Examen 1 Flashcards
Définir l’autoécologie (écophysiologie).
Une espèce vivante avec son environnement. (conditions de subsistance et de vie idéale, les capacités de survie et de résistance, ses habitudes alimentaires, etc.)
Définir la dynamique des populations (démoécologie).
Étude de l’évolution et de la structure des populations dans l’espace et dans le temps.
Définir synécologie.
Étude des rapports entre les diverses espèces d’un même ensemble. C’est l’étude des écosystèmes.
Définir biocénose.
Désigne la totalité des êtres vivants qui sont présents dans un écosystème donné. Le terme “communauté” est aussi employé.
Définir biodiversité.
Désigne la richesse des espèces vivantes qui peuplent la biosphère dans son ensemble ou dans un écosystème en particulier.
Définir biosphère.
Définit la région de la planète dans laquelle la vie est possible en permanence et qui renferme des êtres vivants. Se divise en 3 compartiments : lithosphère, hydrosphère et atmosphère.
Définir biotope.
Composante d’un écosystème constitué par ses dimensions physico-chimiques et spatiales.
Définir chaîne alimentaire
Terme désignant les relations trophiques qui unissent les organismes de niveau trophique différent à l’intérieur d’une même communauté (chaîne trophique).
Définir cycles biogéochimiques
Processus qui caractérise la transformation de la matière et la circulation des éléments dans les écosystèmes et entre les divers compartiments de la biosphère.
Définir facteurs abiotiques.
Désigne les facteurs écologiques de nature physico-chimique, dons indépendants des êtres vivants (paramètre non biologiques. Ex : température et hygrométrie.
Définir facteurs biotiques
Ensemble des facteurs écologiques liés aux êtres vivnats : compétition, prédation, parasitisme, mutualisme par exemple.
Définir habitat.
Lieu où vit l’espèce et son environnement immédiat à la fois abiotique et biotique.
Définir niche écologique.
L’ensemble des paramètres qui caractérisent les exigences écologiques (climatiques, alimentaires, reproductives, etc.) propres à une espèce vivante et qui la différencie des espèces voisines d’un même peuplement. C’est la fonction d’une espèce dans un écosystème, sa profession
Définir pollution.
Modification défavorable du milieu naturel causée directement ou indirectement par l’action humaine en causant des altérations de divers types.
Définir population.
Ensemble des individus appartenant à une même espèce et occupant une même fraction de biotope et qui échangent librement entre eux leurs gènes dans les processus reproductifs
Définir l’écologie microbienne.
Étude des microorganismes dans leur environnement
Définir la microbiologie de l’environnement et donner des exemples.
- S’intéresse aux processus microbiens globaux (et non au microorganismes comme tels).
Ex : Traitement des déchets, fertilisation des sols, récupération des métaux, contrôle des insectes, production d’aliments.
Durant la Terre primitive, que contenait les océans (chimie) ?
H2S, Fe2+, métaux lourd
En quoi consiste l’expérience de Miller ?
Reproduire les conditions de la Terre primitive. En mimant les gaz présents dans l’atmosphère à ce moment, on veut synthétiser les 22 acides aminés, des biomolécules et des polymères.
Pourquoi l’ARN serait le dernier ancêtre commun ?
L’ARN est : thermorésistant, autoréplication, activité catalytique, compatible avec environnement fer/soufre
Nommez deux avantages de l’encapsulation (membrane).
- Protection physique
- Rétention et concentration de composés et de macromolécules.
Qui suis-je?
Bactérie phototrophe filamenteuse anoxigénique qui emprisonnent les sédiments
Stromatolites
Qu’est-ce que la panspermie ?
Selon cette théorie, la vie sur Terre serait venue d’ailleurs (extrémophiles).
Vrai ou faux.
La source d’énergie primitive serait le H2 provenant de la réaction entre le FeS et le H2S.
Vrai
Qu’est ce qui a permit d’avoir de l’oxygène dans l’atmosphère ?
L’oxygène produit par les cyanobactéries provenant de la photosynthèse oxygénique. Ils utilisaient le H2O plus abondant au lieu du H2.
Nommez deux conséquences de l’oxygène dans l’atmosphère.
- Métabolisme basé sur l’oxygène beaucoup plus performant ce qui amène une prolifération des espèces et de leur nombre.
- Amène l’apparition de la couche d’ozone ce qui a permis l’apparition de la vie sur la surface de la Terre.
Qu’est-ce qui est différent entre l’écologie microbienne et la microbiologie de l’environnement ?
Microbiologie de l’environnement ne s’intéresse pas directement aux microorganismes comme tels ni à leur place dans l’environnement. Elle s’intéresse aux processus microbiens globaux.
Qu’est-ce que le principe d’incertitude d’Heisenberg ?
