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Microbiologie et Infectiologie > Détection des micro-organismes > Flashcards

Détection des micro-organismes Flashcards

1
Q

Quel est le type d’observation fait avec l’image 1?

A

Observation directe (microscopie)

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Q

Quel est le type d’observation fait avec l’image 2?

A

Observation indirecte

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3
Q

Quel est le terme désignant l’observation des propriétés?

A

phénotypage (de moins en moins utilisé)

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4
Q

Quels sont les avantages (2) de l’observation indirecte?

A

+ quantitatif

+ précis

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5
Q

Quel sont les termes (2)désignant l’observation indirecte?

A

génotypage

séquençage

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6
Q

On observe quoi par phénotypage et exemples?

A

micro-organisme

  • mycètes
  • PAS virus
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7
Q

On observe quoi par génotypage?

A

ADN/ARN

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8
Q

Pourquoi utilise-t-on la phylogénétique?

A

retracer l’origine historique d’une maladie

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9
Q

Que voit-on en microscopie?

A

forme de bactéries isolées

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10
Q

Que voit-on en macroscopie (3)?

A

apparence
couleur
odeur des colonies

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11
Q 
Image 3 : Donnez un exemple de ;
- Coccus
- Bacillus
- Vibrio
- Spirillum
- Spirochete
Quelle forme représente :
- Coccobacillus
- Fiform bacillus
A
  • Staphylococcus aureus
  • E.colis
  • V. cholerae
  • Famille des Spirilaceae
  • Treponema palidium
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12
Q

Qu’observe-t-on au microscope d’échantillons frais (3 ex.)?

A

sang
urine
salive

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13
Q

Caractéristiques des échantillons frais (3)?

A
  • viable seulement quelques heures
  • aucune fixation possible
  • peu sensible
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14
Q

Que nécessite la coloration? ce qui a pour conséquence?

A

fixation

tue l’échanillon

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15
Q

Qu’est-ce qu’une coloration simple?

A

1 seul colorant

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16
Q

Quel colorant a été utilisé dans l’image 4?

A

bleu de méthylène

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17
Q

Qu’est-ce que la coloration négative?

A

pénètre seulement certaines batéries

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18
Q

Quel colorant a été utilisé dans l’image 5 + c’est quoi?

A

encre de chine

Klebsiella pneumonia

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19
Q

Que représente l’image 6?

A

Francisella tularensis

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20
Q

Pour quelle bactérie est-il utile d’utiliser l’encre de chine?

A

avec une capsule protectrice

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21
Q

Quel colorant a été utilisé dans l’image 7 + c’est quoi?

A

bleu de méthylène

Yersina pestis

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22
Q

Pourquoi utilise-t-on la coloration acido-alcoolo-résistante? + quelle méthode utilise se principe?

A

certains micro-organismes résistent à la décoloration

- Ziehl-Neelsen

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23
Q

Quelle coloration est représentée par l’image 8?

A

Ziehl-Neelsen

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24
Q

Qu’est-ce que la coloration diférentielle?

A

plusieurs colorant sont utilisés

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25
Q

Quelle coloration différentielle est la plus utilisée en laboratoire + sa fct?

A

Gram

- sépare 2 groupes majeurs de bactéries (Gram + et Gram -)

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26
Q

Quelle est la fct des colorations fluorescentes?

A

font intervenir des AntiC

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27
Q

Nommez 1 gram +

A

Staphyloccocus aureus

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28
Q

Nommez 1 gram -

A

E. coli

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29
Q

Expliquez les 4 étapes de la coloration de Gram.

A

Image 9

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30
Q

Quelle est la différence entre gram + et gram -?

A

gram + : paroi de peptidoglycan

gram - : membrane externe (absente chez gram +)

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31
Q

Comment seront coloré les Gram + vs les Gram -

A

gram + : violet

gram - : rose

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32
Q

Que voit-on sur l’image 10?

A

bacilles gram -

coques gram +

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33
Q

Que représente l’image 11? (coloration, intervention, décrire intervention, maladie)

A

coloration gram
ponction lombaire
prélèvement du LCR
méninite

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34
Q

Que représente l’image 12? (coloration, bactérie, lieu)

A

coloration gram
Staphylococcs aureus
écoulement d’une plaie

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35
Q

Que représente l’image 13 + but?

