Domande

Question 1

Descrivi il meccanismo di HIF-alfa e pVHL

Answer 1

La prolina-idrossilasi è l’enzima che idrossila la prolina di HIF-alfa, fattore che agisce su geni che favoriscono l’approvvigionamento di ossigeno, tra cui il gene responsabile della produzione di eritropoietina (gene che aumenta il numero di globuli rossi) e quelli coinvolti nella stimolazione dei glomi carotidei. HIF-alfa con proline idrossilate viene riconosciuto da pVHL, che lo conduce al proteasoma
Per cui
Normale ossigenazione -> degradazione HIF-alfa e diminuzione ossigeno nel corpo
Mancanza di ossigeno -> HIF-alfa porta un aumento di ossigenazione

Question 2

alfa elica destrogira in ramachandran

Answer 2

phi= -57°;

psi=-47°

Question 3

alfa elica e beta sheet in ramachandran

Answer 3

alfa elica psi circa 50/60

beta foglietto circa 120°

Question 4

Meccanismo di blocco dell’ATP sintasi

Answer 4

HIF, un peptide ad alfa-elica può bloccare ATP sintasi: contiene acidi glutammici che a pH neutro sono carichi negativamente e possono rompere la struttura ad alpha elica. Quando il PH si abbassa (assenza di ossigeno) le cariche negative si protonano perdendo la repulsione di carica e si ha l’attivazione di HIF e il blocco dell’ATP sintasi.

Question 5

Di cosa è indice il metionin sulfossido?

Answer 5

Invecchiamento cellulare e degradazione

Question 6

Definizione di TURN

Answer 6

Inversione di direzionalità

Question 7

Definizione di LOOP

Answer 7

Struttura disordinata, ad ansa, lunga anche 15 amminoacidi

Question 8

Definizione di DOMINIO

Answer 8

Porzione della proteina con una propria identità funzionale e strutturale, che può essere denucleata dalla proteina

Question 9

Definizione di SUBUNITà

Answer 9

Catena polipeptidica più o meno ordinata, con una propria estremità N terminale e C terminale

Question 10

Struttura supersecondaria/ motivo/ ripiegamento

Answer 10

Riavvolgimento polipeptidico caratteristico, formato da 2 o più elementi di strutture secondarie e dalle loro connessioni

Question 11

Esperimento di Anfisen

Answer 11

Ribonucleasi denaturata (calore o urea?)
Poi messa in freezer (o tolta l'urea) -> rinaturazione
Tutte le proteine potenzialmente possono rinaturarsi, ma solo le più piccole e intrinsecamente stabili lo fanno

Question 12

CICLOSPORINA

Answer 12

Farmaco inibitore della prolina isomerasi: agisce sulle cellule immunitaria riducendo la capacità di ottenere strutture efficienti, inibendo l’enzima che favorirebbe il folding.

Question 13

SINUCLEINA

Answer 13

Native unfolded protein, trasportatore/mediatore neuronale. Si accumula nei corpi di Lewy (ha una resa del 10% circa)