Exam Flashcards
modelis - tai?
teorinė realaus pasaulio abstrakcija
2 modelio paskirtys
- sumažinti situacijos sudėtingumą, kad būtų galima pastebėti gilesnius reiškinius
- iškelti hipotezes, kurias galima patikrinti eksperimentais ir stebėjimais
modelių nauda (3)
- apibrėžia parametrus, į kuriuos reikia atsižvelgti;
- apibendrina rezultatus;
- nuspėja, kaip sistema veiks ateity
modelių skirstymas (3)
- verbaliniai
- imitaciniai
- analiziniai (HV)
prielaidų tikslas
modelį padaryti parankesnį matematiniam apdorojimui bei lengviau suprantamą
HV modelio principas
idealioje arba realioje pop., kuri yra pusiausvyroje, alelių ir genotipų dažniai iš kartos į kartą nesikeičia
prielaidos HV modeliui (8)
- org. yra diploidinis, dauginasi lytiškai, jam būdingos diskrečios kartos;
- alelių dažniai abiejose lytyse vienodi;
- veikia Mendelio segregacijos dėsnis (aleliai į gametas segreguoja atskirai, pusė gametų turi vieną alelį, kita pusė - kitą);
- atsitiktinis kryžminimasis (nagrinėjamo lokuso, bet nebūtinai kitų lokusų atžvilgiu);
- nevyksta mutacijos;
- nevyksta migracija;
- nevyksta genų dreifas (nes labai didelė pop.);
- nevyksta gamtinė atranka (nėra išgyvenamumo ar reprodukcinės sėkmės skirtumų)
HV modelio esmė
kai kryžminimas atsitiktinis, F1 kartos palikuonių GENOTIPŲ dažniai gali būti apskaičiuojami iš tėvų ALELIŲ dažnių
kokiu atveju heterozigotai yra dažnesni už bet kokį homozigotą?
esant tarpiniams alelių dažniams
kada būna didžiausias heterozigotų dažnis?
kai abiejų alelių dažnis lygus 0,5
kas yra alelio dažnio kvadratas?
genotipo dažnis
kodėl tikrinama HVP? (2)
- nuokrypio priežastis - svarbus evoliucinis/ekologinis procesas
- jei nėra patikimo nuokrypio, negali tvirtinti, kad nė viena prielaida nebuvo pažeista
kuo didesnė X2 kriterijaus reikšmė, tuo…
didesnė tikimybė, kad skirtumas nėra atsitiktinis ir pop. nėra HVP
kokiai P reikšmei esant rezultatai yra statistiškai patikimi?
mažiau nei 0,05
kam lygus laisvės laipsnis?
genotipų ir alelių sk. skirtumui
kokia turi būti P reikšmė, kad HVP hipotezė būtų atmetama?
mažiau nei 0,05
kokia X2 reikšmė turi būti bialeliniam lokusui, kad atmestume HVP?
daugiau nei 3,84
kokia X2 reikšmė turi būti trialeliniam lokusui, kad atmestume HVP?
daugiau nei 7,82
pagal ką galima apskaičiuoti alelių dažnius, jei yra HVP?
pagal recesyvių homozigotų dažnį
kurioje lytyje dažniau aptinkami recesyviųjų genų nulemti fenotipai?
heterogametinėje
kas būdinga mažoms imtims? (4)
- sistemingas nuokrypis nuo HVP;
- mažiau genotipų negu iš tiesų yra;
- padidėja heterozigotų, sumažėja homozigotų;
- vietoj X2 testo siūlomas exact testas
kam dar (be HVP mažoms populiacijoms) yra naudojamas exact testas? (2)
- vertinant heterozigotų deficitą;
2. vertinant heterozigotų perviršį
kokioms 3 prielaidoms esant genų dreifas tiesiogiai priklauso nuo individų sk. subpopuliacijoje?
