Egzamin Flashcards
Bakterie Gram+ budowa
Mają tylko jedną błonę ale za to ich ściana jest grubsza niż bakterii gram-. Peptydoglikany występujące w ścianie są połączone wiązaniami pentaglicynowymi
Bakterie Gram- budowa
Ma dwie błony - zewnętrzna i wewnętrzną. Zewnętrzna jest połączona ze ścianą peptydoglikanową lipoproteinami. Peptydoglikany występujące w ścianie są połączone wiązaniami bezpośrednimi
Przebieg barwienia grama
- Barwienie podstawowe roztworem fioletu Krystalicznego. Wszystkie bakterie zostają wybarwione na fioletowo.
- Utrwalenie płynem Lugola. Jodyna z fioletem krystalicznym tworzy w komórkach kompleksy krystaliczne fiolet-jodyna
- Odbarwienie alkoholem etylowym - część bakterii się odbarwia a część nie
- Odbarwianie barwnikiem kontrastowym - wybarwienie na czerwono lub różowo bakterii które się odbarwily
Wyniki: bakterie wybarwione na kolor ciemnofioletowy to bakterie Gram+. Bakterie różowe/czerwone to gram-
Skład błony u bakterii pozbawionych ściany komórkowej
Występują sterole w błonie (np. mykoplazmy)
Czym się różni budowa błon u archeonow
-w skład fosfolipidów wchodzi L-glicerol a nie D-glicerol
-wystepuje glicerolo-1-fosforan a nie glicerolo-3-fosforan. Do niego w pozycjach sn-2 i sn-3 są przyłączone rozgałęzione łańcuchy izoprenoidowe
Przebieg koniugacji
- Połączenie dwóch bakterii mostkiem
- Nici plazmidu zostają rozplecione, jedna z nici przekazana zostaje biorcy
- U obu bakterii polimeraza dobudowuje brakujące nici
Przebieg transdukcji
- Bakteriofag infekuje komórkę bakteryjną
- Degradacja bakteryjnego DNA pod wpływem enzymów fagowych
- Replikacja bakteriofaga a następnie składanie fagów potomnych, do główki wirusa może zostać włączony fragment bakteryjny
- Bakteriofag niosący bakteryjny DNA infekuje kolejną bakterie
- Fragment DNA bakterii dawcy homologiczny z genomem bakterii biorcy ulega rekombinacji homologicznej z chromosomem
Przebieg transwersji
- Komórka biorcy pobiera pozakomorkowy fragment DNA ze środowiska
- DNA dawcy rozpoznaje komplementarne zasady DNA w chromosomie bakteryjnym biorcy
- DNA dawcy jest włączany do genomu biorcy na zasadzie rekombinacji homologicznej
Chemotaksja
Bakteria wyczuwając wyższy poziom określonego związku porusza się w jego kierunku bądź też oddala
Ruch przy pomocy rzęsek
- Ruch do przodu - kiedy wszystkie rzęski obracają się w jednym kierunku i bakteria płynie do przodu
- Koziołkowanke - zmiana kierunku obrotu rzęsek przez co komórka koziołkuje w miejscu zmieniając kierunek
Ruch krętek
Ich komórki są srobowato skręcone , rzęski są położone między bloną zewnetrzną i błoną cytoplqzmatyczną, owijają komórki i gdy się kurczą poruszają komórkę do przodu ruchem śrubowym
Ruch ślizgowy
Ruch umożliwiający płynne przesuwanie się po powierzchni, mechanizm nie jest dokładnie poznany. Pomocne mogą być fimbrie które przyczepiają się do podłoża a bakteria porusza się ruchem drgającym.
Komunikacja między bakteriami (Quorum sensing)
Za przeniesienie informacji odpowiadają małe cząsteczki sygnalizacyjne. Zsynchronizowana odpowiedz bakterii zachodzi po przekroczeniu określonego stężenia. Dochodzi do skoordynowanej zmiany ekspresji genów i współdziałania całej populacji bakterii.