A

1ère étape cas clinique diarrhée sanglante chez un boucher : coloration de Gram sur prélèvement de selles
- voir s’il y avait une espèce prépondérante (ce n’est pas le cas)

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36
Q

Quelle est la limite de la 1ère étape fait sur l’image 13?

A

ne montre pas l’agent éthiologique (trop de sortes de bactéries (normal dans la flore intestinale)

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37
Q

Que représente l’image 14 + que découvre-t-on à fort grossissement?

A 
Observation des selles à l'état frais
-formes ciliées de grande taille
-forme onlongue
-très mobile
Balantidum coli (protozoaire)
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38
Q

Avantage de l’état frais vs fixation de coloration?

A

voir la mobilité des bactéries

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39
Q

Que représente l’image 15?

A

3ème étape du cas clinique de la diarrhée sanglante chez un boucher : biopsie de régions nécrosées de la muqueuse intestinale

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40
Q

B. coli

  • mode de transmission?
  • cause quoi?
  • traitement?
  • lieu (géographique)?
A
  • fécale-orale depuis le porc
  • ulcérations de l’intestin
  • pls antibiotiques (dont les tétracyclines)
  • balantidiase est distribuée mondialement
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41
Q

Qu’est-ce que le biotypage + 8 ex.?

A

classification par caractéristiques physiologiuqes et métaboliques

  • source de carbone
  • source d’énergie
  • produits de fermentation
  • T optimales de croissance
  • mobilité
  • tolérance osmotique
  • croissance en milieu avec oxygène ou sans
  • optimum de pH de croissance
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42
Q

Nommez 2 ex. de milieux de cultures expériementaux.

A

liquide

semi-solide

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43
Q

Milieu minimal vs complexe

A

minimal : cible les éléments minimals pour qu’un seul type de bactérie vie (on connait la composition)
complexe : contient le maximum de nutriment pour la croissance de pls type de bactéries (on ne connait pas exactemen tout ce qu’il contient)

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44
Q

Qu’on en commun toutes les bactéries pathogéniques?

A

elles sont toutes hétérotrophes

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45
Q

Définir hétértrophe.

A

ne peut fabriquer lui-même tous ses constituants (doit utiliser de la matière organique exogène)

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46
Q

Terme pour présence d’oxygène requise?

A

aérobie obligatoire

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47
Q

Terme pour vie en absence d’oxygène?

A

anaérobie obligatoire

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48
Q

Terme pour vie avec ou sans oxygène?

A

anaérobie facultative

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49
Q

Définir facteurs de croissance.

A

substances que les bacteries sont incapables de synthétiser :

  • les vitamines
  • les aides aminés
  • les bases purines
  • les bases pyrimidines
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50
Q

Comment détermine-t-on le type de respiration d’une souche de bactérie?

A
  • Création d’un milieu semi-solide contenant un gradient en oxygène
  • Ensemencement sur toute la longueur du gradient
  • Observation de la croissance bactérienne
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51
Q

Expliquez l’image 16.

A
  • A Colonies dans tout le tube : bactéries aéro-anaérobies
  • B Colonies en haut du tube : bactéries aérobies strictes
  • C Colonies en haut du tube, légèrement sous la surface : bactéries micro-aérophiles
  • D Colonies en bas du tube : bactéries anaérobies strictes
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52
Q

Autre nom donné à la classification par sérotypage?

A

Antibiogramme

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53
Q

Comment la détection pour la classification par sérotypage se fait-elle? (2)

A

Western (immunobuvardage)
ou
ELISA

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54
Q

Quel est le type de classification qu’est le test de diffusion + caractéristique première de ce test?

A
  • susceptibitilé aux antibiotiques

- surtout qualitatif

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55
Q

Que représente l’image 17? (voit quoi, indique quoi, que représente les contours visibles, que dire de celle sans contour, limite du test)

A
  • 5 antibiotiques différents
  • Si la bactérie est sensible, elle ne pourra pas croître ds cette région
  • Il y a un gradient de concentration autour du médicament qui forme une zone de non-croissance
  • 1 seul qui n’est pas efficace
  • Indique seulement si elle est sensible ou non, n’indique pas vraiment la qté necessaire
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56
Q

Que représente l’image 18?

