Examen 1 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qui change par rapport à l’ADN selon son organisme?

A

1.Organsiation
2. Quantité
3. Régulation

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Q

Quelles sont les 3 composantes de la dogme central?

A

ADN
ARNmessager
Protéines

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3
Q

Combien de paires de bases possèdent une cellule?

A

Environ 3 milliards de pb

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4
Q

Définir le génome et donnez sa forme.

A

1 à plusieurs molécules d’ADN
Sous forme de chromosomes

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5
Q

Quels sont les 3 rôles de l’ADN?

A

Caractère hériditaire
Matériel génétique contenant information
Variation/mutation génétique

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6
Q

Combien de liaison d’hydrogène A-T et G-C ont-ils? Laquelle de ces liaisons est la plus stable?

A

2 liaisons A-T
3 liaison G-C (plus stable et plus difficile à séparer)

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7
Q

Pourquoi isoler un gène est important?

A
  1. Déterminer la séquence d’un gène
  2. Transférer des gènes d’un organisme à un autre
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8
Q

À quoi servent les clones d’ADN?

A

À créer une bande d’ADN (nécessite plusieurs bactéries pour connaître plus de séquence)

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9
Q

Vrai ou faux, on coupe les plasmides pour insérer un fragment d’ADN.

A

Vrai

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10
Q

Qu’est-ce que chaque colonies de bactéries sur une pétri représente?

A

Une séquence codant pour formation d’une bande d’ADN

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11
Q

Nommez une enzyme de restriction.

A

EcoR1 (coupe 6 nucléotides)

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12
Q

Combien de nucléotides peuvent être couper par des enzymes de restriction?

A

4 à 6 nucléotides

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13
Q

Définir : Système immunitaire pour les bactéries.

A

Enzyme de restriction

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14
Q

Est-ce qu’on peut utiliser EcoR1 pour créer bande d’ADN?

A

Oui

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15
Q

À quoi servent les endonucléases?

A

À couper à l’intérieur des molécules d’ADN

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16
Q

Quelles sont les 2 façons d’isoler l’ADN?

A

Centrifugation
Choc thermique

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17
Q

Décrire un peu le choc thermique qui permet l’isolation de l’ADN.

A

Bactérie compétante avec une membrane perturbé par Calcium puis CHOC THERMIQUE qui fait sortir le calcium et qui fait rentrer le plasmique à l’intérieur

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18
Q

Définir lac-, gal- et tetr.

A

Lac- : pas capable d’utiliser du lactose comme source de carbone
Gal- : pas capable d’utiliser du galactose comme source de carbone
Tetr : gène de résistance à la tétracycline

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19
Q

À quoi sert ori dans un plasmide?

A

Origine de réplication pour faire fourche de réplication

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20
Q

Si nous coupons avec BamH 1 375, à quelle endroit l’ADN va s’installer?

A

Après BamH

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21
Q

Vrai ou faux, le plasmide se replit rarement sur lui-même?

A

Faux, la plupart de temps, le plasmide se replit sur lui-même

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22
Q

Quel gène code la bêta-galactosidase?

A

Lac Z

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23
Q

Pourquoi chaque enzyme coupe seulement à une place?

A

Seulement présent à un endroit, car n’existe pas ailleurs donc coupe à un endroit spécifique

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24
Q

Dans un plasmide, qu’est-ce qui est toujours présent?

A

Origine de réplication (ori)
Résistance à antibiotique

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25
Q

Quelle est la simple différence entre pUC ori et f1 ori?

A

Nombre de réplication varie entre les 2 types d’ori

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26
Q

Définir T7

A

Promoteur pour les procaryotes nécessaire pour faire ARNmessager

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27
Q

Définir Pcmv

A

Promoteur utiliser chez les eucaryotes pour faire ARNmessager

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28
Q

Définir SV40

A

Provient du gène de l’herpès

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29
Q

Définir BGH pA (2)

A

Site de polyadénisation
Provient de l’hormone de croissance de la vache

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30
Q

Pourquoi la topoisomérase rend le clonage plus facile?

