ETZ Flashcards
Hücrede ATP kaç yolla sentezlenir?
- Substrat düzeyinde fosforilasyon
- Oksidatif fosforilasyon ile ATP sentezi
ATP ye hangi yollardan alıyoruz ?
- Glikoliz
- TCA
- ETZ
Glikoliz
TCA siklusu
ETZ
ATP üretim şekli nasil ?
Glikoliz…. substrat düzeyinde
TCA…… substrat düzeyinde
ETZ …… oksidatif fosforilasiyon
Substrat düzeyinde fosforilasyonun örnekleri ?
- Fosfogliserat kinaz ATP glikoliz
- Piruvat kinaz ATP glikoliz
- Süksinat CoA sentetaz GTP TCA
- Kreatin kinaz ATP
Hücresel solunumda zincirin son elektron alıcısı kim ?
O2
Kemiozmozis nedir ?
Hücresel solunumda, zincirin son elektron alıcısı oksijendir. ATP üretiminin bu mekanizması, kimyasal reaksiyonları (taşıma zinciri boyunca
elektronların geçişi) hidrojen iyonlarının mitokondriyal membranlar arası boşluğa pompalanmasıyla ilişkilendirdiğinden, buna kemiozmozis denir.
• Kemiozmoz ve elektron taşıma zinciri birlikte oksidatif fosforilasyonu oluşturur.
Oksidatif fosforilasyon üyeleri ?
- Kemiozmoz
- Elektron taşıma
ETZ NEREDE yerleşmiş ?
Iç mitokontriyal zardaki
(Matriksta değil)
Komplekslerin görevleri ?
1 2 3 4 elektron taşıcı
5 fosforilasiyon ATP sentezi
NAD VE FAD nedir ? onların yapısında ?
Elektron lar bunlar ile taşınır.
NAD ve FAD koenzim
NAD niyasin
FAD riboflavin
ETZ in Hareketli elemanlar ?
- Koenzim Q ubikinon
- Sitokrom c
ETZ de membran içine gömülü olan element ?
Koenzim Q
ETZ Lipid yapıda olan ?
Bir tek ubikinon veya koenzim Q
Mobil hareketi yapan ?
- Koenzim Q ubikinon
- Sitokrom c
Sabit elemanlar ?
4 tane
Kompleks 1 2 3 4
Hidrit nedir ?
2 elektron + 1 proton
Kim hidrit kabul ederek indirgenir ?
NAD+
HADH H+
FAD ne şekilde indirgenir ?
2 hidrojen ile FADH2
FAD ne içerir ?
Bağlanma tarzi ?
FAD proteinlere wnzimlere kovalent olarak bağlanır
Bu nedenle prostatik grup olarak adlandırılır.
B2
Riboflavin içerir
NAD ne içerir ?
B3
Niasin içerir
Mitokondrinin iç zarin geçirgenliği ?
Geçirgen
Küçuk moleküllere ve H+ karşı geçirgen değildir
ETZ ait proteinler ?
Kompleks 1 2 3 4
Elektron zincir
Taşıyıcı proteinler
Mekik sistemleri
Mitokondrinin iç zerinde yer alan taşıyıcı proteinler ?
- Fosfat translokaz
- Adenin nükleotid translokaz ( ATP /ADP taşıyıcı)
- Piruvat / H+ simport
Mekik sistemleri ?
- Gliserol fosfat
- Malat aspartat
Mekik sistemlerin gorevi ?
NADH in mitokondri iç membranında geçmesi için .
Gliserol fosfat mekiği nerede ?
Beyin
Iskelet kasi
Malat aspartat nerede yer alıyor ?
KC
Böbrek
Kalp
Komplekslerin enzimleri ?
Kompleks 1 …NADH dehidrogenaz
Kompleks 2 … suksinat dehidrogenaz
Kompleks 3 … sitokrom bc1 Komplek
Kompleks 4 … sitokrom c oksidaz (aa3)
Hangileri elektron taşınır ?
1 2 3 4
Hangileri proton pompasıdır ?
1 3 4
Matriksten intermembran boşluğa
Hangileri hidrofibik / hidrofilik ?
1 2 3 4
Hudrofobik integral proteinler
ETZ indirgenme yükseltgenme merkezleri ?
- FMN , FAD
- Fe S merkezleri
- Sitokrom b, c1, c ve a3 deki fe hem bağli
- Unikinon veya diğer adi ile koenzim Q
Prostetik yapı ?
Proteine sıkı bir şekilde bağlidir .
Demir sulfur merkezleri hangi komplekslerde bulunur ?
1 2 3
Demir sulfur merkezleri kaç tane elektron alır ?
