רפליקציה של DNA Flashcards
DNA polymarse
אנזים מסנתז DNA.
יכול אך ורק להאריך גדיל קיים
RNA polymarse
אנשים מסנתז RNA.
יודע לסנתז יש מאין
Nuclease
אנזים ששובר קשרים פוספודיאסטרים בין נוקלאוטידים
גם דנא וגם רנא.. אלא אם צוין אחרת דיאוקסי\ריבו
Exo nuclease
אנזים ששובר קשרים פוספודיאסטרים בין נוקלאוטידים מבחוץ (צריך פתח\ניק)
פול 1 בנוי מחלבון אחד עם שלושה חלקים בעלי תפקידים שונים
polymerase
3 to 5 exonuclease
5 to 3 exonuclese
תפקיד פולימראז
יכולת סנתוז
פולימרזות מתחברות לקצה 3
תפקיד 3 ל5 אקסונוקלאז
לגזור את קצה 3
הולימראז חוזר אחורה, מסיר נוקלאוטיד שגוי וממשיך בסנתוז DNA.
תפקיד 5 ל3 אקסונוקלאז
מתקן את מה שכבר סנותז. אם אין אותו האנזים לא יכול להתחיל מניק..
*יכול להחליף מקטע של נוקלאוטידים קיימים תוך כדי סנתוז
פול 3
האנזים העיקרי שמסנתז - הוא פרוססיבי מאוד
Origin of replication
רפליקציה של DNA מתחילה מ- ORI
DNA a
בהתחלה מגיעים חלבונים אלו, יודעים להיקשר אחד לשני. נקשרים ויוצרים לולאה שיוצרת מתח על הדנא וכך גורמים להתרת שני הגדילים
DNA b
הליקאז
בנוי משש תת יחידות בצורה של גלגל, כל גלגל עולה על אחד הגדילים שנפתחו ומתקדם לכיוון אחר כדי להתיר שאר דנא. בעזרת השקעת אנרגיה.. על כל קשר - ATP אחת.
DNA c
דנאb מגיע עם חלבון c, התפקיד של c הוא שb לא יעבור אינטרקציה עם שום גורם בתא אלא רק ברפליקציה.
SSB
חלבוני SSB יודעים להיקשר לDNA חד גדילי.
מונעים מהדנא להיסגר בחזרה על עצמו
והגנה- מולקולה חד גדילית זה סימן לוירוס, ויש סיכוי שמנגנוני הגנה יפגעו בו.
RNA פולימראז
שלב ראשון של רפליקציה - להתיר מולקולות DNA ולהניח תחל
RNA פול מניח פריימר בשביל פול 3 שיתחיל לסנתז….
פרימז = רנא פולימרז. (לא אותו אחד שעושה שעתוק… הוא מתמחה רק בריפליקציה)
Leading strand
הגדיל המוביל. נקרא מ3 ל5, פול 3 מסנתז אותו מ5 ל3.
הסינתוז בכיוון מזלג הריפליקציה
Lagging strand
הגדיל המתעכב. נקרא מ5 ל3, בגלל שצריך לסנתז מ3 ל5 ואין כזה אנזים => פול 3 מסנתז בקטעי אוקזקי לכיוון ההפוך.
לכל מקטע מגיע RNA פולימראז שמניח תחל של RNA ובין כל מקטע נוצר ניק.
בעיות במקטעי אוקזקי
נוצרו לנו בדנא מקטעי רנא (בגלל פרימאז)
ליגאז
אנזים שעושה הלחמה של שבר שנעשה בנדא. מחבר בין קצה 5 חופשי לקצה 3 חופשי. הוא זקוק לATP לפעילות שלו.. הפעילות שלו בעיקר במקטעי אוקזקי.
ניק
שני נוקלאוטידים סמוכים שאין ביניהם קשר פוספו-די-אסטרי, יש רק חוסר בקשר ביניהם.
אם יש רק ניק – ליגאז מתקן.
גאפ
מקטע חסר בנוקלאוטידים.
דנא פולימראז 1 יבוא ויתקן אבל הוא יתקן בעזרת אקסונוקליאז 5 ל3.