Examen 1 Flashcards
Défini microbiologie
Étude des organismes trop petits pour être vus à l’œil nu
Décrit les cellules pro et eucaryotes
- Cellules procaryotes
➢ Morphologie simple
➢ Noyau non limité par une enveloppe
➢ Eubactéries et Archées - Cellules eucaryotes
➢ Morphologie complexe
➢ Noyau entouré par une enveloppe
➢ Protistes, champignons…
Décrit l’arbre phylogénétique universel
Classification de tous les organismes vivants
➢ Basée sur la comparaison des séquences d’ARN
ribosomiques(ARNr)
➢ Système développé par Carl Woese (~1970)
* Comprend 3 domaines
➢ Bacteria, Archaea et Eucarya
Qui est crédité pour la découverte des microorganismes
Antony van Leeuwenhoek
(1632-1723)
Décrit la génération spontanée et comment elle fut réfutée
Bouillon qui devient turbulé quand bactéries sont présentes, a été chauffé après avoir été scellé
Définit un virion
- Particule virale complète
- Formé de moins d’une molécule d’ADN ou d’ARN
enfermée(s) dans une coque protéique - Peut contenir d’autres couches additionnelles,
souvent complexes (glucides, lipides et protéines)
Compare un virus à un organisme cellulaire
Virus
➢ Organisation simple et acellulaire
➢ Contiennent soit de l’ADN ou de l’ARN
mais pas les deux (il existe des
exceptions)
➢ Ne peuvent se multiplier et se diviser
indépendamment des cellules vivantes
➢ Ce sont tous des parasites intracellulaires
obligatoires
Bactérie
➢ Organisation complexe
➢ Contiennentde l’ADN et de l’ARN.
➢ Effectuent la division cellulaire pour se
multiplier et se diviser
➢ Certains sont des parasites
intracellulairesobligatoires
Décrit les propriétés générales d’un virus
Nucléocapside : Composée d’acides nucléiques (ADN ou ARN)
maintenus dans une coque protéique nommée capside
* Capside : Coque protéique qui entoure le génome viral. Protège le
matériel génétique et favorise son transfert d’une cellule hôte à une autre.
* Protomères : Protéines qui forment la capside
Beaucoup de virus vont avoir un seul type de protéine qui constitue la capside
Permet de limiter le nombre de bases associé à la capside dansle génome.
Comment se forment les types morphologiques des virus
- Les types morphologiques résultent principalement de la combinaison d’un
type de symétrie de la capside et de la présence ou de l’absence d’une
enveloppe.
Virus avec et sans enveloppes
Virus sans est dit nu, tandis qu’un virus avec est dit enveloppé
Décrit les capsides hélicoïdales
- Ressemblent à des tubes creux faits de
protéines - Les ARN du virus influenza sont inclus dans
des capsides en hélices fines et flexibles,
repliées dans une enveloppe
Décrit les capsides icosaédriques
- Polyèdre régulier avec 20 faces triangulaires
équilatérales et 12 sommets
Capsomères - Unités en forme d’anneau composées de 5 ou
6 protomères
➢ Pentamères(pentons) – 5 sous-unités
➢ Hexamères (hexons) – 6 sous-unités
Décrit les capsides à symétrie complexe
voir diapo 18
Décrit les enveloppes virales
- Structure membranaire qui enveloppe certains virus
➢ Les lipides et les glucides qui peuvent être retrouvés dans l’enveloppe
proviennent généralement des membranes de la cellulehôte - Projections (spicules)
➢ Projections protéiques de l’enveloppe
➢ Spécifiques à certains virus
➢ Peuvent être impliquées dans la fixation du
virus à la surface de la cellulehôte
Décrit les enzymes virales
- Observées chez certains virus
- Associées à la capside (à l’intérieur de celle-ci) ou à l’enveloppe
Décrit les génomes viraux des virus à ADN
- Chez les virus à ADN, on retrouve des génomes dont l’ADN est linéaire
et pour d’autres circulaire. - Certains ADN viraux possèdent des nucléotides contenant des bases
inhabituelles (i.e. le 5-hydroxyméthylcytosine remplace la cytosine)
Exemple du phage lambda : - ADN linéaire dans la capside
- ADN circulaire dans l’hôte
Voir aussi diapo 21
Décrit les génomes viraux des virus à ARN
Beaucoup de génomes à ARN sont des génomes segmentés (divisés en
fragments séparés)
Virus à ARN simple brin à chaîne positive (plus)
* La séquence des bases de l’ARN est identique à celle de l’ARNm viral
➢ Les ARN positifs viraux ressemblent à des ARN messagers et peuvent
diriger la synthèse protéique immédiatement après avoir pénétré dans la
cellule
➢ Exemples : virus de la poliomyélite, virus de la mosaïque du tabac
Virus à ARN simple brin à chaîne négative (moins)
➢ La séquence des bases de l’ARN est complémentaire à celle de l’ARNm viral.