A

analyse automatisée d’un test de diffusion (susceptiblité aux antibiotiques)

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57
Q

Que représetent les images 19 et 20?

A

Test pour détermier la concetration minimal inhibitrice (CMI=MIC)
- approximation de la zone de concentration pour qu’une bactérie ne vive pas

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58
Q

Expliquez l’image 21.

A 
Sulfonamide et triméthoprime ont un effet synergique sur E. coli (il y a une zone ou seul chacun des médicaments ne 
serait pas suffisant
contre la bactérie, mais les 2 ensembles
ils ont un effet sur la
bactérie)
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59
Q

Définir synergie.

A

l’activité d’une drogue augmente celle d’une autre drogue

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60
Q

Définir antagonisme.

A

une drogue inhibe l’action d’une autre drogue

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61
Q

Expliquez l’image 22.

A

La nitrofurantoïne inhibe l’activité de l’acide nalidixique

62
Q

Nommez 4 ex. de tests biochimiques pour la classification des MO.

A
  • analyse des a.gras de la paroi bactérienne par chromatographie
  • analyse des lipides totaux
  • analyse des protéines par spectroscopie de masse (mass spectroscopy)
  • analyse des caractéristiques de certaines enzymes
63
Q

Nommez 2 caractéristiques de Staphylococcus aureus

A
  • sphérique

- gram +

64
Q

Quel est un des tests principaux pour identifier les bactéries (biochimique)?

A

test de catalase

65
Q

Quelles bactéries possèdes l’enzyme catalase?

A

toutes les aérobiques et aérobiques facultatives

66
Q

Rôle de l’enzyme catalase + avantage pour la bactérie?

A
  • dégrader des réactifs oxygènes toxiques dont le peroxyde d’hydrogène H2O2 et l’anion superoxyde (O2-)
  • capable de dégrader ses propres composés et survivre lors de la phagocytose
67
Q

Quelle bactérie exprime une qté importante de catalase + contribue à quoi?

A
  • S. aureus

- résistance à la phagocytose (réstance à la digestion au sein du phagolysosome)

68
Q

Comment fait-on le test de catalase?

A

mélange d’une échantillon bactérien avec du péroxyde d’hydrogène

69
Q

Expliquez l’image 23.

A

Test de catalase à partir d’une culture
Mélange la bactérie au plasma
Coagulation = positif (gauche)
La fibrine permet la formation de thrombus (bactérie transforme le fibrogène (inactif) en fibrine (actif)

70
Q

Que représente l’image 24?

A

Test de catalase à partir d’une colonie

71
Q

Donnez un autre nom pour Staphylococcus aureus.

A

staphylocoque doré

72
Q

Que permet le test de coagulase?

A

séparer S. aureus (coagulase +) de staphylocoques non pathogéniques (coagulase -.)

73
Q

Que permet la coagulase?

A

dégrader le fibrinogène du sang en fibrine (donc que la bactérie résiste au syst.imm.)

74
Q

Qu’on les souches pathogéniques de S.aureus + avantage?

A
  • portent la coagulase à leur surface, ainsi que d’autres facteurs permettant la coagulation de la fibrine
  • permet d’être recouverte de molécules humaines = être « invisible » et échapper à la phagocytose
75
Q

Comment fait-on le test de la coagulase?

A

échatillon + plasma

76
Q

Que représente l’image 25?

A

test de la coagulase dont le tube du haut est positif

77
Q

Nommez 4 caractéristiques qui facilitent l’identification d’une colonie de bactéries.

A
  • coque ou bâtonnet
  • aérobie ou anaérobie
  • gram + ou gram -
  • sécrète la catalase ou non
78
Q

Nommez 5 composantes d’un exemple d’algorithme pour identifier des bactéries.

A 
maculation
forme
respiration
reproduction de forme
gène
espèce
79
Q

Étapes de formation d’une protéine pour les eucaryotes? (6)

A 
Dans noyau :
- ADN (ac introns et exons)
- transcription = ARN primaire
- ajout 5'' queue = ARN avec cap
- épissage de ARN = ARNm
Sortie dans cytoplasme
- translation = protéine
80
Q

Étapes de formation d’une protéine pour les procaryotes?