Fe kadar
1 tip 1 e
2 tip 2 e
3 tip 4 e
Demir sulfur merkezlerin gorevi ?
Elektronleri alıp indirgemiyorlar
Sonra sonraki aliciye verip yükseltgeniyorlar
Rieske demir merkezi ?
Demir sulfur merkezlerinin aksine 4 sisteine değil 2 sistein 2 histedine bağli
Kompleks 3 te
Bakir merkezleri ?
Kaç elektron alıyor ?
Kompleks 4 te bulunur
Cu a
Cu b
Tek elektron alıyor
Kaç tane sitokrom mevcut ?
Ne içeriyorlar ?
Neye göre sınıflandırıyoruz ?
Sitokrom a izopren içeren hem
Sitokrom b Mb ve Hb yapısında bulunan hem
Sitokrom c cys ile kovalent bağlanan hem
Içerdikleri hem gruplarına apoprotein yapıları ve dansititelerine göre
* a ve b non kovalent
C kovalent olarak bağlanır
Sitokromlar ne içerir ?
Hem grubu
Demir atomu taşıyan profilin halka
Işığı karşı ?
Absorbe ediyorlar
Sitokromlarin bağlari ?
A ve b deki hem gruplari non kovalent
C kovalent
ETZ nin sitokrom c üyesi ?
Periferal protein
3 ten 4e elektronlari tek tek taşır
Fe3 => Fe2
Yapisindan vitaminden türememiştir
Sitokrom c gorevleri ?
- ETZ
- Hucresel stres durumunda apoptozda da rol oynar
Apoptoz ?
Apoptoz sırasında sitokrom c mitokondriyal dış zardaki genişlemiş porlardan sitoplazmaya geçebilir
Sitoplazmada
1. sitokrom C faktör 1 apoptotik akif edici ve kaspaz 9 a bağlanır bir kompleks oluşur
2. Daha sonra diğer kaspazlar bağlanır
Sonuç hücre ölümü
sitolcromc+ kenzpuz o+ Apufy freetar? 1 Apopto sem On
.
.
Tek lipid yapıda olan ?
Ubikinon koenzim Q
Ubikinon yapisinda neler vardır ?
Yapısında
Kinon ve
Izoprenoid vardır
10 izoprenoid birimi var bu nedenle koenzim Q10 olarak adlandırır
Koenzim Q gorevi ?
Elektronlari kompleks 1 v 2 den alıyor ve kompleks 3 e veriyor
Koenzim Q kaç tane elektron taşıyabilir ?
2 tane
Bir tane alsa tamamen indirgenmez
Semi Q
Q kaç bicimde bulunur ?
- Okside kinon Q
- Indirgenmiş redukte kinol radikali QH
- Semi kinon QH2
- Kompleksin ismi ?
NADH Koenzim Q oksidoreduktaz
HADH ubikinon oksidoreduktaz
Kompleks 1 gorevi ?
Elektronlari NADH den alıyor ve koenzim Q ya aktarıyor
FMN indirgenmiş halı?
Bir hidrür ve 1 serbest proton alarak FMNH2 indirgenir
Kompleks 1 de elektron yolu ?
- Elektron NADH den FMN ye
- FMN => FMNH2
- FMNH2 den demir sulfur merkezlerine gidiyor
- Sonra koenzim Q ya veriliyor
Kompleks 1 prostetik gruplar ?
- FMN
- Demir sulfur merkezleri
Kaç elektron kompleks 1 den geçip sonra koenzim Q ya verildi ?
2 e
Kompleks 1e giren NADH larin kaynaklari ?
- Piruvat dehidrogenaz
- Alfa ketogluterat dehidrogenaz
- Izositrat dehidrogenaz
- Malat dehidrogenaz
- Yağ asitlerin beta oksidasiyonu
- Kompleksin isimleri ?
Koemzin oksidoreduktaz
Suksinat ubikinon oksidoreduktaz
TCA ve ETZ arasındaki ortak eleman ?
Süksinat dehidrogenaz
Mitokondri membranina bağli olan enzim ?
Süksinat dehidrogenaz
Kompleks 2 tüm alt üniteleri kimin tarafindan kodlanir ?
Nükleer genom tarafından
Kompleks 2 üyeleri ?
- FAD
- Fe S merkezleri
Kompleks 2 elektron yolu
- FADH2 elektron lari demir sulfur merkeze veriyor kendisi FAD da dönüşur
* FAD => FADH2
KIMIN yardımıyla? Suksinat => furmat - Demir sulfur merkezi de elektronlari koenzim Q ya veriyor
Kompleks 2 ye inhibe eden kim ?
Malonat süksinat dehidrogenazı inhibe eder
Koenzim Q ya aktarılan diger FAD lar?