A

Topo reconnaît vecteurs donc 2 extrémités ne peuvent pas se coller ensemble donc rend plus facile le clonage

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31
Q

À quoi se lie le GFP dans le gène?

A

V5 épitope et His6

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32
Q

Qu’est-ce que les enzymes de restriction coupe précisément?

A

Palindrome

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33
Q

Donnez 3 caractéristiques claires des enzymes de restriction.

A
  1. Produites par bactéries pour se défendre contre les phages
  2. Coupent l’ADN du phage, ce qui l’inactive
  3. Coupent à endroits précis de l’ADN
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34
Q

Les enzymes de restriction coupent effectivement à des endroits précis de l’ADN, où se trouvent ses séquences?

A

Dans TOUTES les molécules d’ADN

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35
Q

Définir palindrome.

A

2 brins ont la même séquence mais orientation antiparallèle

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36
Q

Après le clivage, comment est l’extrémité?

A

Extrémité collante (ou cohésive)

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37
Q

Sma1 est une enzyme de restriction à bout franc ou bout collant?

A

Bout franc, comme Hae3

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38
Q

Quel est le rôle de la méthylation et nommez les 2 nucléotides où la méthylation peut se produire.

A

Protège la bactérie contre la coupure par ses propres enzymes de restriction
Sur A et C

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39
Q

Décrire les bactéries utilisées en biomol.

A

Déficientes en méthylases et en enzymes de restriction

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40
Q

Rôle de l’ADN ligament

A

Relier les molécules d’ADN

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41
Q

À quoi sert la phosphatase.

A

Enlève groupement phosphate donc plasmide ne se referme pas, même avec ligase, mais quand il va être mis dans bactérie = il va se refermer

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42
Q

Est-ce qu’une bactérie peut avoir plusieurs plasmides?

A

Oui, après l’amplification (réplication)

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43
Q

Nommez les 5

A

Vecteur d’expression
Phages simple-brin
Cosmides
Fosmides
Plasmides

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44
Q

Qu’est-ce que permet les plasmides?

A

Permet clonage de grosses molécules d’ADN

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45
Q

Nommez les 2 avantages des fosmides.

A

1 seule copie
Moins de toxicité

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46
Q

Les plasmides sont inutilisables si insert supérieur à combien de kb

A

20 kb

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47
Q

À quoi sert le gène de résistance à un antibiotique dans les plasmides?

A

Sélection phénotypique

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48
Q

Que signifie la sélection pour une colonie blanche.

A

ADN présent
Pas de clivage de X-gal

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49
Q

Que signifie la sélection pour une colonie de bactéries bleue

A

Pas ADN
Enzyme clive X-gal

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50
Q

Nommez les 2 avantages des phages pour le clonage de gène.

A
  1. Empaquetage d’environ 50 kb
  2. Bras de 15 kb à chaque extrémité de l’insert
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51
Q

Nommez le site qui est reconnue par la tête des phages.

A

Site cos

52
Q

Définir les sites clos par rapport au schéma à la page 175

A

Reconnu par virus pour encapsulation par fragment 15 kb

53
Q

Les comides sont des vecteurs hybrides entre quoi et quoi.

A

Phages lamda
Plasmide

54
Q

Nommez l’avantage des cosmides p/r aux inserts

A

Insert de 45 kb

55
Q

Est-ce que les plasmides, les fosmides et les phages cause de l’infection?

A

Oui

56
Q

Quels est le phage simple-brin le plus utilisé?

A

Phage M13

57
Q

Quelle est l’avantage des phages simple-brin?

A

Avantageux pour la séquençage par la technique de Sanger

58
Q

Quels est l’objectif des vecteurs d’expression?

A

Déterminer la résultante protéique du gène cloné

59
Q

Combien de nucléotides sont présents dans une amorce?

A

Environ 20 nucléotides

60
Q

Quelle activité les transcriptase inverse?

A

Activité RNAse H

61
Q

À quel niveau se situe le point de branchement du lasso présent lors d’épissage d’introns?

