ÉTUDE ET STRUCTURE DE L'ADN Flashcards
Que représente le génome ?
La base de l’hérédité de tout être vivant
De quoi est constitué le génome ?
Une longue séquence d’acide désoxyribonucléique (ADN)
Que fournit l’ADN ?
L’information génétique dite héréditaire
Quelles sont les différentes formes de l’ADN ?
- ADN chromosomique
- ADN plasmidique
- ADN des organelles
Que représentent les chromosomes ?
Support physique des gènes
Transposons
Segments mobiles de
l’ADN qui peut se déplacer dans le génome d’un organisme, et qui peuvent
réguler l’expression des gènes, l’expression des protéines et la virulence
Rôle du noyau
Le noyau contient l’information génétique
Quelle est la composition de la molécule d’ADN ?
Union de 2 brins enroulés en hélice
constitués chacun par une longue chaîne polydésoxyribonucléotidique
Quelle est l’uinté de base de l’ADN ?
Les nucléotides
Combien de types de bases existent-ils ?
2 types
Qu’est-ce qu’un nucléotide ?
Association d’une base, d’un ose et d’un groupe de phosphate
Combien de groupes de phosphates retrouve-t-on dans un nucléotide ?
1 à 3 groupe de phosphates
Quelles sont les 2 bases ?
- pyrimidiques
- puriques
Bases pyrimidiques
Composés monocycliques qui comprennent un hétérocycle à 6 atomes.
Dans quels nucléotides retrouve-t-on les bases pyrimidiques ?
Thymine
Uracile
Cytosine
Qu’est-ce que la thymine ?
Est un uracile avec un méthyle sur le C5
Bases purines
Composés bicycliques qui
comprennent 2 hétérocycles à 5 atomes (noyau indole) et 6 atomes (noyau pyrimidine).
Quels sont les deux sucres rencontrés ?
ADN : désoxyribose
ARN : ribose
Dans quels nucléotides retrouve-t-on les bases purines ?
Guanine (C6 = carbonyle et C2 = amine)
Adénine (C6 = amine et PAS DE CARBONYLE)
Caractéristique du désoxyribose
Plus stable que le ribose
Les oses des ADN et ARN
Pentose B furanose
Passage du ribose vers le désoxyribose
Réduction du carbone 2 = perte du groupement OH du C2
Nucléoside
Liaison d’une base nucléique à l’atome de carbone 1’
d’un pentose par une liaison de type β N - glycosidique
Liaison de la base purique avec le pentose
Le carbone C1 du pentose est relié à l’azote N9 de la base
Liaison de la base pyrimidique avec le pentose
Le carbone C1 du pentose est relié à l’azote N1 de la base
Comment se forme un nucléotide ? (liaison phosphate)
Par la liaison d’un groupe phosphate à l’atome 5’ d’un nucléoside
Types de nucléotides(en fonction du nombre de phosphate)
Monophosphate
Diphosphate
Triphosphate
Quel est le type de la liaison entre un nucléoside et un phosphate ?
Liaison anhydride acide
Rôle de la liaison de l’anhydride acide
Stockage d’une
quantité importante d’énergie qui pourra être libérée lors de l’hydrolyse
Liaison phosphodiester (permet de relier quels éléments)
Liaison entre deux désoxyriboses
Caractéristiques des liaisons phosphodiesters
Porteuse d’une charge négative susceptible de
repousser les attaques nucléophiles
Uracile
C4 = Cétone
C2 = Cétone
Cytosine
C4 = Amine
C2 = Céthone
Thymine
C2= Cétone
C4 = Cétone
C5 = Amine
Adénine
C6 =amine
Guanine
C2= amine
C6 = cétone
Liaisons A//T
2 liaisons H
Liaisons G///C
3 liaisons H
ADN
Désoxyribose = position 2 : H
ARN
Ribose = position 2 : OH
Principe de la complémentarité de l’ADN
Toute l’information génétique portée par l’un des brins
de la double hélice d’ADN est également portée à l’identique sur l’autre brin
Brin gauche de la double hélice
5’phosphate libre
Brin droit de la double hélice
3’OH libre
Caractéristique de l’enroulement de l’hélice
Elle est dite hélice droite
Positionnement des bases
Tournée vers l’intérieur
Perpendiculaire par rapport à l’hélice
Parallèle par rapport aux bases
Distance entre chaque base
3,4 A
Rotation des bases autour de l’axe de l’hélice
34°
Les deux brins sont dits
antiparallèles
Squellete pentose phosphate (positionement)
À l’extérieur
ADN en solution
Les charges sont neutralisées par des ions (Na+)
Structure B de l’ADN
Double hélice droite
Diamètre = 20 Å.
Existence de deux sillons (petit et grand)
Bases accessibles qu’au niveau des grands sillons
Pas de l’hélice = 34 Å pour 10,4 paires de bases
Structure A de l’ADN
- Double hélice droite dont l’axe ne passe plus par les paires de bases
- Double hélice plus large : diamètre de 2,3 nm
- Pas de l’hélice = 2,8 nm pour 11 paires de bases par tour d’hélice
Structure Z de l’ADN
- S’observe préférentiellement dans les régions riches en paires G-C lors de la transcription de l’ADN en ARN.
- Double hélice plus étroite: diamètre d’environ 1,8 nm
- Pas d’environ = 4,5 nm pour 12 paires de bases par tour d’hélice