➢ Exemples : influenza, virus de la rage, des oreillons, de la rougeole
➢ Les rétrovirus sont des virus à ARN +
Un rétrovirus possède une enzyme appelée transcriptase inverse, un
ADN polymérase qui permet la fabrication d’un ADN à partir de l’ARN
viral lorsque celui-ci entre dans la cellule-hôte.
Cet ADN complémentaire du génome viral s’intègre dans le génome de
la cellule-hôte
Décrit la multiplication des virus (étapes principales0
- L’attachement à la cellule (adsorption). On
pense que ça se fait grâce à une interaction
entre des récepteurs de la cellule hôte et des
molécules spécifiques de la surface du virus.
Ces récepteurs ont une fonction cellulaire
précise (pas spécifiques aux virus) - La pénétration dans l’hôte. Si la nucléocapside
pénètre, il faut en général une décapsidation
avant que la réplication commence - Le stade de synthèse
- L’assemblage
- La libération
Décrit la libérations des virions
- Par lyse de la cellule E.coli
➢ Une enzyme va trouer la membrane plasmique et une deuxième enzyme
(lysozyme) qui va attaquerle peptidoglycane de la paroi de la bactérie - Par bourgeonnement (fréquent chez les virus enveloppés)
➢ Les protéines virales sont d’abord intégrées à la membrane plasmique de
l’hôte. L’enveloppe peut aussi provenir du réticulum endoplasmique, de
l’appareil de Golgi ou d’autresmembranes internes. - Éjection suivant la modification de microfilaments d’actine Vaccine
(ou variole de la vache)
Décrit les deux types d’infection virale des cellules eucaryotes
- Infection lytique: entraine la mort cellulaire
- Infections persistantes: effets cytopathiques
Décrit les infections oncogènes
Certains oncogènes peuvent être introduits par des virus
* Virus à l’origine de cancer : oncovirus
* Codent généralement pour des protéines qui vont se fixer sur des protéines de
l’hôte qui ont habituellement un rôle de suppresseurs de tumeur (Rb, p53)
* Exemple connu: certaines souches de Papillomavirus humains à
l’origine de cancer de l’utérus
Décrit comment on cultive des virus
Requiert l’inoculation d’un hôte approprié
* Hôtes pour des virus d’animaux:
➢ Animaux
➢ Œufs embryonnés
➢ Culturessur des monocouches de cellules animales
* Hôtes pour des bactériophages:
➢ Cultures de bactériesjeunes(milieux liquides ou solides)
Hôtes pour des virus végétaux:
➢ Plantes entières
➢ Cultures de tissus végétaux
➢ Culture de cellulesséparées ou protoplastes
Décrit comment on effectue le dénombrement des virus
Comptage direct
➢ Effectué au microscope électronique (parfois en microscopie à fluorescence)
* Par PCR (indirect)
➢ Dans ce cas, on quantifie l’acide nucléique viral
* Détermine la dilution de virus la plus élevée qui entraîne une
hémagglutination de globules rouges du sang
* Méthode rapide
De nombreux virus peuvent se fixer à la surface des globules rouges du
sang. Si le rapport virus-cellules est suffisamment élevé, les particules
virales uniront les globules rouges entre eux, formant ainsi un réseau ou
agglutinat qui se déposera.
* En pratique, on mélange les globules rouges à une série de dilutions de la
préparation de virus et chaque mélange est examiné
➢ Utilisé par exemple pour dénombrerle virus de la grippe
Différentes dilutions de virus sont étalées sur des cellules hôtes
appropriées
* Dénombrement des plages de lyses
* Les résultats sont exprimés par nombre de virus infectieux ou d’unités
formatrices de plages (UFP)