A

Adénine (hautement conservée)

62
Q

Quelles sont les 3 étapes du mécanisme d’épissage des intrants?

A
  1. Site 2-OH attaque site d’épissage 5’
  2. Relie 5’ de l’intron à 2-OH
  3. Formation liaison phosphodiester 2-5 a/n du A avant le 3’
63
Q

À quoi servent les RNPpn?

A

Catalyse les réactions d’excision et d’épissage

64
Q

Donnez les composantes des RNPpn.

A

Protéines
Petits ARN nucléaires (ARNpn)

65
Q

À l’aide de quel type de liaison les RNPpn peuvent aider à aligner les sites d’épissage avec les séquences situées aux limites exon-intron?

A

Liaisons hydrogène

66
Q

À quel niveau la TATA box est-elle dans les cellules eucaryotes?

A

-35

67
Q

Décrire brièvement le fonctionnement de la transcriptase inverse.

A

Copie ARNmessager en ADN complémentaire

68
Q

Quel est le rôle des splicéosome?

A

Catalyse les réactions d’épissage

69
Q

Nommez les 3 composantes des splicéosomes.

A

RNPpn
Pré-ARNm
Facteurs associés

70
Q

À quoi se lie le O-3’ lors de l’épissage des introns?

A

P-5’

71
Q

Quelle est la demi-vie de l’ARNm mature eucaryote?

A

20-30 minutes à 20-24 heures

72
Q

Nommez le cas exceptionnel d’épissage d’ARN et expliquez le un peu.

A

Protozoaire Tetrahymena
Épissage catalysé par ARN transcrit (ARN possède activité catalytique)

73
Q

Nommez : ARN dotés d’une activité enzymatique

A

Ribozymes

74
Q

Quels sont les 3 codons stop?

A

UAA
UAG
UGA

75
Q

Quels est le codons de départ?

A

AUG (méthionine)

76
Q

Combien y’a de possibilité de codon?

A

64

77
Q

Quelle serait une répercussion d’une mutation dans un ARN de transfert?

A

Aucune modification
Ou
Ajout du mauvais AA

78
Q

Nommez : boucle du milieu de l’ARNt

A

Anticodon

79
Q

Un codon est traduit en acide aminé par quoi?

A

Par ARNt comportant une séquence complémentaire

80
Q

Est-ce qu’un ARNt peut reconnaître plusieurs codons?

A

Oui, peut aussi en reconnaître juste 1

81
Q

Définir le I dans la traduction.

A

Inosine

82
Q

Selon les règles des codons-anticodons, compléter les paires si l’extrémité 5’ est 1. G, 2. C, 3. À, 4. U, 5.I

A
  1. U C
  2. G
  3. U
  4. A G
  5. CAU
83
Q

Qu’est-ce que les facteurs d’élongations utilisent?

A

GTP

84
Q

Lors de la terminaison de la traduction, les codons non-sens sont reconnus par quoi?

A

Facteurs de libération

85
Q

Définir l’initiation fait par les ribosomes lors de la traduction chez les eucaryotes.

A

Ribosome portant ARNt initiateur se fixe, guidé par coiffe 5’, puis glisse jusqu’à AUG

86
Q

Quelle est la séquence d’initiation chez les procaryotes lors de la traduction?

A

Séquence Shine-Dalgarno

87
Q

Contrôle de la transcription, donnez les 2 lois

A
  1. Cellules doivent être capable d’activer ou réprimer la transcription
  2. Cellules doivent savoir reconnaître les conditions environnementales
88
Q

Définir le promoteur.

A

Région régulatrice proche de 5’ qui sert de site de liaison pour l’ARN polymérase

89
Q

Définir le répresseur.

A

Protéine qui bloque l’expression des gènes adjacents

90
Q

Définir l’opérateur.

A

Région d’ADN située à une extrémité d’un opéron

91
Q

Définir un inducteur

A

Agent de l’environnement qui déclenche la transcription à partir d’un oépron

92
Q

Définir l’opéron.