A
  • ADN dans cytoplasme (exons seulement)
  • transcription = ARNm
  • translation = protéine
81
Q

Que dire de la taille des génomes?

A

Varie énormément
Humain : 1000x plus complexe que les bactéries
Certains animaux ont des génomes plus gros que l’humain

82
Q

Quelle est la composition de l’ADN

A 
Desoxyrybose (sucre)
Phosphate
séquences de 4 bases
-Adénine
-Guanine
-Cytosine
-Thymine
83
Q

Quelles sont les fcts de l’ADN? (3)

A

Expression des gènes
Réplication
Base moléculaire de la réplication sexuée

84
Q

Comment utilise-t-on l’ADN et ARN en diagnostic? (2)

A

Amplification de régions spécifiques de l’ADN

Détermination de la séquence (après amplification) : identification plus précise.

85
Q

Que permet le PCR (3)?

A

Amplificatin de l’ADN
Analyse quantitative (nbr de molécules qui étaient présentes ds l’échantillon de départ)
Donne une idée du niveau de réplication du virus

86
Q

À quoi est très utile la détermination de la séquence d’ADN?

A

Pour la phylogénétique (évolution du microbe)

87
Q

Que signifie PCR + utilisation + nécessite quoi?

A

Réaction en chaîne
Amplification exponentielle de fragments d’ADN (environ jusqu’à 15 000 bases)
Amorces

88
Q

Comment peuvent être les fragments d’ADN résultant de la réaction PCR? (3)

A

Directement visualisés
Séquencés
Clonés

89
Q

Quelles sont les 5 étapes de la PCR (image pour vous aidez)?

A
  1. Chauffer pour séparer les 2 brins
  2. amorces se fixent à l’ADN aux segment complémentaire
  3. 1ère réaction de polymérase : copie
  4. On chauffe à nouveau pour séparer d’autre brins
  5. Réplication exponentielle
90
Q

Que permet PCR avec l’ARN?

A

réverse-transcrit en ADN

91
Q

Que dire des amorces utilisées en PCR?

A

choix est connu
nbr de bases est connu
on sait à quoi s’attendre comme résultat

92
Q

Quel virus peut-on détecter avec PCR en temps réel?

A

Epstein-Barr

93
Q

Que peut-on dire de l’image 27?

A

PCR-rt
Les échantillons de gauche contenait + d’ADN au départ que ceux de droite
Il y a de plus en plus de virus qui se forme dans les échantillons

94
Q

Que permet de faire PCR-rt et de quelle façcon?

A

suivre la quantité de PCR formés grâce à l’utilisation d’un marqueur fluorescent (plus il y a de fluorescence + il y a d’ADN)

95
Q

Définir phylogénétique en 5 phrases.

A

Analyse fait sur ordi
Reproduire l’évolution de micro-organisme
Aide à identifier origine et reconstituer des épidémie
Aide a définir des modes de transmission
Basée sur comparaison de séquence (ex. ADN ou de protéines)

96
Q

Sur quoi sont svt basés les arbres phylogénétiques?

A

sur la séquence d’une protéine

97
Q

Image 28

  • c’est quoi
  • montre quoi
  • étrémités
  • proximité
  • taille des branches
  • Ted vs 17.6 vs Gypsy
A
  • Arbre phylogénétique
  • Relation entre les éléments qui on été étudiés
  • Étrémité = échantillons connus
  • plus ils sont près moins il y a eu de mutation
  • taille des branches tjs proportionnelle aux nbr de mutation
  • Ted + près de 17.6 que de Gypsy
98
Q 
Analysez la phylogénétique des éléments suivants :
#1 ATTATCGGCTTCGC
#2 ATAATCGCCTTCGC
#3 TTTTTGCGCTACC
A

1 et 2 ont un ancêtre commun plus récent que avec le 3

99
Q

Le lien est fait avec quoi dans :
Phénotypes
Sérotypes
Génotypes

A
  • comportement
  • AntiC
  • analyse des génomes ARN ou ADN
100
Q

Que représente l’image 29 + ce que l’on peut en conclure?

A
  • diversité génétique du HCV
  • Génotypes 1 : plus fréquent ici et praux droges
    2 : moyen orient
    3 : injection
    4 : voie médiacale
    5 : afrique sud
    6 : Australie et Hong Kong
101
Q

De quoi provient l’épidémie de SIDA? Ce qui la catégorise de quoi? Où les premiers cas connus?

