Examen 1 - Détection des micro-organismes Flashcards
Quels sont les critères que l’on peut utiliser lorsque l’on veut identifier une bactérie par observation au microscope?
- Forme des bactéries
- Arrangement
- Cils ou flagelles
- Spores ou non (morphologie)
Quels sont les critères que l’on peut utiliser lorsque l’on veut identifier une bactérie sur la base de ou bien une colonie bactérienne à l’œil nu?
- Forme
- Grosseur
- Couleur
- Odeur
- Opacité
- Texture
- Aspect de la surface des colonies
Qu’est-ce qu’engendre l’utilisation de bleu de méthylène?
Coloration : Bleu
Fond de la lame : Blanc
Qu’est-ce qu’engendre l’utilisation de l’encre de chine?
Coloration : Blanc
Fond de la lame : Bleu
Qu’est-ce que la coloration acido-alcoolo-résistante?
Utilisée pour détecter la présence de micro-organismes résistante ou non à une mixture d’acide et d’alcool (bactéries acido-alcoolo-résistant)
- Rouge = bactéries acido-alcoolo-résistance
- Bleu = bactéries NON acido-alcoolo-résistance
Quelle espèce bactérienne détecte principalement la coloration acido-alcoolo-résistante?
Mycobactéries (bacilles acido-alcoolo-résistant) contiennent de la cire dans leur paroi cellulaire
Les streptocoques et staphylocoques vont apparaître de quelle couleur après une coloration gram?
Mauve (Gram +)
Quelle structure bactérienne est révélée par le colorant de Gram?
La couche de peptidoglycane
??? Quelles sont les caractéristiques associées aux bactéries Gram -?
Paroi = Fine + Imperméable
Décoloration = Oui
Coloration = Roses
??? Quelles sont les caractéristiques associées aux bactéries Gram +?
Paroi = Épaisse + Composition chimique particulière
Décoloration = NON
Coloration = Violette
Qu’est-ce qu’un milieu minimal?
Minimum pour faire croitre la culture bactérienne
- Milieu très sélectif
- Bactérie précise
- Permet la croissance d’un type particulier de bactéries en lui donnant exactement les paramètres donc elle a besoin pour survivre et proliférer.
Qu’est-ce qu’un milieu complexe?
Milieu ayant plus d’éléments
- Milieu moins sélectif
- PAS bactéries précises
- Sous une forme utilisable par des bactéries sans exigences particulières
Quelle est la façon simple de déterminer si une espèce bactérienne est aérobie ou anaérobie? Expliquer le processus.
Culture de bactéries en bouillon
- Dans un bouillon, si les bactéries se multiplient seulement dans le haut, elles sont strictement aérobiques.
– Multiplication seulement dans le fond du bouillon = bactéries strictement anaérobiques
– Multiplication un peu partout = bactéries aérobies facultatives
Pourquoi les cultures des détections de bactéries dans le sang et des mycobactéries sont-elles sujettes à contamination potentielle par d’autres bactéries?
Le sang est facilement contaminable par les bactéries environnantes (milieu non stérile)
Quelles mesures prend-on pour prévenir les contaminations reliées aux détections de bactéries dans le sang et des mycobactéries?
Utilise des incubateurs spéciaux en prenant les précautions pour éviter la contamination par les bactéries présentes dans le laboratoire.
Qu’est-ce que la transcription?
ADN en l’ARNm par l’ADN polymérase
Qu’est-ce que la traduction?
Synthèse de protéines/polypeptides à partir de l’ARNm, avec l’aide des ARNt qui ajoutent leur AA
Quel type de molécule la réaction de PCR amplifie-t-elle?
ADN
Quelle étape préliminaire est nécessaire pour détecter le génome du VIH par PCR?
Transformer l’ARN en ADN, car le VIH est seulement présent sous forme d’ARN
Dans les méthodes modernes de PCR, incluant la PCR quantitative, comment détecte-t-on les produits de la réaction?
Par fluorescence
- Repose sur la détection et la quantification d’un émetteur fluorescent pendant le processus d’amplification
- L’augmentation du signal d’émission fluorescente est directement proportionnelle à la quantité́ d’amplicons produits durant la réaction
Lorsqu’on quantifie la concentration de virus VIH ou VHC dans le sang de patients par PCR quantitative, comment s’appelle ce que l’on mesure?
Génomes microbiens
Un ELISA permet de détecter quel type de molécule?
Antigène ou Anticorps
Comment un anticorps est détecté par ELISA?
1) L’anticorps primaire se fixe à la protéine pathogène au fond du puit
2) Des anticorps secondaires avec phénomène d’identification (couleur) vont détecter l’anticorps primaire qui est fixé à l’antigène
- Du fond du puit à la surface : antigène → anticorps1 → anticorps2
Comment un antigène est détecté par ELISA?
1) L’anticorps va se fixer au fond du puit
2) L’antigène va aller se fixer sur l’anticorps et l’anticorps secondaire avec signal de détection ira se fixer sur l’antigène
- Du fond du puit à la surface : anticorps1 → antigène → anticorps2
Les tests de type « test de détection rapide » permettent de détecter : des anticorps, des antigènes, des régions du génome ou de l’ARN?
Antigène
Lorsque deux génomes (espèces, souches…) sont proches l’une de l’autre sur un arbre phylogénétique, cela signifie-t-il que peu ou beaucoup de mutations les séparent?
Plus proches = peu de mutations qui les séparent (variants semblables)
Peut-on utiliser des analyses de séquences génétiques telles que la phylogénétique, pour identifier les transmissions de VIH-1 d’une personne à une autre?
Oui ???
- Permet d’identifier de quels types de transmission il s’agit. Cela aide à la mise en place de programmes de prévention de la transmission.