Jak wykorzystując system komunikacji bakterii można zapobiec rozprzestrzenianiu się komórek nowotworowych
Po wprowadzeniu do komórek nowotworowych cząsteczkę oznaczającą u bakterii zahamowanie rozprzestrzeniania to te komórki nowotworowe przestały migrować i zaczynały umierać.
Czas generacji
Czas jaki jest niezbędny do podziału bakterii
Fazy hodowli bakteryjnej
- Faza zastoju
Okres początkowy, zanim komórki przystąpią do podziałów w nowym środowisku muszą się zaadaptować do warunków tam występujących - Faza wykładnicza
Faza intensywnych podziałów. Liczba bakterii wzrasta wykładniczo - Faza stacjonarna
Po wyczerpaniu się składników pokarmowych bakterie przestają się dzielić. Dochodzi do zrównania się liczby komórek tworzących się i obumierających - Faza śmierci
Liczba bakterii się tylko zmniejsza.
Jak można wywołać wzrost synchroniczny
Wiedząc że gęstość bakterii zmienia się podczas cyklu komórkowego to można frakcje o różnej gęstości oddzielić przy użyciu techniki wirowania w gradiencie gęstości
Czym jest sporulacja
Proces tworzenia się endospory. najpierw chromosom się podwaja, jego kopie rozdzielają się, jedna z kopii trafia do spory
Tworzenie się endospor
- Po replikacji chromosomu i rozdziale tych chromosomów błona komórkowa Zagłębia się do komórki i zaczyna się tworzyć septa wokół jednego chromosomu która oddziela tą część od reszty komórki
- Po utworzeniu septy blona otocza sporę
- Mureina odkładana jest w postaci grubej warstwy wokół spory. Rozpoczyna się degradacja DNA bakteryjnego.
- Płaszcz białkowy tworzy się wokół mureiny w endosporze
- Bakteria ulega luzie a spora jest uwalniana
Komora Petroff-Haussera
Liczy żywe i martwe komórki, przy użyciu mikroskopu liczymy komórki zawieszone w komorze której objętość jest nam znana
Komora Coultera
Komórki w roztworze soli fizjologicznej przepływają przez aparaturę - prąd zostaje przerwany przy napotkaniu bakterii
Czym są termofile
Charakteryzują się przystosowaniem do życia w relatywnie wysokich temperaturach (optimum między 50-70°C). Należą do nich przede wszystkim bakterie i archeany, istnieją pojedyncze eukarionty zdolne do przetrwania o reprodukcji na dole tego przedziału.
Hipertermofile
Swoje optimum mają wyższe niż 70°C. W tej grupie wyraźnie dominują archeany.
Dlaczego rozwój bakterii na miodzie jest ograniczony?
-niskie pH działa bakteriobójczo a wraz z dojrzewaniem miodu ilość kwasów wzrasta
-wysokie stężenie cukrów - może zabijać organizmy na drodze osmozy
-nadtlenek wodoru wydzielany przez gruczoły gardzielowe pszczoły miodnej ma działanie antybiotyczne
Czym są promieniowce i jakie znaczenie mają w przyrodzie
Bakterie Gram+, występują głównie w glebie, niektóre patogenne, duża różnorodność miejsc występowania.
Ich budowa jest nieregularna, cylindryczna z tendencją do rozgałęziania co upodabnia je do grzybów . Ze splątek nitek powstaje pseudogrzybnia.
Wśród nich są gatunki wchodzące w symbiozę z roślinami i wiążące azot atmosferyczny oraz patogeny zarówno zwierząt jak i roślin.
Dlaczego deinococcus radiodurans jest oporny na UV
Obecność karotenoidów w ścianie komórkowej działa antyoksydacyjnie, zwiększając odporność na promieniowanie jonizujące. Ma też wiele kopii DNA co umożliwia szybką naprawę uszkodzeń
Mechanizmy działania antybiotyków
- Zakłócanie syntezy ściany komórkowej
- Inhibicja syntezy białek
- Zakłócenie replikacji
- Uszkadzanie błony komórkowej
- Zakłócanie funkcji enzymów
Oporność wewnetrzna bakterii:
brak wnikania antybiotyku do G- z powodu obecności błony zewnętrznej.
