Examen 1 Flashcards
Qu’est-ce qui change par rapport à l’ADN selon son organisme?
1.Organsiation
2. Quantité
3. Régulation
Quelles sont les 3 composantes de la dogme central?
ADN
ARNmessager
Protéines
Combien de paires de bases possèdent une cellule?
Environ 3 milliards de pb
Définir le génome et donnez sa forme.
1 à plusieurs molécules d’ADN
Sous forme de chromosomes
Quels sont les 3 rôles de l’ADN?
Caractère hériditaire
Matériel génétique contenant information
Variation/mutation génétique
Combien de liaison d’hydrogène A-T et G-C ont-ils? Laquelle de ces liaisons est la plus stable?
2 liaisons A-T
3 liaison G-C (plus stable et plus difficile à séparer)
Pourquoi isoler un gène est important?
- Déterminer la séquence d’un gène
- Transférer des gènes d’un organisme à un autre
À quoi servent les clones d’ADN?
À créer une bande d’ADN (nécessite plusieurs bactéries pour connaître plus de séquence)
Vrai ou faux, on coupe les plasmides pour insérer un fragment d’ADN.
Vrai
Qu’est-ce que chaque colonies de bactéries sur une pétri représente?
Une séquence codant pour formation d’une bande d’ADN
Nommez une enzyme de restriction.
EcoR1 (coupe 6 nucléotides)
Combien de nucléotides peuvent être couper par des enzymes de restriction?
4 à 6 nucléotides
Définir : Système immunitaire pour les bactéries.
Enzyme de restriction
Est-ce qu’on peut utiliser EcoR1 pour créer bande d’ADN?
Oui
À quoi servent les endonucléases?
À couper à l’intérieur des molécules d’ADN
Quelles sont les 2 façons d’isoler l’ADN?
Centrifugation
Choc thermique
Décrire un peu le choc thermique qui permet l’isolation de l’ADN.
Bactérie compétante avec une membrane perturbé par Calcium puis CHOC THERMIQUE qui fait sortir le calcium et qui fait rentrer le plasmique à l’intérieur
Définir lac-, gal- et tetr.
Lac- : pas capable d’utiliser du lactose comme source de carbone
Gal- : pas capable d’utiliser du galactose comme source de carbone
Tetr : gène de résistance à la tétracycline
À quoi sert ori dans un plasmide?
Origine de réplication pour faire fourche de réplication
Si nous coupons avec BamH 1 375, à quelle endroit l’ADN va s’installer?
Après BamH
Vrai ou faux, le plasmide se replit rarement sur lui-même?
Faux, la plupart de temps, le plasmide se replit sur lui-même
Quel gène code la bêta-galactosidase?
Lac Z
Pourquoi chaque enzyme coupe seulement à une place?
Seulement présent à un endroit, car n’existe pas ailleurs donc coupe à un endroit spécifique
Dans un plasmide, qu’est-ce qui est toujours présent?
Origine de réplication (ori)
Résistance à antibiotique
Quelle est la simple différence entre pUC ori et f1 ori?
Nombre de réplication varie entre les 2 types d’ori
Définir T7
Promoteur pour les procaryotes nécessaire pour faire ARNmessager
Définir Pcmv
Promoteur utiliser chez les eucaryotes pour faire ARNmessager
Définir SV40
Provient du gène de l’herpès
Définir BGH pA (2)
Site de polyadénisation
Provient de l’hormone de croissance de la vache
Pourquoi la topoisomérase rend le clonage plus facile?
Topo reconnaît vecteurs donc 2 extrémités ne peuvent pas se coller ensemble donc rend plus facile le clonage
À quoi se lie le GFP dans le gène?
V5 épitope et His6
Qu’est-ce que les enzymes de restriction coupe précisément?
Palindrome
Donnez 3 caractéristiques claires des enzymes de restriction.
- Produites par bactéries pour se défendre contre les phages
- Coupent l’ADN du phage, ce qui l’inactive
- Coupent à endroits précis de l’ADN
Les enzymes de restriction coupent effectivement à des endroits précis de l’ADN, où se trouvent ses séquences?
Dans TOUTES les molécules d’ADN
Définir palindrome.
2 brins ont la même séquence mais orientation antiparallèle
Après le clivage, comment est l’extrémité?
Extrémité collante (ou cohésive)
Sma1 est une enzyme de restriction à bout franc ou bout collant?
Bout franc, comme Hae3
Quel est le rôle de la méthylation et nommez les 2 nucléotides où la méthylation peut se produire.
