Examen 1 Flashcards
quel métal a des propriétés antimicrobiennes
cuivre (réduit les transmissions). le zinc dans la pate a dents en a aussi
qui contient plus de bactéries, le téléphone cellulaire ou la cuvette
le telephone en a 10x plus
vrai ou faux, le tétanos s’attrape seulement par les clous rouillés
faux. le tétanos est une bactérie et son réservoir naturel est le syst. digestif des animaux. ils crottent, ca va dans le sol et il y a contamination
qu’est ce que la microbiologie et quels sont les organismes étudiés
-science qui étudie les organismes de taille microscopique
bactérie
virus
micètes (levure et moisissures)
algues
protozoaires
les micros organismes sont-ils tous des agents pathogènes
non, certains sont utiles et essentiels à la vie
ou retrouve-ton des micros organismes
-humains, animaux, plantes
-sol, air, eau, aliments
-environnements extrêmes pour les microorganismes extrêmophiles (cheminée hydrothermale sous-marine et mer morte)
quels sont les 5 nids a bactérie en ordre du moins au plus
-télécommande de chambre d’hotel
-panier d’épicerie
-menu restaurant
-toilettes d’avion
-salle d’attente médecin
combien y a-til de bactéries chez l’humain. combien dans la bouche et combien sur la peau
10^14 bactérie. soit 2kg de notre poids.
10 milliards dans la bouche
1 milliard sur la peau
qu’à fait Antonie van Leuuwenhoek
-invente le 1er microscope
-échantillon de la plaque dentaire
-il y a 250x plus de bct dans la cavité buccale que d’individus sur la planete
qu’à fait Edward Jenner
-premier médecin a tenter un vaccin contre la variole
qu’à fait Louis Pasteur
-procédé de fermentation
-théorie de la biogenèse
-découverte des principes d’asepsie
-procédé de pasteurisation (62,8°c pdnt 30min)
-vaccin contre la rage
-fondation institut Pasteur
qu’à fait Louis Lister
-application des principes d’asepsie en salle opératoire
-vaporisation de phénol et traitement des instruments à la chaleur
nommer des agents infectieux
-bactéries (pneumonie, tuberculose…)
-virus (covid, herpes…)
-mycètes (candidose, aspergillose)
-protozoaire (malaria, leishmaniose)
comment se développent les pathogènes opportunistes
-membres de la flore normale
-baisse de l’efficacité du système immu
-diminution des bactéries bénéfiques
quand les microorganismes deviennent-ils nos ennemis
-sont des agents infectieux
-pathogènes opportunistes
-détériorent des aliments (produits laitiers, fruits/legumes)
-détérioration d’équipements (corrosion de métaux, colmatage de tuyaux)
quels sont les grandes catégories de microorganismes qui sont nos amis
industrie alimentaire
-bactérie ; yogourt, fromage
-levures ; pain, bière, vin
industrie pharmaceutique
-insuline ; produite par E. coli
-antibiotique ; pénicilline, streptomycine
-vaccin ; sources d’antigènes
agents probiotiques (pas sur de l’effet)
-streptococcus, lactobacillus, bifidobacterium
-élimination pathogènes par compétition et antagonisme
-stimulation syst. immu
-role dans la digestion
-production de vitamines
-diminution mauvais cholest.
environnement
-insecticides (bacillus thuringiensis)
-dégradation des dérivés du pétrole (transformation des hydrocarbures en co2 et h2o)
quelle bactérie est la plus connue
Escherichia coli
-découverte par theodore Escherich
-microorganisme dominant de la flore intestinale (80%)
-bactérie modèle dans les labos
-c’est un marqueur de contamination de l’eau
-provoque parfois des intoxications alimentaires et infections urinaires
que produit E. coli
vitamine K (pas présente naturellement chez l’humain) qui permet la coagulation sanguine
qu’est ce qu’un microorganisme et quels sont-ils
êtres vivants unicellulaires microscopiques, ubiquitaires
-virus (cellule acaryote où l’hote est obligatoire)
-bactérie (cellule procaryote unicellulaire)
-algue (cellule eucaryote unicellulaire ou pluricellulaire. présence de chlorophylle)
-mycète (cellule eucaryote unicellulaire-levure ou pluricellulaire-moisissure)
-protozoaire (cellule eucaryote unicellulaire)
qu’est ce que le microbiome
-environnement idéal (température, humidité et nutriments)
-la composition du microbiote est hétérogène-change selon plusieurs aspects.
