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Biomol > Exam Final > Flashcards

Exam Final Flashcards

1
Q

Quelle est l’utilité du PCR simple?

A

Mettre en évidence une portion du gène cible

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Q

Quelles informations peux-t-on retirer d’un PCR simple?

A

Présence ou non du gène

Estimation du poids moléculaire

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3
Q

Quelle est l’utilité du PCR-RFLP?

A

Détecter la présence d’une mutation

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Q

Quel réactif est essentiel au PCR-RFLP?

A

Enzymes de restriction spécifiques à la mutation recherchée

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Q

Quel facteur est très limitant pour la technique du PCR-RFLP?

A

La mutation doit absolument créer ou enlever un site de restriction sur le gène

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6
Q

Quelles sont les caractéristiques des séquences reconnues par les enzymes de restriction?

A

Ce sont des séquences palindromiques de 4 à 8 nt

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7
Q

Quelles sont les 2 types de coupures possibles pour une enzyme de restriction?

A 
Bouts francs (blunt ends) : au même niveau sur les deux brins
Bouts cohésifs (sticky ends) : coupures décalées
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8
Q

Quel est l’avantage principal du PCR en temps réel?

A

C’est une analyse quantitative, on peux évaluer la quantité de copies du gène

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9
Q

Quelle sont les particularités des amorces du qPCR?

A

Il y en a au moins trois dont une possède des fluorochromes qui seront mesurés par l’appareil

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10
Q

Pourquoi la fluorescence n’est pas détectable dès le début du qPCR?

A

Car chaque fluorochrome est lié à un Quencher qui l’inhibe jusqu’a ce qu’il y ait amplification

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11
Q

Que peux-t-on mettre en évidence en utilisant plusieurs sondes de couleurs différentes lors du qPCR?

A

Identification de SNP (single nucleotid polymorphism)

Mutations ponctuelles où un seul nucléotide est changé

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12
Q

Quel est le principal avantage du multiplex?

A

Permet l’amplification de plusieurs séquences différentes à la fois

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13
Q

Quelles sont les conditions à respecter pour faire un PCR multiplex?

A

Les fragments amplifiés doivent être de poids moléculaires différents
Les amorces doivent toutes êtres différentes et non-complémentaires

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14
Q

Que mesure le RT-PCR?

A

L’expression des gènes

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15
Q

À partir de quoi fait-on un RT-PCR?

A

ARNm

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16
Q

Quelle enzyme est essentielle au RT-PCR et d’où vient-elle?

A

Reverse transcriptase qui vient des rétrovirus

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17
Q

Nommez les différents types de PCR

A 
Simple
RFLP ( restriction fragment lenght polymorphism)
En temps réel
Multiplex
RT-PCR
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18
Q

Définition antigène?

A

Substance étrangère qui entraîne une réaction immunitaire lorsqu’elle est introduite dans l’organisme

19
Q

Comment nomme-t-on la partie de l’antigène reconnue par l’anticorps?

A

Épitope

20
Q

V ou F, chaque antigène possède une seule sorte d’épitope

A

Faux, un antigène peut avoir plusieurs épitopes différents

21
Q

Définition anticorps?

A

Protéine complexe utilisée par le système immunitaire pour détecter et neutraliser les agents pathogènes de manière spécifique

22
Q

Quelle cellule sécrète les anticorps?

A

Plasmocytes

23
Q

Comment nomme-t-on la région variable de l’anticorps qui sert à reconnaître les épitopes?

A

Paratopes

24
Q

Nommez les 2 situations où il peut y avoir une réaction immunitaire croisée

A
  • Si 2 antigènes différents ont des épitopes en commun

- Si 2 épitopes ont une structure chimique semblable

25
Q

Nommez les types d’antigènes et leur définition

A
  • Xenoantigène : Ag étranger à l’espèce
  • Alloantigène : molécule variable selon les individus d’une même espèce
  • Autoantigène : Ag du soi, non reconnu par le système immunitaire
26
Q

Quelles sont les 4 techniques de transfert et que transfèrent elles?

A

Northern blot : ARN
Southern blot : ADN
Western blot : protéines
Eastern blot : lipides

27
Q

Nommez les grandes étapes d’un western blot

A 
Préparation de l'échantillon 
SDS-PAGE
Buvardage
Blocage (pre hybridation)
Hybridation
Lavage
Révélation des signaux
28
Q

Dans un western blot, que doit reconnaître l’anticorps primaire?

A

La protéine dénaturée et non la protéine native

29
Q

Quelle est la sonde utilisée dans un southern blot?

A

Un fragment d’ADN auquel on a marqué une base

30
Q

Quel principe physique est utilisé lors de l’étape du transfert d’un southern blot?

A

Capillarité

31
Q

Quels sont les inconvénients du southern blot?

A

Long
Coûteux
Reproductibilité difficile
Besoin de bcp d’ADN

32
Q

Le northern blot a les memes étapes que le southern blot sauf une. Laquelle et pourquoi?

A

La dénaturation car l’ARN est déja simple brin

33
Q

À partir de quelles cellules peux-t-on faire un FISH?

A

Des cellules en métaphase

34
Q

Que permet de détecter le FISH?

A

Séquences particulières
Oncogènes
Translocation et fusion
Trisomie

35
Q

Qu’est ce que le séquençage?

A

Technique permettant de déterminer l’ordre dans lequel se présente les quatres bases de façon successive dans un brin d’ADN ou d’ARN donné

36
Q

La méthode de Sanger utilise quels réactifs?

A

ADN simple brin et ddNTP

37
Q

Qu’est ce qu’un didésoxyribonucléotide?

A

C’est un nucléotide dépourvu du groupement OH en 3’ donc aucun autre nucléotide peut se lier à cette extrémité

38
Q

Quelles sont les 3 types de mutations?

A

Génomique
Chromosomique
Génique ponctuelle

39
Q

Nommez les types de mutations chromosomiques

A

Duplication
Inversion
Deletion
Translocation

40
Q

Nommez les types de mutations géniques ponctuelles

A

Non sens
Chgmt cadre de lecture
Silencieuse
Faux sens

41
Q

Quelles sont les conditions pour qu’un allèle soit considéré polymorphique?

A

Plus d’un type d’allèle
Fréquence de chacun des allèles doit être d’au moins 1%
2% de la population doit être hétérozygote

42
Q

Par quelle(s) méthode(s) peut on détecter les SNP (single nucleotid polymorphism)?

A

Séquençage

qPCR avec 2 sondes

43
Q

Nommez les caractéristiques d’un STR (short tandem repeat)

A 
1 à 7 nucléotides
Se répète de 5 à 100 fois (moyenne 12 à 40)
Très nombreux et polymorphes
Répartis uniformément dans le génome
Multi-allélique pour un même locus

Biomol (1 decks)

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