A

chimpanzés
zoonose
Afrique centrale

102
Q

Que peut-on conclure par l’image 30?

A

VIH-1 provient des CPZ

VIH-2 provient des simiens

103
Q

Quelle est la composition d’une protéine?

A

Chaîne d’acides aminés (taille très variable)

104
Q

Quelles sont les fcts des protéines (4)?

A
  1. Protéines de structure
  2. Enzymes
  3. Communication moléculaire
  4. Défenses cellulaires
105
Q

Que dire de la nature antigénique des protéines?

A

Les AntiC sont généralement dirigés contres des protéines de micro-organismes et jamais vers de l’ADN

106
Q

Définir Épitope.

A

zone de la protéine qui est reconnue par antiC (parfois sur une dénaturée linéaire, d’autre sur la structure 3D)

107
Q

Que permet la détection par western blot (immunobuvardage)?

A

la détection de la réponse immune (antiC)

108
Q

Explique la détection par western blot en 5 étapes.

A
  1. Séparation de protéines virales sur gel d’acrulamine en fct de leur taille
  2. Transfert des protéines sur membrames
  3. Ac secondaire pour reconnaître l’Ac primaire
  4. Réaction avec sérum du patient
  5. Révélation par procédé chimique des protéines reconnues par les AntiC du patient (svt enzyme coloré ou luminescent)
109
Q

Que représente l’image 31?

A

Prélèvement sanguin à différents jours
Isole Ac primaire
Utilise VIH d’un autre personne
Y a-t-il des Ac et à partir de qd sont-ils efficace
Généralement 3 semaines pour voir toutes les protéines du VIH

110
Q

Que permet ELISA?

A

détection d’un antiG ou antiC

111
Q

Que représente l’image 32 et expliquez?

A 
Détection d'un Ag par ELISA
Détection Ag
Besoin de 2 Ac contre celui-ci
1 : Ac se fixe
2 : Ajout échantillon ac Ag
	si reconnu seront fixé un a l'autre
3 : lavage pour enlever le reste
4 : 2e Ag doit reconnaître un autre site de la protéine
5 : lavage final
Ac-Ag-Ac
112
Q

Que représente l’image 33 et expliquez?

A 
Détection d'un Ac par ELISA
Besoin de l'Ag et protéine du micro-organisme
Fixe prot au support solide
Si positif = fixation de l'Ag
2e Ac marqué avec une protéine
Ag-Ac-Ac
113
Q

Pour quoi est utilisé la méthode des bandelettes (2)?

A

Détection de protéine

Paludisme (malaria)

114
Q

Avantange de la méthode des bandelettes pour une certaine maladie?

A

Rapide pour la détection de Plasmodium falciparum un Ag

115
Q

Comment fait-on la méthode des bandelettes? (3 étapes)

A
  1. Un échantillon de sang de patient est lysé (hémolyse) ce qui permettra de libérer les Ag de Plasmodium
  2. Une bandelette couverte d’Ac anti-Plasmodium est trempée dans le sang hémolysé.
  3. La bandelette est ensuite trempée dans une solution de liposomes contenant un colorant rose; les liposomes vont également se fixer aux antigènes de Plasmodium.
116
Q

Que représente l’image 34?

A 
Méthode des bandelettes
Pf : bande spécifique de P. falciparum
Pv : bande spécifique de P. vivax
PAN : bande spécifique des 4 espèces
C : bande contrôle assurant la bonne exécution du test.
117
Q

Que représente l’image 35 et expliquer?

A

Détection d’un Ag par

  • immunofluorescence
  • immunoessai
118
Q

Que représente l’image 36?