Mechanizmy oporności bakterii na antybiotyki
-transport aktywny antybiotyku poza komórkę
- zmiana metabolizmu, wytworzenie alternatywnej drogi pozwalającej ominąć etap wrażliwy na antybiotyk
- dezaktywacja antybiotyku- blokada transportu antybiotyku do komórki
-zwiekszenie stężenia inaktywowanego enzymu przez antybiotyk
Mechanizmy oporności na antybiotyki kodowane przez geny plazmidowe
Głównie synteza enzymów które inaktywują antybiotyki
Lub też przez syntezę białek błonowych wypompowują antybiotyku zanim zaczną działać na rybosomy, może też być metylacja rybosomów która nie dopuszcza do wiązania antybiotyków l
Na czym polega unikalny charakter bakterii i archeonów
-asymilacja azotu atmosferycznego
-synteza witaminy B12
-eykorzystanie związków nieorganicznych jako akceptor elektronów zamiast O2
-zdolnosc do intensywnego wzrostu w warunkach beztlenowych
-mozliwosc wzrostu w temperaturach powyżej 80°C
-ściana komórkowa z peptydoglikanu
-rybosomy 70s
Fotoautotrofy
Energia słoneczna wykorzystywana jest w procesie fotosyntezy do wiązania ditlenku węgla.
Fotoautotrofami są bakterie purpurowe siatkowe i bezsiarkowe, siarkowe bakterie zielone, sinice i organizmy, które posiadają chloroplasty sinicowego pochodzenia -glony i rośliny
Fotoheterotrofy
Wykorzystują świtało jako źródło energii ale są niezdolne do asymilacji CO2.
Np. heliobakterie
Jakie organizmu mają zdolność asymilacji azotu atmosferycznego
Bakterie azotowe, często żyją w symbiozie x roślinami lub grzybami, bakterie brodawkowe -Rhizobium to grupa bakterii gram- w symbiozie z roślinami motylkowymi. Powodują powstawanie brodawek na korzeniach tych roślin.
Czym są siderofory i jakie mają znaczenie w środowisku
Chelatują jony żelaza wytwarzane przez wybrane mikroorganizmy. Żelazo jest potrzebne bakteriom do funkcjonowania ponieważ wchodzi w układy enzymatyczne i jest kofaktorem w reakcjach biochemicznych. Żelazo w glebie jest trudne do pobrania przez mikroorganizmy więc wytrwarzają siderofory
Dlaczego wirusy stanowią przedmiot burzliwych dyskusji
Nie do końca rozumiemy w jaki sposób powstały, są trzy teorie:
- powstały z inny organizmów które zainfekowały inne organizmy, uwsteczniły się
- wirusy powstały w tym okresie co bakterie i następnie koewoluowały z innymi organizmami
- teoria ucieczki genów, tzn. wybrane odcinki materiału genetycznego przestały być kontrolowane przez komórkę.
Wirusy nie spełniają podstawowej definicji życia. Są bardziej powszechne niż bakterie
Cykl lizgoeniczny
Nie powoduje śmierci komórki. Bakteriofag wprowadza własne DNA do komórki i DNA faga włącza się do chromosomu i staje się profagiem. Chromosom z profagiem namnaża się.
Cykl lityczny
Bakteriofag wprowadza DNA do wnętrza komórki. Dochodzi do replikacji. Następuje rozpad DNA gospodarza i utworzenie DNA nowych fagów. Dochodzi do transkrypcji i translacji fagowego DNA. Następuje produkcja enzymów powodujących lizę komórki.
Jakie są zmiany/skutki z konwersją lizogenną
W cyklu lizogenicznym wirus jest uśpiony, ale pod wpływem czynników takich jak promieniowanie może się uaktywnić i wejść w cykl lityczny
Schemat ataku bakterii przez wirusa M13
- M13 jest jednym z fagów z kolistym jednoniciowym DNA otoczonym kapsydem i wnika przez sex pilusa do komórki bakterii
- DNA jest zmieniany na dsRF
- Dochodzi do namnażania nici DNA
- Osłonięcie DNA przez białka łącznikowe
- Białka łącznikowe zastąpione zostają przez kapsyd
- M13 opuszcza komórkę bakterii i atakuje kolejne
Jakie organizmu powodują zakwity i gdzie
Zakwit wody jest efektem masowego rozwoju fitoplanktonu - okrzemków, zielenic, sinic, wiciowców, glonów, euglen i innych w zbiornikach wodnych: w jeziorach, stawach, morzach i rzekach. Może też dojść do zakwitu na lądzie ale rzadko.
