exam intra Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’un autotrophe ?

A

Il utilise le CO2 comme source de C

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2
Q

Qu’est-ce qu’un hétérotrophe ?

A

Il utilise une molécule organique comme source de C (ex : glucose)

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Q

Qu’est-ce qu’un chimiotrophe ?

A

Il utilise des molécules organiques ou des substrats oxydables inorganiques, comme source d’énergie

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4
Q

Qu’est-ce qu’un phototrophe ?

A

Il utilise la lumière comme source d’énergie

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Q

Est-ce que l’implication de l’O2 dans un métabolisme est obligatoire ou non ?

A

Non, c’est facultatif

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6
Q

Quel est le métabolisme grosso modo des photo-autotrophes et des hétérotrophes?

A

Ils utilisent la lumière comme source pour synthétiser des hydrates de C à partir du CO2 et d’H2O, et libèrent de l’O2. Les hétérotrophes utilisent ces molécules organiques, en présence d’O2 ,et forment du CO2 et H2O qui sont libérés dans l’atmosphère pour que le photo-autotrophe recommence son cycle.

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7
Q

Qu’est-ce que le catabolisme ? Quelle est la source d’énergie et l’énergie retirée ?

A

Il s’agit de transformer les molécules complexes en petites molécules plus simple pour faire de l’ATP par exemple. (glycolyse anaérobique). L’énergie utilisée est les lipides, protéines et glucides, et l’énergie retirée (déchets) est l’H2O, le NH3 et le CO2. ADP—->ATP

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8
Q

Qu’est-ce que l’anabolisme ? Quelles sont les molécules précurseurs ? Quels sont les macromolécules ?

A

Il s’agit de prendre des molécules simples précurseurs (acides aminés, acides gras, glucides, bases azoté) pour en faire de plus complexes (protéines, lipides, polysaccharides, acides nucléiques). ATP—>ADP

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9
Q

Quels sont les principales sources d’É chimiques dans le catabolisme et anabolisme ?

A

Catabolisme : ADP —->ATP / NAD+ —–> NADH,H+ / FAD —-> FADH2

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10
Q

Qu’est-ce que le récepteur des protéines G ? Avec quelle enzyme vient-elle se fixer ?

A

Il s’agit d’un récepteur membranaire qui est couplé à la protéine G (dotée de 3 sous-unités). Lorsqu’un ligand vient se fixer au récepteur (ex : insuline), la protéine G s’active. Elle va ensuite de fixer à un effecteur, l’adénylyle cyclase. Celle-ci vient coupé l’ATP en AMPc et Pi. L’AMPc est un second messager.

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11
Q

Sur quel acide aminé est fréquemment fait la phosphorylation ?

A

Sur la thyrosine, la serine et la theronine.

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12
Q

Quelle est la principale cible de l’AMPc?

A

La protéine kinase A, qui ajoute des phosphates.

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13
Q

Parler du maintient de la glycémie grosso modo

A

Une baisse de glycémie est détecté par les cellules alpha du pancréas qui libère le glucagon qui vient augmenter la libération de glucose et diminuer le stockage dans le foie, les muscles et les tissus adipeux. Une hausse de glycémie est détectée par les cellules B du pancréas qui libère l’insuline et augmente le stockage de glucose et diminue la libération.

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14
Q

Quel est le mécanisme d’action du glucagon ?

A

Le glucagon est capté par un récepteur, il y a activation de l’adénylate cyclase et le second messager est actif (AMPc). L’AMPc vient activé la protéine kinase A. La protéine kinase ajoute un phosphate sur la glycogène phosphorylase kinase qui active à son tour la glycogène phosporylase (activation de la dégradation de glycogène) et sur la glycogène synthase (inactivation de la synthèse de glycogène)

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15
Q

Quel est le mécanisme d’action de l’insuline ?

A

Il active la protéine phosphatase 1 qui son rôle est de retirer les phosphates de la glycogène phosphorylase et de la glycogène phosphorylase kinase (inactivation de la dégradation de glycogène) et retire le phosphate de la glycogène synthase (activation de la synthèse de glycogène)

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16
Q

De quoi est formé une enzyme ?

A

Il s’agit d’une chaîne d’acide aminé repliée sur elle-même qui forme une structure 3D

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17
Q

Quel est l’importance des voies métaboliques secondaires ?

A

Si jamais un enzyme de la voie principale est saturée, on s’assure de continuer à métabolisé le substrat en produit

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18
Q

Quelle est la seule manière de contrôler les réactions réversibles ?

A

Jouer sur la quantité de substrat et de produits.

