Domande da esami Flashcards
Concentrazione del calcio nei vari dipartimenti e canali
particolarità del mitocondrio riguardo l’omeostasi del calcio ed enzimi calcio-dipendenti
Meccanismi di signalling per l’aumento del calcio nel mitocondrio e
Ionotropico e metabotropico, calcium-induced calcium-release
Tipi di canali per il calcio sulla membrana
ligando, depositi, voltaggio
Tipologie di proteine fluorescenti
Proteine estratte da meduse, luciferasi
SOCE
Hanno fatto esperimenti siRNA, STIM1 e ORAI
o Quando il calcio va nel citosol, può causare del signalling? Nei linfociti basso segnale ad alta frequenza causa attivazione calmodulina-calcineurina-NFAT-IL2, alti segnali a bassa frequenza attiva GSK-inattiva NFAT e poi attiva Nfkb-IL8
Varianti di GFP: quali sono e perché sono state create?
Per non avere sovrapposizione di spettro, per ottenere il meccanismo FRET e creare il saggio della PKA (si legano un fluoroforo rosso alla sub catalitica e uno verde alla sub catalitica, quando PKA viene attivata da AMPc, le sue estremità si allontanano e si vede fluorescenza rossa)
- Differenze tra pompa ATPasica sull’ER e sulla membrana?
PMCA e SERCA: serca si serve di una proteina ausiliare per l’attivazione mentre pmca usa il calcio e la calmodulina. Comunque serca si può anche attivare con il calcio però tendenzialmente è meglio che venga regolata da una proteina ausiliare perché nei cardiomiociti se fosse attivata dal calcio sarebbe sempre attiva
- Proteine con meccanismo di auto-inibizione?
Calcineurina e PMCA
- Vie di utilizzo di calcio nel citosol?
Può essere pompato nel reticolo o estruso fuori dalla cellula tramite PMCA. Il segnale del calcio può essere usato dalla calmodulina o dalla troponina o paravalbumina (3 EF hands, è un tampone che quindi lega il calcio per abbassare la sua concentrazione intracellulare)
- Come può essere utilizzato il calcio che è nel reticolo?
Rilasciato attraverso recettori canali per l’IP3 entra nel mitocondrio:
o VDAC
o MCU: concentrazione minima di 20 μM
- Differenza tra omeostasi del calcio e segnali generati dal calcio e segnali per il calcio?
Segnali dal calcio = aumento di concentrazione di Ca nel tempo
Segnali per il calcio = segnali che causano l’apertura e chiusura dei canali calcio
o Tipi di domini che legano il calcio: calmodulina (EF hands)
- Come deve essere fatta una sonda per un qualsiasi processo?
Serve un sensore (nella maggior parte dei casi la calmodulina) e un reporter (proteine fluorescenti come YFP)
o Esempio di sonda: ho due proteine distanti eccitate a due lunghezze d’onda differenti, quando eccitate si vede l’emissione di una. Quando sono vicine, dato che la lunghezza di emissione di una corrisponde alla lunghezza di eccitazione dell’altra, si ha emissione della seconda sonda
o Svantaggi: serve un ripiegamento preciso che in spazi cellulari piccoli o ambienti aggressivi non è detto che si riesce
o In che dipartimento funzionano molto bene: mitocondrio, tipo FURA
o Vantaggi FURA: è raziometrica