Związki grzybów z innymi organizmami
1.mikoryza - strzępki grzybki łączą się z korzeniami rośliny. Grzyb dostarcza roślinie soli mineralnych a roślina grzybowi organiczne produkty fotosyntezy
2. Pasożytnictwo - atakują zarówno rośliny jak i zwierzęta
3. Symbioza ze zwierzetami - np. mrówki hodujące grzyby w mrowisku
Cykl wirusa Herpes simplex
- Uśpiony wirus opryszczki lokalizuje się w komórce nerwowej
- Czynniki tj. stres lub choroba mogą aktywować wirusa przez co przemieszcza się on do komórek skóry
- Łączy się on z błoną komórki gospodarza
- Po fuzji z błoną uwalniane jest dsDNA do cytoplazmy a następnie transportowane do jądra
- Replikacja genomy wirusa
- Synteza białek potrzebnych do spakowania wirusa
- Wirus uwolniony z komórki gospodarza
- Uwolnione wirusy infekują kolejne zdrowe komórki
Retrowirusy
1.Rodzina wirusów RNA które przeprowadzają proces odwrotnej transkrypcji
2. Wywołują wiele chorób w tym AIDS, mogą powodować niektóre nowotwory
3. Zbudowane są z dwuwarstwowej błony lipidowej na której obecne są glikoproteiny
4. Pod dwuwarstwa lipifową są położone dwie warstwy białek i kapsyd
5. Wewnątrz kapsydu znajduje się RNA i enzymy
Czym się różni działanie lizozymow od penicyliny
Lizozym wywiera działanie przeciwbakteryjne poprzez destrukcyjny wpływ na ścianę komórkową bakterii. Działanie lizozymu polega na rozrywaniu wiązań glikozydowych pomiędzy NAM a NAG.
Penicilina hamuje biosyntezę peptydoglikanu. Penicilina powoduje uszkodzenia tylko komórek które są w fazie wzrostu
Oddziaływanie mikroorganizmów na skały
-oddzialywanie enzymatyczne - procesy oksydacyjno-redukcyjne i zjawiska przyswajania kompleksów
-oddzialywanie nieenzymatyczne - wpływ produktów metabolizmu bakteryjnego na procesy przekształcania minerałów
Lokalizacja barwników związanych z fotosyntezą u mikroorganizmów
- Bakterie fotosyntetyzujace - różnej wielkości i różnego rodzaju struktury błoniaste
- Bakterie zielone siarkowe - chlorosomy- struktury uformowane w rurki zawieszone w cytoplazmie
- Karotenoidy w chloroplastach i chromatoforach
- Chlorofil a w chloroplastach
Jak określić skład komórki i jej frakcji
Frakcjonujemy składniki komórkowe a następnie poddajemy analizie pod względem biochemicznego składu
Np. poprzez wirowanie różnicujące.
