Examen 2 Flashcards
Peux-tu me décrire la structure de l’ADN ?
- L’ADN est constitué de désoxyribonucléotides
- Cytosine
- Thymine
- Guanine
- Adénine
- Liaisons phosphodiestier (Groupements phosphates
forment deux liaisons ester C5’ C3’ - Forme de doubles hélices
- Adénine et thymine = Doubles liaisons (O-H , N-H)
- Guanine et cytosine = Triples liaisons (O-H, N-H, O-H)
- Par convention la séquence est lue de 5’ -> 3’
- Deux brins antiparallèles
Quelles sont les 3 principales étapes du processus de réplication ?
1- Initiation de la réplication
2- Élongation
3- Terminaison
Quelles sont les 4 étapes de la réplication de l’ADN chez les bactéries ?
1- Réplication débute à l’origine de réplication unique
(Séquence riche en A-T)
2- Protéine initiatrice reconnaît origine de réplication et
sépare les deux brins d’ADN => Rupture liaisons
hydrogènes
3- ADN simple brin exposé permet fixation et assemblage
des protéines impliquées (2 fourches se forment)
4- Réplication se poursuit dans les deux sens jusqu’à
atteindre une séquence de terminaison unique
Vrai ou faux, la réplication dans les cellules eucaryotes s’effectue. Des centaines de fourches se forment simultanément et se dirigent dans le même sens.
Faux, elles se dirigent dans un sens opposé = réplication bidirectionnelle.
Qu’est-ce que l’hélicase et peux-tu me décrire son mode de fonctionnement chez les bactéries (4 étapes) et les eucaryotes (3 étapes) ?
L’hélicase est une des premières protéines qui se fixe à l’origine. C’est une protéine hexamèriques en forme d’anneau qui entoure les deux brins.
Fonctionnement :
(Bactéries)
1- Protéine initiatrice se fixe sur une séquence riche en AT et
crée une déformation
2- L’hélicase liée à une protéine chargée se lie à la
déformation d’ADN
3- Protéine chargée se détache ce qui active l’hélicase
4- L’hélicase ouvre les brins
(Eucaryotes)
1- Forme inactive de l’hélicase se lie à l’ADN à chaque origine
bien avant la réplication
2- MAP kinase activé par un mitogène (présence de
nutriments) initie la réplication
3- Chaque hélicase sont activées par phosphorylation
catalysée par la MAP kinase
Qu’est-ce que les protéines SSB et quel est leur rôle dans la réplication ?
Ces protéines stabilisent l’ADN simple brin puisque celui-ci est très instable. Cette protéine se fixe sur le brin monocaténaire et se déplace au fur et à mesure que l’ADN polymérase avance.
=> Appelée SSB chez E.coli
Protéine A. chez Eucaryotes
Qu’est-ce que la topoisomérase et quel est son rôle dans la réplication ? De plus, expliques moi ce que font les tropoisomérases I et tropoisomérases II.
C’est une enzyme qui modifie le statut topologique de l’ADN. Elle empêche le surenroulement en éliminant les tension de torsion (Exemple de la pelote de laine). Elle coupe l’ADN et lui permet de se relâcher.
Tropoisomérases I : Engendre une coupure simple brin transitoire pour éliminer le surenroulement
Tropoisomérases II : Engendre une coupure double brin transitoire pour éliminer le surenroulement
=> Aussi capable de recoller les brins
Qu’est-ce que l’ADN polymérase et quel est son rôle ?
C’est une enzyme qui utilise le brin matrice d’ADN pour synthétiser un nouveau brin dans le sens 5’ -> 3’. Plusieurs ADN polymérase peuvent aussi avoir une activité exonucléase ce qui veut dire qu’elle peut enlever des nucléotides à l’extrémité du brin (Correction sous épreuve).
=> Elle nécessite une amorce
Qu’est-ce que la primase et quel est son rôle ?
La primase est une ARN polymérase qui synthétise une courte séquence d’ARN (10-12 nucléotides) comme amorce pour l’ADN-polymérase
Quelles sont les 2 contraintes auxquelles fait face l’ADN polymérase ?
1- L’ADN polymérase n’est capable d’allonger qu’une
séquence préexistante
2- L’ADN polymérase synthétise toujours dans le sens 5’ -> 3’
Comment se fait la synthèse du brin discontinue (Brin retardé) par l’ADN polymérase (5 étapes) ?
1- Il faut attendre que la fourche soit assez avancée pour
qu’il y est une deuxième réplication (En bas)
2- Cette réplication se fait fragments par fragments
(fragments d’Okasaki) puisque la réplication se fait dans le
sens opposé de l’ouverture de la fourche. Ceux-ci sont
synthétisé à partir d’une amorce
3- Une exonucléase enlève l’amorce d’ARN et quelques
nucléotides contigus (Augmente fidélité)
4- L’ADN polymérase remplace les ribonucléotides par des
désoxyribonucléotides
5- L’ADN ligase catalyse la ligature des fragments contigus et
produit un brin retardé continu
=> Aller voir diapo 27
Quelle est la différence entre les fragments d’Okasaki des bactéries et ceux des Eucaryotes ?
fragments d’Okazaki beaucoup plus long chez les bactéries (500 à 2000 pb) que chez les eucaryotes (100 à 200 pb) puisque la structure de l’ADN chez les bactéries est beaucoup plus simples, donc la réplication est plus simple et ne nécessite pas plein de petits fragments
Quelles sont les caractéristiques des pinces coulissantes qui maintiennt en place l’ADN polymérase ?
1- C’est une protéine accessoire qui forme une pince
coulissante autour de l’ADN pour maintenir l’ADN
polymérase en place
2- Une protéine chargeur de pince est jumelée à la pince
pour permettre son assemblage au brin
3- La pince coulissante doit être replacée à chaque début
de synthèse d’un fragment d’Okasaki du brin retardé (En
bas)
Pourquoi le brin retardé peut former des boucles de façon périodique ?
Il forme des boucles afin que l’ADN polymérase puisse travailler dans le même sens que le brin du haut (Vers la droite ou vers la fourche)
=> Voir diapo 29
Vrai ou faux, l’ADN polymérase a aussi un rôle d’exonucléase et peut se déplacer de 3’ -> 5’
Vrai, l’ADN polymérase est capable de détecter la distorsion engendrée dans la double hélice au cas où un mauvais nucléotide est incorporé ce qui permetterait de l’exciser
Quelles sont les 5 polymérases des bactéries et leurs spécificités ?