(niches buccales, apport nutritif, hygiène buccodentaire, age de l’individu)
qu’est ce que la nomenclature
discipline qui établit les règles d’un langage international permettant de désigner par un m^me nom, de microorganismes identiques dans nimporte quelle région du monde
quels sont les échelons hierarchiques de la nomenclature
-règne
-embranchement
-classe
-ordre
-famille
-genre
-espece
RECOFaGE
comment est la nomenclature pour le genre et l’espece
-genre et espece en italique
-genre en majuscule
-espece en minuscule
que veut dire sp
on parle d’une espece non spécifiée du genre
que veut dire spp
on parle de deux ou plus especes non spécifiées du genre
que représente la cellule
l’unité biologique structurelle et fonctionnelle fondamentale de tous êtres vivants
qu’est ce qui permet de prouver la parenté de tous les être vivant
l’unité structurelle du vivant (cellule). tout le monde a une ou plusieurs cellules composées d’une mb, d’un cytoplasme et de materiel génétique
qu’est ce qu’une cellule eucaryote
-grande taille
-noyau entouré d’une mb
-présence d’organelles
qu’est ce qu’une cellule procaryote
-être unicellulaire
-dépourvu de noyau
-absence d’organelle
quelles sont les différences entre eucaryotes et procaryote
EUCARYOTE :
-chromosomes linéaire entourés d’une mb
PROCARYOTE :
-un seul chromosome circulaire sans mb nucléaire
EUCARYOTE :
-réticulum endo
-mitochondrie
-appareil de golgi
PROCARYOTE :
-absence d’organelle
EUCARYOTE :
-absence de paroi
-division cellulaire par mitose
PROCARYOTE :
-présence de paroi
division pas par mitose
chez les bactéries, par quoi est délimité le cytoplasme (dans lequel baigne le matériel génétique)
-paroi et mb cytoplasmique
vrai ou faux, le matériel génétique des bactéries se présente sous forme de simple brin
faux, unique double filament d’ADN de forme circulaire
les bactéries peuvent-elles avoir des capsules
oui, mais n’en ont pas toutes
de quoi est composée la mb cytoplasmique des bct et dans quoi est-elle impliquée
-phospholipides et protéines
-barrière sélective
-transport trans-membranaire de substances nutritives
-transport des électrons
-sécretion d’enzymes et de toxines
qu’est ce que la paroi des bactérie
-mb rigide formée de mucopeptides (peptidoglycane) qui donne sa forme à la bct et la protège de la lyse
-protège contre le stress de l’environnement (pression osmotique, température, stress mécanique)
-perméabilité sélective
comment se présente un peptidoglycane de la paroi
polymère complexe formé de deux parties reliées par des ponts interpeptidiques:
-glucidique (alternance de N-acétylglucosamine et N-acétylmuramique)
-peptidique (chaine peptidique de 4aa attachés à l’acide N-acétylmuramique)
qu’est ce qu’une bct gram +
-peptidoglycane est le constituant majeur de la paroi
-les acides téichoiques aident au maintient de la paroi en permettant l’attachement du peptidoglycane à la membrane cytoplasmique (sous jacente)
(paroi et en dessous mb plasmique)
qu’est ce qu’une bct gram -
-la couche de peptidoglycane est moins épaisse
-présence d’une membrane externe composée de phospholipides, de prots et de lipopolysaccharides. Des porines permettent le passage de molécules.