Kolumna winogradskiego (od góry)
Cyjanobakterie
Bakterie heterotroficzne
Bakterie utleniające żelazo
Purpurowe bakterie niesiarkowe
Purpurowe bakterie siarkowe
Zielone bakterie siarkowe
Bakterie redukujące siarczany
Jak wyhodować bakterie beztlenowe
- pobieramy muł z jeziora i umieszczamy w szklanym naczyniu z medium z NH4, K, Mg, Na, Cl, weglan sodu, glicerol o pH 7
-butelka z dostępem do swiatla
-po 2-3tyg pobieramy 1ml i umieszczamy w probówce z 9ml medium z agarem, ekstraktem drożdży, wodoroweglanem sodu i siarczanem (VI) sodu który reaguje i usuwa tlen z probówki - rozcieńczenia
- umieścić w miejscu z dostępem do swiatla
-po czasie można zebrać kolonie bakterii
Budowa rybosomu
Składa się z 2 dopasowanych do siebie podjednostek: małej i dużej, które zbudowane są z białek oraz rRNA. Do złączenia podjednostek dochodzi podczas translacji. Po jej zakończeniu rozdzielają się. W budowie rybosomu wyróżniamy miejsce A i miejsce P które uczestniczą w przyłączeniu tRNA do mRNA oraz miejsce E (wyjścia)
Czym są i gdzie występują Actinobakteria
Grupa bakterii gram+
Patogeny roślin i zwierząt (część z nich jest symbiontami roślin i wiąże azot atmosferyczny)
- występują głównie w glebie, jednak ze względu na zdolność adaptacyjną do warunków środowiska ich zakres występowania jest duży
Znaczenie actinobacterii
-uczestniczą w rozkładzie resztek roślinnych i zwierzęcych, polisacharydów oraz związków trudno rozkładalnych . Rozkładają między innymi chityne
-wytwarzają antybiotyki, syntetyzują pestycydy, insektycydy oraz związki chemiczne o działaniu przeciwwirusowym.
Czym jest ryzosfera
Jest częścią gleby która podlega wpływowi korzeni. Charakteryzuje się wzmożoną aktywnością mikroorganizmów. Różni się od innych części gleby składem pierwiastkowym, a także składem mikroorganizmów. W ryzosferze zachodzi wydzielanie substancji przez korzeń (ryzodepozycja), które przyciągają mikroorganizmy.
Fotosyntezą u bakterii halofilnych
Ich błoną jest pokryta ciemnoczerwonymi plamkami. Błona ta prowadzi charakterystyczny rodzaj fosforylacji. Pod wpływem światła dochodzi do przechowywania protonów, Retina przenosi H+ przez błonę, protony wracają do komórki i generują ATP
Czym się różni oporność od odporności
Odporność wiąże się z systemem immunologicznym, zdolność organizmu do czynnej ochrony przed patogenami
Oporność to po prostu niewrażliwość organizmu na substancje (np. bakterii na antybiotyki)
W jaki sposób uwidaczniały bakterie
Wybarwiający je. Barwieniem prostym bądź też złożonym.
Jest też rozróżnienie na barwienie pozytywne i negatywne. Pozytywne polega na wybarwieniu obiektów które chcemy zaobserwować a negatywne na barwieniu tła
Znaczenie pigmentów u mikroorganizmów
-fotosynteza
-czynnik wirulencji
-ochrona przed szkodliwym działaniem czynników środowiskowych
-do pozyskania żelaza
Fotosynteza u Archea
Możliwa jest dzięki obecnym w purpurowej błonie bakteriorodopsynę i halorodopsynę.
Bakteriorodopsyna pod wpływem światła zielonego zachowuje się jak pompa protonowa dostarczając tym samym komórce energii w postaci ATP.