1- ADN polymérase III : Principale enzyme de réplication,
responsable de la synthèse de la majorité de l’ADN. Elle est
rapide et hautement processive
2- ADN polymérase I : Possède une activité exonucléase 5’ ->
3’ afin d’éliminer les amorces d’ARN et les remplacer par
l’ADN
3- ADN polymérase II, IV, V : interviennent dans la réparation
de l’ADN
Peux-tu me décrire les étapes de la réplication de l’ADN chez les bactéries ?
1- L’ADN polymérase III fonctionne simultanément sur
chacun des brins et la primase synthétise des amorces sur
le brin retardé
2- Une boucle se forme sur le brin retardé permettant une
réplication dans le même sens pour les deux brins
3- Quand l’ADN polymérase III termine de synthétiser un
fragment sur le brin retardé, elle la pince se libère. L’ADN
polymérase I se fixe pour éliminer l’amorce
4- Le chargeur de pince se fixe sur la pince et la place sur
l’ADN polymérase III ce qui crée une nouvelle boucle sur le
brin retardé. L’ADN ligase réunit les fragments après
l’élimination de l’amorce par l’ADN polymérase I
5- Lorsque la pince est chargée, l’ADN polymérase III rajoute
des bases au fragment d’okasaki suivant
Peux-tu me décrire les étapes de la réplication de l’ADN chez les eucaryotes ?
1- L’ADN polymérase alpha est constituée de 2 sous-unités
ADN polymérase et 2 sous-unités de primase commence à
synthétiser le brin directe et retardé
2- L’ADN polymérase delta continue la synthèse du brin retardé
3- L’ADN polymérase epsilon continue la synthèse du brin
directe
4- La RNAse-H (exonucléase)retire l’amorce ARN
=> Regarder diapo 35
Peux-tu me donner les 5 étapes de la terminaison de la réplication de l’ADN chez les bactéries ?
1- Les fourches de réplications avancent jusqu’à ce qu’elles
entrent en collision
2- Dans un chromosome bactérien circulaire, une série de
séquence de terminaison (Ter) sont localisées à l’extrémité
de l’origine
3- La première fourche arrivant à Ter s’arrête jusqu’à l’arrivé
de l’autre fourche
4- La réplication produit deux anneaux d’ADN
5- La topoisomérase II crée une cassure double brin
transitoire (Coupe et recolle) ce qui sépare les anneaux
=> Regarder diapo 36-37
Peux-tu me donner les 2 étapes de la terminaison de la réplication de l’ADN chez les eucaryotes ?
1- Deux fourches qui se rapprochent et fusionnent
2- La réplication de l’ADN eucaryote donne deux brins
identiques
3- Ajout de télomères à l’aide de la télomérase (Séquence de
6 nucléotides TTAGGG)
Expliques pourquoi la réplication de l’ADN crée un raccourcissement des chromosomes ?
Les extrémités 3’ des deux brins causent problème…
L’amorce est éliminée par la RNase-H, donc il y a des bouts d’ADN simple brin qui sont sensibles aux exonucléases. Les exonucléases vont les dégrader. Au fur et à mesure de la réplication, l’ADN sera réduit jusqu’à disparaître. Il y a une durée de vie limité des cellules eucaryotes liée à ces extrémités de brins. Notre mortalité vient entre autre de là. Les cellules ont une capacité limite de division puisqu’à un moment donné ce raccourcissement (Raccourcissement des chromosomes) touchera à des gênes essentiels du génomes. Selon cette théorie, les procaryotes seraient immortels
Comment les cellules luttent contre le raccourcissement des chromosomes ?
En allongeant activement leurs extrémités à l’aide de télomères de courtes répétitions en tandem.
Vrai ou faux, la télomérase a une activté transciptase inverse. Comme les virus, elle peut copier l’ARN en ADN.
Vrai
Expliquez la relation existant entre l’immortalité cellulaire et l’activité télomérase.
Les télomères diminuent à chaque division jusqu’à atteindre une phase de sénescence et arrêtent de se diviser. Ensuite l’ADN raccourcit de plus en plus jusqu’à toucher à des gènes essentiels. Cela peut expliquer pourquoi nous sommes des êtres mortels
=> Organismes unicellulaires ou les cellules souches (Moelle
osseuse -> regénération du sang) possèdent une
télomérase active ce qui leur confère une immortalité
Peux-tu me nommer les 4 différentes altérations endogènes et dires ce qu’elles engendrent (Subsitution/Délétion/Insertion) ?
=> Le métabolisme cellulaire expose l’ADN aux effets
dommageables des espèces réactives à l’oxygène
(Superoxyde, H2O2) qui sont des sous-produits normaux
du métabolisme oxydatif
1- L’oxydation : Guanine peut être oxydée en 8-oxoguanine
et peut former ensuite une paire de base avec soit A ou C
lors de la réplication = Substitution, car G:C peut devenir
T:A
2- Dépurination/Dépyrimidination : Hydrolyse de la liaison
N-Glycosidique produit un site abasique (apurinique,
apyrimidique) = Délétion
3- Désamination : L’uracile a tendance à former les mêmes
paires de bases que la thymine ainsi paire de base G:C
peut devenir T:A après réplication
4- Méthylation :
Quels sont les 3 éléments pouvant être à l’origine d’altérations d’origine environnementales et ce qu’elles produisent dans l’ADN ?
1- La lumière ultraviolette => Liaison covalentes entre des
bases de thymines contigues => Rapproche et distord la
structure hélicoïdale de l’ADN
2- Les rayons ionisants => Produisent cassure dans l’ADN
grâce à des radicaux libres
3- Agents chimiques =>
Quelles sont les 3 principaux mécanisme de réparation de l’ADN ?
1- Les voies spécifiques qui ciblent un seul type de lésion
2- Les voies non spécifiques où un mécanisme permet de
réparer de multiples types de lésions
3- Réparation des cassures double-brin
Quelles sont les 3 enzymes liées à la réparation spécifique de l’ADN qui cible un seul type de lésion et expliques précisément ce qu’elles permettent de réparer ?