- Gliserol 3P dehidrogenaz enzimi tarafından üretilen
- Açil koA dehidrogenaz basamağinda üretilen
Burda üretilen FADH2 kompleks 1 v2 ye atlayarak doğruden koenzim Q ya elektron veriyorlar
Kaç çeşit demir sulfur merkezleri var ?
- Hem içeren
- Hem içermeyen
Kompleks 3 ?
- 3 adet hem içeren ve 1 adet hem içermeyen demir sulfur merkezleri
[rieske demir sulfur protrin 2 histidin 2 sistein] - Proton pompalanir
- Ferrik Fe 3 => ferröz Fe 2
- Elektron koenzim Q den alıyor sitokrom c ye veriyor
ROS nedir ve nasıl oluşur ?
Radikal
O2 suya tam olarak indirgenmesi içi. 4 e gereklidir
Kismi indirgenmeler reaktif oksijen türlerinin oluşumuna yol açar
ATP sentazin yapısı ?
F0 ve f1
F0 integral protein hidrofobik
3 fakli alt birim a b c
F1 kuresel yapıda periferal proteindir matrikse doğru
3 alfa 3 beta gama epsilon teta
F1 ATPsentaz aktiviteye sahip
Beta bolgesi
Gama epsilon ve c bölgeleri hareketli
F1 ünitesinin 1 tam dönüşu ile 3 ATP üretilir
F0 kim ile inhibe olur ?
Oligomisin
Translokazlar ?
- ADP ATP translokaz antiport
- Fosfat translokaz simport
1 NADAH
1 FADH2
KAÇ ATP üretiyoruz?
1 NADH 2.5 ATP
1 FADH2 1.5 ATP
ATP ADP translokaz inhibitorlari ?
- Bitki tiksini atraktilozid
- Bongkreatin asit
Çürümüş hindistan cevizinden mantarların ürettiği pufa
Geliserol mekiği?
Membran arasi boşluk
Periferal protein
Her çift elektron için 1.5 ATP
Elektronları koenzim Q üzerinden kompleks 3e aktariyor
Gliserol 3 P dehidrogenaz
Gliserol 3 fosfat => dihidroksiass
Etin fosfat
Malat aspartat ?
Elektronlari doğrudan kompleks 1 e aktarılır
Her elektron çifti için 2.5 ATP elde edilir
7. ETZ 54
Elektron taşıma inhibitörleri ?
Zara bağlı taşıyıcı enzimlari bozar
Proton gradienti azalır
ATP sentezi azalır
Oksijen tüketimi azalır
Hücre içi NADH / NAD+ oranı ile sonuçlanır
Riboflavin den sentezlenen koenzimler hangileri ?
FAD FMN
Ağır rebiflavin eksikliğinde ne olur ?
Mitokindri ATP üretim yeteneği azalır
Fe S merkeslerin ve sitokromlarin eksikliği?
Fe eksikliği anemisi
Siyanür zehirlenmesi ?
Sitokrom c oksidaz inhibe olur
OKPHOS hastalıkları?
Mt DNA veya Nükleer DNA mutasyonlari
Kompleks 1 inhibitorlari ?
- Rostenon
- Amital
- Sekonal
- Pierisidin
Kompleks 2 inhibitorlari?
- TTFA tenoiltrifluroasetat
- Karboksin
Kompleks 3 inhibitorlari?
- Dimerkaprol BAL
- Antimisin A
- Miksotiazol
- Stigmatellin
Kompleks 4 inhibitorlari neye inhibe ederler ?
Heme a3 fe3+
1. Sodium azide
2. Co
3. H2S
4. cyanide CN
Karbon monoksid zehirlenmesi
- Yanma sigara içme yangınlar araba egzozu ızgara
- Boya sökücüler
Siyanür kaynaklari ?
- Bazi Gada bitki
- Ortak meyvelerin çekirdek ve tohumları
- Siyata dumani
- Plastik gibi sentetik malzemelerin yanma ürunleri
- Madencilik altin metal çıkarma
Siyanur hangi komplekse etkiler ?
Sitokrom c oksidaz hem a3 deki demirinr fe 3+ bağlanmasıyla kompleks 4 oksijen bağlanamaz
Solunum inhibe olur
Ölüm
Dinitrofenol
Amfipatik
Eskiden zayıflama ilacı
Ölümden dolayı yasaklandı
ETZ üzerinde etkisi ısı artışına neden olur
Oksijen tüketimi arttırır
Elektron oksijene aktarımı artar
ATP sentezi olmadığından enerji olarak ortaya çıkar
ATPaz inhibe olsa
Proton gradienti artar
Elektron transport durduğundan ATP üretilmez
Ornek oligomisin