Halorodopsyna pod wpływem światła zielonego zachowuje się jak pompa chlorkowa a pod wpływem światła niebieskiego jak pompa protonowa
Pozyskiwanie energii u Thiobacillus ferroxidans
Ma zdolność uzyskiwania energii na drodze utleniania jonów żelaza (II)
Organizmy zasiedlające przewody pokarmowe zwierząt
U zwierzat roślinożernych występują bakterie rozkładające celulozę i umożliwiające wchłanianie pokarmu pochodzenia roślinnego
Bakterie metanowe - umożliwiają przeprowadzenie fermentacji w warunkach tlenowych
Bakterie w układzie pokarmowym przeżuwaczy hydrolizują skrobię do maltozy i glukozy
Enterobakterie - fermentacja w warunkach beztlenowych, np. E.coli
Termity mogą trawić celulozę dzięki wiciowcom i bakteriom
Mikroorganizmy glebowe
-odpowiedzialne za obieg materii organicznej, napowietrzenie i poprawę struktury gleby
-zapobiegaja erozji, chronią przed przesuszeniem, biorą udział w rozkładzie pestycydów
-bakterie azotowe -przyswajają azot atmosferyczny i przekształcają w formę lepiej przyswajalną dla roślin
-promieniowce - biorą udział w rozkładzie resztek roślinnych, zwierzęcych, związków trudnorozkładalnych. Istotna rola w uzyznjaniu i mineralizacji gleb
Budowa ściany komórkowej u bakterii
Ściana komórkowa utrzymuje kształt, chroni komórkę
Głównie z peptydoglikanu
Bakterie Gram+ gruba ściana komórkowa
Bakterie Gram- cienka ściana komórkowa znajdująca się pomiędzy błoną komórkową a błoną zewnętrzną
Czasami ściana komórkowa jest otoczona lepką warstwą polisacharydu lub białka
Sposoby sterelizacji
Wyżarzanie
Spalanie
UHT
Parą wodna w podciśnieniu
Biezącą parą wodną
Wyżarzanie
Działanie palnikiem na metalowe przedmioty w celu spalenia komórek drobnoustrojów
Spalanie
Wykorzystywane do całkowitego zniszczenia materiałów
UHT
Krótkie intensywne podgrzewanie i szybkie schładzanie do temperatury pokojowej
Sterylizacja parą wodną w podciśnieniu
Para wodna w krótkim czasie niszczy drobnoustroje koagulując białka, nie jest toksyczna dla środowiska
Sterylizacja bieżącą parą wodną
Trzykrotna sterylizacja parą wodną w 24-godzinnych odstępach, niszczy formy wegetatywne
Z czym związane było powstawanie warstw żelaza utlenionego w skałach
Z cyjanobakteriami, które przeprowadzając fotosyntezę wykorzystywały żelazo (na drugim stopniu utlenienia) jako donor elektronów. Bakterie purpurowe mogły przyczynić się do powstania żelaza na 3 st utlenienia
Czym są endofity
Mikroorganizmy żyjące wewnątrz innych organizmów. Kolonizują tkanki gospodarza nie wywołując objawów chorobowych
Endofity w układzie pokarmowym zwierząt są niezbędne do jego prawidłowego funkcjonowania
Budowa wirusa
-w zależności od rodzaju wirusa - jednoniciowy DNA, dwuniciowy DNA, Jednoniciowy RNA, dwuniciowy RNA
-kapsyd
-niektoee mają dodatkowe struktury pomagające w zakażeniu gospodarza
Cykl replikacyjny wirusa
-Wirus wnika do komórki po odpłaszczeniu uwalniając swój DNA i białka
-enzymy gospodarza replikują genom wirusa
-W tym samym czasie inne enzymy gospodarza przeprowadzają transkrypcje genomu wirusa, powstaje mRNA wirusowe, zostaje wykorzystane do produkcji kolejnych białek kapsydu
-skladanie nowych wirusów
-opuszczanie zakażonej komórki często uszkadzając jednocześnie lub niszcząc komórkę
Do czego służy test Amesa
Służy do wykrywania siły mutagenu. Pozwala określić czy dany czynnik powoduje mutację.
Przebieg testu Amesa
- Dwie probówki z salmonellą z mutacja His. Do 1 dodajemy substancji testowej do 2 nie - próba kontrolna
- Zawartość probówki 1 przekładamy na pożywkę glukozową bez histydyny
- Zawartość probowki 2 przekładany na taką samą szalkę
- Inkubujemy w 37 stopniach przez 2 dni
- Po inkubacji należy zaliczyć kolonie na szalkach
- Na szalce kontrolnej mogą się pojawić kolonie
- Na szalce testowej jeśli są obecne liczne kolonie to wskazuje to na działanie mutagenne substancji. Jeśli jest podobna liczba kolonii jak na szalce kontrolnej to wskazuje to na brak właściwości mutagennych
Kultury wzbogacone
-mają dodatkowe substancje odżywcze, np. krew lub mleko.
