exame 1 Flashcards
Diferença entre polimorfismo e mutação
O polimorfismo está presente em mais de 1% da população, a mutação está presente em menos de 1%.
STR’s
- short tandem repeats
- sequências pequenas (2-5bp) repetidas um certo número de vezes
- alelos têm diferente número de repetições
- cria uma impressão digital genética de um indivíduo
Previsão dos efeitos de uma mutação
- sequência codificante ou não codificante
- deleção ou inserção de 1 ou 2 nucleótidos - mudança do quadro de leitura, provável STOP prematuro (proteína inexistente ou truncada)
- deleção ou inserção de múltiplos de 3 - proteína com mais ou menos aminoácidos, pode alterar ou não a função
- substituição (nonsense, miscense ou silent)
- locais de splicing
Splicing Críptico
- surge por mutação
- sequência normalmente não utilizada
- surgem antes ou depois do splicing normal, incluíndo intrões ou excluindo exões.
- alteração do mRNA e da proteína.
Transposões
- elementos genéticos móveis
- segmentos de DNA com a capacidade de se movimentarem no genoma da célula, por mecanismo de “cut and paste” ou por retrotransposição.
Proteínas ribossomais
- síntese no citosol
- maturação no núcleo nos nucléolos (associação a RNAribossomal)
- citoplasma onde formam ribossomas
Radioterapia em cancro
- radiação ionizante lesa o DNA
- ativa proteínas p53 que atua como fator de transcrição da p21
- inibe complexos S-CDK e pára o ciclo celular (antes da fase S)
- em lesões irreparáveis a p53 desencadeia apoptose (libertação do citocromo c e ativação das caspases)
(resistência à radioterapia pode ser detectada pela sequenciação do p53 e outros genes da resposta apoptótica)
Caudas das histonas
- aminoácidos com carga positiva, atraem o DNA (negativo) e permitem compactação da cromatina (menos acesso a DNA)
- HAT’s acetilam a lisina - cauda fica com carga neutra, perde atração ao DNA, descompactação (mais acesso a DNA)
- Podem ser modificadas por fosfato ou metilo - recrutam seletivamente fatores de transcrição
Inativação do cromossoma X
- durante embriogénese (10ºdia)
- aleatório
- mediado pelo gene XIST que origina um RNA não codificante que leva à metilação de cromossoma X. Este cromossoma é depois compactado com histonas até originar o corpo/corpúsculo de Barr
Genoma
- totalidade de material genético celular em DNA
- 6,4x10^9 bp
Exoma
- totalidade dos exões do DNA
- 1% do genoma (6,4x10^7)
Erros: transcriptase reversa vs. DNA polimerase
- transcriptase reversa comete mais erros
- maior taxa de mutações do vírus (vantagem evolutiva pode criar resistência a fármacos)
- não percebe a incorporação do AZT no lugar da timina (pode ser usado não afeta DNA).
Importação nuclear
- proteínas marcadas por sinal nuclear (lisinas e argininas)
- proteínas mantêm a conformação
- recetor de importação no citosol
Importação mitocondrial
- proteínas marcadas por sinal mitocondrial
- recetor transmembranar na mitocôndria
- passagem para o lúmen
- linearização da proteína (chaperoninas)
Peroxissomas
- degradação de substâncias tóxicas
- beta-oxidação
- síntese de fosfolípidos
Internalização de LDL
- ligação da LDL ao recetor membrana
- formação de vesícula revestido de clatrina
- formação de endossoma
- perda da clatrina e reciclagem do endossoma
- fusão do endossoma com lisossoma
- digestão
Origem célula cancerosa
- mais de uma mutação (os processos celulares são controlados por muitos fatores, são redundantes)
iPSC
- células estaminais pluripotentes induzidas
- derivam se células somáticas adultas
- tornam-se pluripotentes por indução da expressão de 4 fatores de transcrição, fatores de Yamanaka.
Enzimas específicas da recompilação BCR e TCR
- RAG e TdT
Estadios dos linfócitos B
- pró-B (medula)
- pré-B (medula)
- B imaturo (medula)
- B maturo (tecidos periféricos)
Enzima da agamaglobulinémia
BTK (tirosina cinase)
Hipermutação Somática
Diversificação das sequências variáveis do BCR na periferia. Mudança na afinidade, mantendo-se a especificidade.