À l’échelle microscopique, l’action de mesurer un objet affecte l’objet et peut même le modifier.
Vrai ou faux.
L’analyse faite sur un échantillon peut être généralisée à l’environnement.
Faux.
Vrai ou faux.
L’échantillonnage, les manipulations et les mesures n’introduisent pas tous des biais lors de l’interprétation des résultats.
Faux.
Vrai ou faux.
Lorsqu’on atteint un plateau, on atteint le max d’espèces avec la méthode utilisée. On a pas tous les espèces dans l’environnement.
Vrai.
Pour avoir des résultats fiables, on veut qu’ils soient entre :
a) LID (limite instrumentale de détection
b) LDM (limite de détection de la méthode)
c) LQM (limite de quantification de la méthode)
d) LL (limite de linéarité)
entre c) et d)
Que permet l’analyse de l’environnement (2) ?
- Permet une évaluation globale de l’activité d’une communauté microbienne donnée.
- Permet la conception de milieu d’enrichissement.
Quel antibiotique prometteur a été trouvé avec iShips et comment agit-il ?
Teixobactin : efficace contre les bactéries Gram+ et les mycobactéries. Il se lie à deux précurseurs de la paroi cellulaire (peptidoglycane et teichoic acid).
- Incapable de générer des bactéries résistantes à cet antibiotique.
Nommez une solution alternative aux microorganismes non cultivables.
Étude de l’ADN.
Nommez trois limites à la microscopie.
1- limite de résolution (petite bactérie)
2- difficulté à distinguer (mort-vivant/cell.-matière)
3- Pas d’évaluation de la diversité
Nommez des paramètres pouvant influencer l’hybridation d’une amorce/sonde (4).
- Son niveau de similarité avec la cible
- les concentrations en ions
- température
- type de fixation de l’échantillon
Vrai ou faux.
Avec la méthode FISH, il n’est pas nécessaire de connaître la séquence de l’ARNr 16S.
Faux.
Définir ectosymbiote et endosymbiote.
ce sont deux type de contact (ne définit pas la nature de l’interaction.
- Ectosymbiote : interaction entre deux microorganismes
- endosymbiote : organisme vivant à l’intérieur d’un autre.
Quel est la différence entre une relation positive et une relation négative?
- Relation positive : permet l’optimisation des ressources
- Relation négative : permet le contrôle de l’utilisation des ressources disponibles en régulant les densités de populations.
Complétez.
- Interaction positive intra-population = _____.
- Interaction négative intra-population = _____.
- Interaction positive intra-population = coopération.
- Interaction négative intra-population = compétition.
Définir le neutraliste.
- Phénomène rare (voire purement théorique)
- Pas d’interaction (faible densité de population, environnement à faible croissance, microorganismes en dormance (spores))
Définir le mutualisme.
Synonyme : symbiose - relation mutuelle obligatoire - très spécifique - dépendant de l'autre pour vivre - résultat d'une longue co-évolution Ex : Lichens (algue ou cyanobactérie + champignon), Thermite mange le bois mais le digère pas.
Vrai ou faux.
Certains organismes perdent des gènes car ils vivent en symbiose.
Vrai.
Définir la protocoopération.
Synonyme : synergisme
- relation mutuelle positive mais pas obligatoire.
- Peu spécifique (peu importe le cuisinier c’est la bouffe qui est importante)
- viable sans l’interactions
Qu’est-ce que le synthophisme (cross-feeding) ?
Association de microorganismes dans laquelle la croissance des microorganismes dépend ou est améliorée par les nutriments, facteurs de croissance ou substrats fournis par les autres microorganismes.
Ex : E. coli produit de la putrescine à cause de l’ornithine produit par un autre organisme.
Définir le commensalisme.
- Profite de l’autre sans lui nuire.
- habituellement pas obligatoire
- peu spécifique
Le commensalisme survient si une population : ______.
- modifie un environnement avantageusement pour une autre population ou produit un facteur de croissance utilisé par un autre organisme.
Ex : E. coli (ana. facultatif) aide Bactérioides (ana strict) / Flavobacterium brens produit cysteine pour L. pneumophila. - permet un changement d’état de la matière (insoluble=soluble)
- Permet l’élimination d’un produit toxique
- devient l’habitat d’un autre espèce (colonisation du corps humain)
Définir le cométabolisme (fait partie du commensalisme).
Transformation d’un composé organique par un microorganisme qui est incapable de l’utiliser comme substrat pour produire de l’énergie ou pour l’utiliser comme éléments de constitution.
Ex : Mycobacterium transforme un métabolite qui ne lui est pas utile, mais est utile à quelqu’un d’autre.
Définir la compétition.
- Interaction négative entre deux population ou plus
Qu’est-ce que le principe d’exclusion compétitive ?