- abiejų lyčių ind. sk. vienodas;
- kiekvieno individo lyt. ląst. galimybės formuoti palikuonis vienodos;
- subpopuliacijos dydis keičiantis kartoms lieka pastovus
kokiu atveju genų dreifo dydis nusakomas efektyviu populiacijos dydžiu (Ne)?
jei pažeistos genų dreifo sąlygos
kas yra efektyvus populiacijos dydis?
idealios populiacijos dydis, ji patiria tokio paties dydžio genų dreifą kaip ir atitinkama reali populiacija
kokiu atveju Ne (efektyvus pop. dydis) bus mažesnis už faktinį pop. dydį pagal individų sk. (N)?
kai pažeistos genų dreifo sąlygos
kokiu atveju lyčių santykis turi didelę įtaką Ne (efektyviam pop. dydžiui)?
kai labai žymus skirtumas tarp skirtingų lyčių individų dažnių populiacijoje
koks apytiksliai bus Ne, kai yra labai dideli lyčių santykio skirtumai?
apie 4x retesnės lyties individų sk.
kas nutinka, kai individų reprodukcinės sėkmės dispersija didesnė už atsitiktinai tikėtiną?
sumažėja Ne (nes individų įnašas į genofondą nevienodas)
Ne = Na sąlygos (3)
- kiekvienas individas palieka po vieną palikuonį;
- kiekviena šeima palieka po 2 palikuonis;
- kiekvienas individas prie kitos kartos atsiradimo prisideda 2 gametomis
Ne mažėjimo sąlygos (2)
- žymiai skiriantis patinų ir patelių reprodukcinei sėkmei
2. didėjant reprodukcinės sėkmės dispersijai
kas aprašoma pagal Puasono skirstinį?
šeimos palikuonių dydis
kas yra butelio kaklelio efektas?
žymus pop. dydžio sumažėjimas
kada naudojamas harmoninis pop. dydžio vidurkis?
kai pop. dydis svyruoja skaičiuojant Ne
per kokius reiškinius prarandama genetinė įvairovė butelio kaklelio efekto atveju? (3)
- heterozigotiškumą
- alelių sk. lokuse
- genotipų įvairovę
kur bus stipresnis butelio kaklelio efektas heterozigotiškumo praradimui?
rūšyse, kuriose būdingas mažesnis augimo tempas
kas gali nutikti dėl butelio kaklelio efekto?
gali būti prarasti retai pasitaikantys aleliai
kada mažėja alelio praradimo tikimybė?
esant lygiems alelių dažniams
kas yra įkūrėjo (pradininko) efektas?
kai nedidelis emigrantų sk. įkuria naują populiaciją
kas yra genų dreifo priežatis naujai susikūrusioje subpopuliacijoje?
mažas emigrantų sk.
pradininko efekto padariniai (2)
- alelių dažnio pasikeitimas
2. genetinės įvairovės sumažėjimas
ką reiškia retų alelių nebuvimas?
kad populiacija neseniai patyrė butelio kalklelio arba pradininko efektą
kam butelio kaklelio ir įkūrėjo efektai turi didesnį poveikį: heterozigotiškumui ar alelio sk. praradimui?
alelių sk. praradimui
nuo ko priklauso Ne, kai metapopuliacija yra nepertraukiama? (2)
- reprodukuojančių individų sk. ploto vnt.
2. reprodukuojančių individų gimimo vietų ir jų palikuonių gimimo vietų dispersijos
nucDNR ir mtDNR skirtumai (3)
- individai yra haploidiniai pagal mt
- mt paveldima per motinos liniją
- mt nevyksta rekombinacija
kuriems genams Ne yra mažesnis?
mtDNR (nebent Nf/Nm santykis yra 7 ir daugiau)
kuriems genams genų dreifas turi didesnę įtaką?
mtDNR
kai lyčių santykis 1:1, koks Ne yra mtDNR ir nucDNR?
mtDNR 4 kartus mažesnis
kuriuos DNR žymenis geriau naudoti tiriant genų dreifo sukeltą neseną subpopuliacijų atsiskyrimą?
plastidžių, ne branduolio
kuo didesnis kūno dydis, tuo… (2)
- mažesnė populiacija
2. ilgesni kartų periodai
ką leidžia įvertinti Ne/Na santykis?
genetinės įvairovės praradimą skirtingose rūšyse
Ne/Na santykis pop. ar rūšyse skiriasi priklausomai nuo… (2)
- demografijos
2. gyvenimo istorijos
nuo ko priklauso genų dreifo dydis?
nuo efektyvaus pop. dydžio (Ne)
kas naudojamas diferenciacijai tarp subpop. išmatuoti?