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19
Q

Comment est-il possible de réguler une réaction irréversible ?

A

Activer l’enzyme ou l’inactiver par notamment la phosphorylation/déphosphorylation.

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20
Q

Comment est définie l’activité enzymatique ?

A

Elle est définie en terme de vitesse de réaction. On utilise l’I.U. (qte d’enzyme requise pour convertir 1 umol de substrat en produit en 1 min à ph de 7 et température de 25)

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21
Q

Quels sont les 2 modèles pour expliquer la spécificité des enzymes ?

A

Le modèle clé-serrure et la forme induite (qui est celui retenu aujourd’hui)

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22
Q

Quels sont les facteurs affectant l’activité enzymatique? expliquez

A

1) température : l’augmentation peut accélérer la vitesse de réaction chimique ou de dénaturation de l’enzyme (diminuant son activité catalytique)
2) Ph : un changement de PH peut agir sur plusieurs facteurs (liaison de substrat, activité catalytique, structure tertiaire et ionisation des résidus de l’enzyme
3) quantité de subtrat : en faible concentration, la vitesse de Rx sera proportionnelle, mais en grande quantité, la vitesse tend vers une valeur maximal (saturation)
4) concentration d’enzyme : vitesse directement proportionnel à la quantité d’enzyme, c’est linéaire, il n’y a pas de saturation

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23
Q

Qu’est-ce qu’un cofacteur / coenzyme ?

A

Il s’agit d’une molécule (ex : ion métallique ou petite molécule organique appelé coenzyme) qui viennent s’associer à l’apoenzyme pour qu’elle fonctionne

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24
Q

Qu’est-ce que la Vmax et le Km ?

A

La Vmax est lorsque toutes les enzymes sont complexées au substrat. (enzyme est saturé). Le Km = Vmax/2. Plus le Km est petit, plus l’affinité de l’enzyme pour le substrat est élevée, car l’affinité est inversement proportionnelle au Km

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25
Q

Comment s’appellent les chiens de la prof ?

A

Michaelis et menten pour l’équation.

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26
Q

Quelss sont les différents contrôle enzymatique ?

A

(1) modifications covalentes (phosphorylation qui permet l’activation ou l’inhibition de l’activité enzymatique et met en jeu des protéines kinases et phosphatases qui catalysent des réactions irréversibles)
(2) protéolyse : particulièrement pour les enzymes digestives et les enzymes de la cascade de la coagulation du sang. Le zymogène est le précurseur inactif et protéase active. (ex :chymotrypsinogène qui doit être fragmentée pour être active sous forme de chymotrypsine)
(3) inhibiteurs

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27
Q

Quels sont les différents types d’inhibiteurs et quel est leur impact sur Vmax et km ?

A

(1) irréversibles : diminue la quantité d’enzyme (ex : aspirine)
(2) non-compétitif : Vient se lier ailleurs qu’au site catalytique et modifie la forme. Ils sont allostériques. Le Km est pareille et la Vmax est diminuée.
(3) compétitif : analogue du substrat, donc le Km apparent est diminué, la Vmax est pareille
(4) incompétitif : Vient se fixer au complexe E-S et empêche la production de produit. Le km est augmenté et la Vmax diminue.

28
Q

Qu’est-ce qu’une enzyme allostérique ?

A

Elle a, en plus d’un site catalytique, un site allostérique sur lequel des régulateur (inhibiteur ou activateur (viennent se fixer pour déformer l’enzyme. Ex : atcase qui son état moins actif est favorisé par la fixation du CTP et son état plus actif est favorisé par la fixation du substrat

29
Q

Qu’est-ce qu’on attend par ATP une molécule de “haute énergie”?

A

C’est une molécule qui a un haut potentiel de transfert du groupement P. En effet, le Pi peut être spontanément séparé de l’ATP pour son transfert à un autre composé. Son delta G est de -30,5 kj/mol

30
Q

Nommer d’autres composés que l’ATP qui son riches en énergie.

A

Le PEP avec un delta G de -61,9 kj/mol

31
Q

Le glucose est un … et le fructose est un …

A

(1) aldéhyde (2) cétone

32
Q

Nommer des glucides importants dans le métabolisme (5)

A

Glucose-6-phosphate, glucose-1-phospohate, ribose-5-phosphate, glycéraldéhyde-3-phosphate, dihydroxyacétone phospohate.

33
Q

Quels sont les dérivés alcool, amine et acide des glucides ?

A

alcool - glycérol
amine - Glucosamine ( 1 glucose + 1 gr. amine)
Acide - Gluconate

34
Q

Nommer 2 formes d’amidons avec leur liaison

A

Amylose (polymère de glucose a-1,4) et amylopectine (polymère de glucose a-1,4 branché a-1,6). Plus, il y de ramification, moins il sera hydrosoluble.

