
comment oriC est controlé ?
le mecanisme est pas encore connu mais une methyllase appelée Dam reconnait la sequence
qu’es que le degré de méthylation du plaindrom GATC permet de voir ?
si l’origine est repliqué ou non
es ce qu’une origine hémi-methyle peux etre reconnu par DnaA DnaB et DnaC ?
non
oriC est activé seulement si le GATC est méthylée ?
Vrai
lors de la terminaison de la replication , la fourche 1 traverse quelle Ter pour arreter ? et la fourche 2 ?
fourche 1 : terA, terD, terE
Fourche 2: terC, terB, terF
ques qui arrete la fourche lorsqu’elle entre en contact avec un site ter ?
La proteine Tus qui inhibe la DnaB
ques ce qui sépare les deux molécule d’ADN ?
Topoisomerase type 2
a quoi s’apparente la synthese du brin d’ADN avec le bactériophage M13
La synthese du brin avencé dans l’ADN d’E. coli
a quoi s’apparente la synthese du brin d’ADN avec le bacteriophage oX174 ?
elle s’apparente a la synthese du brin retardé
comment expliquer le faible taux d’erreur dans l’ADN
1Les cellules maintiennent des niveeaux équilibrés en dNTP
2 la polymerisation par l’ADN polymerase es fidele, gravce a son mecanisme a 2 etapes
3 les fonction exonuclease 3’ 5’ de pol 1 et 3 sdetectent et eliminent les erreurs
4 d’autre enzyme peuvent reparer
quelle sont les deux propriétés des ADN polymerases qui contrinuent a augmenter la fidelité de la replication
pas d’élongation sans amorces
l’incapacité de synthetiser l’ADN dans le sens 3’ 5’