1- L’ADN photolytase :
Capable de dissocier les thymines contiguës reliées par
des liaisons covalentes induites par la lumière
ultraviolette
2- Méthyltransférase :
Retire le groupe méthyle indésirable induit par la
méthylation
3- Réparation des mésappariements (Mismatch Repair MMR)
réalisé par une protéine et 3 enzymes => Question plus
loin sur les étapes de cette réparation
Quelles sont les 4 étapes de la réparation de mésappariements (MMR) ? (Cible un seul type de lésion)
1- Une protéine contrôle l’ADN nouvellement synthétisé et
se fixe au niveau des mésappariements ce qui provoque
une courbure
2- Une endonucléase reconnait la déformation de l’ADN et
clive le brin renfermant la base incorrecte
3- Une hélicase déroule l’hélice pour éliminer le fragment
défectueux
4- ADN polymérase remplace le fragment éliminé par les
nucléotides corrects
Quelles sont les 4 étapes de la réparation par excision de base (BER) ? (Cible plusieurs types de lésion)
=> Corrige les lésions les plus fréquentes de l’ADN
1- La base endommagée est éliminée par une glycosylase
2- Une endonucléase coupe ensuite le squelette du brin
3- La lacune est comblée par l’ADN polymérase
4- L’ADN ligase ressoude la coupure
=> L’uracile incorporée par erreur ou par désamination de la
cytosine ou par oxoG est éliminé par ce système. La
dépurination/dépyrimidination est aussi réparée par BER
= Commence à l’étape 2, car base déjà enlevée
Quelles sont les 4 étapes de la réparation par excision de nucléotide (NER) ? (Cible plusieurs types de lésion)
=> Corrige la deuxième forme de lésions les plus fréquentes
de l’ADN
1- Cible les dommages causés par des réactions
d’oxydations ou des rayons UV
2- Un segment contenant le nucléotide endommagé et
environ 30 de ses voisins est enlevé par l’intervention
d’une hélicase
3- Une endonucléase coupe le squelette du brin
4- La lacune est comblée par l’ADN polymérase
Qu’est-ce que le xeroderma pigmentosum ?
C’est une maladie caractérisée par une sensibilité élevée à la lumière solaire. Cela cause une mutation d’un gène impliqué dans le NER qui engendre une absence de réparation des lésions induites par les UV.
=> 1000x plus de risque de développer un cancer de la peau
Quelles sont les 4 étapes de la réparation par jonction d’extrémités non homologues ? (Réparation cassures double brins)
=> Répare les cassures causées par les radiations et radicaux
libres
1- Reconnaissance des cassures doubles brins par la
protéine Ku
2- Fixation de Ku sur l’ADN coupé et recrutement d’une
nucléase qui excise jusqu’à 10 nucléotides de l’extrémité
de l’ADN
3- ADN polymérase peut allonger les extrémités. Des
nucléotides peuvent être rajoutés ou supprimés.
4- Une ADN ligase achève le travail
=> Ce mécanisme peut être responsable de la
recombinaison de segments qui ne vont pas ensemble
(Translocation de chromosome)
Quelles sont les 3 étapes de la réparation par recombinaison homologue ? (Réparation cassures double brins)
=> Mécanisme qui opère lors du brassage des gènes entre chromosomes homologues lors de la méiose
1- Des protéines Rad51/RecA se fixent sur l’ADN simple brin
en commençant au point de cassure
2- Le segment Rad51-ADN s’aligne côte à côte avec l’ADN
double brin contenant une séquence complémentaire (Force l’insertion)
3- Le filament Rad51 va induire l’appariement du brin
complémentaire homologue au simple brin cassé
Peux-tu me donner 3 caractérisitiques de structure de l’ARN ?
1- L’ARN est un polynucléotide simple brin, il a une plus
grande liberté de conformation que l’ADN
2- Un brin d’ARN peut se replier sur lui-même pour former
des paires de base entre des segments complémentaires
du même brin
3- Joue un rôle plus actif dans l’expression de l’information
stockée dans l’ADN
Pourquoi l’instabilité de l’ARN est fondamentale ?
Pour la modulation de l’expression de gènes
Qu’est-ce qu’un gène ?
Un segment d’ADN qui est transcrit dans le but d’exprimer l’information génétique qu’il code ou de le transformer en une forme plus utile pour la cellule
Peux-tu me décrire l’organisation des génomes chez les procaryotes et chez les eucaryotes ?
Procaryotes :
-> Leur génome est compact
-> Dans les génomes des procaryotes, l’ADN représente
pratiquement que des gènes codant pour des prots ou de
l’ARN
Eucaryotes :
-> 45% du génome est constitué de séquences
moyennement répétées (Non codante, mais essentielles
pour la régulation de la transcription)
-> 3% de séquences hautement répétitives
-> Séquences uniques (Introns, séquences de régulation)
-> 1,4% séquences codantes
Vrai ou faux, la traduction de l’ARN se réalise dans le noyau chez les procaryotes et dans le cytoplasme chez les eucaryotes
Faux, toutes les étapes (Réplication, Transcription et Traduction) se réalisent dans le cytoplasme chez les procaryotes tandis que chez les eucaryotes, la traduction se fait dans le cytoplasme et la transcription dans le noyau
Quelles sont les différentes sections de l’ADN (5) et de l’ARNm (!) chez une bactérie et quelles sont leur rôle ?
ADN :
1- Opérateur : c’est une séquence de régulation, de contrôle
de la transcription. (Soit une augmentation de la
transcription ou une réduction). Elle peut bloquer la
transcription. Elle va être reconnue par des protéines qui
vont être spécifiques à l’opérateur.
2- Promoteur : Site de fixation de l’ARN polymérase
3- Codon start : Séquence reconnue pour la transcription par
l’ARN polymérase
4- ORF (Open reading frame) : Phase ouverte de lecture
5- Un terminateur : Fin de transcription pour l’ARN
polymérase
ARN :
1- RBS : Séquence reconnue par le ribosome afin de
commencer traduction
Réviser diapo 22
Comment l’ARN polymérase bactérienne peut être positionner sur le bon site et dans la bonne direction sur le brin ?
Les deux gros doigts bleus (Facteur σ) reconnaît les deux séquences -35 et -10 du promoteur (Un doigt sur -35 et l’autre sur -10).
=> Déroule l’hélice d’ADN à -10
Peux-tu me décrire comment se fait l’élongation et la terminaison (2 types) dans la transcription de l’ADN chez les bactéries ?
L’élongation : Le premier nucléotide est en général un ATP ou un GTP. Celle-ci se réalise en ajoutant des ribonucléotides dans le sens 5’ -> 3’
Terminaison :
Terminateur Rho indépendante :
Se réalise à une localisation spécifique = Région palindromique (On peut lire dans le sens inverse) suivie d’un résidu T. Cette région peut se replier sur elle-même afin de former une épingle. Cette région sera suivie d’une série de UUUU (Liaisons moins fortes) => Se détache
Terminateur Rho indépendant :
Nécessite l’intervention d’une protéine appelée facteur rho (ρ) afin de couper l’ARN messager au lieu de nécessité une épingle
Vrai ou faux, dès que l’ARNm est disponible, les ribosomes s’y fixent afin de synthétiser des peptides
Vrai
Que permettent les opérons chez les bactéries ? Peux-tu me donner un exemple ?
