Définitions

Question 1

Génome

Answer 1

Ensemble des caractères héréditaires, de l’information génétique d’un individu. Animaux : information des chromosome et des mitochondries. Cell végétales : infos des chr, mitochondries et chloroplastes
Ce n’est pas uniquement l’ADN qui constitue les gènes
Ensemble des séquences nucléotidiques connues

Question 2

Taille du génome humain et nombre de gènes

Answer 2

Génome de 3 milliards de pb (3 gigabases) et environ 25000 gènes

Question 3

Génomique structurale

Answer 3

S’interesse à l’emplacement des gènes, permet de donner une carte la plus précise possible de l’emplacement des gènes.

Question 4

Génomique fonctionnelle

Answer 4

S’interesse à la fonction des gènes, étude de l’interaction des gènes.

Question 5

Génomique comparative

Answer 5

2 niveaux de comparaison : comparaison de génomes d’espèces différentes et étude de la variabilité intra-espèces en comparant le génome de plusieurs individus d’une même espèce.

Question 6

Techniques

Answer 6

Sanger : séquençage de 1000pb par expérience (1997 : 1er eucaryote séquencé : C. cerevisiae
PCR : amplification de fragments d’ADN (max quelques milliers de pb) in vitro

Question 7

Epigénome

Answer 7

Ensemble des modifications covalents au niveau des nucléotides ou des histones, susceptible d’entrainer une reprogrammation de la cellule sans altérer la séquence génomique.
Analyse grâce à des AC spécifiques d’une topologie de la molécule : étude de la topologie de la chromatine en fonction des modifications covalentes de la chromatine

Question 8

Analyse de l’interactome

Answer 8

Identification des régions de l’ADN sur lesquelles se fixent les protéines

Question 9

Analyse en 3D du génome

Answer 9

étude de l’interaction entre des régions très distantes

Question 10

Analyse du transcriptome

Answer 10

étude du contenu en ARN d’une cellule à un moment donné, varie d’une cellule à l’autre

Question 11

Clonage

Answer 11

réplication à l’identique

Question 12

Vecteur de clonage

Answer 12

ADN circulaire avec une cassette de clonage. Capable de se répliquer de façon autonome donc présence d’une ORI. Gène de résistance à un antibiotique pour maintenir le gène dans la bactérie

Question 13

Cassette de clonage

Answer 13

fragment d’ADN ave des sites uniques de coupure ar des enzymes de restriction

Question 14

Transcriptome

Answer 14

Contenu en ARN d’une cellule à un moment donné, spécifique d’un type de cellule et varie en fonction des signaux extérieurs.

Question 15

Transcription

Answer 15

recopiage de ce qui est écrit sur les gènes (ADN –> ARN)

Question 16

Traduction

Answer 16

Changement de langage (ARN – protéines)

Question 17

Protéome

Answer 17

contenu en protéines d’une cellule

Question 18

Gène

Answer 18

région d’ADN qui va être transcrite par ARN polymérase, sous la dépendance d’un promoteur.

Question 19

Promoteur

Answer 19

séquence d’ADN qui renferme un motif reconnu spécifiquement par la machinerie transcriptionnelle. promoteur dos à dos, se superposant, à transcription convergente…

Question 20

Pseudogène

Answer 20

Dans le génome eucaryote, ressemble à un gène mais pas de traduction en protéines. Il faut donc toujours coupler l’étude du transcriptome à celle du protéome

Question 21

Gènes bactériens

Answer 21

Organisés en opérons, promoteurs constitués de 2 motifs en position -10 et -35. Séquence de ces éléments varie mais les gènes de ménages ont une séquence proche ou régulée.

Question 22

ARN polymérase I

Answer 22

synthétise les ARN ribosomiques
grande taille, codent pour un transcrit primaire qui renferme le 18S, 5,8S et 28S
tous la même architecture avec 2 motifs (sur le +1 et en amont)

Question 23

ARN polymérase II

Answer 23

synthétise les ARNm sous forme de précurseurs et des petits ARN nucléolaires
gènes transcrits ont rarement une TATA box (si oui, en -20) ; corps promoteur autour du +1 ; promoteur de bas (1000 nucléotides en amont du +1 (=en 5’) ; enhancers, ce sont des activateurs

Question 24

ARN polymérase III

Answer 24

transcrit les gènes qui codent pour des petits ARN non codant (ARN de transfert et petits ARN de nucléolaire)
petite taille, élément promoteurs à l’intérieur de la région transcrite
TTTT en 3’ : terminateur de la transcription

Question 25

Immunoprécipitation de protéines

Answer 25

pour l’étude de la régulation des gènes, pour mettre en évidence une protéine, pour étudier la structure de la chromatine