de l'ADN à la protéine Flashcards
Qu’est-ce qui arrive au niveau des nucléotides pendant la transcription?
Elles s’apparient pour former un ARN complémentaire à l’un des brins d’ADN
C’est quoi l’avantage de l’ARN d’avoir des appariements intramoléculaires?
Forment des structures particulières et donc de diverses fonctions
Transcription : enzyme? implique quelle région?
ARN Polymérase
Région régulatrice de l’ADN (promoteur)
Promoteurs a quelles 2 rôles?
Recrutement de FT
Fixation de l’ARN Polymérase
4 types d’ARN Pol et leurs ARN synthétisés
ARN Pol I : Grands ARNs (28S, 18S, 5.8S)
ARN Pol II : ARNm, plupart des petits ARNs, miARN, ARN de télomérase
ARN Pol III : Petits ARNs (ARNt, ARNr 5S et ARNsn U6)
ARN Pol IV : ARNsi
Combien il y a t-il d’ARN Pol chez les procaryotes?
1
Fonctions d’ARNm
codent pour les protéines
Fonctions ARNr
faisent partie des ribosomes et catalyse la biosynthèse des protéines
Fonctions ARNmi
Contrôle expression des gènes
Fonctions ARNt
Apportent acides aminés au site de traduction des ARNm par les ribosomes
Les FT recrutés par le promoteur font quoi?
Indiquent à l’ARN Pol ou commencer la transcription
Facteur sigma?
recruté au niveau du promoteur et permet la fixation de l’ARN Pol
Quelles deux sites portent des séquences qui sont reconnues par l’ARN Pol?
Promoteurs
Sites de terminaison bactériens
Transcription se fait 5’-3’ ou 3’-5’?
5’-3’
Eucaryotes : trans. plus ou moins complexes que procaryotes?
plus complexe
Deux classes de FT pour les eucaryotes
Facteurs généraux de transcription
Facteurs spécifiques de transcription
Structure de FT? (deux domaines) Quelle forme permet la fonction des FT?
domaine de fixation à l’ADN
domaine d’activation
-Forme dimère
ARN Pol II des eucaryotes a besoin de quels facteurs de transcription?
généraux
Comment former le complexe de pré-initiation? Ou est le site d’initiation de transcription?
Complexe : FGTS et Pol II
Site initiation : 24-32 nt après le promoteur, 10 nt après boite TATA
Qu’est-ce qui permet l’élongation de la transcription?
La phosphorylation du domaine C-terminal de l’ARN
Qu’est-ce qui arrive suite à l’initiation de la transcription? (3)
- TFIID reste en place
- Pol II se déplace suite à la phosphorylation de la C-terminal par TFIIH
- Recrutement d’une nouvelle Pol II et une nouvelle transcription
Importance de la boite TATA dans l’initiation de la transcription? qu’est-ce qui se lie sur TATA pour commencer la transcription?
TATA cause repliement pour faciliter le recrutement des FT.
TBP (sous-unité de TFIID) se lie au TATA
Importance des Facteurs Spécifiques de Transcription dans la régulation de l’expression des gènes?
Elles relient les voies de signalisation et la transcription. Elles sont activées suite à l’activation d’une voie de signalisation
Exemple de FT spécifique?
CREB/CREM : relié à la signalisation de la protéine kinase A
Les régions amplificatrices font quoi au niveau de la régulation de l’expression des gènes?
Elles favorisent le recrutement des FT aux régions promotrices, menant à l’activation de la transcription
Deux régions non-traduits?
Coiffe 5’ et Queue Poly-A
Importance de la coiffe 5’? (3)
Prévient digestion de 5’ de l’ARN par les exonucléases
Facilite la sortie de l’ARNm du noyau
Important dans le déclenchement de la traduction de l’ARNm
Importance de la queue poly-A? (1)
Protection contre les exonucléases
Qu’est-ce qui permet le recrutement des protéines de maturation de l’ARN au niveau de la queue?
Les sites de phosphorylation
Le domaine C-terminal permet quoi au niveau de l’ARNm?
permet l’organisation des composantes participants à la maturation du pré-ARNm
Gène bactérien possède-t-il des introns? et l’ARNm mature?
non et non
Comment les introns sont-ils enlevés de l’ARN?
Épissage:
clivage par spliceosome en reconnaissant le ‘A’ du lasso
L’épissage alternatif permet quoi?
La diversité des protéines produites
L’ARNm mature va ou? par quelle complexe?
exporté hors du noyau par le complexe de pores nucléaires
Le complexe de pores nucléaires inclue quoi? (3)
- Protéines de liaison à la queue poly-A
- Complexe de liaison à la coiffe
- Protéines qui reconnaissent les ARNm épissés
Combien de cadres de lectures pour la traduction? codon start?