Les opérons sont des séquences d’ADN permettant l’expression coordonée des gènes.
Exemple :
L’opéron lac (lactose) qui code des protéines impliquées dans le métabolisme du lactose (Servent toutes à l’absorption du lactose) :
- Beta-Galactosidase : Enzyme qui catalyse l’hydrolyse du
lactose en monosaccharides
- Lactose perméase : Transporte le lactose vers l’int. de la
cellule
- Transacétylase : Enzyme qui catalyse l’acétylation de beta
galactoside
Comment l’expression des gènes présents sur l’opéron lac peuvent être empêchés/permis d’être transcrit chez les bactéries ?
Empêchés :
Gène de régulation est transcrit et produit un répresseur actif qui viendra se fixer sur le site opérateur juste avant l’opéron ce qui bloquera le passage de l’ARN polymérase, donc il n’y aura pas d’enzymes de synthétisées
Permis :
Gène de régulation est transcrit et produit un répresseur actif qui est inactivé par l’allolactose (Transformation du lactose lorsque présent) ce qui l’empêche de se fixer sur le site opérateur. À cet effet, l’ARN polymérase pourra passer et il y aura des enzymes de synthétisées pour la digestion et abs du lactose
(Faire un dessin => Diapo 30)
Quel est la différence entre l’opéron lac et l’opéron trp par rapport au répresseur chez les bactéries ?
Contrairement au répresseur de l’opéron lac, le répresseur de l’opéron tryp est inactif en absence de son ligand (tryptophane) et ne se fixe pas sur le site opérateur et devient actif lorsque le tryptophane est présent et se fixe pour bloquer l’expression des gènes de l’opéron
(Faire un dessin => Diapo 32)
Vrai ou faux, le brin matrice des eucaryotes ne possèdent pas d’opéron
Vrai
Peux-tu me nommer les 3 caractéristiques de l’empaquetage de l’ADN et comment cet empaquetage affecte la transcription chez les eucaryotes ?
1- L’ADN des eucaryotes est empacté dans les nucléasomes
2- La chromatine hautement condensée a tendance à être
inactive d’un point de vue transcriptionnel
3- Le degré d’empaquetage est contrôlé en partie par des
modifications covalentes des histones formant le coeur
des nucléasomes
=> L’addition ou l’ablation de divers groupes modifie les
histones et modifie la structure de la chromatine ce qui
promouvoir ou empêcher l’expression des gènes
Peux-tu me décrire les 3 modifications des histones et comment cela influence son interaction avec l’ADN chez les eucaryotes ?
1- Acétyle (Acétyltransférase) :
Ce groupement chargé négativement vient s’ajouter à
l’arginine (K) qui devient neutre ce qui modifie l’attraction
entre l’ADN et les histones puisque l’ADN est chargé
négativement, donc permet à l’ADN de se dérouler pour
rendre l’accès libre à l’ADN polymérase
2- Méthyle (Méthyltransférase) :
Ce groupement est chargé négativement et vient s’ajouter
à la lysine (R) et c’est le même principe que pour l’acétyle
3- Phosphoryle (Kinase) :
Groupement négatif repoussant l’ADN
Qu’est-ce que le complexe de remodelage de la chromatine chez les eucaryotes ?
C’est un complexe protéique qui effectue le remodelage de la chromatine pour exposer l’ADN afin d’interagir avec la machinerie de transcription
=> En faisant intervenir des groupements protéiques, par
exemple (Acétyle, méthyle, phosphoryle)
.
Vrai ou faux, la méthylation fait partie d’un marquage ou de silencing de l’ADN qui ne contient pas de gènes chez les eucaryotes ?
Vrai, c’est un processus de modification qui n’est pas relié au code génétique (épigénétique). De plus, les traits héréditaires ne sont pas uniquement dériviés de la génétique classique. C’est au-delà de cela puisque ça peut venir de si la cytosine est méthylée ou pas.
Qu’est-ce que la boîte TATA chez les eucaryotes ?
C’est une séquence contenue dans le promoteur et c’est là ou la transcription commence chez les eucaryotes
Qu’est-ce que les facteurs de transcription généraux et les facteurs de transcriptions spécifiques chez les eucaryotes ?
=> Ceux-ci reconnaissent les promoteurs des eucaryotes
1- Les facteurs de transcription généraux sont nécessaires à
l’assemblage d’un appareil de transcription et au
recrutement de l’ARN polymérase
2- Les facteurs de transcription spécifiques augmentent ou
diminuent le taux de transcription dans certains types de
cellules ou en réponse à des signaux
Quelles sont les 4 étapes de l’initiation de la transcription par les facteurs de transcriptions généraux chez les eucaryotes ?
=> Requiert 5 protéines TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF et TFIIH
1- TFIID se fixe à TATA et TFIIB se fixe aux séquences BRE
2- TFIID a une activité histone acétyltransférase
(décompactage)
3- TFIIE rejoint le complexe et recrute TFIIH qui est un hélicase qui
déroule l’ADN de façon ATP-dépendante
4- TFIIF interagit avec le brin non matrice pour stabiliser la
bulle de transcription
=> TAF = Facteurs associés de transcription
Comment les amplificateurs et les silenceurs agissent sur le brin matrice de l’ADN chez les eucaryotes ?
Ceux-ci agissent à distance du promoteur (120kb en amont ou en aval du site de démarrage de la transcription)
- Des protéines (activateurs ou répresseurs = facteurs de
transcription) se fixent aux amplificateurs pour soit activer
ou désactiver la fonction spécifique d’un gène - Un complexe protéique appelé médiateur relie l’activateur
lié à l’amplificateur à la machinerie de transcription par un
repliement en attente de la transcription
=> Diapo 43, Chap 6
Comment les hormones et la signalisation par Ras et stéroïdes agissent amplifient l’expression des gènes chez les eucaryotes ?
1- Les hormones stéroïdes activent directement des
protéines de liaisons à l’ADN, donc sont eux-même des
facteurs de transcription
2- La signalisation par Ras active directement plusieurs
facteurs de transcription
Quelles sont les 3 types d’ARN polymérase chez les eucaryotes et leur rôle respectif ?
1- ARN polymérase : Transcription des ARNr
2- ARN polymérase II : Transcription des gènes codants des
protéines
3- ARN polymérase III : Transcription des ARNt et autres
petits ARN
Comment s’effectue l’élongation de la transcription chez les eucaryotes (2 étapes) ?
1- L’ARN polymérase II est phosphorylée par l’activité kinase
de TFIIH (Hélicase)
2- L’ARN polymérase II se détache des facteurs d’initiation de
la transcription et avance le long de la matrice pendant
que le décompactage s’opère
Comment s’effectue la terminaison de la transcription chez les eucaryotes (2 étapes) ?