Estadios de células T no timo
1º - duplamente negativo
2º - duplamente positivo
3º - singularmente positivo
Marcadores dos linfócitos
CD4 (auxiliares)
CD8 (citotóxicos)
CD3 (todos)
Tratamento para NUDE
Transplante de Timo
Tratamento SCID associado ao X
Transplante da Medula Óssea
PDGF
- Plaquet Derived Growing Factor
- Libertado quando são formados coágulos
- Estimula células do tecido lesado a crescer e multiplicarem-se, migrarem
- permite neovascularização
- Ativa proteínas Ras e MAP cinases, que permitem expressão de genes de proliferação
- quando descontrolado pode estimular cancro
Vesículas
- formadas por fosfolípidos que têm tendência a formar micelas (efeito entrópico, diminui a energia)
- clatrinas presentes na membrana. Atraem-se entre si, agregando e juntando-se à adaptina obrigando a um forma redonda
Tráfego em microtúbulos
- microtúbulos têm polaridade (da tubulina)
- transporte por proteínas motoras para os polos (DINEÍNAS e CINESINAS)
Dineínas
proteínas motoras que se deslocam para o polo negativo, ao longo dos microtúbulos
Cinesinas
proteínas motoras que se deslocam para o polo positivo, ao longo dos microtúbulos
Transporte Núcleo-Citoplasma
- núcleo para citoplasma: mRNA (cap+poli-A) e RNA’s não codificantes
- citoplasma núcleo: proteínas
miRNA
- pequenos RNA’s não codificantes.
- inibem a expressão genica
- reconhecidos pelas proteínas que formam o complexo RISC (RNA-induced silence complex)
- ligam-se à UTR 3’ de um mRNA, dimuindo a tradução e levando à degradação
- regulação independente presente em todas as células
Terapia Genética
- correção de um erro genético/mutação responsável por um fenótipo patológico
- substituição do alelo mutado por um não mudado através de um vetor genético
- o vetor pode integrar o alelo (retrovírus) ou garantir a sua expressão (adenovírus)
Telomerase
- tipo de transcriptase reversa (que é um tipo de DNA polimerase).
- tem na sua constituição uma sequência de RNA que é molde de sequências de DNA repetitivas não codificantes
- ficam na extremidade 3’ dos cromossomas
- manutenção do comprimento dos telómeros, ao longo dos ciclos
- necessários para a primase poder adicionar um primer, e existir replicação da parte codificante inicial da cadeia lagging
- permite não perder informação
Telomerase e Cancro
- quase sempre reativada.
- células nunca ficam com telómeros curtos, nunca param de replicar - imortais
Células T - fase duplamente negativa
- síntese de uma cadeia do TCR, formação de um complexo pré-TCR
Células T - fase duplamente positiva
- síntese da outra cadeia do TCR, já existe o complexo propriamente dito
IL-7
- interleucina-7
- fornece sinais de sobrevivência e diferenciação ou proliferação a precursores das células T
Mutações DNA mitocondrial vs. DNA nuclear
- DNA mitocondrial 100x mais mutações
- polimerase gama (mtDNA) com maior taxa de erro
- ambiente rico em espécies reativas do oxigénio (cadeia respiratória)
- mecanismos de reparação menos eficientes
(não se encontra associados a histonas e então está mais sujeito a danos, as mitocôndrias replicam-se mais frequentemente e independentemente do núcleo)
Fragmentação do invólucro nuclear
- permite a distribuição dos cromatídeos irmãos
- deve-se à fosforilação das lâminas nucleares
- na telofase, a ciclina é marcada pela ubiquitina, desativando o complexo M-CDK.
- dá-se a desfosforilação e a reconstrução do invólucro
Fatores de incidência de erros de uma célula cancerosa
- maior taxa replicativa
- apoptose comprometida
- maior sobrevivência
- disfunção nos mecanismos de reparação do DNA
BRACA 1 e BRACA 2
- genes que codificam as proteínas BRACA 1 e 2 responsáveis pela reparação homóloga da dupla cadeia
- BRACA 1 é checkpoint na fase S e G2
- oncorrepressores
Chaperoninas
- proteínas responsáveis por conferir às chaperoninas a sua estrutura tridimensional, após a sua síntese ou após a sua linearização para a entrada em estruturas
Imprinting
- leva à expressão monoalélica (determina fenótipos)
- processo não aleatório na gametogénese
- silencia alelos por metilação dos mesmos
Proto-oncogene
- gene responsável pela proliferação celular
- estimula a proliferação ou inibe a apontoes
- podem ser alterados para oncogenes, contribuindo para a formação de tumores e cancros
Origem de um oncogene
- duplicação (hiper- expressão de proteína)
- alteração de nucleótidos (síntese de proteína hiperativa)
- translocação (hiper-expressão)
Intrões
- sequências não codificantes
- sofrem pouca conservação e muitas alterações (menos relacionados com o fenótipo, sofrem uma pressão menor da seleção natural)
- o seu número e tamanho é maior quanto maior a complexidade do ser vivo
Reprodução Sexuada
- crossing over
- segregação aleatória de apelos
- fecundação
- seleção natural atua sobre o fenótipo, eliminado apelos deletérios