-podloze wzbogacone stosuje się do hodowli drobnoustrojów słabo różniących in vitro
Litofit
Roślina naskalna. Roślina glon lub porost rosnący na skałach. Odpowiadają za powstawanie zwietrzeliny skalnej, szczelin i niewielkich ilości próchnicy działając destrukcyjnie na skały
Jakie grupy litofitów się wyróżnia
Egzolitofity - zasiedlają powierzchnię skał
Ryzolitofity - wnikające w powierzchniową warstwę skały
Endolitofity -wrastajace w szczeliny we wnętrzu skał
Chomolitofity - korzystające z warstewki gleby na powierzchni skały
Chasmolitofity - korzystające z gleby powstającej w szczelinach skały
Na czym polega pasteryzacja
Technika konserwacji produktów spożywczych za pomocą odpowiedniego podgrzania. Niszczy formy wegetatywne organizmów ale nie niszczy form przetrwalnikowych ani wirusów
Metody pasteryzacji
1.Najnowsza - mikrofalowe ogrzewanie wolumetryczne
2. Stosowanie niskiej temperatury w krótkim czasie - rozpylanie kropelek w komorze grzewczej
Czym jest Tyndalizacja
Szczególna forma pasteryzacji. 2-3krotnie przeprowadzona pasteryzacja z przerwami w 1-3 dni. Zabija się formy wegetatywne jedną pasteryzacją. Czeka się aż wyrosną nowe z przetrwalników o ponownie przeprowadza się pasteryzację.
W jaki sposób można udowodnić transfer materiału genetycznego u bakterii
Białka z DNA szczepu z otoczką (S) podzielic na dwie probówki. Jedna potraktowana enzymem niszczącym DNA, drugą proteinazami i RNAazami. Każda z nich dodana do probówek ze szczepem R (bez otoczki). W pierwszej probówce tylko typ R a w drugiej S i R
Przykłady symbioz eukariotycznych mikroorganizmów
-Koralowce i tobołki. Tobołki pobierając CO2 do fotosyntezy ułatwiają koralowców tworzenie węglanowych szkieletów
-Termity i wiciowce żyjące w ich jelitach - pozwalają na trawienie celulozy
-symbioxa piewików z grzybami z grupy ascomycota
Ochrona bakterii w warunkach stresu
Ochrona przed wirusami/plazmidami
Ochrona przed antybiotykami
Utrata plazmidów w warunkach stresowych
Wytwarzanie endospor
Ochrona grzybów w warunkach stresu
Trehaloza - uczestniczy w regulacji ekspresji części genów związanych z odpowiedzią na stres
Wytwarzanie form przetrwalnikowych
Synteza pigmentów - karotenoidy chronią przed fotoutlenianiem, melaniny przed stresem środowiska
Gdzie zachodzodzi transport elektronów i synteza ATP u bakterii, roślin i zwierząt
Bakterie:
Transport elektronów w błonie
Synteza ATP zachodzi w wyniku pompy protonowej wbudowanej w błonę
Rośliny:
Transport elektronów w tylakoidach chloroplastów i w błonach mitochondrialnych
Synteza ATP: pompy protonowej w tylakoidach i wewnętrznych mitochondrialnych błonach
Zwierzęta:
Transport elektronów i synteza ATP - wewnetrzne błony mitochondrialne (synteza ATP przez pompę protonową)
Co to izolat aseptyczny i jak go uzyskac
Czysty izolat, pozbawiony mikroorganizmów
Poprzez sterylizacja medium
Cykl retrowirusa (HIV)
- Fuzja wirusa i błony komórkowej, uwalnianie białek i RNA wirusa
- Odwrotna transkryptaza syntetyzuje nić DNA, komplementarną do RNA wirusowego
3.synteza drugiej nici DNA (komp do 1) - Dwuniciowe DNA wbudowane do DNA komórki (prowirus)
- Geny prowirusa ulegają transkrypcji do RNA, które pełni funkcję genomu w następnym pokoleniu
- Pęcherzyki z glikoproteina mi z kapsydami wokół wirusowego genomu i odwrotnej transkryptazy transportowane są do błony komórkowej
- Nowe wirusy odpączkowują od komórki gospodarza
Na czym polegają reakcje redox i czemu służą
Na przenoszeniu elektronów między cząsteczkami chemicznymi, co z kolei prowadzi do zmiany stopnia utlenienia niektórych atomów lub jonów biorących udział w reakcji.
