énergie libre et macromolécules Flashcards
cellule, énergie libre, reconnaissance moléculaire, construction par module
C’est quoi une cellule ?
Paquet de molécules et macromolécules associées les unes aux autres dans un réseau complexe et formant parfois des interactions
Quelles sont les deux lois de la thermodynamique obéis par la cellule ?
- L’énergie est toujours conservée (rien ne se perd, rien ne se crée, tout se transforme)
- L’entropie d’un système isolé augmente ou reste constante: elle ne peut que croitre au cours d’une transformation
Pour que les molécules puissent intéragir entre elles, la cellule…
Dépend d’un flux continuel d’énergie et d’émission de chaleur.
Qu’est ce qui est nécessaire pour combattre l’entropie ?
L’énergie
C’est quoi l’entropie?
Degré de désordre d’un système.
Qu’est ce qui contrôle les réactions chimiques retrouvées dans la cellule ?
Les enzymes
Comment les cellules créent de l’ordre et pourquoi ?
Elles le créent avec un flux constant de réactions chimiques (métabolisme), qui demande beaucoup d’énergie, afin de rester en vie. Sans ordre, la cellule ne peut pas exister.
L’énergie dégagée par le catabolisme est conservée oû?
Dans les molécules nouvellement synthétisées ou dans la chaleur créée par la cellule.
Qu’est ce que l’énergie dissipée par cellule entraîne dans le système de la cellule ?
Elle augmente l’entropie totale malgré l’ordre établi à l’intérieur de la cellule.
Si deux atomes s’unissent, ils…?
Libèrent de l’énergie
Quelle équation représente un bris de liaison ?
Molécule AB + énergie — Atome A + Atome B
C’est quoi l’énergie libre ?
C’est l’énergie capable d’accomplir un travail. C’est aussi le changement d’énergie dans une réaction.
Vrai ou faux: dans une réaction impliquant plusieurs molécules, de l’énergie est libérée chaque fois qu’un lien entre deux atomes se crée et de l’énergie est nécessaire chaque fois qu’un lien se brise.
Vrai.
L’état dans lequel l’énergie libre de la réaction se rapproche de 0 est nommée…
État d’équilibre
Qui suis-je? Je suis une réaction exergonique, catabolisme, qui libère de la chaleur avec un delta G négatif
Réaction spontanée
Qui suis-je? Je suis une réaction endergonique, anabolisme avec un delta G positif
Réaction non-spontanée
Vrai ou faux: une réaction spontanée nécessite un apport d’énergie pour s’effectuer dans le sens des produits.
Faux. Elle libère de l’énergie libre.
Comment une réaction non-spontanée peut se produire dans une cellule ?
Avec un couplage énergétique (réaction spontanée couplée avec une réaction non-spontanée)
Dans une réaction spontanée, les réactifs sont…
Plus en haut que les produits
C’est quoi une enzyme ?
C’est une protéine qui accélère une réaction chimique en diminuant l’énergie d’activation de la réaction.
Quelle est la condition pour qu’une réaction s’effectue, même si elle est spontanée?
Les réactifs doivent atteindre un niveau minimal d’énergie pour activer la réaction (énergie d’activation)
Qu’est ce qui se passe si l’énergie d’activation est abaissée ?
Plus de molécules auront l’énergie pour faire la réaction
Vrai ou faux: l’énergie totale libérée lors de la réaction spontanée change avec la présence d’une enzyme.
Faux. Elle ne change pas.
Dans les réactions spontanées, l’énergie d’activation nécessaire pour la réaction inverse est…?
Plus élevée
Dans la cellule, le delta Grxn dépend de quoi ?
- L’énergie intrinsèque des molécules (delta Go)
- La concentration des produits et des réactifs à un moment précis de la réaction
Remplis les cases manquantes: Plus le delta Go d’une réaction est négatif, plus il faut de _______ pour atteindre l’équilibre, car l’énergie intrinsèque des _____ est plus faible
Produits et produits
Remplis les cases manquantes: Plus le delta Go d’une réaction est positif, plus il faut de _______ pour atteindre l’équilibre, car l’énergie intrinsèque des _____ est plus faible
Réactifs et réactifs
C’est quoi les macromolécules ?