-les lipoprotéines de Braun assure la liaison de la mb externe au peptidoglycane
(mb externe, couche peptidoglycane et en dessous mb plasmique)
qu’est ce que les lipopolysaccharides et quelle est leur structure
-propres à la mb externe des gram -
-antigène O à la surface (polysaccharide respondable de la spécificité antigénique)
-polysaccharide central (CORE) (riche en heptose et sa composition peut varier d’une bct à l’autre)
-vitamine A (acide gras inséré dans la mb externe. est la partie toxique de la molécule)
qui a développé la coloration de gram
christian gram
sur quoi est basée la coloration de gram
sur la composition de la paroi cellulaire de bct
quelles sont les couleurs de bactéries apres la coloration gram
gram + = mauve
gram - = rose
quelles sont les étapes de la coloration de gram
-fixation (deux sont blanche)
-coloration au cristal violet (2 sont mauves)
-traitement à l’iode (2 sont mauves pales)
-décoloration a l’éthanol (- devient blanc et + reste mauve pale)
-contre coloration à la safranine (- devient rose et + reste mauve pale)
gram + :
1) réaction à la coloration
2)peptidoglycane
3)acide téichoique
4)lipopolysaccarides
5)mb externe
1)rétention du crystal violet (devient mauve)
2)épaisses couches
3)oui sert à l’attachement
4)non
5)non
gram - :
1) réaction à la coloration
2)peptidoglycane
3)acide téichoique
4)lipopolysaccarides
5)mb externe
1)pas de rétention du crystal violet, contre coloration (devient rose)
2)une mince couche
3)non
4)oui dans mb externe
5)oui
quels sont les transports transmembranaires
passif :
-diffusion simple (petites molécules avec gradiant)
-diffusion facilité (protéine memb en suivant le gradiant)
actif :
implique la modification d’une protéine dans mb et utilise ATP
quels sont les types de transports passif a diffusion facilité
-uniport
-symport (cotransport)
-antiport (cotransport)
Qu’est ce que la capsule d’une bactérie et a quoi sert-elle
structure de nature polysaccharidique recouvrant la cell
-role de protection pour la bct contre phagocytose, dessiccation, variation de milieu
-role dans l’adhérence à différentes surfaces
qu’est ce que le glycocalyx d’une bct et a quoi sert-elle
polysaccharides sécrétés par les cellules
-ubiquitaire (peut se retrouver a plusieurs endroits différents)
-sert à l’attachement des bct aux cellules et aux structure abiotiques
-protège l’enveloppe cellulaire
qu’est ce que la flagelle sur des bct
structurue de nature protéique constituée de protéines différentes et codée par plus de 20 gènes
-responsable de la motilité (chimiotactisme)
quels sont les différents noms pour le différent nombre de flagelle
1 fgl = monotrice
2 fgl = amphitriche
plusieurs sur le m^me pole = lophotriche
plusieurs partout = péritriche
qu’est ce que le fimbriae
filaments fins et courts de nature protéique constitués de sous-unités répétitives
-role dans l’adhérence à différentes surfaces
qu’est ce que le pili
filament épais et court de nature protéique (1 à 10 pili par cellule) et constitué de sous-unités répétitives
-joue une role dans l’échange de matériel génétique entre 2 bct
qu,est ce que le spore bactérien
forme de survie de certaines bct
-formé a l’intérieur de certaines bct lorsque les conditions environnementales deviennent défavorables à leur survie
-hautement résistant à la chaleur
-il y a germination des spores lorsque les conditions redeviennent propices
nommez deux genre producteurs de spores
bacillus et clostridium
de quoi est composé un nucléotide
sucre
acide phosphorique
base azotée
qu’est ce qu’un plasmide
élément d’ADN extra-chromosomique
-petit, circulaire et libre
-se réplique indépendemment du chromosome
-non essentiel à la survie mais peut apporter une fonction supplémentairei à la bct (résistance a un antibio ou expression d’une toxine)
comment se divisent les bct et quelles sont les étapes
par division binaire.
