ENCIMI 1 Flashcards
Kakšne so lastnosti katalizatorjev?
Povečajo hitrost reakcije, tako da zničajo energijsko bariero.
Med reakcijo se ne porabijo in se trajno ne spremenijo.
Ne vplivajo na ravnotežje reakcije ampak le na hitrost s katero se ravnotežje doseže.
Z reaktanti tvorijo začasen kompleks in tako stabilizirajo prehodno stanje.
Razloži pojme holoencim, apoencim, kofaktor, koencim in prostetična skupina.
Holoencim je celoten aktivni encim (encim in kofaktor skupaj). Apoencim je le proteinski del holoencima. Kofaktor je lahko koencim ali kovinski ion. Koencim je organska ali koordinacijska skupina. Prostetična skupina je kofaktor, ki je kovalentno vezan na encim.
Opiši vrsto reakcije, ki jo katalizirajo in napiši klasifikacijsko številko za oksidoreduktaze.
Prenos elektronov, navadno v obliki hidridnih ionov ali vodikovih atomov. Št. 1
Opiši vrsto reakicije in napiši klasifikacijsko številko za transfertaze.
Prenos funkcionalnih skupin z ene na drugo molekulo. Št. 2
Opiši vrsto reakicije in napiši klasifikacijsko številko za hidrolaze.
Razcep vezi s hidrolizo. Št. 3
Opiši vrsto reakicije in napiši klasifikacijsko številko za liaze.
Nastanek dvojnih vezi z odvemom skupin ali dodajanje skupin na dvojne vezi. Št. 4
Opiši vrsto reakcije in napiši klasifikacijsko številko za Izomeraze.
Pretvorba enega izomera v drugega s prenosom skupin znotraj molekule. Št. 5
Opiši vrsto reakicije in napiši klasifikacijsko številko za ligaze.
Nastanek vezi C-C, C-N, C-S in C-O, ki je sklopljen z razgradnjo ATP. Št. 6
Zakaj pri omejenem številu aktivnih mest pride do učinka nasičenja, katera krivulja ga prikaže?
Ker lahko omejeno število aktivnih mest veže omejeno količino substrata in more substrat v presežku priti na vrsto da je lahko vezan. Nastane maksimalna hitrost s katero količina encima pretvarja substrat v produkt. Takrat na reakcijsko hitrost ne vpliva več dodajanje substrata.
Naštej značilnosti aktivnih mest
- Aktivno mesto je specifično (absolutno ali skupinsko).
- Aktivno mesto je majhen delček 3D oblike encima (le nekaj aminokislin).
- Substrat se na encim najprej veže s šibkimi nekovalentnimi interakcijami: hidrofobne interakcije, ionske in vodikove vezi.
Kakšna je naloga encimov kot katalizatorjev?
Da olajšajo nastanek visoko energijskega prehodnega stanja in ga stabilizirajo. Poleg tega poteka še splošna kislinsko bazična kataliza, kataliza s pomočjo kislinskih ionov in kovalentna kataliza.
Od kje energija, ki je potrebna za katalitsko delovanje encimov?
Iz nekovalentnih interakcij med encimom in substratom.
Kako poteka kislinsko-bazična kataliza?
Različne funkcionalne skupine na encimu lahko delujejo kot kisline (COOH, NH3+) ali baze (COO-, NH2) in pomagajo pri prenosu protona ter tako olajšajo razcep vezi. Te skupine so v aktivnem mestu encima, da lahko pride do interakcij s substratom.
Na kakšne načine pomagajo kovinski ioni v encimskih procesih?
- držijo substrat v pravilni usmeritvi s pomočjo koordinacijskih kovalentnih vezi- substrat se lahko veže na zelo specifično mesto
- pospešijo reakcijo s polarizacijo vezi ki se bo cepila ali s stabilizacijo negativnega intermedia
- z reverzibilnim prenosom elektronov med substratom in kovinskimi ioni sodelujejo prioksidoredukcijskih reakcijah
S kakšnimi vezmi se vežejo ireverzibilni inhibitorji?
kovalentnimi ali zelo močnimi nekovalentnimi