np. procesy fotosyntezy, oddychania komórkowego, korozja metali, fermentacja
W jaki sposób można konserwować żywność
-obrobka cieplna
- suszenie (mogą przetrwać przetrwalniki)
-chłodzenie
-liofilizacja- usuwanie wody z zamrożonego produktu przez sublimację
-peklowanie mięsa za pomocą NaCl i NaNO2
-kiszenie
-pasteryzacja
-tyndalizacja
Na czym polega większą zdolność adaptacyjną bakterii niż organizmów eukariotycznych
-zdolnosc do przetrwania w warunkach ekstremalnych
- mniejszy genom
-brak intronów
-szybkie podziały komórkowe,
-szybsza wymiana genów
Przykłady substratów i produktów w fermentacji
Alkoholowa: glukoza ->etanol
Mlekowa: laktoza -> kwas mlekowy
Octowa: etanol -> kwas octowy
Regulacja negatywna u bakterii na przykładzie operonu laktozowego
Występuje podczas deficytu laktozy. Represor wiąże się z promotorem i blokuje przyłączanie się polimerazy RNA. w momencie dostarczenia laktozy cząsteczka cukru wiąże represor i dezaktywuje go. Polimeraza RNA przyłącza się w miejscu promotora i rozpoczyna transkrypcje genów odpowiedzialnych za rozkład laktozy.
W skrócie: regulacja negatywna polega na przyłączeniu aktywnej formy białka represorowego do operatora uniemożliwiając w ten sposób wiązanie polimerazy RNA i zachodzenie transkrypcji
Bakterie purpurowe i ich różnorodność
Wyróżniamy dwie grupy: siarkowe i bezsiarkowe. Bakterie te mogą występować w gorących źródłach lub gejzerach, w wodzie słodkiej lub słonej, bagnach i mułach dennych.
Tworzą układy ekologiczne z organizmami redukującymi siarczany
Kaulobakterie
Żyjące w oligotroficznych wodach, odgrywają ważną rolę w obiegu węgla. Heterotroficzne aerob.
Sterylizacja za pomocą promieniowania
Naświetlanie za pomocą promieniowania X, gamma, UV. Najczęściej stosuje się UV o długości fali 260nm. Uszkadza kwasy nukleinowe. Bakterie zabija szybko, ale grzyby i ich zarodniki wolno. Używany do sterylizowania pomieszczeń
MIC
Najmniejsze stężenie środka bakteriobójczego hamujące wzrost drobnoustrojów. Można wyznaczyć poprzez seryjne rozcieńczenia na podłożu płynnym bądź stałym
Nitrozobakterie
Bakterie I etapu nitryfikacji
NH4+ ->NO2-
Nitrobakterie
Bakterie II etapu nitryfikacji
NO2- -> NO3-
Grupa Vibrio
Bakterie Gram-
W słonej wodzie
Niektóre są patogenami, niektóre powodują psucie się żywności
Np. przecinkowiec cholery
Symbionty mszyc
Mszyca i buchnera - mszyca żywi się sokiem z roślin, ma niedostatek białek i niektórych witamin. Buchnera syntetyzuje aminokwasy i witaminy, nadmiar aminokwasów wykorzystywany jest przez mszyce. Buchnera od mszycy pozyskuje cukry i proste związki organiczne.
Test fluktuacji
hodowano wiele kultur tej samej bakterii w płynnym podłoży zawierającym tylko sole i glukozę. Następnie wylewano próbki na szalki gdzie to samo podłoże było utwardzone agarem i zawierało czynnik selekcyjny
Gdy pobieranie wiele próbek z jednej kultury to układ liczb mutantów miał kształt Poissina
Takie same probki były pobierane z wielu kultur i wykazywały fluktuacje - na niektórych szalkach pojawiało sienvatxo wiele mutantów. Wyniki indukują że mutantów jest wiele gdzie powstaną i rozmnoza się zanim zadziała czynnik selekcyjny