1- Une séquence de polyadénylation AAUUAAA sert de signal
à un complexe protéique qui clive (coupe) l’ARN et le
rallonge d’une séquence poly (A) => On rentre dans la
phase de maturation
2- La réaction de clivage de l’ARN déclenche la terminaison
de la transcription
Comment s’effectue la maturation de la transcription chez les eucaryotes (2 étapes) ?
1- Les ARNm eucaryotes reçoivent une coiffe en 5’ et une
queue poly (A) en 3’
2- La maturation de l’ARN commence dès que le transcrit
émerge de l’ARN polymérase
Quels sont les rôles de la queue poly (A) en 3’ et de la coiffe en 5’ sur un brin d’ARN chez les eucaryotes ?
1- Protection contre les exonucléase
2- Transport de l’ARN, vers le cytoplasme pour la traduction
-> (queue poly (A))
De manière générale, quel est le rôle de l’épissage lors de la maturation de l’ARNm chez les eucaryotes ?
=> Retirer les introns par excision et le raboutage des exons.
=> Tout cela ce réalise avant même que l’ARN polymérase ait
fini de transcrire
Quelles sont les étapes de l’épissage dans la maturation de l’ARNm chez les eucaryotes ?
=> Effectué par le spliceosome (Complexe de 5 molécules de
petits ARN = snARN et plus d’une centaine de protéines)
1- Le spliceosome reconnait des séquences conservées à la
jonction intron - exon
2- Appariement de bases entre les séquences conservées de
l’ARNm et des séquences des snARN
3- Extrémité 5’ est coupée et se fixe au site de ramification
4- Les exons sont réunis, le spliceosome se désagrège
Quel est sont les 2 désavantages et l’avantage de l’épissage de l’ARNm chez les eucaryotes ?
Désavantages :
1- Processuss d’épissage est complexe et offre de nombreuses opportunités pour que les choses se déroulent mal
2- Plusieurs maladies génétiques concernent des épissages défectueux
Avantage :
- Épissage alternatif pouvant offrir une variétés de protéines
grâce à la modulation des exons et introns
=> Augmentation de de la variation de l’expression
génétique
Les ARNm sont continuellement synthétisés et dégradés (durée de vie 1h - 24h), de quoi dépend sa vitesse de dégradation ?
La durée de vie dépend de la vitesse de dégradation de la queue poly (A) par l’exonuclase Désadénylase
Des ARN peuvent être produits de façon endogène et sont appelés petits ARN interférants (siARN) et micro ARN, quelles sont les 5 étapes de la régulation post transcriptionnelle lors de l’utilisation des siARN chez les eucaryotes ?
1- Production d’un ARN qui se replie sur lui-même en
épingle à cheveux (Élongation)
2- Une ribonucléase Dicer coupe l’ARN double brin et génère
des segments de 20-25 nucléotides
3- Le siARN se fixe sur le complexe multiprotéique appelé
RISC
4- L’ARN double brin est séparé en simple brin grâce à une
hélicase et une nucléase
5- Le brin restant sert de guide à RISC pour trouver une
séquence complémentaire et de s’y fixer
6- Un composant de RISC est une protéine appelée
Argonaute clive l’ARNm le rendant impropre à la
traduction
De manière générale, quelles sont les 3 étapes du cycle cellulaire ?
1- Croissance et duplication de l’ADN
2- Ségrégation du matériel génétique
3- Division du contenu cellulaire en deux cellules filles
De manière générale, quelles sont les deux principales phases du cycle cellulaire chez les eucaryotes et ce qu’ils comprennent comme « sous-phases » ?
1- Phase I ou interphase = G1 + S + G2
2- Phase M = Mitose (Division du noyau) et Cytocinèse
(Division du cytoplasme) => Phase la plus courte
Quelles sont les caractéristiques des phases dans l’interphase (G1, S et G2) ?
Phase G1 (Principale phase de croissance) :
- Augmentation en taille de la cellule (Prod. de prots)
- Longueur de la phase très variable en fonction des
conditions externes et des signaux cellulaires
- Si conditions externes = défavorables, cellules peuvent
entrer dans un état de repos (quiescence) -> Phase G0
- Cellules progressent jusqu’à un point de non retour/start
Phase S (Synthèse et réplication d’ADN) :
- Donne deux cromatides soeurs
Phase G2 :
- Phase de croissance
- Prépare la séparation du génome répliqué
- Réplication des organites
- Fuseau commence à s’assembler au niveau du fuseau
- Duplication du centrosome
Quelles sont les différentes phases de la phase M et leurs spécificités ?
1- La prophase :
- Condensation de l’ADN en chromosome à deux
chromatides soeurs maintenues ensemble sur toute la
longueur
- Formation du fuseau mitotique entre les deux
chromosomes
2- La prométaphase :
- Rupture de l’enveloppe nucléaire, attachement des
chromosomes aux microtubules du fuseau par les
kinétochores
3- La métaphase :
- Alignement des chromosomes à l’équateur et
attachement des chromosomes aux deux pôles
- Plus longue étape de la mitose
4- L’anaphase :
- Séparation des chromatides soeurs et migration vers les
pôles
- Raccourcissement des microtubules attachés aux
kinétochores et éloignement des pôles du fuseau
5- Télophase :
- Arrivé des chromosomes à chaque pôle du fuseau
- Formation d’une enveloppe nucléaire
- Début de la division du cytoplasme, contraction de
l’anneau contractile
6- Cytokinèse :
- Division du cytoplasme, anneau contractile composé
d’actine et de myosine => Deux cellules filles
Vrai ou faux, un centromère est caractérisé par une petite séquence de nucléotides qui sont répétés plusieurs fois (Séquences non-codantes) ?
Vrai
Quels sont les 3 éléments qu’une série d’interrupteurs biochimiques (Points de contrôle) initiant un événement du cycle permettent de respecter ?
1- Assure que chaque étape est correctement réalisée
2- Que ces étapes se passent selon une séquence bien
définie
3- Qu’une étape ne commence pas sans que la précédente
soit finie
Quels sont les trois points de contrôle différents et leurs spécificités ?
