DNA und RNA Flashcards
Die Helixstruktur wiederholt sich alle ……, eine Windung der Helix umfasst ….. Basen.
Die einzelnen Basen sind um …… gegeneinander verdreht.
3,4 nm
10
36grad
Purin Basen?
Pyrimidin Basen?
Purin: Adenin, Guanin
Pyrimidin: Cytosin, Uracil, Thymin
A zu T oder G zu C = 1
A zu G = variiert
Wasserstoffbrückenakzeptor der kleine Furche?
Wasserstoffbrückendonator?
Das N-3 von Adenin und Guanin sowie das O-2 von Thymin und Cytosin
Die Aminogruppe am C-2 von Guanin
Vergleich von A-, B- und Z-DNA:
Höhe pro Basenpaar:
Drehsinn:
Anzahl der Basenpaare pro Helixwindung:
Große Furche:
Kleine Furche:
Höhe pro Basenpaar:
A: 0,23 nm
B:0,34 nm
Z: 0,38
Drehsinn:
A und B: rechtsgängig
C: linksgängig
Anzahl der Basenpaare:
A: 11
B: 10,4
Z: 12
Große Furche:
A: eng und sehr tief
B: breit und ziemlich tief
Z: flach
Kleine Furche:
A: sehr breit und flach
B: eng und ziemlich tief
Z: sehr eng und tief
Schmelztemperatur?
Ist definiert als diejenige Temperatur, bei der die Helixstruktur zur Hälfte verloren gegangen ist.
Hypochromie?
Die innerhalb der Helix dicht gepackten Basen absorbieren weniger UV-Licht als die lockerer gepackten in einem Einzelstrang. Das Schmelzen von Nucleinsäuren lässt sich daher gut anhand der Extinktionsänderung bei 260nm verfolgen.
Tautomerie von Uracil?
Lactam ( Uracil): 6 Ring, 2 NH, 1 DB, 2 =O
Zu
Lactin: 6 Ring, 1 NH, 1 N, 2 DB, 1 OH, 1 =O
Zu
Double Lactim: 6 Ring, 2 N, 3 DB, 2 OH
Pattern von Basenpaare in kleiner Furche und große Furche?
Große Furche: G: H- bond acceptor C: H- bond donor A: H-bond Donor T: H- bond acceptor
Kleine Furche:
G-C: H-A, H-D, H-A
A-T: H-A, hydogen atom, H-A
Unusual DNA Struktur??
Palindrome:
Hairpin, cruciform,
Mirror repeat
Triplex DNA: in der großen Furche (N6,7 ,O6 Hoogsteen base pairing)
Guanosin tetraplex: parallel, antiparallel
H-DNA: lange Polypyrimidine oder Polypurine mit spiegelwiederholung
Die vier doppelsträngigen Bereiche der tRNA?
3’-CCA-Ende: Akzeptorstamm
T¥C-Schleife:
Ribothymin-Pseudouracil- Cytosin
Extraarm: enthält variable Anzahl von Resten
DHU-Schleife: mit mehreren Dihydrouracilbausteinen
Anticodonschleife
Verdichtung der DNA?
- DNA: 2 nm
- Nucleosom: 11 nm
- Fiber: 30 nm
- Verlängerte Form der DNA: 300 nm
- Condensed (Verdichtung) der Chromosome: 700 nm
- Chromosome: 1,400 nm
Condensed chromosome structure is maintained by SMC proteins, what are they?
SMC have 5 domains N and C domains form ATP-binding site Two major types: -cohesin-help link sister chromatids -condensins-help chromosomes to condense (create positive supercoil)
Woraus besteht Chromatin?
Aus sich wiederholenden Einheiten, die jeweils 200 bp der DNA sowie je zwei Exemplare von H2A, H2B, H3 und H4 enthalten.
Was ist Nucleosomen-Core-Partikel?
Kleiner Komplex aus einem Histonoktamer und dem 145 bp langen DNA-Fragment
Wie heißt die DNA, die einzelnen Core-Partikel verbindet?
Linker- oder Verbindungs-DNA