A

immunofluorescence

cellules infectées par l’herpes simplex au sein d’une section du cerveau d’un patient atteint d’encéphalite

119
Q

Nommez les 6 façons de classification/identification

A
  1. phénotypage
  2. Par analyses biochimiques
  3. Par génotypage
  4. La phylogénétique
  5. L’analyse des protéines
  6. Une visite au CHRTR
120
Q

Comment procède-t-on à l’utilisation d’appareils PCR automatinsées? (3 étapes formation de mélanges)

A
  1. Les échantillons sont prélevés
    - urine
    - vaginal
    - cutané
    - sang
  2. les acides nucléiques sont extraits et mélangés automatiquement avec les solutions constituant le « mix » de PCR
    - amorces
    - enzyme
  3. Les mélanges réactionnels permettant de détecter des micro-organismes spécifiques sont vendus « prêts à l’emploi » par les compagnies de diagnostic, pour utilisation dans les instruments
121
Q

Que dire de l’appareil de droite image 37? (lieu des mélanges, comment on mélange, que dire des disques, surtout utile qd)

A
  • les mélanges sont contenus dans des « puits » du disque
  • une centrifugation permet de mélanger échantillons et réactifs
  • Les disques sont spécifiques pour la détection de micro-organismes (ex: HSV-1 ou -2, C Difficile, influenza),
  • surtout utile pour les détections ne nécessitant pas d’extraction
122
Q

Nommez 5 ex d’origine d’échantillon testés pour l’identification de bactéries et de mycètes pour faire une culture.

A
  1. LCR
  2. cutané
  3. lavages broncho-alvéolaires
  4. ongles
  5. crachats
123
Q

Comment divise-t-on les échantillons pour détecter la présence d’espèces spécifiques?

A
  • bactérie
  • mycose
  • mycobactérie
124
Q

Que dire des conditions de cultures?

A

peuvent être faites dans de multiples conditions différentes, souvent sur des milieux contenant des réactifs colorés permettant d’identifier les micro

125
Q

Que représente l’image 38?

A

Candida albicans est révélée par la coloration verte

126
Q

Comment appelle-t-on les géloses permettant l’identification?

A

« géloses API » (analytical profile index)

127
Q

Que représente l’image 39?

A

De droite à gauche:
• CAMPY: permet la croissance des campylobactéries (C. jejuni cause des diarrhées contenant du sang ou non, chez les enfants ou adultes)
• gélose CIN permettant la croissance sélective de Yersinia enterocolitica (cause des diarrhées contenant du sang chez les jeunes enfants)
• gélose XLD pour la culture de Salmonella (colonies rouges, certaines avec un centre noir) et Shigella (seulement rouges); d’autres bactéries peuvent pousser mais auront une autre couleur.
• gélose sorbitol-MacConkey (“SMAC”) pour l’identification de E. coli O157:H7 qui, contrairement aux espèces non pathogéniques de E. coli, est incapable de fermenter le sorbitol. La gélose contient du sorbitol et la présence de O157:H7 va causer l’acidification du milieu ce qui va être révélé par un marqueur colorimétrique.

128
Q

Que représente l’image 40?

A

Salmonelles

gélose XLD

129
Q

Que représente l’image 41?

A

La flèche montre une colonie de O157:H7

gélose SMAC (absence de couleur est caractéristique)

130
Q

Donnez un exemple de contrôle de qualité dans les protocoles d’identification.

A

tests avec des souches bactériennes de référence provenant de d’organisations comme l’ATCC (American Type Culture Collection)

131
Q

Que dire du milieu du sang?

A

normalement stérile

132
Q

Pourquoi fait-on la détection de bactéries dans le sang par hémocultures?

A

détecter de façon précoce la présence de bactéries dans le sang, même en petits nombres

133
Q

Comment fait-on la détection de bactéries dans le sang par hémocultures?

A

on réalise des cultures de sang (hémocultures) dans des incubateurs spéciaux et en prenant des précautions pour éviter la contamination par des bactéries présentes dans le laboratoire

134
Q

Qu’est-ce que le système API?

A

analytical profile index
système de culture miniaturisée permettant d’identifier les espèces bactériennes sur la base de leurs propriétés, en combinant
-leur capacité à pousser dans des milieux contenant certaines sources de nutriments (ex. lactose, sorbitol, etc)
-la présence de certaines enzymes

135
Q

Qu’est-il nécessaire pour utiliser le système API?

A

obtenir une culture homogène (pure) de l’espèce bactérienne à identifier

136
Q

Comment sont certains puits dans le système API?

A

la micro-culture est couverte d’une couche d’huile minérale pour créer un milieu sans oxygène, de façon à pouvoir détecter également les bactéries anaérobies

137
Q

Comment l’identification est-elle réalisée dans le système API?

