Eucaryote Flashcards

Biologie

1
Q

Il y a combien d’années environ que les cellules eucaryotes se sont constituées en organismes Pluricellulaires ?

A

Environ 800 millions d’années.

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2
Q

Qu’est-ce que des organites ?

A

Les organites cytoplasmiques sont des compartiments délimités par une membrane similaire à la membrane plasmique qui entoure la cellule entière,
et qui accomplissent différentes fonctions dans la cellule.

Les organites sont des petits organes de la cellule.

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3
Q

Avec le Microscope électronique nomme les organites qu’on peut visualiser dans la cellule eucaryote ?

A
  • Réticulum endoplasmique lisse
  • Réticulum endoplasmique granulaire,
  • Complexe de Golgi,
  • Lysosomes,
  • Peroxysomes,
  • Mitochondries,
  • Chloroplasmes,

De même que d’autres constituants : (Pas des organites) :
- Les ribosomes,
- Le Cytosquelette.
- Le noyau est aussi mieux défini.

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4
Q

Qu’est-ce que le nucléoplasme ?

A

Est la substance liquide dans laquelle baignent la chromatine (ADN + histones)
et les autres molécules retrouvées dans le noyau,
et est délimité par l’enveloppe nucléaire.

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5
Q

Qu’est que le Cytoplasme et le Cytosol ?

A

est la substance liquide entre l’enveloppe nucléaire et la membrane plasmique, dans laquelle baignent les organites, les autres constituants (ribosomes et cytosquelette) et des molécules.

Le Cytosol est la fraction Soluble du cytoplasme entre les organites qui y résident.

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6
Q

Comment se nomme les régions interne et externe du Cyytoplasme ?

A

L’Endoplasme = La région Interne du cytoplasme riche en organites.

L’Ectoplasme = La Zone Périphérique ou corticale du cytoplasme, sous la membrane plasmique, oû se retrouvent moins d’organites mais beaucoup de cytosquelette.

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7
Q

La cellule eucaryotes possèdent plus d’une molécule d’ADN, comment est t’elle accompagnée/placée dans le Noyau ?

A

Chaque molécule d’ADN est associée à des protéines alcalines = Les Histones,
autour desquelles s’enroule l’ADN.

Une molécule d’ADN est les histones associées forment un chromosome et l’ensemble des chromosomes constitue la Chromatine.

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8
Q

Dans la cellule eucaryote d’une espèce donnée, est-ce que les molécules d’ADN ont la même longueur ? pourquoi ?

A

Non,
puisqu’elles ne comprennent pas toutes le même nb de nucléotides.
Conséquement, les chromosmes n’ont pas tous la même longueur.

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9
Q

Décrit l’enveloppe nucléaire ?

A

L’enveloppe nucléaire est constituée de 2 membranes,
Chacune étant une bicouche lipidique typique (= 2 feuillets de phosphoglycérolipides) qui renferme des protéines.

  • Membrane nucléaire interne :
    En contacte avec le Nucléoplasme,
    Tapissée de filaments intermédiaires formant la Lamina à laquelle s’accrochent les molécules d’ADN.
  • Membrane nucléaire externe :
    Continue avec le réticulum endoplasmique granulaire,
    Des ribosomes s’accolent à son feuillet cytoplasmique.
  • Espace Intermembranaire :
    Entre le 2 membranes.
  • Pores Nucléaires :
    Perforations oû les 2 membranes sont en contacte pour le transport entrant et sortant.
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10
Q

Entre les membranes nucléaires interne et externe, l’espace intermembranaire ou périnucléaire se trouve en continuité avec la lumière du REG. Les deux membranes nucléaires entrent en contact en certains endroits, créant des perforations dans l’enveloppe

Comment se nomme ses perforations ? et décrit moi les rapidement.

A

Les Pores Nucléaires.

Dans une cellule de mammifère, on dénombre environ pores/um2 d’enveloppe nucléaire,
soit 3 000 à 4 000 pores par noyau, mais leur nb varie selon la taille du noyau et au cours du cycle pour une cellule donnée.
De 3% à 35% de la surface nucléaire consiste en pores.

Le diamètre interne (ouverte d’un pore est d’environ 45nm,
mais cette ouverture est partiellement obstruée par des protéines, si bien qu’un canal de 9nm seulement est réellement ouvert.