A

Groupe de gènes de structure proche dont l’ARNm est synthétisé en un seul morceau, avec les signaux régulateurs proches qui affectent la transcription de ces gènes de structure (séquence codante)

93
Q

Où s’installe le répresseur?

A

Sur l’opérateur

94
Q

Quelle est la différence entre le lactose et le IPTG?

A

IPTG ne se dégrade pas

95
Q

Définir les opérateurs cis et trans.

A

Cis : Agit sur sa propre allèle
Trans : Influence sur les 2 allèles

96
Q

Lorsqu’il y a beaucoup de glucose, comment est l’AMPc?

A

AMPc est bloqué

97
Q

Définir le AMPc quand glucose et lactose présents et quand pas glucose, mais lactose présent.

A
  1. AMPc faible (peu de ARNmessager lac)
  2. AMPc élevé (ARNmessager lac ++)
98
Q

À quoi sert le Gal80?

A

Inducteur

99
Q

Donnez la définition d’auxotrophe.

A

Incapacité d’un organisme vivant de synthétiser un composé organique nécessaire à son développement

100
Q

Définir prototrophe.

A

Organisme peut lui-même synthétiser le composé organique nécessaire à son développement

101
Q

Complétez la phrase ; lors de la polymérisation de l’ARN, les nouveaux nucléotides sont _______ ajoutés à l’extrémité ____ de la molécule en cours d’________

A

Toujours
3’
Élongation

102
Q

Est-ce que les procaryotes ont des introns?

A

NON

103
Q

Promoteur

A

Élément de régulation

104
Q

Dans un gène avec 1 exons, combien y’a-t’il d’introns.

A

Aucun introns

105
Q

Avec quel type de division cellulaire à lieu les transmission des mutations de maladie?

A

Méiose

106
Q

Quel truc génétique saute normalement une génération

A

Récessif relié à X

107
Q

Qu’est-ce que l’ADN pol ajoute lors de la polymérisation?

A

Désoxyribonucléotides à 3’ en cours d’élongation

108
Q

La réplication de ADN à lieu dans quelle phase?

A

S

109
Q

Rôle ADN polymérase 1

A

Enlève amorces d’ARN

110
Q

Rôle fragment Okazaki

A

Ajoute des amorces

111
Q

Rôle hélicase

A

Ouvre fourche de réplication

112
Q

Rôle ligase

A

Ferme dernier lien phosphodiester

113
Q

Vrai ou faux, il y a toujours 2 fourches de réplication

A

Oui, 1 dans chaque sens

114
Q

Est-ce que les télomérase sont présent à la fin de la réplication de l’ADN chez les eucaryotes?

A

OUI

115
Q

Quelles sont les 3 propriétés de l’ARN

A

Chaîne nucléotidique simple brin adoptant des structure tridimensionnelles complexes
Sucre = ribose
Uracile présent

116
Q

Nommez l’ARN informationnels

A

ARNmessager (eucaryotes à partir du pré-ARNm)

117
Q

Nommez différence entre ARN fonctionnels et ARN informationnels?

A

ARN fonctionnel = jamais traduit en protéine

118
Q

2 exemples d’ARN fonctionnels

A

ARNr
ARNt

119
Q

Donnez le sens de la transcription de l’ADN en ARNm

A

TOUJOURS 5’ vers 3’

120
Q

Complétez ; _____ rencontre boîte TATA puis ________________ pour commencer la transcription

A

Holoenzyme
Changement de conformation

121
Q

Donnez durée demi vie de ARNm chez les bactérie

A

Moins de 2 minutes

122
Q

Nommez la coiffe chez les eucaryotes

A

7-méthyle guanosine tri-phosphate

123
Q

Combien d’adénosine sont ajouté sur la coiffe lors de l’élongation de la transcription chez les eucaryotes

A

150 à 200 A

124
Q

Est-ce que les pré-ARN possède des introns?

A

Oui donc ils doivent être modifier

125
Q

Est-ce que les pré-ARN possède des introns?

A

Oui donc ils doivent être modifier