Protège la bactérie contre la coupure par ses propres enzymes de restriction
Sur A et C
Décrire les bactéries utilisées en biomol.
Déficientes en méthylases et en enzymes de restriction
Rôle de l’ADN ligament
Relier les molécules d’ADN
À quoi sert la phosphatase.
Enlève groupement phosphate donc plasmide ne se referme pas, même avec ligase, mais quand il va être mis dans bactérie = il va se refermer
Est-ce qu’une bactérie peut avoir plusieurs plasmides?
Oui, après l’amplification (réplication)
Nommez les 5
Vecteur d’expression
Phages simple-brin
Cosmides
Fosmides
Plasmides
Qu’est-ce que permet les plasmides?
Permet clonage de grosses molécules d’ADN
Nommez les 2 avantages des fosmides.
1 seule copie
Moins de toxicité
Les plasmides sont inutilisables si insert supérieur à combien de kb
20 kb
À quoi sert le gène de résistance à un antibiotique dans les plasmides?
Sélection phénotypique
Que signifie la sélection pour une colonie blanche.
ADN présent
Pas de clivage de X-gal
Que signifie la sélection pour une colonie de bactéries bleue
Pas ADN
Enzyme clive X-gal
Nommez les 2 avantages des phages pour le clonage de gène.
- Empaquetage d’environ 50 kb
- Bras de 15 kb à chaque extrémité de l’insert
Nommez le site qui est reconnue par la tête des phages.
Site cos
Définir les sites clos par rapport au schéma à la page 175
Reconnu par virus pour encapsulation par fragment 15 kb
Les comides sont des vecteurs hybrides entre quoi et quoi.
Phages lamda
Plasmide
Nommez l’avantage des cosmides p/r aux inserts
Insert de 45 kb
Est-ce que les plasmides, les fosmides et les phages cause de l’infection?
Oui
Quels est le phage simple-brin le plus utilisé?
Phage M13
Quelle est l’avantage des phages simple-brin?
Avantageux pour la séquençage par la technique de Sanger
Quels est l’objectif des vecteurs d’expression?
Déterminer la résultante protéique du gène cloné
Combien de nucléotides sont présents dans une amorce?
Environ 20 nucléotides
Quelle activité les transcriptase inverse?
Activité RNAse H
À quel niveau se situe le point de branchement du lasso présent lors d’épissage d’introns?
Adénine (hautement conservée)
Quelles sont les 3 étapes du mécanisme d’épissage des intrants?
- Site 2-OH attaque site d’épissage 5’
- Relie 5’ de l’intron à 2-OH
- Formation liaison phosphodiester 2-5 a/n du A avant le 3’
À quoi servent les RNPpn?
Catalyse les réactions d’excision et d’épissage
Donnez les composantes des RNPpn.
Protéines
Petits ARN nucléaires (ARNpn)
À l’aide de quel type de liaison les RNPpn peuvent aider à aligner les sites d’épissage avec les séquences situées aux limites exon-intron?
Liaisons hydrogène
À quel niveau la TATA box est-elle dans les cellules eucaryotes?
-35
Décrire brièvement le fonctionnement de la transcriptase inverse.
Copie ARNmessager en ADN complémentaire
Quel est le rôle des splicéosome?
Catalyse les réactions d’épissage
Nommez les 3 composantes des splicéosomes.
RNPpn
Pré-ARNm
Facteurs associés
À quoi se lie le O-3’ lors de l’épissage des introns?
P-5’
Quelle est la demi-vie de l’ARNm mature eucaryote?
20-30 minutes à 20-24 heures
Nommez le cas exceptionnel d’épissage d’ARN et expliquez le un peu.
Protozoaire Tetrahymena
Épissage catalysé par ARN transcrit (ARN possède activité catalytique)
Nommez : ARN dotés d’une activité enzymatique
Ribozymes
Quels sont les 3 codons stop?
UAA
UAG
UGA
Quels est le codons de départ?
AUG (méthionine)
Combien y’a de possibilité de codon?
64
Quelle serait une répercussion d’une mutation dans un ARN de transfert?
Aucune modification
Ou
Ajout du mauvais AA
Nommez : boucle du milieu de l’ARNt
Anticodon
Un codon est traduit en acide aminé par quoi?
Par ARNt comportant une séquence complémentaire
Est-ce qu’un ARNt peut reconnaître plusieurs codons?
Oui, peut aussi en reconnaître juste 1
Définir le I dans la traduction.
Inosine
Selon les règles des codons-anticodons, compléter les paires si l’extrémité 5’ est 1. G, 2. C, 3. À, 4. U, 5.I
- U C
- G
- U
- A G
- CAU
Qu’est-ce que les facteurs d’élongations utilisent?