A

par comparaison des résultats obtenus avec des standards

138
Q

Que représente l’image 42?

A

système API
Croissance révélée par l’augmentation de la turbidité du milieu (gauche) et/ou l’utilisation de marqueurs colorimétriques montrant la présence de certains produits de réactions enzymatiques.
Ex: La présence de H2S (sulfate d’hydrogène) est révélée par une réaction donnant un produit noir. TDA: test indiquant la présence de tryptophane déaminase.
La présence de fermentation utilisant le glucose, le mannitol, le sorbitol, etc. est révélée par une réaction donnant un produit jaune.

139
Q

Quelle est l’espèce présente sur l’image 43?

A

Alternaria (une espèce commune dans la nature, qui infecte les personnes immunodéprimées)

140
Q

Quelle mycobactérie est principalement recherché à détecter?

A

M. tuberculosis

141
Q

Comment sont les échantillions pour détecter M. tuberculosis?

A

échantillons sont respiratoires (lavages broncho-alvéolaires ou utilisation d’une brosse télescopique protégée)

142
Q

Que dire de la M. tuberculosis?

A

bactérie est fastidieuse et des cultures de plusieurs semaines sont courantes

143
Q

Nommez 2 milieux spécifiques à M. tuberculosis.

A

Gruft

Jensen

144
Q

Que dire de la détection de M. tuberculosis?

  • contrôle
  • lieu de culture
  • culture positive
  • coloration
  • identification final
A
  • contrôles de qualité sont nécessaires pour vérifier que les micro-organismes isolés ne sont pas des bactéries
  • salle spéciale et un incubateur spécialisé
  • augmentation de la turbidité
  • coloration Gram (résultat attendu: négatif, absence de coloration) et une coloration acido-alcoolo-résistante (résultat attendu: positif).
  • PCR
145
Q

Antibiogrammes

  • svt utilisés comment
  • but
  • milieu (2)
  • analyse (2)
A
  • parallèlement à l’identification
  • choix du traitement
  • semi-solide (géloses) ou liquide
  • automatisée ou manuelle (cas des SARM et SARV)
146
Q

Que représente l’image 44?

A

Test de multiples antibiotiques

147
Q

Que représente l’image 45?

A

Une culture de S. aureus résistante à la méthicilline (SARM) mais sensible à la vancomycine (SARV). Fox = cefoxitine, un antibiotique de la famille des beta-lactames tout comme la méthicilline (les SARM sont en fait résistants à un grand nombre de beta-lactames). VA = vancomycine.

148
Q

Que représente l’image 46?

A

Instrument pour l’analyse simultanée de la résistance de multiples cultures bactériennes à de multiples antibiotiques. La résistance se traduit par une croissance plus importante ce qui active un marqueur fluorescent (plus sensible qu’une mesure de turbidité).

149
Q

Détection par test immunologique: les « antigen cards »

  • similaire à quoi
  • détection particulière de quoi
  • fctnement
A
  • « dip sticks »
  • malaria
  • Des anticorps contre le pathogène sont immobilisés sur une membrane
  • L’échantillon est déposé à proximité et une solution de tampon est appliquée pour le faire diffuser
  • Le 2d anticorps couplé au composé coloré est présent sur une 2ème membrane qui est ensuite appliquée contre la 1ère, mais pas directement contre la zone contenant l’anticorps lié ou pas à sa cible antigénique (« fenêtre »).
  • Les Ac secondaires vont eux aussi diffuser et si l’Ag est présent, ils vont se concentrer à cet endroit, provocant l’apparition d’une ligne colorée.

-L’Ac contrôle se lie directement à l’Ac secondaire en l’absence d’Ag.
La compagnie Alere vend de tels kits pour le diagnostic de nombreuses maladies infectieuses (la seule contrainte est la nécessité de disposer d’un antigène soluble présent en qtés suffisantes dans l’échantillon)

150
Q

Que représente l’image 47?

A

Détection par test immunologique: les « antigen cards »

151
Q

À quoi est très utile la détection par test immunologique: les tests ELISA?

A

détecter de nombreux marqueurs de cancers et de problèmes métaboliques

Microbiologie et Infectiologie (4 decks)

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