1- Le point de contrôle G1 (Point de démarrage) :
- Vérifie que l’environnement est favorable pour la
prolifération cellulaire
- Vérifie la présence de dommage à l’ADN
- Passé ce point de contrôle, il y a une division qui peut
s’enclencher
2- Le point de contrôle G2 :
- Vérifie que l’entrée en phase M se fait avec l’ADN
entièrement répliqué et sans dommage à l’ADN. Sinon, il
y a une pause, l’ADN est réparé pour ensuite passer au
prochain checkpoint
3- Le point de contrôle M :
- Vérifie que tous les chromosomes sont correctement
attachés au fuseau sinon les cellules filles pourrraient
ne pas recevoir le même matériel génétique (Point de
contrôle pour une bonne anaphase)
=> Ces 3 phases assurent l’intégrité de l’ADN pour une bonne transmission de matériel génétique à la prochaine génération
=> ADN circulaire chez bactérie, donc moins complexe
Quelles sont les protéines permettant le contrôle du cycle cellulaire et comment fonctionnent-elles ? Peux-tu me donner un exemple ?
Ces protéines sont :
1- Une kinase cycline-dépendante (Cdk), unité catalytique qui
peut faire une phosphorylation en présence d’une :
2- Une cycline, unité de régulation qui active les Cdk. Celles-
ci sont produites à des moments précis du cycle cellulaire
pour activer ou désactiver des protéines cibles qui
peuvent engendrées des changements dans la mitose
Exemple : L’activation des Cdk au point G2/M augmente la phosphorylation des protéines qui contrôlent la condensation des chromosomes, la rupture de l’enveloppe nucléaire, l’assemblage du fuseau.
Vrai ou faux, les cyclines subissent des synthèses à des moments aléatoires dans le cycle cellulaire ?
Faux, elle subissent des synthèses et des dégradations à des moments bien précis dans le cycle permettant ainsi l’initiation des différentes phases.
Quelles sont les 4 classes de cyclines (Chacune sont définies par le cycle dans lequel elles se fixent au Cdk)
1- Cyclines G1 : Activent les Cdk qui gouvernent les activités
des cyclines G1/S
2- Cyclines G1/S : Activent les Cdk en fin de G1 pour franchir
le point de démarrage
3- Cyclines S : Activent les Cdk tôt après le point de
démarrage et restent présents jusqu’au début de la
mitose
4- Cyclines M : Activent les Cdk qui stimulent l’entrée en
mitose au point G2/M
Peux-tu m’expliquer comment la Cdk peut être activé, inhibé ou réactivé ?
Activé :
- Phosphorylation de la Cdk proche du site actif par la kinase
CAK active le complexe Cdk-Cycline
Inhibition :
- Phosphorylation (inhibitrice) de 2 sites situés au dessus du
site actif (Cdk) inhibe le complexe Cycline-Cdk
- Protéine inhibatrice de la Cdk inactive les complexes
Cycline-Cdk en induisant des réarrangement dans la
structure du site actif
- Dégradation ciblée de certaines cyclines (S et M) est due à
l’ubiquinylation des cyclines. Maintenant marquées, elles
peuvent être détruites par des protéasomes.
=> Essentiel pour terminer le cycle
Réactivation :
- Déphosphorylation des deux sites active le complexe
Qu’est-ce qui permet une augmentation de la concentration des cyclines ?
Augmentent de façon graduelle due à une augmentation de la transcription des gènes codants les cyclines
Par contre, une diminution est due à la destruction ciblée de celles-ci (En milieu de phase M = fin mitose)
Faire un schéma avec la diapo 27 du chapitre 7
Quelles sont les 6 étapes de l’entrée en phase G1 du cycle cellulaire ?
1- Les mitogènes (Conditions environnementales favorables)
interagissent avec les récepteurs de surface (RTK) ->
Activation d’une cascade MAP kinase
2- Augmentation de l’expression de régulateurs
transcriptionnels dont Myc qui déclenche l’entrée dans un
nouveau cycle cellulaire : G1, en activant les cyclines G1 =
activation de G1-Cdk
3- G1-Cdk active facteurs de transcription E2F qui activent à
leur tour un grand nombre de gène impliqué dans l’entrée
en phase S
4- En absence de mitogènes (Conditions environnementales
défavorables), les protéines rétinoblastomes (Rb) inhibent
l’activité de E2F
5- En présence de mitogènes, G1-Cdk phosphorylent les
rétinoblastomes (Rb) et les inactive
6- E2F active induit expression de G1/S-cycline et S-cycline
=> Rétrocontrôle (+) possible => G1/S-Cdk et S-Cdk
phosphorylent encore plus Rb (Inactivé)
Que se passe-t-il si la protéine rétinoblastome est constamment inactivée ?
Si toujours désactivé, il y aura toujours de la réplication de l’ADN. Une cellule qui ne cesse pas sa division donne un cancer. Dans ce cas ci c’est un cancer de la rétine (rétinoblastome)
Qu’est-ce qui se passe avec la phase G1 si l’ADN est endommagé en 4 étapes (oral) ?
1- Les dommages de l’ADN bloquent la division cellulaire
2- Les dommages activent la protéine p53 par
phosphorylation
3- p53 active l’expression de p21 protéine inhibitrice de Cdk
ce qui donne une inactivation de G1/S-Cdk et S-Cdk
4- Bloque la progression vers la phase S jusqu’à ce que les
dommages soient réparés
=> ADN réparé = Cycle continue
=> ADN non réparé = Apoptose (Mort cellulaire), cycle
cellulaire recommence pour organisme unicellulaire
(levures => mutations => évolutions)
Quelles sont les étapes de la phase S du cycle cellulaire ?
1- 2 ADN hélicase inactives sont recrutées à l’origine de
réplication formant le complexe préréplicatif préRC en fin
de mitose et début de la phase G1
2- Les complexes préRC sont activés une seule fois par S-Cdk
en phase S et la réplication de l’ADN démarre
3- S-Cdk induit l’augmentation de la synthèse de protéines
histones
4- À la fin de la phase S, l’ADN est dupliqué et les
chromatides soeurs identiques sont attachés ensemble
sur toute leur longueur par des cohésines => Crucial pour
une bonne ségrégation
Quelles sont les étapes de l’entrée en mitose ?
1- Augmentation de la synthèse de M-cycline durant la phase
G2 -> Accumulation de complexe M-Cdk inactifs
2- L’activation de M-Cdk par la prophosphatase Cdc25 active
démarre la mitose
3- M-Cdk active inhibe la kinase wee 1 et active plus de
Cdc25 -> Plus de M-Cdk activé, donc entrée en phase M
4- Phase avancée de la mitose est contrôlée par APC/C,
contrairement à la phase précoce qui est contrôlée par M-
Cdk
En cas de dommage à l’ADN : Cdc25 est maintenu inactif par un autre phosphorylation inhibitrice
Quelle est la fonction de la condensine dans la mitose et comment est-elle activée ?
Participe à la condensation des chromosomes
=> Aide à les structurer avant leur séparation
=> Activée par phosphorylation des sous-unités par les
complexes M-Cdk
Qu’est-ce que le fuseau mitotique dans la mitose et quel est le fonctionnement des microtubules ?