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11
Q

Qu’est qu’un Complexe du Pore Nucléaire (CPN) ?
et décrit comment il est constitué ?

A

Complexe de Pore nucléaire = Une imposante structure protéique qui compose le Pore.

Chq Complexe de Pore Nucléaire est constitué de 2 bagues protéiques octogonales :
- La bague Intranucléaire (dans la membrane interne),
- La bague Cytosolique (dans la membrane externe),

Reliées l’une à l’autre par des colones protéiques espacées d’environ 9nm.

Des protéines transmembranaires (Sous-unités Luminales et Annulaires) retiennet le Complexe de Pore Nucléaire dans l’enveloppe nucléaire.

De plus, sur chq bague se déploient verticalement des filaments protéiques.
Les filaments reliés à la bague intranucléaire (dirigés vers le nucléoplasme) forment une structure en panier,

mais pas ceux reliés à la bague cytosolique (dirigé vers le cytoplasme).
Ils agissent comme des guides pour les molécules qui traversent le pore.

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12
Q

Comment se nomme la famille de Protéine composant le Complexe de Pore Nucléaire ?

A

Nucléoporine

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13
Q

Qu’est que veut dire le Transport passif par diffusion ?

A

Les petites molécules peuvent facilement franchir les pores nucléaires, du nucléoplasme au cytosol et inversement.

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14
Q

Qu’est que veut dire le Transport Actif ?

A

Les molécules qui sont plus grosses, comme les histones, les enzymes servant à la transcription ou à la réplication de l’ADN, qui sont tranduites sur les ribosomes du cytoplasme
et qui doivent gagner le noyau, il leur faut le transport actif.

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15
Q

Comment fonctionne le transport actif des plus grosses molécules à travers les pores nucléaires ?

A

Les protéines nuclaires possèdent une séquence signal le long de leur chaîne (riche en acide aminés basiques - Lysine et Arginine), = Séquence (ou signal) de Localisation Nucléaire (SLN).

La protéiine nucléaire qui vient tout juste d’être traduite dans le cytoplasme = Cargo (la Cargaison).

En présence de GDP (Guanosine Diphosphate), la Séquence de localisation nucléaire de cette protéine se lie à un récepteur d’importation nucléaire (une protéine) = Importine α,
qui elle-même se lie au récepteur Importine β situé sur les filaments de la bague Cytosolique.

Le complexe Cargo-Importines fait ouvrir le pore nucléaire et glisse le long des filaments des 2 bagues pour gagner le nucléoplasme oû le cargo est libéré.

Ainsi, la Séquence de Localisation nucléaire permet aux protéines qui la possèdent de passer du cytoplasme, oû elles ont été traduites, au noyau, oû elles exécutent leurs fonctions,
tout en conservant leur structure tertiaire acquises dans le cytoplasme.

Le transport dans le sens inverse, du noyau vers le cytoplasme, de protéines possédant une séquence d’exportation nucléaire, SEN, s’effectue grâce au récepteur exportine, de façon comparable au transport entrant.

On a estimé qu’il peut s’effectuer jusqu’à 1 000 transports par seconde par pore.

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16
Q

Comment se nomme les Séquences d’acides aminés qui permet aux protéines d’accèder du Noyau au Cytoplasme et l’inverse ?
Et Quelles sont les protéines qui les aident à faire le chemin ?

A

Vers le Noyau = Séquence de Localisation Nucléaire (SLN)

Vers le Cytoplasme = Séquence d’Exportation Nucléaire (SEN).

L’Importine (SLN)
L’exportine (SEN)

Ces derniers ne sont pas considérées comme faisant partie intégrante du Complexe de Pore nucléaire,
Elles sont libres dans le Cytosol ou dans le Nucléoplasme et ne font que glisser sur les filaments.

Une fois que les protéines nucléaires sont rendues dans le nucléoplasme, leur SLN n’est pas excisée, ce qui vaut aussi pour les protéines possédant la SEN, qui n’est pas non plus excisée.

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17
Q

Qu’est que le Nucléole ?
Et quelles sont ses parties ?

A

Nucléole =
Une région dense du noyau, qui est souvent la mieux coloré au microscope photonique.