35
Q

Qu’est-ce que la cellulose, peut-on la dégrader ?

A

Il s’agit d’un polymère de glucose végétal avec des liaisons B-1,4. On ne possède pas d’enzyme pour dégrader ceci.

36
Q

Qu’est-ce que le maltose et le lactose ?

A

Le maltose est un lien a-1,4 entre 2 glucoses. Le lactose est un lien B-1,4 entre un galactose et glucose

37
Q

Nommer 3 enzymes hydrolytiques

A

A-amylase, B-amylase, amylo-A-(1-6)-glucosidase

38
Q

Qu’est-ce qui inhibe et accélère la PFK-1 ?

A

L’ATP (diminue son affinité pour F6P), le citrate et le PH inhibe la PFK-1. L’ADP et F-2,6-BP accélère PFK-1.

39
Q

Qu’est-ce que permet la F-1,6-BP aldolase ?

A

Le clivage aldolique du F-1,6-BP qui produit 2 trioses phosphates : DHAP et GA3P

40
Q

Qu’est-ce qui tire la réaction 5 dans la glycolyse ?

A

C’est l’utilisation du G3P, car l’énergie provenant de son oxydation est utilisée pour réduire NAD + en NADH, H+.

41
Q

Vers quelle voie est orienté le G6P autre que la glycolyse en phase nourrie et au jeûne ?

A

En phase nourrie, le G6P est orienté vers la voie des pentose phosphate (ribulose-5-phosphate), il est transformer en G1P par la phosphoglucomutase pour aller vers la voie du glycogène ou du glucuronate, il se transforme en F6P puis en glucosamine-6-phosphate pour aller vers le carbohydrate synthèse. Au jeûne, il fait la néoglucogenèse.

42
Q

Quelles sont les étapes de la phase 1 de la glycolyse ?

A
  1. glucose + ATP —> G6P + ADP (par HK ou GK)
  2. G6P F6P (par G6P isomérase). Important piur l’activation du C3 (réaction 4) et phosphorylation en C-1 (étape 3)
  3. F6P + ATP —–> F-1,6-BP + ADP(par PFK-1)
  4. F-1,6-BP + 5. DHAP GA3P (clivage aldolique par aldolase pour former 2 trioses phosphates et isomérisation du DHAP en GA3P par isomérase
43
Q

Quelle est la réaction critique de la glycolyse ?

A

La réaction 3, car elle engage la glycolyse

44
Q

Quelles sont les étapes de la phase 2 de la glycolyse

A
  1. GA3P oxydé en 1,3 -BPG (haut potentiel énergétique) et l’énergie provenant de cette réaction est utilisé pour réduire le NAD+ en NADH,H+.
  2. 1,3-BPG 3 PG (par PG kinase). transfert de groupement phosphate à l’ADP, réaction très favorable
  3. 3 PG 2 PG (par PG mutase). Prépare à la synthèse d’une seconde ATP
  4. 2 PG PEP (dérivé à haut potentiel énergétique)
  5. PEP —-> pyruvate créant une ATP
45
Q

Qu’est-ce que le rôle de la LDH ?

A

Permet la fermentation pour la régénération du NAD+. La LDH convertit le pyruvate en lactate, et oxyde NADH, H+ en NAD+, et le lactate est reconverti en glucose dans le foie par le cycle de Cori

46
Q

Quelles sont les 3 enzymes clés de la glycolyse ?

A

La HK/GK, la PFK-1, la PK

47
Q

Comment est régulé la glycose ? Dépend principalement de 2 choses …

A

Dépend de la disponibilité en glucose et de la vitesse des réactions limitantes (1,3 et 10)

48
Q

Il y a-t-il des récepteur à glucagon dans les muscles ?

A

Non

49
Q

En phase nourrie, que se passe-t-il dans le muscle ?

A

L’insuline est sécrété par le pancréas, et celle-ci active la phosphatase. L’enzyme bidirectionnelle, déphosphorylé favorise la réaction F-2,6-BP —-> F6P, donc la glycolyse est ralenti, permettant l’entreposage du glycogène.

50
Q

En activité, que se passe-t-il dans le muscle ?

A

L’adrénaline est secrétée, activant la protéine kinase A, qui phosphoryle l’enzyme bidirectionnelle, qui favorise la production du F-2,6-BP qui accélère la PFK-1 et la glycolyse

51
Q

En phase nourrie, que se passe-t-il dans le foie.