C’est un réseau bipolaire de microtubules qui tirent et séparent les chromatides soeurs au cours de l’anaphase => Activer par M-Cdk
Fonctionnement :
=> Dans certaines conditions le microtubule subit un effet de
tapis roulant
=> Les extrémités - sont souvent ancrées à certains
organisateurs de la cellule (centrosome)
=> Les extrémités + sont celles qui subissent polymérisation
et dépolymérisation
Que permet la duplication du centrosome et où elle commence dans le cycle cellulaire ?
- La duplication du centrosome permet la création des pôles
du fuseau mitotique - La duplication commence en phase S et est sous le contrôle
des S-Cdk et G1/S-Cdk
Peux-tu m’expliquer le fonctionnement du fuseau mitotique ?
Des moteurs protéiques gouvernent l’assemblage et le fonctionnement du fuseau mitotique (Kinésines 5, kinésines 4 et 10 et dynéine)
- Les kinésines 5 possèdent deux domaines moteurs se
fixant sur des microtubules antiparallèles permettant de les
faire glisser l’un sur l’autre et ainsi pousser les pôles dans
des sens opposés - Les kinésines 4 et 10 s’associent au bras des chromosomes
et les poussent loin du centrosome (Prométaphase) - Les dynéines poussent les pôles vers le cortex cellulaire
=> Diapo 45, Chap 7
Que se passe-t-il à la prométaphase dans le cycle cellulaire (4 choses) ?
1- À la prométaphase, les microtubules s’attachent à chaque
chromatides soeurs au niveau de son kinétochore
2- Les chromatides soeurs doivent être attachées aux pôles
opposées
3- Les kinétochores sont positionnées dos à dos
4- Si la fixation est correcte, il y a une tension entre les
microtubules liés aux pôles opposés et ceci stabilise
l’attachement des chromatides pour la métaphase
kinétochore = Complexe protéique se fixant sur la région centromérique du chromosome
Comment le complexe APC/C déclenche l’anaphase et l’achèvement de la mitose ?
1- M-Cdk phosphoryle APC/C et permet la fixation de Cdc20
pour l’activer
2- APC/C désactive la sécurine (Bloque la séparase) par
ubiquitinylation et dégradation de celle-ci par un protéasome
3- La séparase est maintenant active, donc elle clive la
cohésine et permet la séparation des deux chromatides
soeurs pour l’anaphase
Que se passe-t-il dans l’achèvement de la mitose si un kinétochore n’est pas attaché au fuseau ?
Il y a la catalysation de la modification de la structure d’une protéine (Mad2) qui se fixe sur Cdc20-APC/C et l’inhibe,donc pas d’anaphase
Que se passe-t-il dans l’anaphase A et l’anaphase B de la phase M ?
Anaphase A : Traction des chromatides soeurs aux pôles opposés
Anaphase B : Éloignement des fuseaux polaires (Centrosomes)
Qu’est-ce qui permet la reformation de l’enveloppe nucléaire lors de la télophase
=> Durant la prométaphase, M-Cdk phosphoryle des sous-unités des complexes du pore nucléaire et des composants de la lamina (En bleu)
C’est l’inactivation des M-Cdk par l’APC/C et l’activation de phosphatases qui permet la déphosphorylation de la lamina => Reformation de l’enveloppe lors de télophase
Qu’est-ce que la cytokinèse et comment est-elle possible ?
C’est le processus par lequel le cytoplasme est séparé entre deux cellules filles
Possible grâce à un anneau contractile constitué de filaments d’actine et de myosine qui se forme vis à vis du fuseau mitotique créé lors de l’anaphase
Qu’est-ce que les aneuploïdies et polyploïdie et quelles sont leurs conséquences ?
Aneuploïdie :
- Perte d’un chromosome lors de la divison ce qui peut engendrer la mort de la cellule puisque c’est certain qu’il y aura des gènes essentiels dans le chromosome perdu.
- Trisomie 21 (gène en trop)
Polyploïdie :
- La cellule a dupliqué tout son génome sauf que ce matériel n’a pas été séparé en deux cellules. En effet, il n’y a qu’une seule cellule contenant plusieurs chromosomes
Quelles sont les étapes de la méiose (2 tours) ?
=> 2 tours, donc réduction de moitié le nombre de
chromosomes (2n -> 1n) et recombinaison génétique entre
les chromosomes homologues
1er tour :
- Prophase I
- Métaphase I
- Anaphase I
- Télophase I
2e tour
- Prophase II
- Métaphase II
- Anaphase II
- Télophase II
=> Regarder diapos 58 à 60
Quels sont les 4 stades de la prophase I dans la méiose et leurs spécificités ?
1- Leptotène : Les chromosomes homologues se condensent et
s’apparient, la recombinaison homologue commence
2- Zygotène : Le complexe synaptonémal (permet de coller
chromosomes homologues) commence à s’assembler sur les
sites où la recombinaison homologue a lieu
3- Pachytène : Assemblage est achevée, les chromosomes
sont réunis sur toute leur longueur
4- Diplotène et diakinèse : Désassemblage du complexe
synaptonémal, condensation et raccourcissement des
chromosomes
=> Les régions de crossing-overs Chiasmas restent réunies
Qu’est-ce qu’il se passe avant la ségrégation des chromosomes lors de la méiose I (2 éléments) ?
1- Les kinétochores des chromatides soeurs de chaque
chromosome sont fusionnés pour que les paires de
chromatides soeurs migrent vers le même endroit
2- Perte de cohésine au niveau seulement des bras des
chromatides soeurs
Qu’est-ce qu’il se passe avant la ségrégation des chromosomes lors de la méiose II (2 éléments) ?
1- Les cohésines au niveau du centromère ne sont plus
protégées par des protéines Shugoshin puisque l’on veut
séparer les chromatides soeurs
2- Les kinétochores ne sont plus fusionnées
3- La métaphase II et l’anaphase II se déroule comme dans la
mitose
Quelles sont les différences entre la méiose I et la méiose II (détaillez les différences de ségrégation des chromosomes)?
1- Il y a une perte de cohésine sur toutes les chromatides
soeurs dans la méiose II tandis que dans la I c’est sur
seulement les bras
2- Les kinétochores ne sont plus fusionnées afin que les
chromatides soient libres dans la méiose II contrairement
à la méiose I
Quel est le rôle de la recombinaison homologue dans la méiose et par quel mécanisme se réalise-t-elle ?