En microscopie électronique, on décrit 4 parties qui ont été désignées selon leur apparence :

  • Pars Fibrosa = Région oû les copies du gène 45S sont transcrites en ARNr 45S.
    Afin de répondre à l’immense demande en ARNr de la cellule, le gène 45S a été copié en plusieurs exemplaires au cours de l’évolution = C’est l’amplification.
    Sa transcription en ARNr 45S donne un aspect fibreux à cette région nucléolaire, d’oû son nom.
  • Pars Granulosa = Région oû s’assemblent les ARNr et les protéines ribosomales en petites et grosses sous-unités ribosomales,
    ce qui confère une apparence granulaire à cette région.
  • Pars Chromosoma = À la périférie du nucléole, continue avec la chromatine du reste du noyau.
  • Pars Amorpha = Région nucléoplasmique claire entre les précédentes.
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18
Q

Que ce passe t’il avec le transcrit d’ARNr 45S ?

A

Le transcrit d’ARNr 45S :
est coupé en 3 segments, donnant 3 des 4 types d’ARNr des cellules eucaryotes :
28S
18S
5.8S
désignés collectivement ARNr lourds.
Le 4ième type, l’ARNr 5S (ARNr léger), est synthètisé à partir de gènes qui ne se trouvent pas dans le nucléole, mais ailleurs dans noyau, puis est amené à la Pars Granulosa du nucléole.

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19
Q

Combien de différentes protéines contient un ribosome ? (nb et identité diffèrent selon les espèces).
et comment sont-il codées ?

A

80 différentes protéines.

sont codées par autant de gènes différents de l’ADN situés dans le noyau à l’extérieur du nucléole.

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20
Q

Les ARNm des différents types de protéines des ribosomes font quoi pour sortir du noyau ? et que se passe t’il après (une fois la protéine codée) ?

A

Les 80 types d’ARNm transcrits à partir des 80gènes d’ADN quittent le noyau en empruntant les pores nucléaires.
Pour ce faire,
ils s’associent à des protéines possédant un Signal d’exportation nucléaire qui se lie à l’Exportine.

Les ARNm vont sur des ribosomes libres du cytoplasmique,
oû ils sont traduits en protéines.

Ces protéines sont ensuite importées dans le noyau via les pores nucléaires, grâce à leur Signale de localisation nucléaire
qui se lie à l’Importine,

puis sont dirigées vers la Pars Granulosa du nucléole pour s’associer à des ARNr et former les sous-unités ribosomales.

21
Q

Combien de protéines forme la petite et la grosse sous-unités ribosomales ?

A
  • Environ 30 protéine différentes s’assemblent avec l’ARNr 18S = Petit sous-unité ribosomale.
  • Environ 50 protéines différentes s’assemblent avec les ARNr 5S, 5.8S, 25S = Grosse sous-unit ribosomale.
22
Q

Une fois les Sous-Unités ribosomales formées que se passe t’il ?

A

Chq sous-unité ribosomale se compose d’environ 60% d’ARNr et 40% de protéines.

Le petites et les grosses sous-unités sont exportées vers le cytoplasme via les pores nucléaires grâce au Signal d’Exportation nucléaire que possèdent leurs protéines et au récepteur Exportine.
(Les protéines ribosomales possèdent SLN et SEN).

(Il faut des ribosomes pour fabriquer des ribosomes).

Les sous-unités ribosomales sont en réserve dans le cytoplasme pour être prêt à s’associer aux autres composante nécessaires à la synthèse protéique.

23
Q

Qu’elles sont les 3 types d’amplification que l’ont peut retrouver ?

A

(Peut se produire dans les eucaryotes et les procaryotes)
L’amplification peut se réaliser à trois niveaux et les trois types d’amplification peuvent se produire pour pourvoir à la production de protéines abondantes:

  • L’amplification Pré-Transcriptionnelle =
    celle d’un gène, tel le gène 45S.
    Elle existe non seulement pour produire de l’ARNr, mais aussi pour produire de l’ARNm pour fournir des protéines requises en grande qté.
  • L’amplification Transcriptionnelle =
    Enn la transcription d’un gène codant une protéine donnée en de multiples molécules d’ARNm pour produire plusieurs copies de la protéine. (se produit dans le noyau).
  • L’amplification Traductionnelle =
    Fait que chq molécule d’ARNm code plusieurs exemplaires d’une protéine en s’associant à plusieurs ribosomes organisés en polysomes dans le cytoplasme de la cellule.
24
Q

Qu’elles sont les 3 catégories de protéines pour leur route et adresse de direction (routage et adressage) ?