A

L’insuline est sécrété par le pancréas, et celle-ci active la phosphatase qui déphosphoryle l’enzyme bidirectionnelle, qui favorise la production du F-2,6-BP qui accélère la PFK-1 et la glycolyse.

52
Q

En jeûne, que se passe-t-il dans le foie ?

A

Le glucagon est sécrété et il active la protéine kinase A et l’enzyme bidirectionnelle favorise la réactionF-2,6-BP —-> F6P, donc la glycolyse est ralenti.

53
Q

Quels sont les autres sucres de la glycolyse ?

A
  1. Le fructose phosphorylé en F6P.
  2. La fructokinase forme du F1P, et la F1P aldolase permet la formation des 2 trioses phosphates comme dans la glycolyse régulière.
54
Q

Quel est le contrôle allostérique de la pyruvate kinase ?

A

phosporylée : inactive

Activée par F-1,6-BP

55
Q

Quels sont les substrats de la néoglucogenèse ?

A

pyruvate, lactate, glycérol, acide aminé,

56
Q

Quels sont les 3 enzymes clés de la néoglucogenèse ?

A

La G6Pase, la F-1,6-BPase, la PC (pyruvate carboxylase) et PEPCK (PEP carboxykinase)

57
Q

Quelles sont les réactions de contournement de la pyruvate kinase ? pourquoi, faut-il contourner ?

A
  1. Dans la mitochondrie, pyruvate ——> OAA (par PC, nécessitant CO2 et ATP et rejetant ADP + Pi)
  2. OAA converti en malate par la malate déshydrogénase, car ne peut pas ressortir sous forme OAA. (NADH,H+ —-> NAD+)
  3. Sortie du malate de la mitochondrie et réaction inverse de la 2.
  4. OAA —-> PEP par la PEPCK, nécessitant du GTP et rejetant CO2 et GDP
58
Q

Quel est l’activateur de la PC ?

A

Acétyl-COA

59
Q

Quel est le contrôle allostérique exercé sur F-1,6-BPase ?

A

inhibiteur : F-2,6-BP et AMP

Activateur : citrate et ATP

60
Q

Quel est le contrôle hormonal de la néoglucogenèse ?

A

La glucagon induit AMPc qui active la protéine kinase A. Celle-ci phosphoryle la PK ralentissant la glycolyse et l’enzyme bifonctionnelle qui ralenti la glycolyse également.

61
Q

Quels enzymes sont impliqués dans la dégradation de glycogène ?

A

L’enzyme principale est la glycogène phosphorylase. Elle dégrade le glycogène des extrémités non-réductrices en G1P jusqu’à la dextrine limite (4 glucoses). Ensuite, l’enzyme débranchante (4-alpha-glucanotransférase), prends 3 glucoses et les met au bout. Puis, le glucose restant est coupé par amylo-alpha-1,6-glucosidase. (le seul qui n’a pas besoin de modifications). Puis, la phosphoglucomutase transforme G1P en G6P.

62
Q

Quels sont les enzymes impliqués dans la synthèse de glycogène ?

A

La phosphoglucomutase transforme le G6P en G1P. Ensuite, l’UDP-glucose pyrophosphorylase transforme le G6P en UDP-glucose et nécessite de l’UTP. La glycogène synthase transforme l’UDP-glucose en glycogène. L’enzyme branchant fait ensuite des ramifications par des liaisons alpha-1,6.

63
Q

Quel est l’effet de l’AMPC (glucagon) sur le métabolisme du glycogène.

A

L’AMPc acitve la protéine kinase A. Celle-ci phosphoryle la glycogène synthase, la rendant inactive. Puis, elle phosphoryle la phosphorylase kinase qui a son tour phosphoryle la glycogène phosphorylase qui active la dégradation de glycogène

64
Q

Quel est l’effet de l’insuline sur le métabolisme du glycogène ?

A

L’insuline active la protéine phosphatase-1 qui déphosphoryle la glycogène synthase qui active la synthèse de glycogène. Elle déphosphoryle aussi phosphorylase kinase et la glycogène phosphorylase.

65
Q

Quels sont les différents transporteurs de glucose ? Donner les km de chacun

A

Les GLUTS4 dans les muscles. Le GLUTS1 globules rouges et les GLUTS2 pour le foie. Les globules rouges ont la meilleur affinité pour le glucose avec un km de 1 mM, contrairement au foie de 15-20 mM et aux muscles 5 mM.

66
Q

Est-ce que la glucokinase et l’hexokinase se retrouvent dans toutes les cellules ?

A

Non, seule la HK est partout, car la GK se retrouve dans le foie seulement.