-réplication ADN
-élongation cellulaire
-formation d’un septum
-séparation des cellules
par quels processus peuvent varier les chromosomes bactériens
-mutation (modification brusque d’un caractère particulier, rare et est induit par certain agents mutagène)
-recombinaison génétique (transfert d’ADN bactérien à une bct réceptive)
quels sont les trois types de recombinaison génétiques
transformation
transduction
conjugaison
qu’est ce que la transformation
introduction d’ADN bactérien dans une bct réceptive. Cet ADN de la bactérie donneuse devient disponible suite à la lyse cellulaire que la cellule receveuse va absorber et intégrer certain gènes dans son ADN
qu’est ce que la transduction
introduction d’ADN bactérien dans une bct réceptrice par l’intermédiaire d’un bactériophage
qu’est ce que la conjugaison
introduction d’ADN bactérien suite à un contact entre la bct donatrice et la bct réceptrice.
l’ADN est introduit via les pilis de la bct donatrice
qu’est ce que la taxonomie bactérienne
étude de la classification des bct
quels sont les deux grandes classes de caractéristiques pour la classification et l’identification des bct
1)morphologiques
-forme et taille
-cils et flagelles
-inclusions cellulaires
2)physiologiques et métaboliques
-source d’énergie
-constituants de la paroi cellulaire
-relation avec l’oxygène
-métabolites secondaires
qu’est ce que le métabolisme bactérien
l’ensemble des transformations chimiques qui assurent l’élaboration des constituants bactériens et leur fonctionnement
quelles sont les sources d’énergies possibles et comment appelons nous les bct dans chacun des cas
1)énergie lumineuse
transformée en ATP par les phototrophes, grace à des pigments (chlorophylle, carotènes…)
2)énergie chimique
provenant de l’oxydation de molécules minérales (chimio-lithotrophe) ou organiques (chimio-organotrophes)
quelles sont les deux grandes catégories de bct créées par les exigences nutritionnelles en carbone
-autotrophes : capables de se développer en milieu inorganique en utilisant le co2 ou les ions hco3- comme seule source de carbone pour synthétiser leurs constituants carbonés
-hétérotrophes : exigent des molécules organiques (sucres, acides organiques, peptides, aa…) pour leur croissance
quels sont les 3 grands paramètres physiques
1)température
0-20°c ; psychrophile
20-45°c ; mésophile
>45°c ; thermophile
2)pH
1-5 ; acidophile
6,5-7,5 ; neutrophile
8-12 ; alcalophile
3)oxygène
aérobie stricte
microaérobie
anaérobie facultative
anaérobie stricte
qu’est ce qu’une culture pure
culture originaire d’une cellule individuelle (une seule souche de bactérie). l’étalement doit se faire sur un milieu de culture gélosé
vrai ou faux, il n’est pas obligatoire d’avoir une culture pure pour étudier une bct particulière
faux
quels sont les critères pour obtenir une croissance microorganique en labo
-conditions doivent être les plus proches possibles du milieu naturel
-contenir des éléments nutritifs essentiels à leur activité métabolique. exigences nutritives sont cependant variables (fer, aa, vitamine…)
quelles sont les différentes formes que peuvent prendre les milieux de culture
1) état physique
-liquide (permet croissance abondante)
-solide/gelose (1,5% d’agar)
-semi-solide (0,75% d’agar)
2) composition chimique
-défini (composantes connues)
-complexe (milieu de culture général, riche en nutriments divers)
-sélectif (composantes établies et spécifiques à l’isolement d’une espèce particulière)
-différentiel (permet de différencier 2 types de microorganismes se développant dans un même milieu)
que retrouve-t-on dans un milieu de culture nutritif complexe
présence d’extrait de viande ou protéines
que retrouve-t-on dans un milieu de culture sélectif
agents inhibiteurs (antibio) pour isoler une espèce dans l’échantillon complexe
que retrouve-t-on dans un milieu de culture différentiel
bactéries coliformes (lactose+indicateur complexe) pour mettre en évidence une espèce particulière en présence d’une population mixte
à quoi sert la croissance en milieu liquide
la plupart des bct donne une croissance homogène dans le bouillon de culture. Cela permet une étude de la croissance de bct. Elles se divisent pas mal toute aux 20-30minutes dans les conditions optimales.