A
  • Protéines destinées au Cytosol =
    Telles les enzymes de la Glycolyse et les protéines composant le cytosquelette, sont traduit sur des ribosomes libres dans le cytosole (Ribosomes organisés en Polysomes)
    et accomplissent leurs fonctions dans le cytosol.
    Ces protéines ne sont PAS incorporées aux organites.
  • Protéines destinées au Noyau, aux Peroxysomes, aux Mitochondries et aux Chloroplastes =
    Sont traduites sur des ribosomes libres dans le cytosol puis sont ensuite incorporées à leur organite respectif, une Incorporation Post-traductionnelle.
    (ex.: Protéines nucléaires et ribosomales).
  • Protéines destinées au Réticulum endoplasmique Granulaire, au Complexe de Gogli, aux Lysosomes, à la Membrane plasmique et à la Sécrétion =
    Sont traduites sur des ribosomes attachés à la membrane du Réticulum endoplasmique Granulaire,
    il s’agit d’une Incorporation Co-Traductionnelle, étant incorporées à un organite (au REG) lors de leur traduction.
25
Q

Oû dans la cellule ont-il besoin de lipides et pourquoi ?
et oû sont-ils synthétisé dans la cellule ?

A

Dans les membranes, elles nécessitent une grande qté de lipides.
En particulier les Phosphoglycérolipides,
les Glycolipiddes,
et le Cholestérol (chez les cellules animales).

Les lipides sont nécessaires à d’autres fonctions de la cellules,
exemple : aux hormones lipidiques.

Les lipides sont synthétisés sur une portion du réticulum endoplasmique.

26
Q

Quelle portion du Réticulum endoplasmique lisse ou granulaire est impliquée dans la Synthése des Lipides ?

A

Réticulum Endoplasmique Lisse (REL)

27
Q

Qu’est qu’un Saccule ?

A

Organelle qui prend la forme d’un sac de petite taille. (Cavité)

28
Q

Qu’est que le Réticulum endoplasmique Lisse (REL) et que fait-il

A

Le Réticulum endoplasmique Lisse =
est un ensemble de saccules membranaires empilés qui contiennent les Enzymes nécessaires à la Synthèse des Lipides Saponifiables et Non Saponifiables.

Les lipides y sont synthétisés puis transportés vers les sites oû ils serviront.

Toutes les cellules produisent des lipides, dont pour les membranes.

Le Réticulum endoplasmique Lisse est particulièrement bien développé dans certains types de cellules oû la Synthèse Lipidique est importante pour leur fonction (exemple : Les cellules sécrétrices d’hormones stéroïdes).

29
Q

En plus de la Synthèse Lipidique, à quoi sert le Réticulum Endoplasmique Lisse (REL) ?

A

Est un site de Réserve d’ions Ca++
et agit comme régulateur de la concentration de Ca++ intracellulaire.

Le Réticulum endoplasmique est particulièrement bien développé dans les cellules qui nécessitent une grande qté de Calcium pour leur fonction (neurones et fibres musculaires).

30
Q

Quelle est l’autre Organites qui sont aussi des Réservoirs de Ca++ intracellulaire ?

A

Les Mitochondries

31
Q

Explique qu’Est-qu’est de Sécrétion par Exocytose ?

A

Les cellules produisent plusieurs protéines destinées à être exportées vers le milieu extracellulaire.

Chez les eucaryotes,
La sécrétion cellulaire s’effectue par Exocytose :

Une Vésicule (Cavité, petit sac membraneux) cytoplasmique, qui contient les protéines, fusionne la membrane plasmique et expulse les protéines à l’extérieur.

32
Q

Est-ce que la Sécrétion par Exocytose existe chez les Procaryotes ? Justifie

A

Non,
Les Procaryotes ont le mécanisme d’expulsion des Exoenzymes bactériennes.