La recombinaison homologue par le mécanisme qui dépend des cassures doubles brins induites par spo11 (Crossing-over et non crossing-over) contribue à la diversité génétique. Il y a aussi plus de chance d’avoir de l’évolution avec de la reproduction sexuée puisque c’est une source de variation plus importante => Diversité
=> Diapo 64, Chap 7
Quel types d’erreurs peuvent se produire durant la méiose et quelles sont leurs conséquences?
Il peut y avoir une non disjonction ce qui produit des gamètes ne contenant aucun chromosome, donc l’individu portant ces gamètes voit sa fertilité être diminuée
Qu’est-ce que l’apoptose ?
Processus par lequel les cellules déclenchent leur auto-destruction en réponse à un signal. Il intervient dans divers processus clé (Ex : Tombée des feuilles ou disparition des fleurs suite à repro.)
Dans quels processus cellulaire l’apoptose joue un rôle important (3) ?
1- Élimine des cellules mal placées, non fonctionnelles,
potentiellement dangereuses pour l’organisme, ayant subi
des dommages à l’ADN
2- Rôle important dans l’embryogenèse :
- La mort cellulaire aide à sculpter les mains et les pieds
lors du développement embryonnaire
- Les cellules meurent par apoptose lorsque la structure
n’est plus nécessaire (Queue de têtard)
3- Rôle important dans le système immunitaire :
- Apoptose élimine cellule lymphocytaires (B et T)
lorsqu’ils ne produisent pas de récepteurs spécifiques
d’antigènes potentiellement utiles ou si ils produisent
des récepteurs auto-réactifs (Maladie auto-immune)
- Élimine aussi lymphocytes ayant activés par une
infection une fois qu’ils ont aidé à détruire et qu’ils ne
sont plus utiles
Quelles sont les principales différences entre l’apoptose et la nécrose ?
Nécrose :
- C’est la mort cellulaire qui n’est pas programmée qui peut
subvenir à forte dose d’un polluant, par exemple
- Il y a une réaction inflammatoire qui subvient
Apoptose :
- Mort cellulaire programmée qui peut subvenir à faible
concentration d’un polluant, par exemple
- Se ratatine, se fragmente et forme des corpuscules
d’apoptose toujours entourés d’une membrane
- Aucune réaction inflammatoire
Qu’est-ce qui signal aux macrophage de phagocyter une cellule ?
C’est lorsque les phosphatidylsérine sont placer du côté externe de la membrane que les macrophages phagocytent les cellules apoptotiques
Peux-tu me décrire les 3 phases de l’apoptose ?
1- Phase d’induction : Correspond à la phase de réception
des signaux et l’induction de l’apoptose par la cellule
- Signaux d'apoptose intracellulaire : - Lésion de l'ADN - Perturbation du cycle cellulaire - Stress cellulaire - Signaux d'apoptose extracellulaire : - Stéroïde = Grenouille - Lymphocytes T - Privation en facteur de croissance - Drogues diverses
2- Phase d’exécution de l’apoptose : Intégration des signaux,
franchissement ou non d’un point de non-retour,
activation des cascades de réactions protéolytiques
3- Phase de destruction : Dégradation de la cellule et
élimination des corps apoptotiques
Qu’est-ce qu’une caspase et peux-tu me décrire le fonctionnement des cascades de caspases ?
=> Caspase = Enzyme (protéase) possédant un résidu de
cystéine au niveau de leur site catalytique
1- Pro-caspases possédant des prodomaines
2- Activation des caspases lorsqu’elles perdent les
prodomaines
3- Cascade de caspases engendrant une cascade de
protéolyse (détruit prots) ou d’endonucléase (détruit
ADN) ou de clivage du cytosquelette (Détruit
cytosquelette) => Détruit les éléments du cytoplasme
Peux-tu me donner les 4 étapes de la voie extrinsèque de l’activation d’une apoptose ?
1- Un lymphocyte tueur se lie à partie de son ligand de Fas
sur le récepteur de mort de Fas de la cellule cible
2- Il y a un assemble de DISC qui se forme avec une
procaspase 8/10, un domaine effecteur de mort et un
domaine de mort
3- Activation et clivage des procaspase devenant des
caspases exécutrices
4- Cellule cible meurt par apoptose
=> Diapo 24, Chap 8
Quelles sont les 3 classes de protéines Bcl2 contrôlant la voie intrinsèque de l’apoptose et comment elles fonctionnent ensemble ?
1- Protéines Bcl2 : Anti-apoptotiques :
- Bcl2, BclX
2- Protéines BH123 : Pro-apoptotiques :
- Bax et bak
3- Protéines BH3-seulement : Pro-apoptotiques :
- Bad, Bim et Bid
=> Bax et bak lorsqu’elles recoivent un stimulus d’apoptose, elles libèrent les cytochrome c et autres prots de la
mitochondrie. En présence de Bcl2 active, bax et bak sont inactivées. En revanche, lorsqu’il y a un sitmulus d’apoptose et que Bim et Bid sont activées, il y aura une inactivation de Bcl2 et les Bax et Bak seront actives en aggrégats pour libérer les cytochrome c et autres prots
Qu’est-ce que les IAP ?
Ce sont des protéines inhibitrices de l’apoptose qui interviennent si jamais il y a une activation des caspases accidentelle. Celles-ci viennent se fixer sur les caspases exécutrices. En revanche, il y a un blocage des IAP par les anti-IAP
Peux-tu me donner les 4 étapes de la voie intrinsèque de l’activation d’une apoptose ?
1- Bax et Bak sont actives en aggrégats et libèrent les
cytochrome c
2- Les cytochrome c se lient à l’Apaf1 contenant un domaine
CARD
3- Il y a création d’un apoptosome
4- Des procaspases possédant des domaines CARD se lient à
l’apoptosome et il y a une cascade de caspases
exécutrices
=> Diapo 27, Chap 8
Vrai ou faux, il peut y avoir une activation de la voie intrinsèque de l’apoptose par la voie extrinsèque
Vrai
Que peut engendrer un excès d’apoptose ?
- Des maladies dégénératives : Alzheimer et Parkinson
Que peut engendrer un deficit d’apoptose ?
Le cancer :
Mutation de certains gènes contrôlant apoptose
- Bcl2 (cancer des lymphocytes chez l’être humain):
Une mutation (translocation) cause une production excessive de Bcl2
-> L’apoptose inhibée prolonge la survie cellulaire et augmente le
nombre de cellules.
-p53 (suppresseur de tumeurs): le gène codant pour p53 est muté dans 50% des cancers de façon qu’elle n’induit plus l’apoptose en cas de dommage à l’ADN.
->Les cellules cancéreuses vont survivre avec des dommages dans l’ADN ce qui engendre l’accumulation de mutations.