-on peut de facon simpke mesurer le nombre de cell vivantes ou la concentration cell totale
-permet d’Établir une courbe de croissance mais ne permet pas l’isolement de microorganisme
comment fonctionne un milieu de culture liquide
on mesure la turbidité (densité optique) de la suspension bactérienne à l’aide d’un turbidimètre ou spectrophotomère (660 nm)
quelles sont les 4 phase d’une courbe de croissance bactérienne
-phase de latence (adaptation, synthèse des enzymes essentiels à la croissance)
-phase exponentielle (on mesure le temps de génération et le taux de croissance de la bct)
-phase stationnaire (autant qui sont créées que qui meutent)
-phase de déclin (épuisement de substance nutritives et accumulation de produits toxiques)
à quoi correspond le temps de génération (G) de la phase exponentielle
temps nécessaire à une bct pour se diviser. correspond donc au temps nécessaire pour qu’une population de cellule double en nbr
à quoi correspond le taux de croissance
exprime la vitesse de multiplication des bct. C’est donc le nombre de division effectuées par unité de temps
comment se forment les bct dans un milieu solide
des bactéries sont inoculées et se développent sous forme de colonies visibles à l’oeil nu.
combien existe-t-il de types de colonies en milieux solide et quelles sont-elles
3
-lisse
-muqueux
-rugueux
que permet la culture sur un milieu solide
l’énumération des bct, leur différenciation et leur isolement
quelles sont les étapes de l’analyse de la microflore buccale (6)
1) échantillonnage (curette-dents, pointes absorbantes-muqueuses, écouvillons, seringues-salive)
2)transport au labo
-milieu de transport approprié pour bct anaérobies strictes
-absence de substances nutritives
-temps doit être court
3)observation microscopique (microscopie à contraste de phase et coloration de gram)
-permet de déterminer les proportions des différents morphotypes
4)dispersion de l’échantillon (vortex, ultrasons)
-séparer les agrégats en cell individuelles
-bct fragiles peuvent ne pas résister
5)culture
-préparation de dilutions
-étalement sur milieu de culture
-incubation avec plus ou moins O2
6)identification
-tests biochimiques
-systèmes commerciaux
-séquençage du gène de l’ARN ribosomal 16S
sur quoi on se base lors d’une identification bactérienne phénotypique
1)morphologie cellulaire (forme, arrangement, présence de spores, motilité)
2)coloration de Gram
3)réponse à l’oxygène
4)tests biochimiques
-fermentation des sucres, production de métabolites et d’enzymes
ex; test de la catalase = pendant la respiration aérobie, certaine bct produisent h2o2 qui est toxiques. Ces dernières produisent alors la catalase qui décompose le H2O2 en H2O et O2
quelles les méthodes d’identifications qui sont maintenant préférées aux galeries d’identification (galerie API)
-PCR
-Séquençage du gène de l’ARN 16S
-Séquençage de type Shotgun
qu’est ce que la réaction en chaine par polymérase (PCR)
permet de cibler un gène présent uniquemenr chez une famille ou un genre bactérien par réhybridation spécifique de courtes séquences d’ADN synthétiques précises (oligonucléotides amorces)
On doit cependant connaître ce qu’on cherche. mettons on a deux bactéries et on veut savoir laquelle est laquelle entre les deux