Daño y reparación del ADN Flashcards
Polimerasas que siguen realizando la síntesis de ADN aún cuando esta dañada
TLS (trans-lesión)
- muy riesgoso
Que tipo de ADN pol se detiene cuando se encuentra una lesión de ADN
DNA pol delta y epsilon
Tipos de polimerasas TLS
- Poln
- Poli
- Polk
- REV1
- Polv
- Pol ζ
- Pol0
Cómo se clasifican los daños al ADN
Endógenos
Exógenos
Tipos de daños endógenos del ADN
- Error replicativo
- Desaminación espontánea de base
- Pérdida de bases
- Daño oxidativo
- Metilación del ADN
Tipos de daños exógenos del ADN
- Radiación ionizante
- Radiación ultravioleta
- Agentes alquilantes
- Agentes aromáticos
Tipo de daño donde las polimerasas incorporan un nucleótido erróneo y la topoisomerasa alinea mal las hebras
Error replicativo (ENDO)
Tipo de daño donde hay una pérdida de amino exocíclico
Desaminación espontánea de base (ENDO)
Citosina desaminada:
Uracilo
Adenina desaminada
Hipoxantina
Guanina desanimada:
Xantina
5-metil citosina desanimada:
timina
Tipo de daño donde hay una hidrolización y se rompe el enlcae N-glucosídico (deja un espacio sin nucleótido)
Pérdida de bases (ENDO)
Tipo de daño cuando las especies son reactivas de oxígeno
Daño oxidativo (ENDO)
O2 en el daño oxidativo
Superoxido
H2O2
Peróxido de hidrógeno (presente en el daño oxidativo)
OH
Radical hidroxilo (daño oxidativo)
- Genera dobles enlaces
- Fragmenta purinas y pirimidinas
- Rotura de una sola hebra de ADN
Tipo de daño donde hay grupos metilo en una base nitrogenada e inhibe la síntesis del ADN
Metilación del ADN
Tipo de daño que rompe moléculas de agua y hace radicales libres, y puede romper una o dos cadenas de ARN
Radiación ionizante (EXO)
Tipos de radiación ionizante
-Alfa
-Beta
-Gamma
-Neutrones
- Rayos X
Tipo de rayos UV que dañan al ADN
UV-C (lo rompe)
Hasta cuanto un ADN puede absorber una onda de rayos UV
Onda de 260 nm de longitud
Tipo de daño que añade grupos alquilos al ADN y no pueden hacer su funcionamiento
Agentes alquilantes (EXO)
Elementos que actúan como agentes alquilantes
. Tabaco
- Agentes mostaza nitrogenasas
Función y qué son los cisplatinos y ciclofodamidas
- Agentes alquilantes
- Dañan al ADN para matar células cáncerosas pero en este proceso dañan a otras tmb
Tipo de daño que forma enlaces covalentes con la otra hebra (cuando deben ser puentes de hidrógeno)
Agentes alquilantes (EXO)
Tipos de agentes aromáticos
- Tabaco
-Carbón - Pesticidas
Agentes utilizados para matar células cáncerosas, pero q a la vez matan tmb a otras células
Cisplatino
Ciclofosdamida
Tipo de daño que sustituye una base por un agente aromático (por afinidad)
Agentes aromáticos (EXO)
Qué necesita el daño de agentes aromáticos para funcionar?
Activación metabólica por el citocromo P450
Tipo de daño de ADN específico que altera la geometría del ADN
Agentes aromáticos (EXO)
Tipos de reparación del ADN
- Por escisión de base (BER)
- Por escisión de nucleótidos
- Por mismatch (MMR/MUT)
- Por recombinación homóloga
- Por reparación no homóloga
Tipo de reparación que elimina los nucleótidos alterados generados por reactivos químicos y solo deja la base fosfato y pentosa
Reparación por escición de base (BER)
Daños que causan una BER
- Desaminaciones
- Alquilaciones
- Especies reactivas a oxígeno
Función y de donde es la ADN glucosilasa
- Elimina base dañada (hidroliza enlace glucosídico entre la base nitrogenada y azúcar)
- BER
Función y de donde es la endonucleasa AP
- Rompe enlaces fosfodiester
- BER
Función y en que tipo de reparación trabaja la ADN pol beta
- Pone nucleótidos
- BER
Función y en qué tipo de reparación trabaja la ligasa
- UNE nucleótidos y fragmentos
- BER
Tipo de reparación que quita una gran cantidad de nucleótidos dañados formando una burbuja (dañados y distorsionados por rayos UV)
Reparación por escisión de nucleótidos (NER)
Proteína que reconoce el daño en la reparación de escisión de nucleótidos
XPC
Complejo de proteínas que se le unen a XPC al reconocer el daño en la reparación NER
- XPA
- TFIIH
- XPB y XPD
Función de XPB y XPD en la reparación NER
Función de helicasa
- Corta la hebra y rompe los puentes de hidrógeno
Función de XPF y XPG en la reparación NER
ENDONUCLEASAS -> hidrolizan enlaces fosfodiester
XPF: corta extremo 5’
XPG: corta extremo 3’
(libera la sección dañada)
Proteína que reconoce bases mal apareadas en la reparación por mismatch
MSH
Proteína que permite la formación del complejo y se une a MSH (MMR)
MLH
Proteínas que quitan nucleótidos en MMR
Exonucleasas
- Exonucleasa 7: 5’ → 3’
- Exonucleasa 1 & 10: 3’ → 5’
Qué reconoce la proteína MutM / mutH en la MMR?
Reconoce sitio GATC y puede reconocer a la cadena copia de la original por su falta de metilación
Cuándo sucede la reparación por recombinación homóloga?
Fase S o G2 (cromosomas homólogos)
Que reparación no está presente en el cáncer de mama?
Reparación por recombinación homóloga
Cuál es el complejo MRN y en qué tipo de reparación se encuentra?
Recombinación homóloga
- MRE11, RAD 50, NBS1
Cómo es que se reculta el complejo MRE11?
Por la activación del gen ATM (ataxia-telangiectasia mutado)
Función de la RPA y donde se encuentra?
RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA
- Reconoce las zonas de rompimiento
Función del complejo de BRCA2, RAD52, RAD51 y donde se encuentra?
RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA
- Señaliza a la cadena de rompimiento hacia la cadena original
Ku 70, Ku80, ADN-PKcs y XRCC4 son utilizadas en esta reparación
No homóloga
Complejo MRN, RPA, RAD 51, RAD52 y BRCA2 son utilizadas en esta reparación
Por recombinación homóloga
MSH, MLH, mutH, Exo7,1,10 son utilizados en esta reparación
Por mismatch MMR
XPC, XPA, XPD, XPG, TFIIH, pol epsilon y delta son utilizados en esta reparación
Por escisión de nucleótidos
ADN glucosilasa, endonucleasa AP, ADN pol beta son utilizados en esta reparación
Por escisión de bases