Ce sont des objets solides dont les surfaces interagissent entre elles ou avec d’autres molécules en formant des liaisons chimiques
Donne moi l’ordre des liaisons chimiques (en ordre croissant)
Interaction hydrophobe, hydrogène, ionique et covalente
Quelles sont les propriétés des liaisons hydrogènes ?
- Cohésion
- Solvant pratiquement universel (sphère)
C’est quoi une liaison hydrogène ?
Interaction faible entre deux molécules polaires (atome d’hydrogène en ligne droite entre deux atomes électronégatifs (F, O, N))
Quels groupements sont responsables du repliement des protéines ?
Les groupements hydrophobes.
Dans un environnement aqueux, les interactions hydrophobes sont…
Des liaisons de Van der Walls avec une composante d’exclusion d’eau.
Comment se forment les chaînes carbonées ?
Avec des liaisons covalentes non polaires.
Vrai ou faux: Les squelettes des macromolécules biologiques peuvent faire des liens avec d’autres molécules.
Vrai
Les chaînes de carbones sont retrouvées sous quelles formes ?
Longues et rectilignes, ramifiées ou cycliques.
Quelles types de liaisons sont formées par les atomes de carbone ?
Simple, double ou triple.
Quels sont les avantages de posséder des liaisons covalentes polaires par rapport aux liaisons covalentes non polaire?
- Plus grande solubilité dans l’eau
- Forment plus de liaisons
- Plus de réactions
Comment la forme d’une macromolécule est déterminée ?
Par la séquence.
Vrai ou faux: La stucture 3D d’une macromolécule est stabilisée par des liaisons covalentes seulement.
Faux. C’est aussi avec des liaisons non-covalentes.
La survie de la cellule dépend de quelles types d’interaction entre les molécules ?
Généralement par des liaisons non covalentes
C’est quoi la complémentarité ?
C’est lorsque deux molécules s’assemblent bien
Donne deux exemples de complémentarité dans le corps
Anticorps et antigène
Acide nucléique et acide nucléique (T-A et C-G)
C’est quoi un acide aminé ?
C’est le module de construction pour la structure primaire des protéines
Quelles types de liaisons unissent les acides aminés ?
Liaisons peptidiques (liens covalents)
Rempli les cases manquantes: une protéine commence toujours par un groupement ______ et se termine par un groupement __________
Amine (N-terminal), carboxyle (C-termional)
Comment les structures secondaires se forment spontanément dans l’eau ?
Grâce aux liaisons hydrogène
Vrai ou faux: les structures secondaires sont les modules de construction de la structure tertiaire
Vrai
Quelle type de structure possède les domaines fonctionnels ?
Structure tertiaire
C’est quoi un domaine fonctionnel ?
Régions ayant des activités enzymatiques et/ou des sites de liaisons pour d’autres molécules
La structure tertaire est formée de…
Hélices et/ou feuillets
La fonction d’une protéine est interprétée par…
Ses domaines
Qu’est ce qui détermine la fonction d’un domaine ?
La forme
Vrai ou faux: un domaine se replie différemment selon le contexte dans lequel il se trouve.
Faux. Il se replie toujours de la même façon, peu importe le contexte.
Quelle structure permet l’interaction entre plusieurs chaînes peptidiques ?
Structure quaternaire
Vrai ou faux: les protéines possèdent toutes une structure quaternaire.
Faux
Qui suis-je? Je permet de séparer différents fragments d’ADN en fonction de leur taille
Électroporèse sur gel d’agarose
Qui suis-je? Je permet de séparer les protéines selon leur taille.
Électroporèse sur gel de polyacrylamide
Vrai ou faux: Les protéines dans le gel de polyacrylamide sont chargées positivement et sont dénaturées
Faux. Elles sont chargées négativement et sont dénaturées