- implique deux populations métaboliquement similaires voulant occuper le même espace
- une population gagne, l’autre est exclue.
- la vitesse de croissance élevée est un net avantage pour gagner la compétition.
Qu’est-ce que la co-existence ?
- Possible lorsque plusieurs facteurs impliqués dans la compétition sont limitants.
Ex : A. formosa a besoin de moins de PO4, tandis que C. meneghiniana a besoin de moins de SiO2. Lorsque les deux gaz deviennent limitant, les deux peuvent co-exister.
Définir la prédation.
- Interaction de courte durée
- le prédateur mange et digère la proie.
Vrai ou faux.
Les rencontres prédateurs-proies peuvent ne pas être au hasard.
Vrai (la chasse)
Définir le parasitisme.
Le parasite se nourrit des ressources de l’hôte.
- long contact (physique ou métabolique)
- très spécifique
Ex : des Amibes et L. pneumophila.
Complétez.
L’hyperparasite est un ____ d’un ____.
L’hyperparasite est un parasite d’un parasite.
Complétez.
Le ____ et le ____ sont plus importants à forte densité et diminuent à faible densité.
Le parasitisme et la prédation.
De quelles façons le parasitisme et la prédation permettent le contrôle des populations (3) ?
- impliquent la notion de feedback négatif
- permettent de préserver les ressources du milieu
- augmentent le recyclage de la matière
Définir l’amensalisme.
- Microorganismes produisant une substance toxique (avantage compétitif).
- composés possiblement impliqués : Acides organique (lactique, acétique), O2, Alcool, ammoniaque, antibiotique, bactériocine
Nommez les deux avantages de l’amensalisme dans un environnement.
- Peut prévenir la colonisation d’un habitat par un second organisme (production acide dans le conduit vaginal)
- permet de préserver les ressources d’un habitat.
Comment les bactériocines agissent-ils ?
- gènes présents généralement sur plasmides ou transposons
- peptides et protéines de bas poids moléculaires
- s’insère dans la membrane d’autre microorganismes –> lyse et mort
- agissent sur microorganismes apparentés au producteur
- action à spectre très restreint.
Vrai ou faux.
Les microorganismes ont souvent des interactions non complexes.
Faux.
Qu’est-ce qu’un guilde ?
Ensemble de populations (de microorganismes) métaboliquement apparentés
La structure d’une communauté dépend de quoi ? (2)
- conditions environnementales (température, pH entre 5 et 9, pression osmotique, O2)
- Ressources disponibles ( nutriments…)
Complétez. La ____ doit être occupée pour maintenir la _____ de la _____.
La niche doit être occupée pour maintenir la stabilité de la communauté.
Complétez. Le nombre de niche détermine la _____ .
Le nombre de niche détermine la diversité.
Qu’est-ce que le climax ?
Stade ultime et à l’équilibre d’une succession évolutive de communautés dans un milieu donné
Qu’est-ce qu’une succession primaire ?
- succession de communauté dans un environnement initialement vierge (non colonisé)
Ex : tube digestif d’un nouveau né
roches volcaniques nouvellement formées
nouvelle plomberie d’une maison
Qu’est-ce qu’une succession secondaire ?
- succession de communauté dans un environnement déjà occupé, mais qui a subi un évènement catastrophique
Ex : recolonisation du tube digestif après un traitement aux antibiotiques / la peau après une douche ou un bain / cuir chevelu après un shampoing.
Qu’est-ce qu’une succession autogénique ?
- Succession provoquée par l’action des organismes sur l’habitat (organismes provoquent eux-même la succession)
Ex : ana facultatif aide ana stricte / formation d’un biofilm
Qu’est-ce qu’une succession allogénique ?
- Succession provoqué par des modifications de l’habitat par des facteurs environnementaux.
Ex : saisons
Qu’est-ce qu’une succession autotrophique ?
- Production de matière organique plus grande que le taux de respiration
- accumulation de matière
Qu’est-ce qu’une succession hétérotrophique ?
production de matière est plus petite que le taux de respiration
- utilisation, consommation de la matière (ne produit pas de matière)
Ex : composte
Décrivez un organisme de type R.
- grande capacité de reproduction et de croissance
- souvent colonisateur initial
- reproduction efficace à faible densité de population
- dominant si ressources illimitées
- subissent variations extrême de population
- souvent membre transitoire d’une communauté
Décrivez un organisme de type K.
- taux de reproduction faible
- adapté à l’environnement
- utilisation optimal des ressources
- efficace dans un environnement limité en ressources
- membre plus stable et permanent d’une communauté.
Vrai ou faux.
Les microorganismes de type K sont seulement visible à l’échelle macro.
Faux. À l’échelle macro, tous les microorganismes sont des types r.
