DNA Replikation

Question 0

Replikationsmekanisme

Answer 0

Initiatorproteiner binder til DNA og adskiller de to strenge i replikationorigin (AT strækninger)
Replikationsgaflen dannes ved hvert origin og bevæger sig hver deres vej
helicase river strengene fra hinanden i hver sin retning ved hydrolyse af ATP,
single strand protein forhindre de to strenge i at binde igen
RNA polymerase danner primer så dna polymerase kan bindes. Holdes fast med sliding clamp som loades ved brug af ATP af clamploader
Dna polymerase syntetisere ny streng
Nukleaser klipper primer af, repair polymerase påsætter DNA, ligase limer 5’ til 3’ enden

Sker kontinuerligt på leading strand, men med backsting og mange primere på lagging strand(okazaki fragmenter).

Question 1

Dna polymerase funktion

Answer 1

Producere nye komplementære strenge til hverdag de to template. Kan kun ske i 5’-3’ retningen

Question 2

Telomerase funktion og betydning

Answer 2

Ved enden på lagging strand kommer telomerase indeholder RNA template så laggingstand forlænges med gentagen sekvens (telomer), som kan fungere som template for det sidste stykke. Sørger for at det sidste stykke på hvert kromosom ikke mistes hver gang, og for at være en gentagen sekvens som markere enden af et kromosom (som altså ikke er ødelagt)

Question 3

Hvordan kan mutationer opstå

Answer 3

Mismatch af baser af dnapolymerase
Depurination g/a =o erstattes af OH
Tab af base

Deamination en bases (ofte cytosin->uracil) aminogruppe udskiftes med =o
5-methyl cytosin -> uracil

Thymindimer ultraviolet lys

Double strand break ved ioniserende stråling

Højaktive radikaler ros(reaktive oxygen species)

Question 4

Proofreading

Answer 4

Dna polymerase tjekker at de baser der lige er parret matcher før den påsætter den næste. Hvis ikke den matcher klipper den af og prøver igen. En fejl pr 10^7

Question 5

Mismatch repair

Answer 5

Retter evt fejl som dna polymerase har overset. Et kompleks af mismatch proteiner genkender mismatch, fjerner nye streng (genkendes ved nicks, små single strand breaks) og resyntetisere den. En fejl pr 10^9

Question 6

Excision repair

Answer 6

Ved DNA der er ødelagt i en streng

1. Ødelagt dna genkendes og fjernes, af f.eks nucleaser
2. Repair polymerase binder til 3’ (hydroxy) enden og udfylder hullet ved at lave komplementær kopi af ikke ødelagte streng (5-3 retning og incl Proofreading)
3. Sidste binding i backbone limes af DNA ligase

Question 7

Dna reparation recombination

Answer 7

Ved dobbeltstrand break
Nonhomolog: brækkede ender klipper af og resten limes
Homolog: kun lige efter replikation
Nukleaser nedbryder 5’ enderne
Strandinvasion, intakt åbner sig og den ene ødelagte streng krydser ind over og laver komplementær baseparing. Invandring strand forlænges af repair dna polymerase ved at bruge den anden som template. Krydsstedet migrere, som nogle basepar brydes mens nye dannes. Færdiggøres ved dna syntese og limes