33
Q

Quels sont les Organites qui entrent en jeu dans la formation des Vésicules de Sécrétion ?

A

Le Réticulum Endoplasmique Granulaire (REG),
Le Complexe de Golgi

34
Q

L’endocytose, qu’est-ce que c’est ?

A

L’endocytose est le mécanisme inverse de l’exocytose, qui agit dans le cadre de la Digestion cellulaire.

35
Q

Décrit le Réticulum Endoplasmique Granulaire ?

A

Est un ensemble de Saccules membranaires empilés portant des RIbosomes sur le feuillet Cytosolique de leur membrane.

Il est continue avec la membrane nucléaire externe
et sa Lumière est en continue avec l’espace Intermembranaire nucléaire.

36
Q

Oû sont traduites les Protéines destinées à la Sécrétion et que subissent telle comme type d’incorporation ?

A

Sont traduites sur des Ribosomes liés au Réticulum endoplasmique Granulaire (REG).
Elles subissent dont une Incorporation Co-Traductionnelle.

37
Q

Explique le processus de Traduction des protéine destinées à la Sécrétion ?

A

Une fois que l’ARNm est rendu dans le Cytosol et s’est associé à un Ribosome,
La traduction de la Protéine débute.

Or, les protéines destinées à la sécrétion et les protéines membranaires, ainsi que du Réticulum endoplasmique Granulaire même
possèdent une Séquence Signal d’acides aminées à leur extrémité NH2 = Peptide Signal d’initiation de Transfet (PSIT),
qui fait aue chq ribosome (d’un Polysome) auquel est associée une molécule d’ARNm se fixe à la membrane du Réticulum endoplasmique Granulaire.

38
Q

Comment se fait l’association de la Séquence signal d’Acide aminées à l’extrémité NH2 de la protéine ?
(Peptide Signal d’Initiation de Transfert PSIT)

A
  • Une Particule de Reconnaissance du Signal (PRS) (Composée de 6 protéines + 1 petit ARN) dans le cytosol se lie au Peptide Signal d’initiation de Transfert (PSIT) et
    Inhibe la poursuite de la Traduction de l’ARNm.
  • La Particule de Reconnaissance du Signal (PRS) se lie au Récepteur (récepteur du PRS) et à un Translocateur (un canal protéique) situé dans la membrane du Réticulum endoplasmique Granulaire.
    L’inhibition de la Traduction est levé dès que la Particule de Reconnaissance du Signal (PRS) se lie à son récepteur.
  • Le Translocateur s’ouvre et la protéine pénètre dans la lumière du Réticulum endoplasmique Granulaire au fur et à mesure qu’elle est Traduite (durant son Élongation).
    C’est ce qu’on entend par = Incorporation Co-Traductionnelle.

Une fois que la Protéine est complétée,
le Peptide Signal d’initiation de Transfert (PSIT) est coupé par l’action d’une Enzyme appelée Peptidase du signal
qui se trouve dans la lumière du Réticulum endoplasmique Granulaire,
puis est dégradé.

La protéine adopte sa structure Tertiaire.

39
Q

Quels sont les 3 Groupes des Protéines à Incorporation Co-Traductionnelles ?

A
  • Les Protéines destinées à la Sécrétion et à la membrane Plasmique, de même que les protéines Lysosomales.
  • Les Protéines enchâssées dans la membrane du Réticulum endoplasmique Granulaire (REG), qui ne doivent donc pas pénétrer en entier dans la lumière du Réticulum endoplasmique Granulaire.
  • Les Protéines qui accomplissent leurs fonctions dans la Lumière du Réticulum endoplasmique Granulaire (REG), telle la peptidase du signal, qui ne doivent donc pas passer au Golgi.
40
Q

Explique ce que fait la Protéine destinées à la sécrétion et à la membrane plasmique, de même que les protéines lysosomales ?
(Une de protéine à Incorporation Co-Traductionnelle)

A

Elles progressent dans la lumière du Réticulum endoplasmique Granulaire (REG)
et se dirigent vers le Complexe de Golgi.

41
Q

Explique ce que fait la Protéine enchâssées dans la membrane du Réticulum endoplasmique Granulaire ?
Une des protéines à Incorporation Co-Traductionnelle.