GTP
Lors de la terminaison de la traduction, les codons non-sens sont reconnus par quoi?
Facteurs de libération
Définir l’initiation fait par les ribosomes lors de la traduction chez les eucaryotes.
Ribosome portant ARNt initiateur se fixe, guidé par coiffe 5’, puis glisse jusqu’à AUG
Quelle est la séquence d’initiation chez les procaryotes lors de la traduction?
Séquence Shine-Dalgarno
Contrôle de la transcription, donnez les 2 lois
- Cellules doivent être capable d’activer ou réprimer la transcription
- Cellules doivent savoir reconnaître les conditions environnementales
Définir le promoteur.
Région régulatrice proche de 5’ qui sert de site de liaison pour l’ARN polymérase
Définir le répresseur.
Protéine qui bloque l’expression des gènes adjacents
Définir l’opérateur.
Région d’ADN située à une extrémité d’un opéron
Définir un inducteur
Agent de l’environnement qui déclenche la transcription à partir d’un oépron
Définir l’opéron.
Groupe de gènes de structure proche dont l’ARNm est synthétisé en un seul morceau, avec les signaux régulateurs proches qui affectent la transcription de ces gènes de structure (séquence codante)
Où s’installe le répresseur?
Sur l’opérateur
Quelle est la différence entre le lactose et le IPTG?
IPTG ne se dégrade pas
Définir les opérateurs cis et trans.
Cis : Agit sur sa propre allèle
Trans : Influence sur les 2 allèles
Lorsqu’il y a beaucoup de glucose, comment est l’AMPc?
AMPc est bloqué
Définir le AMPc quand glucose et lactose présents et quand pas glucose, mais lactose présent.
- AMPc faible (peu de ARNmessager lac)
- AMPc élevé (ARNmessager lac ++)
À quoi sert le Gal80?
Inducteur
Donnez la définition d’auxotrophe.
Incapacité d’un organisme vivant de synthétiser un composé organique nécessaire à son développement
Définir prototrophe.
Organisme peut lui-même synthétiser le composé organique nécessaire à son développement
Complétez la phrase ; lors de la polymérisation de l’ARN, les nouveaux nucléotides sont _______ ajoutés à l’extrémité ____ de la molécule en cours d’________
Toujours
3’
Élongation
Est-ce que les procaryotes ont des introns?
NON
Promoteur
Élément de régulation
Dans un gène avec 1 exons, combien y’a-t’il d’introns.
Aucun introns
Avec quel type de division cellulaire à lieu les transmission des mutations de maladie?
Méiose
Quel truc génétique saute normalement une génération
Récessif relié à X
Qu’est-ce que l’ADN pol ajoute lors de la polymérisation?
Désoxyribonucléotides à 3’ en cours d’élongation
La réplication de ADN à lieu dans quelle phase?
S
Rôle ADN polymérase 1
Enlève amorces d’ARN
Rôle fragment Okazaki
Ajoute des amorces
Rôle hélicase
Ouvre fourche de réplication
Rôle ligase
Ferme dernier lien phosphodiester
Vrai ou faux, il y a toujours 2 fourches de réplication
Oui, 1 dans chaque sens
Est-ce que les télomérase sont présent à la fin de la réplication de l’ADN chez les eucaryotes?
OUI
Quelles sont les 3 propriétés de l’ARN
Chaîne nucléotidique simple brin adoptant des structure tridimensionnelles complexes
Sucre = ribose
Uracile présent
Nommez l’ARN informationnels
ARNmessager (eucaryotes à partir du pré-ARNm)
Nommez différence entre ARN fonctionnels et ARN informationnels?
ARN fonctionnel = jamais traduit en protéine
2 exemples d’ARN fonctionnels
ARNr
ARNt
Donnez le sens de la transcription de l’ADN en ARNm
TOUJOURS 5’ vers 3’
Complétez ; _____ rencontre boîte TATA puis ________________ pour commencer la transcription
Holoenzyme
Changement de conformation
Donnez durée demi vie de ARNm chez les bactérie
Moins de 2 minutes
Nommez la coiffe chez les eucaryotes
7-méthyle guanosine tri-phosphate
Combien d’adénosine sont ajouté sur la coiffe lors de l’élongation de la transcription chez les eucaryotes
150 à 200 A
Est-ce que les pré-ARN possède des introns?
Oui donc ils doivent être modifier
Est-ce que les pré-ARN possède des introns?
Oui donc ils doivent être modifier