Fst inbrydingo koef.
ką parodo Fst?
dalinį metapop. heteroz. sumažėjimą dėl subpop. diferenciacijos lyginant su tuo atveju, kai metapop. nebūtų susiskaidžiusi į subpop.
kuo mažesnis efektyvus pop. dydis (Ne), tuo…
intensyvesnis genų dreifas
nuo ko priklauso subpop. diferenciacijos mastas?
nuo subpop. dydžio
kas vyksta pop. dėl genų dreifo? (2)
- tampa labiau inbrydinė
2. didėja homozigotiškumas (jei kryžminimas nėra atsitiktinis)
kokiose gamtinėse populiacijose (mažose ar didelėse) sparčiau mažėja heterozigotiškumas?
mažesnėse
kas yra tikrasis inbrydingas?
kryžminimasis tarp giminingų individų didesniu nei atsitiktinai dažniu
kuo panašus inbrydingas ir genų dreifas?
dėl abiejų padidėja homozigotiškumas
pagal ką skiriasi tikrasis imbrydingas ir inbrydingas dėl genų dreifo?
pagal poveikį genotipams
kaip tikrasis imbrydingas veikia homozigotų dažnį?
padidina abiejų homozigotų dažnius, subpop. nukrypsta nuo HVP
kaip imbrydingas dėl genų dreifo veikia homozigotų dažnį?
padidina tik vieno iš homozigotų dažnį, lieka HVP
dėl ko vyksta inbrydinė depresija?
dėl genų dreifo
kaip genų dreifas veikia žalingų alelių dažnius?
padidina
nuo ko priklauso aukštesniojo lygio požymis?
nuo daugelio žemesniojo lygio požymių
kokie požymiai yra veikiami didesnio sk. genų lokusų?
esantys aukštesniuose hierarchiniuose lygmenyse
kam daro įtaką žemesniojo lygio požymiai? (2)
- išgyvenimui;
2. reprodukcijai
kokie gyvenimo ciklo požymiai nusako individo tinkamumą? (2)
- išgyvenimas;
2. reprodukcija
tinkamumas - tai…
organizmo gebėjimas išgyventi, daugintis ir palikti palikuonių
pagal ką dažniausiai vertinamas ind. tinkamumas?
pagal palikuonių, paliktų per gyvenimą, sk.
kas yra diskretieji matomi polimorfizmai?
pirmieji pop. genetikos žymenys, kokybiniai požymiai
diskrečiųjų matomų polimorfizmų bruožai (3)
- turi tik kelias ryškiai besiskiriančias morfas
- sąlygoti 1 ar 2 lokusų
- nepatiria stipraus aplinkos poveikio
2 diskrečiųjų matomų polimorfizmų panudojimo būdai
- kaip žymenys
2. kaip adaptacijos
fenotipinių polimorfizmų trūkumai (6)
- labai nedidelė dalis yra kontroliuojama 1 ar kelių lokusų ir patiria nedidelį aplinkos poveikį;
- nedidelis gen. kintamumas;
- neapima viso genomo;
- vieno geno poveikį gali nustelbti kitas;
- genų poveikis gali būti nustelbtas aplinkos;
- dauguma yra kiekybiniai (ne kokybiniai)
pagal kokį skirstinį išsidėsto dauguma tolydžių požymių (kai fenotipai sugrupuoti į intervalus ir pateikti stulpeline diagrama)?
normalųjį
kokie yra dauguma matomų polimorfizmų? (2)
- tolydieji;
2. multifaktorialiniai
ką reiškia “tolydieji” polimorfizmai?
kiekybiniai
ką reiškia multifaktorialiniai?
jiems daro įtaką daug genų arba aplinkos faktorių
dažnai ar retai gamtoje yra sutinkami diskretieji matomi polimorfizmai?
retai
kada dažniau yra aptinkami diskretieji matomi polimorfizmai: studijuojant genus bei jų produktus ar fenotipus?
genus bei jų produktus
4 rūšių fenotipinis kintamumas?
- spalvų polimorfizmas;
- morfologinis p.;
- elgsenos p.;
- fenologinis p.
pilkos ir raudonos morfų atveju, kuris yra dominantinis?
raudonas
kaip paveldimas pelėdų kailio spalvos požymis?
pagal vieną bialelinį lokusą
koks alelis lemia lokių kailio spalvą?
recesyvinis autosominis
pleotropija - tai…
reiškinys, kai vienas genas veikia daugiau nei vieną skirtingą fenotipinę savybę
fluktuojančios asimetrijos priežastis
atsitiktiniai fiziologiniai skirtumai individų vystymosi metu
kas lemia paukščių migracinę elgseną?