A

Elles ne doivent donc pas pénétrer en entier dans la lumière du Réticulum endoplasmique granulaire (REG),
possèdent, le long de leur chaîne polypeptidique, un Séquence d’Arrêt de transfert (SAT) d’acides aminés Hydrophobes qui signale l’arrêt de leur internalisation dans la lumière du Réticulum endoplasmique granulaire et
la fermeture du Translocateur, sans arrêter leur Élongation, qui se poursuit alors à l’extérieur du Réticulum endoplasmique granulaire.

La Séquence SAT est COnservée.

Ainsi, ces protéines possèdent les séquences peptide signal d’initiation de transfert (PSIT) coupée et SAT conservée.

42
Q

Explique ce que fait la Protéine qui accomplit leurs fonctions dans la lumière du Réticulum endoplasmique granulaire (REG) telle la Peptidase du Signal ?
Une des protéine à Incorporation Co-traductionnelle.

A

Ne doivent donc pas passer au Golgi,
possèdent à leur extrémité COOH une Séquence KDEL
KDEL (K=Lysine, D=Aspartate, E=Glutamate, L=Leucine),
Elle aussi COnservée.
Elles possèdent donc les Séquence Peptide Signal d’Initiation de Transfert et KDEL.

Il arrive que certane de ces protéines s’échappent du Réticulum endoplasmique Granulaire (REG), mais elles seront rattrapées.

43
Q

Qu’est que la glycosylation ?

A

Plusieurs protéines membranaires et celles de sécrétion,
traduites sur le Réticulum endoplasmique Granulaire (REG) et
donc d’Incorporation Co-traductionnelle,
sont des Glycoprotéines.

Leur Glycosylation s’effectue par l’ajout d’un Oligosaccharide
le long de la chaîne d’acides aminés en cours d’Élongation, et non pas à une extrémité.

Le nb de momonères composant l’Oligosaccharide et leur nature dépendent de la protéine à laquelle il est lié.

L’Oligosaccharide est synthètisé en entier sur le Dolichol, un lipide insaturé produit dans le Réticulum endoplasmique Lisse (REL) puis incorporé à la membrane du Réticulum endoplasmique Granulaire (REG).

L’oligosaccharide se détache du Dolichol pour se lier au Polypeptide dans la lumière du Réticulum endoplasmique Granulaire (REG) grâce à l’action d’une Enzyme de la famille Glycosyltransférase.

44
Q

Qu’est que le Dolichol ?

A

Un lipide Insaturé produit dans le Réticulum endoplasmique Lisse (REL) puis incorporé à la membrane du Réticulum endoplasmique Granulaire (REG).

45
Q

Explique l’exemple de Glycosylation de l’acide aminé Asparagine (Asn) ?

A

Une protéine dont l’Oligosaccharide est lié à l’Acide aminé Asparagine (Asn).
Lorsqu’une Asparagine franchit le Translocateur
et se présente dans la lumière du Réticulum endoplasmique Granulaire (REG),
l’Oligosaccharide lui sera ajouté si l’Asparagine fait partie d’une séquence d’acides aminés bien précise :
NH2 aa-aa-aa——Asparagine - X - Sérine ou Thréonine -aa-aa-aa—-aaCOOH
(X ≠ Proline).

La Glycosyltransférase spécifique transfère l’Oligosaccharide en bloc du Dolichol à l’Asparagine.

Comme l’Oligosaccharide est lié au N de l’acide aminé Asparagine,
il s’agit d’une N-glycosylation (la plus fréquente).

46
Q

Quels sont les 4 types d’Oligosaccharides N-Glycosidiques ?

A
  • Phosphorylés,
  • Riches en Mannose,
  • Complexes et Hybrides.
    (soit intermédiaire entre les 2types précédents)
47
Q

Les protéines destinées aux vésicules de sécrétion ou à la membrane plasmique Sont glycosylées avec quel type d’Oligosaccharide ?

A

Complexes !

48
Q

Quelles sont les avantages de la Glycosylation pour les cellules eucaryotes ?

A
  • Elle protège leur membrane,
    une genre de substitut du peptidoglycane qui protège la membrane des procaryote, mais qui, contrairement à ce dernier, permet l’Exocytose et l’Endocytose.
  • Elle permet l’adhérence intercellulaire.
49
Q
A