Egzamin

Question 1

Jaki % Gatunków to bakterie

Answer 1

78%

Question 2

Czym jest taksonomia

Answer 2

Zasady klasyfikacji istot żywych, poznanie pokrewieństw gatunkow

Question 3

Taksonomia fenetyczna

Answer 3

Opiera się na analizowaniu podobieństw między obiektami

Question 4

Taksonomia filogenetyczna

Answer 4

Oparta na pokrewieństwie

Question 5

Taksonomia integratywna

Answer 5

Łączy klasyfikacje na podstawie cech morfologicznych, genetycznych, geograficznych, ekologicznych i behawioralnych

Question 6

Homologia

Answer 6

Podobieństwo wynikające z wspólnego pochodzenia danych cech

Question 7

Homoplazja

Answer 7

Występowanie podobnych cech u różnych taksonów nie wynikających z pokrewieństwa, wspólny przodek ich nie posiadał

Question 8

Konwergencja

Answer 8

Przystosowanie do warunków życia, jp. Delfin i rekin

Question 9

Parakelizm

Answer 9

Cechą podała niezależnie u blisko spokrewnionych gatunki

Question 10

Rewersja

Answer 10

Cechą która odwróciła do stanu wyjściowego, utrata skrzydeł u owadów

Question 11

Analogia

Answer 11

Podobne cechy wypełniają te same funkcje

Question 12

Gatunki bliźniacze

Answer 12

Blisko spokrewnione, morfologicznie nierozróżnialne, ale izolowane rozrodczo. Np. słoń afrykański i słoń leśny

Question 13

Kompleks gatunków

Answer 13

Niewielka zmienność genetyczna ale duża morfologiczna

Question 14

Holotyp

Answer 14

Okaz na podstawie którego opisano gatunek

Question 15

Paratyp

Answer 15

Inne egzemplarze opisywanego gatunku

Question 16

Allotyp

Answer 16

Egzemplarz płci przeciwnej

Question 17

Neotyp

Answer 17

Nowy wzorzec

Question 18

Jaki % sekwencji w jądrowym DNA to sekwencje kodujące

Answer 18

25%

Question 19

mtDNA

Answer 19

• Mniejszy niż jądrowy (zwykle ok. 20tys pz)
• jedna kolista cząsteczka
• w wielu kopiach
• brak sekwencji niekodujących
• nie podlega rekombinacji
• haploidalny

Question 20

Izolacja DNA

Answer 20

• homogenizacja próbek
• liza błon komórkowych jądrowych i organellowych
• usunięcie białek, RNA i innych zanieczyszczeń
• wytrącanie DNA
• zagęszczenie

Question 21

Co się składa na mix do PCR

Answer 21

• mieszanina dNTP
• startery
• bufor
• woda molekularna
• polimeraza

Question 22

Sekwencjonowanie nowej generacji etapy

Answer 22

Izolacja
Stworzenie biblioteki
Amplifikacja matrycy
Masowe równoległe sekwencjonowanie

Question 23

Czym jest drzewo filogenetyczne

Answer 23

Graf przedstawiający ewolucyjne zależności między sekwencjami lub gatunkami

Question 24

Elementy drzewa

Answer 24

• korzeń
• gałęzie
• węzły wewnętrzne ( przodkowie)
• węzły terminalne (taksony żyjące obecnie)

Question 25

Ewolucja mozaikowa

Answer 25

Ewolucja cech w różnych tempach w obrębie danej linii filogenetycznej, organizm nie ewoluuje jako całość

Question 26

Gatunki pierscieniowe

Answer 26

Sąsiednie populację są blisko spokrewnione, najdalsze różnią się na tyle, że nie mogą się krzyżować

Question 27

Gatunek genetyczny

Answer 27

Zbiór genetycznie izolowanych populacji osobników wzajemnie się krzyżujących.

Question 28

Gatunek ekologiczny

Answer 28

Grupa organizmów przystosowanych do zajmowania określonej niszy

Question 29

Pojęcie ewolucyjne gatunku

Answer 29

Linka która ewoluuje w oddzieleniu od innych, mając swą własną funkcję i tendencje ewolucyjne. Gatunek jest linią rozwojową

Question 30

Pojęcie filogenetyczne gatunku

Answer 30

Grupa monofiletyczna wywodząca się od wspólnego przodka, gatunek jest wynikiem ewolucji. Stanowi najmniejsza grupę populacji, które rozróżnić można pośród innych przez zestaw unikalnych morfologicznych i genetycznych cech

Question 31

Węzeł terminalny drzewa

Answer 31

Istnieje współcześnie

Question 32

Węzeł wewnętrzny drzewa

Answer 32

Takson przodków

Question 33

Gałąź drzewa

Answer 33

Rozmiar zmian genetycznych

Question 34

Korzeń drzewa

Answer 34

Wspólny przodek

Question 35

Politomia

Answer 35

Powstaje gdy brak jest synapomordii łączących pary taksonów; taksony ewoluowały tak szybko, że nie zdążyły się wytworzyć żadne synapomorfie łączące je w pary

Question 36

Drzewo addytywne

Answer 36

Odległość między dwoma dowolnymi węzłami równa się sumie długości wszystkich łączących je gałęzi

Question 37

Paralelizm

Answer 37

Równoległy rozwój tej samej cechy w dwóch bliskich grupach filogenetycznych, wynika z genetycznej bliskości gatunków

Question 38

Metoda łączenia sąsiadów

Answer 38

Łączenie razem taksonów które dzieli najmniej zmian

Question 39

Zalety i wady metod odległościlwych

Answer 39

Zalety:
Metoda szybka i prosta
Akceptuje linie wykazujące różne tempo ewolucji
Dychotomiczne drzewo
Wady:
Inf z sekwencji jest zredukowana
Daje 1 możliwe drzewo
Silnie zależy od rodzaju zastosowanego modelu ewolucji

Question 40

Parsymonia

Answer 40

Poszukiwanie drzew lub drzew o najmniejszej liczbie zmian, analizowane są tylko miejsca zmienne. Pomijane są cechy występujące tylko w jednym taksonie

Question 41

Zalety i wady parsymonii

Answer 41

Zalety:
Jedyna w pełni kladystyczna metoda
Sprawdza różnorodne drzewa
Wady:
Nie wykorzystuje pełnej informacji z sekwencji
Nie zakłada modelu ewolucji
Nie daje inf o długości gałęzi

Question 42

Metoda największej wiarygodność

Answer 42

Poszukiwanie drzewa, które zgodnie z określonym modelem ewolucji maksymalnie uwiarygadnia dane

Question 43

Zalety i wady metody największej wiarygodności

Answer 43

Zalety:
Sprawdza różne topologie
Używa całą informacje
Wady:
bardzo wolna
Rezultaty zależą od zastosowanego modelu ewolucji

Question 44

Metoda bootstrap

Answer 44

Symuluje powtarzanie zbierania danych.
Jeśli informacja filogenetyczna zawarta jest w wielu miejscach sekwencji to wartości bootstrap będą wysokoe

Question 45

Modele ewolucji sekwencji

Answer 45

• określają sposób w jaki obliczana jest długości gałęzi
• długość gałęzi obrazuje rozmiar zmian genetycznych między przodkami a potomkami
• wpływają na topologię drzewa