multilokusinė sistema
fenologija - tai…
biologinių įvykių laiko parinkimas, kuris susijęs su klimatinėmis ar aplinkos variacijomis
pagr. fenologinės savybės gyvūnams (5)
- migracijos;
- kiaušinių dėjimo;
- veisimosi;
- šėrimosi;
- žiemos miego laikas
ką gali sukurti reprodukcinio laiko skirtumai rūšies viduje? (2)
reprodukcinius barjerus;
2 rūšių susidarymą iš rūšies reprodukciškai pagal laiką izoliuotų pop. (simpatrinis rūšių susidarymo būdas)
chromosomų įvairovės tyrimų metu naudojamų žymenų rūšys (4)
- morfologiniai;
- baltymų polimorfizmas;
- imunogenetiniai;
- DNR
kur dažniausiai pasitaiko poliploidija? (4)
- bestuburiuose;
- žuvyse;
- varliagyviuose;
- driežuose
ar artimai giminingos rūšys dauguma turi vienodą chrom. rinkinį, ar skirtingą?
skirtingą
koks yra paukščių patelių lytinių chrom. rinkinys?
heterogametinis
koks yra paukščių patinų lytinių chrom. rinkinys?
homogametinis
ką dažnai sukelia chrom. rinkinio skirtumai?
sumažėjusį palikuonių vaisingumą
pagal ką elektroforezės metu diferencijuojamos makromolekulės? (4)
- krūvį;
- dydį;
- formą;
- molekulinį svorį
nuo ko elektroforezėje priklauso judėjimo greitis? (9)
judančios molekulės:
- krūvio;
- formos;
- dydžio;
- molek. masės;
- matricos (terpės);
- matricos konc.;
- buferio konc.;
- temp.;
- įtampos
nuo ko priklauso elektroforezinis judrumas?
polimero tankumo
polimerų pvz (4)
- krakmolas;
- agarozė;
- acetatceliuliozė;
- poliakrilamidas
kas naudojama juostų išryškinimui? (3)
- chem. dažai;
- radioaktyvios medž.;
- fluorescuojančios medž.
kokie tirpūs fermentai naudojami elektroforezėje? (2)
- izofermentai;
2. aloenzimai
kokie dažniausiai yra izofermentai: kodominuojantys ar dominuojantys žymenys?
kodominuojantys
baltymų elektroforezės pranašumai (4)
- kodominavimas;
- tiria daug lokusų;
- greita, pigu, paprasta;
- rezultatų atkartojamumas
baltymų elektroforezės trūkumai (7)
- ištiriama nedidelė DNR dalis;
- neatskleidžia intronų kintamumo;
- tik spec. genų rinkiniui, kuris koduoja vand. tirpius baltymus;
- daugeliui baltymų negalima naudoti spec. dažų;
- kai kurios aminor. variacijos neatsiskindi rezultatuose;
- pakitimai 3iojoje kodono pozicijoje dažnai nesukelia pakitimų baltymo aminor. sekoje;
- reikia daug medžiagos
kam nustatytas mažiausias, vidutinis ir didžiausias izofermentų genetinio kintamumo mastas? (3)
mažiausias - stuburiniams;
vid. - augalams;
didž. - bestuburiams
kur randami I gr. fermentai?
audiniuose ir kūno skysčiuose
II gr. fermentų bruožai (2)
- įtraukti į centrinius metabolinius procesus;
2. mažas specifiškumas substratui
Darvino teiginiai (3)
- rūšims būdinga daugiau palikuonių nei gali išgyventi;
- individai skiriasi pagal fenotipus ir tai turi įtakos išgyvenamumui ir dauginimuisi;
geriau prisitaikę ind. sulauks daugiau palikuonių
gamtinė atranka - tai…
laipsniškas procesas, kurio metu sąveikaujant su aplinka keičiasi genotipų dažnis pop.
kam svarbūs vietinių adaptyvių pop. genetiniai skirtumai?
rūšies išlikimui
kaip adaptacijos veikia vietinių pop. adaptyvumą?
sumažina
gamtinės atrankos priežastis
individų tinkamumo skirtumai, kuriuos lemia nevienodi individų genotipai ir fenotipai
ką nusako gyvybingumas?
zigotos išgyvenimą iki reproduktyvaus amžiaus
griežta atranka - tai…
išgyvenimo skirtumai esant skirtingiems genotipams
švelni atranka - tai…
vaisingumo skirtumai esant skirtingiems genotipams