3 cadres de lecture
AUG
2 propriétés du code génétique
- Universel (identique pour tout le monde vivant)
2. Dégénéré (un AA peut être codé par plusieurs codons, mais un codon code pour un seul acide aminé)
Combiens de possibilités de codons?
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Qu’est-ce qui fait l’appariement de acides aminés et des codons de l’ARNm?
ARNt
ARNt porte quoi? et présente quoi?
un acide aminé et présente un anticodon complémentaire au codon de l’ARNm pour cet a.a.
Les a.a pendant la traduction sont unis à l’extrémité 3’ de l’ARNt par quel enzyme?
Aminoacyl-ARNt synthétase
Les promoteurs des ARNt sont situés dans quels régions?
ARNt sont transcrits par quel enzyme?
À l’intérieur des régions codantes
Transcrits par ARN Pol III
Quel enzyme est impliqué dans la maturation des pré-ARNt?
Ribonucléase P (endonucléase)
Les ribosomes se situent ou dans la cellule eucaryotes?
cytoplasme
Site de production des ribosomes?
Nucléoles
Ribosome eucaryote:
Combien de sous-unités? contiennent combien de protéines ribosomiques et quels ARNr?
2
Sous unité 60S : 49 protéines, ARNr 5S, 5.8S et 28S
Sous unité 40S : 33 protéines, ARNr 18S
Initiation de la synthèse protéique , 3 étapes
- Assemblage de la petite sous-unité ribosomique au codon d’initiation (implique recrutement des FT)
- Recrutement du premier aa-ARNt au ribosome
- Assemblage du complexe d’initiation complet
4 étapes de la traduction
- Grosse sous-unité ribosomique lie sur la chaine et recrutement d’un 2e ARNt-a.a.
- Attachement des deux a.a
- Grosse sous-unité transloque
- Petite sous-unité transloque
La fin de la traduction nécessite quoi?
La rencontre d’un codon stop
chez les procaryotes, un ARNm peut coder ______
plusieurs protéines différentes
Les protéines sont synthétisés par des ______
polyribosomes
comment contrôle-t-on le taux de protéines? (2)
Ajout de groupements ubiquitine aux protéines cibles
Destruction par le protéasome
On ajoute des groupements Ub à quelles protéines? (2)
Protéines mal repliées
Protéines de courte durée
Mécanisme de signalisation activé par une hormone hydrosoluble? 5 étapes
- Hormone (1e messager) se lie au récepteur
- Le récepteur active une protéine G
- Protéine G active l’adénylate cyclase
- Adénylate cyclase convertit ATP en AMPc (second messager)
- AMPc active les protéines kinases
Activation de la voie PKC? Rôles des produits formés?
- Activation de récepteur membranaire par hormone hydrosoluble
- Ga active la phospholipase C
- Formation de IP3 et DAG à partir de PIP2
IP3 : libère Ca dans cytosol
DAG : active PKC (implique aussi calcium)
5 étapes de l’Activation d’un gène par un hormone liposoluble
- Hormone stéroide diffuse à travers la membrane plasmique et se lie à un récepteur intracellulaire
- Complexe hormone-récepteur pénètre dans le noyau
- Complexe hormone-récepteur se lie à un élément de réponse aux hormone (une séquence d’ADN particulière)
- Cette liaison déclenche la transcription d’un gène en ARNm
- ARNm dirige la synthèse de protéines
Quelles sont les protéines importées dans le noyau par le complexe de pore nucléaire? (3)
Protéines de structure (histones)
Enzymes (les Pol, protéines de réparation)
Protéines régulatrices (FT)
Quelles sont les protéines exportées hors du noyau par le complexe de pore nucléaire?
Protéines en association avec des ARN (sous-unités ribosomiques, ribonucléoprotéines donc spliceosome)
Complexe de pore nucléaire : petite molécules sont transportés comment? et les grandes molécules?
Petites: diffusion passive
Grande : mécanisme de transport
Les protéines qui entrent dans le pore nucléaire contiennent quel signal? Quels 2 récepteurs se situent sur le pore nucléaire?
Signal de localisation nucléaire
Récepteurs:
Importines et Exportines
Les récepteurs importines et exportines ont besoin d’impliquer quoi pour faire le transport de substances?
Ran-GTP
6 méthodes de contrôle de l’expression des gènes
- Transcription
- RNA processing
- Transport d’ARN et localisation
- Dégradation d’ARNm
- Traduction
- Activité protéique
Méthylation = activation ou répression de l’expression des gènes?
Répression
Cellules souches et cellules différenciées : quelles présentent des niveaux de méthylation les plus faibles?
Les cellules souches
2 rôles que ARN peut avoir
autocatalyse
ribozyme
6 réactions biochimique que les ARNs peuvent catalyser
- Coupure d’ARN et sa ligation
- Coupure de l’ADN
- Formation de liaison peptidique
- Ligation de l’ADN
- Épissage de l’ARN
- Polymérisation, phosphorylations ou alkylation des ARNs
